Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,122,266 |
G→T |
100% |
S35* (TCG→TAG) |
wcaF ← |
putative acyl transferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,122,266 | 0 | G | T | 99.0%
| 706.5
/ ‑1.8
| 217 | S35* (TCG→TAG) | wcaF | putative acyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (116/98); total (118/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCGACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTT > CP009273/2122123‑2122407
|
cATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCa < 1:1831746/148‑1 (MQ=255)
cATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCa > 2:1428007/1‑148 (MQ=255)
aTCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAg > 1:3584637/1‑148 (MQ=255)
cccACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAatat < 2:1143104/148‑1 (MQ=255)
ccACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAtt > 2:1374566/1‑148 (MQ=255)
cACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttg < 1:1195727/148‑1 (MQ=255)
cACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttg < 1:3101544/148‑1 (MQ=255)
cACGCGTAATCACATAAGGTTAATTTCCACGGATATGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttg < 1:659472/148‑1 (MQ=255)
cgcgTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttgtt < 1:3449557/148‑1 (MQ=255)
cgcgTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttgtt > 2:2609867/1‑148 (MQ=255)
gcgTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATAttgttg < 2:1928011/148‑1 (MQ=255)
cgTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGc > 2:1306565/1‑148 (MQ=255)
aaTCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTg > 2:2292904/1‑148 (MQ=255)
tCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTa > 2:3460437/1‑148 (MQ=255)
tCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTa > 2:2862646/1‑148 (MQ=255)
ccTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTg < 1:2995476/148‑1 (MQ=255)
cTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGc > 2:236782/1‑148 (MQ=255)
aatgTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAAAGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGTCTACCCGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGacc > 1:1650100/4‑148 (MQ=255)
aGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCcca < 1:1039682/148‑1 (MQ=255)
tAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCAt > 1:952065/1‑148 (MQ=255)
aaTTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATa > 2:3775018/1‑148 (MQ=255)
aaTTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATa > 2:3775138/1‑148 (MQ=255)
aTTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATaa > 2:1241895/1‑148 (MQ=255)
tttCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAAt < 1:1322731/148‑1 (MQ=255)
ttCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAAtt > 2:2332773/1‑148 (MQ=255)
tCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTg < 1:1509118/148‑1 (MQ=255)
tCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTg < 2:672279/148‑1 (MQ=255)
tCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTg < 1:2309348/148‑1 (MQ=255)
ggATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACtt < 1:898353/148‑1 (MQ=255)
gATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACttt > 2:1432989/1‑148 (MQ=255)
aTAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTa > 2:185794/1‑148 (MQ=255)
aTAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTa < 1:3270501/148‑1 (MQ=255)
aGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAAt < 2:21712/148‑1 (MQ=255)
aGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAAt > 2:3107107/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTTTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAg > 1:122305/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAg > 1:529174/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAg > 1:1426798/1‑148 (MQ=255)
gTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAg < 2:3611364/148‑1 (MQ=255)
tAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGc > 2:493879/1‑148 (MQ=255)
tAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGc > 2:703498/1‑148 (MQ=255)
aaTTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCg > 1:3729964/1‑148 (MQ=255)
ttttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTg > 2:2555132/1‑148 (MQ=255)
ttttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTg > 1:2527512/1‑148 (MQ=255)
tACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTgccg > 2:2924617/1‑148 (MQ=255)
acggacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCg > 2:472116/1‑148 (MQ=255)
gacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGaa > 1:3792012/1‑148 (MQ=255)
gacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGaa > 2:3045984/1‑148 (MQ=255)
acgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAAc > 2:2736347/1‑148 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt < 2:1404822/148‑1 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt < 2:3308314/148‑1 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt > 1:3403302/1‑148 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGAGTTGCCGCCCCGGAACCCtt < 1:1306565/148‑1 (MQ=255)
tACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCTAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGc < 2:1008292/148‑1 (MQ=255)
aCGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCa < 1:2590061/148‑1 (MQ=255)
ttttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCATGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCg < 2:2873173/148‑1 (MQ=255)
ttttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCg > 1:2447697/1‑148 (MQ=255)
tttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCga > 2:1408483/1‑148 (MQ=255)
tttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCga > 2:2033932/1‑148 (MQ=255)
tCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGaaa < 2:829049/148‑1 (MQ=255)
ccTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAAc < 2:948985/148‑1 (MQ=255)
tATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCg > 1:3642766/1‑148 (MQ=255)
tATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCg > 1:2141680/1‑148 (MQ=255)
tATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCg > 2:2494885/1‑148 (MQ=255)
ttttGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCtt > 1:2846655/1‑148 (MQ=255)
ttttGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCtt > 1:593968/1‑148 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATc < 1:3770857/148‑1 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATc < 1:718696/148‑1 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATc < 1:2263945/148‑1 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATc > 2:775234/1‑148 (MQ=255)
ccGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCtt > 2:586066/1‑148 (MQ=255)
cGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTg > 1:3207865/1‑148 (MQ=255)
gAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGc < 2:1719832/148‑1 (MQ=255)
gAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGc < 1:1673949/148‑1 (MQ=255)
aCGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGt > 1:221660/1‑148 (MQ=255)
aCGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGt < 1:703218/148‑1 (MQ=255)
taataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGtttt > 1:1072956/1‑148 (MQ=255)
taataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGtttt > 1:2888612/1‑148 (MQ=255)
aataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTc < 2:2953201/148‑1 (MQ=255)
aataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTc < 2:2447697/148‑1 (MQ=255)
ataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTcc > 2:3327880/1‑148 (MQ=255)
taaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCt > 1:1250005/1‑148 (MQ=255)
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aaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTatat < 1:1329765/148‑1 (MQ=255)
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TCATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCGACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCT > CP009273/2122122‑2122413
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |