Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,641,167 |
A→T |
94.3% |
intergenic (+173/+264) |
flxA → / ← intK |
Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,641,167 | 0 | A | T | 94.3%
| 649.3
/ 23.0
| 209 | intergenic (+173/+264) | flxA/intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/7); new base T (101/95); total (107/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAG > CP009273/1641023‑1641310
|
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gCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTAtt > 2:1675339/1‑148 (MQ=255)
gCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTATTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTAtt < 2:1761535/148‑1 (MQ=255)
cTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGa < 2:883297/148‑1 (MQ=255)
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ttttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGaa > 1:371454/1‑148 (MQ=255)
ttttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGaa < 1:3395992/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTCTTATGAATTGCAACt > 2:1834121/1‑148 (MQ=255)
tCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTa < 2:1061816/148‑1 (MQ=255)
cAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTAt < 1:2104835/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTTAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTAttt < 2:311924/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTAttt < 2:1611271/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTAttt < 1:612406/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTAttt < 2:2510166/148‑1 (MQ=255)
ccTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTc > 2:2462034/1‑148 (MQ=255)
cTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCt < 2:297091/148‑1 (MQ=255)
cTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAAAATTACAAGATATAAGTAATGTACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCt > 2:1373629/1‑148 (MQ=255)
tttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 2:1550835/1‑148 (MQ=255)
ttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTa < 2:2424721/148‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGt > 2:1974897/1‑148 (MQ=255)
cTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGt < 2:2084879/148‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGt > 1:2187170/1‑148 (MQ=255)
tttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc < 2:1460970/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCa > 2:2614084/1‑148 (MQ=255)
tAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCAc < 1:1577389/148‑1 (MQ=255)
tAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCAc < 1:1578006/148‑1 (MQ=255)
aaGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACtt < 1:2261649/148‑1 (MQ=255)
aaGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACtt < 2:3314741/148‑1 (MQ=255)
aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACttt > 2:3190034/1‑148 (MQ=255)
aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACttt > 1:332963/1‑148 (MQ=255)
aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACttt < 2:342163/148‑1 (MQ=255)
gACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACtttt > 2:1231133/1‑148 (MQ=255)
aCATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTtg > 1:681568/1‑148 (MQ=255)
cATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTtgt > 2:1138056/1‑148 (MQ=255)
cATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTtgt < 1:2223312/148‑1 (MQ=255)
atatTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATAATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTtgtg > 2:77500/1‑148 (MQ=255)
cTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAg > 1:1757025/1‑148 (MQ=255)
cTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAg < 1:2618376/148‑1 (MQ=255)
ttttTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGt < 2:2880760/148‑1 (MQ=255)
tttGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTTAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGt < 1:853096/148‑1 (MQ=255)
ttGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTc > 2:579433/1‑148 (MQ=255)
ttGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTc > 2:2104894/1‑148 (MQ=255)
gTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCca > 1:3495532/1‑148 (MQ=255)
tATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCcac > 1:414022/1‑148 (MQ=255)
aTCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCcaca > 2:1600362/1‑148 (MQ=255)
tttCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAAc > 2:1866960/1‑148 (MQ=255)
tttCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAAc > 2:190177/1‑148 (MQ=255)
ttCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACt > 1:2204807/1‑148 (MQ=255)
tGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGcc > 1:2853142/1‑148 (MQ=255)
gATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCa < 2:2183570/148‑1 (MQ=255)
aTAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCaa < 2:3166760/148‑1 (MQ=255)
aTAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCaa < 1:2803033/148‑1 (MQ=255)
ttAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTc < 2:2537380/148‑1 (MQ=255)
ttAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTc > 1:1181418/1‑148 (MQ=255)
ttAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCAGGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTc < 2:2153062/148‑1 (MQ=255)
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tACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGcttct > 1:1433588/1‑148 (MQ=255)
tACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGcttct < 1:2315705/148‑1 (MQ=255)
cAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTg < 2:3327716/148‑1 (MQ=255)
atatAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGctct < 1:3169588/148‑1 (MQ=255)
tataAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCtt < 2:2214024/148‑1 (MQ=255)
gTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCgg > 2:789852/1‑148 (MQ=255)
aTGGACGCACGCCCAATGAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACa < 2:655965/148‑1 (MQ=255)
tGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACAt < 2:2525621/148‑1 (MQ=255)
ggACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACAtt < 1:2840290/148‑1 (MQ=255)
cGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGc > 1:1716115/1‑148 (MQ=255)
cACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCAt < 1:1675339/148‑1 (MQ=255)
cACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCAt < 2:520655/148‑1 (MQ=255)
aCTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATa < 2:3433740/148‑1 (MQ=255)
cTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAg > 1:2300801/1‑148 (MQ=255)
cTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAg < 1:2677440/148‑1 (MQ=255)
cccAATTAGTCTATTTAAATCGCCACAAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGc > 2:1069952/1‑148 (MQ=255)
cccAATTAGTCTATTTAAATCGCCACAAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGc > 2:3073554/1‑148 (MQ=255)
cccAATTAGTCTATTTAAATCGCCAAGAGTTTAACTGACAACCCATGATCGATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGATTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGc > 2:3143647/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTAttt > 1:1392731/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTAttt > 1:2546025/1‑148 (MQ=255)
ttAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTAttt > 1:2088079/1‑148 (MQ=255)
tAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTa < 2:2777674/148‑1 (MQ=255)
cTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCAt > 1:2606673/1‑148 (MQ=255)
tATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATa < 1:1066497/148‑1 (MQ=255)
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CACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAG > SRR19973065.2315278/1‑150 (MQ=60)
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TTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCTATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGC > SRR19973065.419855/1‑150 (MQ=60)
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TATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTT < SRR19973065.2630285/150‑1 (MQ=60)
AATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTT > SRR19973065.2574333/1‑150 (MQ=60)
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GGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTTTTGTGGGGACAGTCCACAAAACTGCCAACTTCCGCTTCTTGCTCTTAGCGGACATTAGCATAGGCTATTTACCATAACGCCTCATTACGCGCACCGCCCAGACTGACTCAGCGCGTT > CP009273/1641021‑1641316
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
