Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCC > CP009273/3098754‑3099048
|
TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTTCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCTCCCCTGACGATGCTCAGGGC < SRR19973062.5023852/150‑1 (MQ=60)
CACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAA > SRR19973062.4312401/1‑150 (MQ=60)
CCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAA > SRR19973062.2374494/1‑150 (MQ=60)
CATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAAT > SRR19973062.5070909/1‑150 (MQ=60)
CATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCAGACGATGCTCA‑GGGCAAAAAT > SRR19973062.5070887/1‑150 (MQ=60)
TGACGCCGGGCGATGTTTATCAGCCGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGT < SRR19973062.1060333/150‑1 (MQ=60)
TGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTACATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATG > SRR19973062.3010935/1‑150 (MQ=60)
GACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTT < SRR19973062.85845/150‑1 (MQ=60)
GACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTT < SRR19973062.1824150/150‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTAT < SRR19973062.609892/150‑1 (MQ=60)
CGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTAT < SRR19973062.556666/150‑1 (MQ=60)
GCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATC > SRR19973062.3845386/1‑150 (MQ=60)
CGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCC < SRR19973062.212206/150‑1 (MQ=60)
CGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCC < SRR19973062.212205/150‑1 (MQ=60)
GGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACA > SRR19973062.2356597/1‑150 (MQ=60)
ctttttttatctgcggcttcgtacccccctgccttatgggtaatctggccgttatattattaatttgattaccgggaAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATC < SRR19973062.1347856/73‑1 (MQ=60)
GTTGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCA < SRR19973062.4591758/150‑1 (MQ=60)
GATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCA > SRR19973062.2609264/1‑150 (MQ=60)
GATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCA > SRR19973062.2472777/1‑150 (MQ=60)
GATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCA > SRR19973062.1915346/1‑150 (MQ=60)
ATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCA > SRR19973062.5212096/1‑150 (MQ=60)
ATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCAC > SRR19973062.2224610/1‑150 (MQ=60)
TGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACA < SRR19973062.1017377/150‑1 (MQ=60)
TTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAAT < SRR19973062.1324782/150‑1 (MQ=60)
TTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAAT < SRR19973062.811095/150‑1 (MQ=60)
TTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAAT < SRR19973062.4569154/150‑1 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAATTGAATAACGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATTTTATACACATCACCATT > SRR19973062.505722/1‑150 (MQ=60)
TATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTACATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAAAT > SRR19973062.505735/1‑150 (MQ=60)
CAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACACTTTCG > SRR19973062.3371006/1‑150 (MQ=60)
AGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCAGACGATGCTCA‑GGGCCAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTT > SRR19973062.3605289/1‑150 (MQ=60)
ACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTT < SRR19973062.3459069/150‑1 (MQ=60)
GCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGC > SRR19973062.4362658/1‑150 (MQ=60)
CTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCA < SRR19973062.2793679/150‑1 (MQ=60)
TGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTTCAA > SRR19973062.1370764/1‑150 (MQ=60)
TGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAA > SRR19973062.844640/1‑150 (MQ=60)
TGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAA > SRR19973062.844543/1‑150 (MQ=60)
TGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCAGACGAAGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGATTTGCAA > SRR19973062.2986465/1‑150 (MQ=60)
GACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTCCCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAA < SRR19973062.3803055/150‑1 (MQ=60)
ACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAAT < SRR19973062.3974103/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973062.4412570/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973062.1595825/150‑1 (MQ=60)
CGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATT < SRR19973062.1596488/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGG > SRR19973062.1618038/1‑150 (MQ=60)
CCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGG < SRR19973062.2137388/150‑1 (MQ=60)
CCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGG < SRR19973062.1962056/150‑1 (MQ=60)
CCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGGAAATTGGG > SRR19973062.3334163/1‑150 (MQ=60)
CCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTGATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGGTTTGCAAATTGGG > SRR19973062.428176/1‑150 (MQ=60)
CCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAAT < SRR19973062.2108047/150‑1 (MQ=60)
CCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATG < SRR19973062.2960407/150‑1 (MQ=60)
CCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATG > SRR19973062.5140284/1‑150 (MQ=60)
CCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATAACGCGCAAAAATCCAACCGCCGCCCATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATG > SRR19973062.2903998/1‑150 (MQ=60)
ATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTT > SRR19973062.1699622/1‑150 (MQ=60)
ATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTGATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTT > SRR19973062.1699679/1‑150 (MQ=60)
TCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTT < SRR19973062.4401880/150‑1 (MQ=60)
CCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTT < SRR19973062.3656871/150‑1 (MQ=60)
CTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCA < SRR19973062.4303639/150‑1 (MQ=60)
TCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAA < SRR19973062.559818/150‑1 (MQ=60)
GCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCAGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATTTTATCCACATCACAATTTCGTTTTTCAAATTGGGAATGTTTGCAATTA > SRR19973062.472242/1‑150 (MQ=60)
GGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTAGTTTTTCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAT > SRR19973062.1474764/1‑150 (MQ=60)
GGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAAAGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTTCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAT > SRR19973062.1474727/1‑150 (MQ=60)
GGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAACACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTAT < SRR19973062.1233947/150‑1 (MQ=60)
GAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTT < SRR19973062.2066090/150‑1 (MQ=60)
GAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTT < SRR19973062.3744445/150‑1 (MQ=60)
AATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTG < SRR19973062.1952243/150‑1 (MQ=60)
ATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGC < SRR19973062.4842025/150‑1 (MQ=60)
ATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGC > SRR19973062.1644766/1‑150 (MQ=60)
TCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCC > SRR19973062.4228934/1‑150 (MQ=60)
TCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCAC < SRR19973062.4917019/150‑1 (MQ=60)
CGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACA < SRR19973062.1387997/150‑1 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGG > SRR19973062.17274/1‑150 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGT > SRR19973062.3640503/1‑150 (MQ=60)
CGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGT > SRR19973062.3327356/1‑150 (MQ=60)
GTTATCGTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGAAATTATTTGCCACAGGTA > SRR19973062.4564906/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTA < SRR19973062.4139833/150‑1 (MQ=60)
TTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAATATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCATATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAA < SRR19973062.1343125/150‑1 (MQ=60)
TTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAA < SRR19973062.3175890/150‑1 (MQ=60)
TTATCATTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTA < SRR19973062.4139973/150‑1 (MQ=60)
TATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAAC < SRR19973062.1714226/150‑1 (MQ=60)
CTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAA > SRR19973062.175891/1‑150 (MQ=60)
CTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAA > SRR19973062.354357/1‑150 (MQ=60)
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TATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCA‑GGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAA > SRR19973062.5294573/1‑150 (MQ=60)
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TAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCC > CP009273/3098754‑3099048
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
