Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCAT > CP009273/3098754‑3099052
|
TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGC > SRR19973063.4886132/1‑150 (MQ=60)
CACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAA < SRR19973063.2218693/150‑1 (MQ=60)
ACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAA < SRR19973063.3721774/150‑1 (MQ=60)
ATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATG < SRR19973063.537791/150‑1 (MQ=60)
TGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGT > SRR19973063.316708/1‑150 (MQ=60)
TGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGT < SRR19973063.2482201/150‑1 (MQ=60)
GACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTT > SRR19973063.1577676/1‑150 (MQ=60)
ACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTA < SRR19973063.2340857/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTA < SRR19973063.3627253/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTA < SRR19973063.3627266/150‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTAT > SRR19973063.4535333/1‑150 (MQ=60)
CGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTAT > SRR19973063.4535328/1‑150 (MQ=60)
GCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATC > SRR19973063.3711966/1‑150 (MQ=60)
CCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGAAAAAATGTTATCC < SRR19973063.1319786/150‑1 (MQ=60)
GGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCCAAAATGTTATCCAC > SRR19973063.4554848/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCAC > SRR19973063.2098086/1‑150 (MQ=60)
GGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCAC > SRR19973063.4554630/1‑150 (MQ=60)
GGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACA < SRR19973063.1994343/150‑1 (MQ=60)
GGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACA < SRR19973063.1994102/150‑1 (MQ=60)
GCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACAT > SRR19973063.3814535/1‑150 (MQ=60)
CGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATC < SRR19973063.2898156/150‑1 (MQ=60)
TTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATT < SRR19973063.292680/150‑1 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTT > SRR19973063.2997039/1‑150 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTT > SRR19973063.3008107/1‑150 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTT > SRR19973063.3007956/1‑150 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTT < SRR19973063.826384/150‑1 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGAAAAAATGTTATCCACATCACAATTT < SRR19973063.826529/150‑1 (MQ=60)
ATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTC > SRR19973063.1975859/1‑150 (MQ=60)
ATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTC > SRR19973063.1975744/1‑150 (MQ=60)
AGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTT < SRR19973063.4669397/150‑1 (MQ=60)
GACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTT < SRR19973063.3736949/150‑1 (MQ=60)
ACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGAAGATGCTCA‑GTGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAAT < SRR19973063.140839/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGTAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973063.642804/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973063.2230861/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973063.3316814/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGG < SRR19973063.3281177/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGG < SRR19973063.3281341/150‑1 (MQ=60)
CCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGG > SRR19973063.828508/1‑150 (MQ=60)
CCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGA < SRR19973063.2048226/150‑1 (MQ=60)
CGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAA < SRR19973063.424277/150‑1 (MQ=60)
CGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAA < SRR19973063.3020796/150‑1 (MQ=60)
CGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAA > SRR19973063.375780/1‑150 (MQ=60)
GCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAA > SRR19973063.261033/1‑150 (MQ=60)
GCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAAT < SRR19973063.1884716/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTG < SRR19973063.2630207/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTG < SRR19973063.2515423/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTG < SRR19973063.1342741/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTG < SRR19973063.1342708/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATACACATCACAAATTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTG > SRR19973063.86690/1‑150 (MQ=60)
CTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAAT > SRR19973063.3529000/1‑150 (MQ=60)
CGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAT > SRR19973063.1533400/1‑150 (MQ=60)
GGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATT > SRR19973063.369609/1‑150 (MQ=60)
GGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAAATTAGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATT > SRR19973063.1896879/1‑150 (MQ=60)
GAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTT < SRR19973063.1013294/150‑1 (MQ=60)
AATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTT > SRR19973063.1822115/1‑150 (MQ=60)
AATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTG > SRR19973063.4998318/1‑150 (MQ=60)
TCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCC < SRR19973063.4787224/150‑1 (MQ=60)
TCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCC < SRR19973063.3686502/150‑1 (MQ=60)
CTCGCCGTTATCTTTATCAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCA > SRR19973063.4109645/1‑150 (MQ=60)
CTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCA > SRR19973063.4744535/1‑150 (MQ=60)
CTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCA < SRR19973063.3304199/150‑1 (MQ=60)
TCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCAC < SRR19973063.540541/150‑1 (MQ=60)
TCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTGATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCAC < SRR19973063.2303254/150‑1 (MQ=60)
CCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGG > SRR19973063.5086548/1‑150 (MQ=60)
CCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGG > SRR19973063.2759918/1‑150 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGNT < SRR19973063.4922332/150‑1 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGT > SRR19973063.125725/1‑150 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGT > SRR19973063.2229768/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTA < SRR19973063.2770816/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACA < SRR19973063.4600191/150‑1 (MQ=60)
TTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAA < SRR19973063.4800488/150‑1 (MQ=60)
TTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAA < SRR19973063.1741506/150‑1 (MQ=60)
TATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAA < SRR19973063.3062909/150‑1 (MQ=60)
TAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACC < SRR19973063.2559702/150‑1 (MQ=60)
AAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCA < SRR19973063.961845/150‑1 (MQ=60)
AGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGT < SRR19973063.1580524/150‑1 (MQ=60)
TGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCC < SRR19973063.2698833/150‑1 (MQ=60)
GAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCG > SRR19973063.383995/1‑150 (MQ=60)
GAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCG > SRR19973063.4374614/1‑150 (MQ=60)
AATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGC > SRR19973063.4651415/1‑150 (MQ=60)
AATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTAGCAATTATTAGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCAGC > SRR19973063.2073115/1‑150 (MQ=60)
TACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGA > SRR19973063.894184/1‑150 (MQ=60)
ACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTCTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAA < SRR19973063.2883547/150‑1 (MQ=60)
CCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAG > SRR19973063.1263963/1‑150 (MQ=60)
CCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAG < SRR19973063.301800/150‑1 (MQ=60)
CCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAG < SRR19973063.301817/150‑1 (MQ=60)
CGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTG < SRR19973063.4102962/150‑1 (MQ=60)
CGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTG < SRR19973063.2855716/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGA > SRR19973063.4498052/1‑150 (MQ=60)
CAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGAT > SRR19973063.3310229/1‑150 (MQ=60)
CCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCC > SRR19973063.4113916/1‑150 (MQ=60)
CCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCC > SRR19973063.702321/1‑150 (MQ=60)
CCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTACTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCC > SRR19973063.4113876/1‑150 (MQ=60)
TACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCC < SRR19973063.4143397/150‑1 (MQ=60)
TACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCC < SRR19973063.4141956/150‑1 (MQ=60)
TACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCA < SRR19973063.4999899/150‑1 (MQ=60)
TACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCA > SRR19973063.4657935/1‑150 (MQ=60)
CGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCT < SRR19973063.4664991/150‑1 (MQ=60)
CGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGC > SRR19973063.1650002/1‑150 (MQ=60)
AATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGG < SRR19973063.556654/150‑1 (MQ=60)
AAGTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGG < SRR19973063.894686/150‑1 (MQ=60)
ATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGT < SRR19973063.779059/150‑1 (MQ=60)
CCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAA > SRR19973063.2943274/1‑150 (MQ=60)
CATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATatcacccggtcggc > SRR19973063.3700007/1‑136 (MQ=60)
CATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATatcacccggtcggc > SRR19973063.3606366/1‑136 (MQ=60)
CATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATatcacccggtcggc > SRR19973063.3698256/1‑136 (MQ=60)
ATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTAATCCACATCACAATTTCGGTTTGCCAATTGGGAATGGTTGCAATTATTTGCCACAGGAAACAAACAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCAGCATCTCGCCCGGTCAAAT > SRR19973063.2665858/1‑150 (MQ=60)
TTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATG < SRR19973063.4283861/150‑1 (MQ=60)
TAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGT > SRR19973063.3909922/1‑150 (MQ=60)
AACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTG < SRR19973063.1849152/150‑1 (MQ=60)
ACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGC > SRR19973063.4228779/1‑150 (MQ=60)
CGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTT > SRR19973063.1022848/1‑150 (MQ=60)
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CTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCA > SRR19973063.2215116/1‑150 (MQ=60)
CTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCA > SRR19973063.1353097/1‑150 (MQ=60)
ATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACT < SRR19973063.2871998/150‑1 (MQ=60)
attctcaGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACT < SRR19973063.2872263/143‑1 (MQ=60)
caGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCC < SRR19973063.1931081/148‑1 (MQ=60)
caGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCC > SRR19973063.2808256/3‑150 (MQ=60)
GGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCA > SRR19973063.2828461/1‑150 (MQ=60)
GCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCAT < SRR19973063.3761316/150‑1 (MQ=60)
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TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCAT > CP009273/3098754‑3099052
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |