Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,819,892 |
C→A |
94.2% |
intergenic (‑10/+320) |
spy ← / ← astE |
periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,819,892 | 0 | C | A | 94.2%
| 552.4
/ 24.6
| 191 | intergenic (‑10/+320) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/2); new base A (98/82); total (107/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GACCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAA > CP009273/1819747‑1820036
|
aCCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtactt < 1:216859/148‑1 (MQ=255)
aCCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtactt > 2:508161/1‑148 (MQ=255)
aCCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtactt < 2:3321772/148‑1 (MQ=255)
ccGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttc < 1:1636930/148‑1 (MQ=255)
cGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttcc < 2:1933861/148‑1 (MQ=255)
cGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttcc < 2:1475030/148‑1 (MQ=255)
gAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttcct < 1:3097457/148‑1 (MQ=255)
gAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttcat < 2:2449296/148‑3 (MQ=255)
aaCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATacttcctt > 1:1082967/1‑148 (MQ=255)
aaCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATacttcctt < 1:3184823/148‑1 (MQ=255)
aaCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATacttcctt > 2:2227438/1‑148 (MQ=255)
aCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCttt > 1:2723654/1‑148 (MQ=255)
aCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCttt < 1:199250/148‑1 (MQ=255)
cTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTc < 1:776771/148‑1 (MQ=255)
cTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGATTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTc > 2:2530111/1‑148 (MQ=255)
ttGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCa > 1:2487469/1‑148 (MQ=255)
tGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAg < 2:2917424/148‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttatt > 2:1239349/1‑148 (MQ=255)
gtggtgCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttattta > 2:2129776/1‑148 (MQ=255)
tggtgCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttatttat < 2:2757753/148‑1 (MQ=255)
ggtgCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTtatttatt > 2:790416/1‑148 (MQ=255)
catcatCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTTGTGGTGTCTGCGGCATGGTGCATGTTAGCCGCGCCAAGAGACATGGTAGAGGCATCAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATTTTCTTTATACTTCCTTTCAGTTATTTATTActg < 2:1772563/148‑3 (MQ=255)
tcatcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCt < 1:3371141/148‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTa < 2:2397952/148‑1 (MQ=255)
cTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTaa > 2:301999/1‑148 (MQ=255)
cTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTaa > 2:1164361/1‑148 (MQ=255)
tCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGt < 2:2097663/148‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgt < 2:2283585/148‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgt < 2:2429913/148‑1 (MQ=255)
gTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtgt < 2:3237737/148‑1 (MQ=255)
gctgcGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTg < 1:1837080/148‑1 (MQ=255)
gcGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACg < 1:275338/148‑1 (MQ=255)
gTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACgaga < 1:1339171/148‑1 (MQ=255)
tggtgTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTaa > 1:223037/1‑148 (MQ=255)
gtgtCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACt < 2:1960311/148‑1 (MQ=255)
tgtCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACtt > 2:487488/1‑148 (MQ=255)
gtCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACttt > 1:968134/1‑148 (MQ=255)
cTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTAc > 2:1302036/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACt > 2:2152830/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACt > 2:1121743/1‑148 (MQ=255)
gCGACATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTg > 2:426363/1‑148 (MQ=255)
gCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACt < 1:1112294/148‑1 (MQ=255)
gCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACt > 1:727150/1‑148 (MQ=255)
cATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACtt < 1:1426548/148‑1 (MQ=255)
aTGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACttt < 1:1050931/148‑1 (MQ=255)
ggTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCaa > 1:350099/1‑148 (MQ=255)
gTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAAt > 1:3194740/1‑148 (MQ=255)
gTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAAt > 1:1974382/1‑148 (MQ=255)
gCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAAt > 2:404710/1‑148 (MQ=255)
gCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAAt > 2:405767/1‑148 (MQ=255)
ccGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATc < 1:1471679/148‑1 (MQ=255)
ccGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATc > 1:2935747/1‑148 (MQ=255)
ccGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATc > 1:1002805/1‑148 (MQ=255)
ccAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGc > 1:2269899/1‑148 (MQ=255)
cAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCa < 1:391456/148‑1 (MQ=255)
aaGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCaa > 1:2618645/1‑148 (MQ=255)
aaGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCaa < 2:2682496/148‑1 (MQ=255)
gagCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACg > 2:2478245/1‑148 (MQ=255)
gagCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACg > 2:2650963/1‑148 (MQ=255)
gagCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACg > 2:3438748/1‑148 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACgg > 2:3117753/1‑148 (MQ=255)
tAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACaa < 2:171635/148‑1 (MQ=255)
tAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACaa < 2:1509612/148‑1 (MQ=255)
tAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACaa > 1:3440673/1‑148 (MQ=255)
agagGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAAt > 1:1128295/1‑148 (MQ=255)
ggCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGaa < 1:1491759/148‑1 (MQ=255)
aacaaacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAgt < 2:1737417/148‑1 (MQ=255)
aacaaacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAgt < 2:3348985/148‑1 (MQ=255)
aaacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTa < 2:2240653/148‑1 (MQ=255)
aacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaa > 1:50679/1‑148 (MQ=255)
aacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaa > 2:871203/1‑148 (MQ=255)
acaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaaa > 1:2336027/1‑148 (MQ=255)
acaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaaa > 1:1203498/1‑148 (MQ=255)
acaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaaa > 1:1155065/1‑148 (MQ=255)
acaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaaa > 1:1761014/1‑148 (MQ=255)
aGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCNTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTaaaaa > 1:1784576/1‑148 (MQ=255)
tGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAac > 1:440172/1‑148 (MQ=255)
gCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAaca < 1:3342189/148‑1 (MQ=255)
gCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAaca < 1:458651/148‑1 (MQ=255)
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gTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACtt < 2:3227884/148‑1 (MQ=255)
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AGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTA < SRR19973065.2415662/150‑1 (MQ=60)
AGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTA > SRR19973065.2262025/1‑150 (MQ=60)
GGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAA > SRR19973065.3461657/1‑150 (MQ=60)
GTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAAT > SRR19973065.1135634/1‑150 (MQ=60)
GGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAG < SRR19973065.1501330/150‑1 (MQ=60)
CAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTG > SRR19973065.1027663/1‑150 (MQ=60)
CAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTG > SRR19973065.2793929/1‑150 (MQ=60)
AACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGT < SRR19973065.490786/150‑1 (MQ=60)
CAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAA > SRR19973065.51246/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.2350090/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.2350614/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1162487/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1171551/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1211222/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1772575/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1773149/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAA > SRR19973065.1171556/1‑150 (MQ=60)
ACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCNTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAA > SRR19973065.1796250/1‑150 (MQ=60)
ACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCNTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAA > SRR19973065.1796649/1‑150 (MQ=60)
ACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAA > SRR19973065.2427192/1‑150 (MQ=60)
AGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAAC > SRR19973065.443222/1‑150 (MQ=60)
TGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACAC > SRR19973065.1602061/1‑150 (MQ=60)
TGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACAC > SRR19973065.1602044/1‑150 (MQ=60)
GCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACT < SRR19973065.461589/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACT < SRR19973065.461816/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACT < SRR19973065.3362609/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACT < SRR19973065.3365467/150‑1 (MQ=60)
AGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTT < SRR19973065.2487635/150‑1 (MQ=60)
GTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTT > SRR19973065.1838629/1‑150 (MQ=60)
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ATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGC > SRR19973065.367291/1‑150 (MQ=60)
TTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCA > SRR19973065.437983/1‑150 (MQ=60)
TACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAA < SRR19973065.2442674/150‑1 (MQ=60)
GCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTA > SRR19973065.3076991/1‑150 (MQ=60)
GCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTA > SRR19973065.3076936/1‑150 (MQ=60)
CATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTAT < SRR19973065.3082542/150‑1 (MQ=60)
CATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTAT > SRR19973065.897507/1‑150 (MQ=60)
ATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATG < SRR19973065.457331/150‑1 (MQ=60)
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TTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAG < SRR19973065.2126486/150‑1 (MQ=60)
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GCGGACCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAAAAG > CP009273/1819744‑1820041
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |