Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,122,266 |
G→T |
100% |
S35* (TCG→TAG) |
wcaF ← |
putative acyl transferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,122,266 | 0 | G | T | 99.0%
| 1054.2
/ 0.3
| 328 | S35* (TCG→TAG) | wcaF | putative acyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/4); new base T (178/145); total (179/149) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
ACGTCATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCGACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTC > CP009273/2122119‑2122412
|
gTCATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCa > 1:1102979/1‑150 (MQ=255)
gTCATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCa > 1:5047771/1‑150 (MQ=255)
tCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑a < 2:2966147/150‑1 (MQ=255)
gCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑aaa < 1:2586802/150‑1 (MQ=255)
ccGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAat > 2:47204/1‑150 (MQ=255)
cGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAata < 2:1915292/150‑1 (MQ=255)
cccACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATAttg > 2:4577553/1‑150 (MQ=255)
cccACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATAttg > 2:3006024/1‑150 (MQ=255)
cACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATAttgtt > 1:3163506/1‑150 (MQ=255)
tAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGt < 1:5095827/150‑1 (MQ=255)
aTCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATAttgtt < 2:2720100/142‑1 (MQ=255)
cACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGACAAAATATTGTTGCCTGTACt < 2:2864754/150‑1 (MQ=255)
cTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGccc < 2:1375096/150‑1 (MQ=255)
aaGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCccac > 1:3278771/1‑150 (MQ=255)
aaGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCccac > 1:4505313/1‑150 (MQ=255)
gTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCGACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCAACCAt > 2:4479698/1‑150 (MQ=255)
ttAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAACAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATa < 2:4887052/150‑1 (MQ=255)
aaTTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAAt > 1:2662973/1‑150 (MQ=255)
tCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCa < 1:4758821/150‑1 (MQ=255)
aGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAg < 1:4968113/150‑1 (MQ=255)
ggTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTTCGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGc < 2:349629/150‑1 (MQ=255)
aaTTTTTACTGACTGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTTCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGtt < 2:5215237/150‑1 (MQ=255)
ttttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTgcc < 1:2313062/150‑1 (MQ=255)
tttACTGACGGACGACTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTgccg < 2:667906/150‑1 (MQ=255)
tttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTgccg > 2:2274497/1‑150 (MQ=255)
ttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTgccgc > 1:2321999/1‑150 (MQ=255)
ttACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGAGTTgccgc > 1:4092631/1‑150 (MQ=255)
cTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGcccc < 2:5315300/150‑1 (MQ=255)
tGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCg > 2:2630830/1‑150 (MQ=255)
tGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCg < 1:2042889/150‑1 (MQ=255)
tGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCg > 1:4614971/1‑150 (MQ=255)
gacggacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCgg > 2:2196775/1‑150 (MQ=255)
cggacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATCATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGaa > 2:1635677/1‑150 (MQ=255)
ggacgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAAc > 2:1090403/1‑150 (MQ=255)
acgAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAAccc < 2:2146708/150‑1 (MQ=255)
gAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt > 1:3729793/1‑150 (MQ=255)
gAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt > 1:2903970/1‑150 (MQ=255)
gAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCta > 2:1475070/1‑149 (MQ=255)
gAATAACTACGTTATTTCCTATTTATGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCCTAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCtt > 2:4787940/1‑150 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTc > 1:4484919/1‑150 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTc < 2:3199789/150‑1 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTc < 2:3790596/150‑1 (MQ=255)
aTAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTc < 1:3443095/150‑1 (MQ=255)
tAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGTGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCg > 2:399313/1‑150 (MQ=255)
tAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAAGTGCACGTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGACCCCTTTCg > 1:2721169/1‑150 (MQ=255)
aaCTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCgg > 1:418425/1‑150 (MQ=255)
cTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCa > 2:4091679/1‑150 (MQ=255)
tACGTCTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCAc < 1:3042228/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCg > 1:5187923/1‑150 (MQ=255)
cGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCAAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTGTAATAGCGTTGCCTCCCCGGAACCCTTTCGGCACCg > 1:1242840/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCga < 1:2244991/150‑1 (MQ=255)
ttttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCgag < 2:3881560/150‑1 (MQ=255)
ttttCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGaa < 2:4069731/150‑1 (MQ=255)
ttCCTATTTTTGCTCCGAATACACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAAc < 2:709843/150‑1 (MQ=255)
tCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAAcc < 1:5199272/150‑1 (MQ=255)
ccTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCg < 1:1568376/150‑1 (MQ=255)
cTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGAAACAAAACTTTTTGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCAGTACTGCCCACCAAAATTGCACATTAATATCGTTTCCGCCCCGGAACCCAATCGGCACCGAGAAACCGc > 1:1840676/1‑150 (MQ=255)
tATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCt < 1:4836383/150‑1 (MQ=255)
tttttGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTa > 1:2192056/1‑150 (MQ=255)
ttttGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTaa > 2:4957329/1‑150 (MQ=255)
ttGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAAt < 2:3139815/150‑1 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCtt < 2:5253063/150‑1 (MQ=255)
cTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCtt < 2:1833577/150‑1 (MQ=255)
tCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTg > 1:848417/1‑150 (MQ=255)
ccGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGc < 2:2535265/150‑1 (MQ=255)
gAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCAt < 1:1990168/150‑1 (MQ=255)
aaTAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCAtt < 2:4558484/150‑1 (MQ=255)
aaTAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCAtt > 1:600297/1‑150 (MQ=255)
aaTAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCAtt > 1:4871605/1‑150 (MQ=255)
aTAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTg > 1:1365326/1‑150 (MQ=255)
cGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGtttt < 1:1929432/150‑1 (MQ=255)
gTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCAGTGGTTTTc > 2:2314335/1‑150 (MQ=255)
taataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTcc > 1:1015402/1‑150 (MQ=255)
ataaAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCtt > 2:3380807/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTtat > 2:1060371/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTtat > 2:1027756/1‑150 (MQ=255)
aaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTc > 2:1987561/1‑150 (MQ=255)
aaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTc > 2:2665525/1‑150 (MQ=255)
aaGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTc > 1:712142/1‑150 (MQ=255)
aGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCTACCAGGC‑AAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCa < 1:1426646/150‑1 (MQ=255)
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ATACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATA > SRR19973062.356669/1‑150 (MQ=60)
ACAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATA > SRR19973062.4439713/1‑150 (MQ=60)
AAAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGACGCCCCTGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCTATTAAATCTTGCATTTGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATA < SRR19973062.704163/150‑1 (MQ=60)
CAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAA > SRR19973062.4879598/1‑150 (MQ=60)
CAATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAA > SRR19973062.2539633/1‑150 (MQ=60)
AATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAG > SRR19973062.153276/1‑150 (MQ=60)
ATACTTGTGGCTACCATGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCATTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGG < SRR19973062.3115021/150‑1 (MQ=60)
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ATACTTGTGGCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTAAATTCAGACTTTGTTATATAAGG > SRR19973062.197655/1‑150 (MQ=60)
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GCTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCT < SRR19973062.1756830/150‑1 (MQ=60)
CTACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTT < SRR19973062.3690433/150‑1 (MQ=60)
TACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTT < SRR19973062.4949969/150‑1 (MQ=60)
TACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTT < SRR19973062.3835807/150‑1 (MQ=60)
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GACGTCATCGCCGACCCACGCGTAATCACCTAAGGTTAATTTCCACGGATAGGTAATTTTTACTGACGGACGAATAACTACGTTTTTTCCTATTTTTGCTCCGAATAAACGTAATAAAAAAGCCCGCCAGCGATACAATACTTGTGGCGACCAGGCAAATATTGTTGCCTGTACTGCCCACCATAATTGCACTTTAATAGCGTTGCCGCCCCGGAACCCTTTCGGCACCGAGAAACCGCTTAAATCTTGCATTGGTTTTCCTTATATTCAGACTTTGTTATATAAGGCTTTCGTCTTT > CP009273/2122118‑2122415
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |