Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,643,336 |
C→A |
100% |
D771Y (GAC→TAC) |
yfhM ← |
bacterial alpha2‑macroglobulin colonization factor ECAM; anti‑host protease defense factor; periplasmic inner membrane‑anchored lipoprotein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,643,336 | 0 | C | A | 95.7%
| 556.3
/ 13.8
| 185 | D771Y (GAC→TAC) | yfhM | bacterial alpha2‑macroglobulin colonization factor ECAM; anti‑host protease defense factor; periplasmic inner membrane‑anchored lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/5); new base A (99/78); total (102/83) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCA > CP009273/2643191‑2643479
|
ttCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGc < 1:529365/148‑1 (MQ=255)
tCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGcc > 2:3231698/1‑148 (MQ=255)
aGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAgg < 1:3003237/148‑1 (MQ=255)
ttttATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCg > 2:2357850/1‑148 (MQ=255)
ttttATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCg < 1:821064/148‑1 (MQ=255)
tttATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGa > 1:1755113/1‑148 (MQ=255)
tttATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTAGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGa > 1:2783803/1‑148 (MQ=255)
tATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATa < 1:3030969/148‑1 (MQ=255)
aTCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATaa < 1:3808286/148‑1 (MQ=255)
cGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACt > 2:2693161/1‑148 (MQ=255)
ccGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGc < 2:2734648/148‑1 (MQ=255)
ccGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGc < 1:1382229/148‑1 (MQ=255)
cGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCt < 1:3209754/148‑1 (MQ=255)
aaTCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTa < 1:2970969/148‑1 (MQ=255)
aaTCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTa > 1:611482/1‑148 (MQ=255)
aaTCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTa < 1:1111377/148‑1 (MQ=255)
cGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATcc > 1:1013021/1‑148 (MQ=255)
cGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATcc > 1:1095512/1‑148 (MQ=255)
cGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATcc > 1:1319266/1‑148 (MQ=255)
cAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGt > 1:1195453/1‑148 (MQ=255)
cAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGt > 1:3101594/1‑148 (MQ=255)
gATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAAAGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGttt > 1:2295819/1‑148 (MQ=255)
ccAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAg < 2:349912/148‑1 (MQ=255)
gCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGt > 1:3621466/1‑148 (MQ=255)
ccTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGa > 2:2627624/1‑148 (MQ=255)
ttGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGaca > 2:2601184/1‑148 (MQ=255)
ttGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGaca > 2:364559/1‑148 (MQ=255)
gCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACggt < 1:1720362/148‑1 (MQ=255)
cGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACggtcgg > 2:1658775/1‑148 (MQ=255)
gAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACggtcggg < 2:1987622/148‑1 (MQ=255)
aaCATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACggtcgggt > 1:160450/1‑148 (MQ=255)
cATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACggtcgggtcg > 1:733683/1‑148 (MQ=255)
tCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCa > 1:1903474/1‑148 (MQ=255)
cAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCAc > 1:1504961/1‑148 (MQ=255)
cAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCAc > 1:264450/1‑148 (MQ=255)
aaTCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACt < 1:460574/148‑1 (MQ=255)
aTCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTg > 1:760055/1‑148 (MQ=255)
aTCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTg > 2:2386831/1‑148 (MQ=255)
aTCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTg < 1:2413101/148‑1 (MQ=255)
tctcTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTgc > 2:3451667/1‑148 (MQ=255)
ctctTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTgcg > 1:558181/1‑148 (MQ=255)
tGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGcgccgc > 1:351711/1‑148 (MQ=255)
tGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGcgccgc < 1:475079/148‑1 (MQ=255)
caGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCg > 2:2941192/1‑148 (MQ=255)
caGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCg < 2:2937261/148‑1 (MQ=255)
caGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCg < 2:2936913/148‑1 (MQ=255)
caGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCg > 1:2257670/1‑148 (MQ=255)
caGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCg < 2:160450/148‑1 (MQ=255)
gCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCtgtt > 1:3136225/1‑148 (MQ=255)
cccTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACgg > 1:1216679/1‑115 (MQ=255)
cccTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACgg < 2:1216679/115‑1 (MQ=255)
cccTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCtgttg > 1:2934952/1‑148 (MQ=255)
cTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTc < 2:1504961/148‑1 (MQ=255)
cTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGcc > 2:3654765/1‑148 (MQ=255)
cTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGcc > 2:3544991/1‑148 (MQ=255)
gACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGc < 2:797928/148‑1 (MQ=255)
gACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGc < 2:800093/148‑1 (MQ=255)
aCTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCt < 2:1444037/148‑1 (MQ=255)
cATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATagcca > 2:3562315/1‑148 (MQ=255)
tCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATagccagc < 2:1697854/148‑1 (MQ=255)
cATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCa > 2:473998/1‑148 (MQ=255)
aTAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCNGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCGGTTGTCCTGCCAGCGATATCCCGccccg > 1:1935156/1‑146 (MQ=255)
aaCCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGaa < 1:2601184/148‑1 (MQ=255)
aaCCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGaa > 2:3491543/1‑148 (MQ=255)
aaCCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGaa > 2:2828400/1‑148 (MQ=255)
ccTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAAc < 1:3692445/148‑1 (MQ=255)
cTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACg < 1:3570441/148‑1 (MQ=255)
cgccgTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACacta < 2:733683/148‑1 (MQ=255)
cgccgTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACacta < 1:1445250/148‑1 (MQ=255)
cgccgTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACacta < 2:558181/148‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCg < 2:3269269/148‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCg < 2:246445/148‑1 (MQ=255)
gcgcGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGc < 1:977991/148‑1 (MQ=255)
gcgcGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGc < 2:1925790/148‑1 (MQ=255)
cggcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTc < 2:1596454/148‑1 (MQ=255)
cggcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTc < 1:246006/148‑1 (MQ=255)
cggcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTc < 2:489799/148‑1 (MQ=255)
ggcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCa < 2:611482/148‑1 (MQ=255)
gcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCCGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAAAACTACTGACCGCTTCAt > 2:1683792/1‑148 (MQ=255)
gcgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCAt > 2:2890568/1‑148 (MQ=255)
cgATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCAtt < 1:175312/148‑1 (MQ=255)
atatGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCCGCCCAGAAACCAACACAACAGACCCCATCAATCg > 1:1711720/1‑148 (MQ=255)
atatGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCg > 1:2065276/1‑148 (MQ=255)
atatGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCg > 1:2363999/1‑148 (MQ=255)
atatGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCACCTATAGCCACCCCAGAAACCAACACAAAAGACCCCTTCaatag > 1:1419661/1‑144 (MQ=255)
atGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGgc > 1:2228539/1‑148 (MQ=255)
atGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACAACTGACCGCTTCATTCGgc > 1:3326123/1‑148 (MQ=255)
tGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTGCTGCCACCTATATCCAGCCCACAAAACAAAACAACTTACCCCATCaaaaggcg > 1:3194882/1‑141 (MQ=255)
cAACTTACTGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCt < 2:2194906/148‑1 (MQ=255)
cAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCt < 1:598358/148‑1 (MQ=255)
aaCTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCtt < 2:1254361/148‑1 (MQ=255)
aaCTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCtt < 2:180079/148‑1 (MQ=255)
cTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTg > 2:2234958/1‑148 (MQ=255)
cTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTAGGCGCTTTg > 2:1006009/1‑148 (MQ=255)
ttAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGa < 1:2142857/148‑1 (MQ=255)
tAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCCGAAACGAACACAACAGACCGCGTCATTAGGCGCTTTTAc > 1:830147/1‑148 (MQ=255)
tAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGAc < 2:285570/148‑1 (MQ=255)
tGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTc < 1:599004/148‑1 (MQ=255)
tGGTGTAACCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGAGACACGGTCGGGTCGAACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTACTTCAAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAAAACAAATGACCGCTTCATACGGCTCTTTGACTTc > 2:3498087/1‑148 (MQ=255)
gtgtAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCa > 2:2313170/1‑148 (MQ=255)
|
TTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCA > CP009273/2643191‑2643479
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACGATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCAGACGAT > CP009273/2643187‑2643485
|
ACGATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTA > SRR19973069.153603/1‑150 (MQ=60)
CGATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAG < SRR19973069.2156287/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCC < SRR19973069.2164693/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCC < SRR19973069.1781214/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCC < SRR19973069.1247834/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCC < SRR19973069.1247692/150‑1 (MQ=60)
ATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCC < SRR19973069.2164689/150‑1 (MQ=60)
TTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCA < SRR19973069.533098/150‑1 (MQ=60)
AGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGC < SRR19973069.3023163/150‑1 (MQ=60)
GTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGA > SRR19973069.1767477/1‑150 (MQ=60)
GTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTAGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGA > SRR19973069.2802331/1‑150 (MQ=60)
TTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGAT < SRR19973069.826861/150‑1 (MQ=60)
TATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAAC > SRR19973069.614428/1‑150 (MQ=60)
TATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAAC < SRR19973069.3051070/150‑1 (MQ=60)
ATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACT < SRR19973069.3832941/150‑1 (MQ=60)
CGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGG > SRR19973069.493329/1‑150 (MQ=60)
CGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGG > SRR19973069.1607228/1‑150 (MQ=60)
ACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCT < SRR19973069.59152/150‑1 (MQ=60)
CCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTT < SRR19973069.1391876/150‑1 (MQ=60)
CCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTT < SRR19973069.1391083/150‑1 (MQ=60)
CCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTT < SRR19973069.3254223/150‑1 (MQ=60)
CGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTT < SRR19973069.3230674/150‑1 (MQ=60)
GGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTA < SRR19973069.1480118/150‑1 (MQ=60)
GGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTA > SRR19973069.2343817/1‑150 (MQ=60)
GGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTA > SRR19973069.615569/1‑150 (MQ=60)
GAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTAT < SRR19973069.1208599/150‑1 (MQ=60)
AATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATC > SRR19973069.1454110/1‑150 (MQ=60)
AATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATC < SRR19973069.1119132/150‑1 (MQ=60)
AATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATC < SRR19973069.2990692/150‑1 (MQ=60)
ATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCC > SRR19973069.1103164/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCC > SRR19973069.1105135/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCC > SRR19973069.1020008/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCC > SRR19973069.1328320/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCGTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCC > SRR19973069.42766/1‑150 (MQ=60)
TCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCA < SRR19973069.2612412/150‑1 (MQ=60)
TCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCA < SRR19973069.972050/150‑1 (MQ=60)
GTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGT > SRR19973069.1203680/1‑150 (MQ=60)
GTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGT > SRR19973069.1203677/1‑150 (MQ=60)
GTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGT > SRR19973069.3122018/1‑150 (MQ=60)
CAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTT > SRR19973069.679378/1‑150 (MQ=60)
CAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAAAGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTT > SRR19973069.2311415/1‑150 (MQ=60)
AGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTC > SRR19973069.2883454/1‑150 (MQ=60)
CAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGT > SRR19973069.3645132/1‑150 (MQ=60)
AGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTG < SRR19973069.3514578/150‑1 (MQ=60)
CCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCACCTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTAAGCGTGACA > SRR19973069.2185798/1‑150 (MQ=60)
GCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCG < SRR19973069.1732420/150‑1 (MQ=60)
GCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCG > SRR19973069.1757578/1‑150 (MQ=60)
CGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGT > SRR19973069.161851/1‑150 (MQ=60)
AACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCG > SRR19973069.738882/1‑150 (MQ=60)
AACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCG > SRR19973069.81711/1‑150 (MQ=60)
CATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCA > SRR19973069.1916627/1‑150 (MQ=60)
ATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCAC > SRR19973069.1515388/1‑150 (MQ=60)
ATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCAC > SRR19973069.266345/1‑150 (MQ=60)
CAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTG > SRR19973069.181582/1‑150 (MQ=60)
CAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTG > SRR19973069.3633675/1‑150 (MQ=60)
CAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTG > SRR19973069.765426/1‑150 (MQ=60)
CAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTG > SRR19973069.1262838/1‑150 (MQ=60)
CAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTG > SRR19973069.748125/1‑150 (MQ=60)
AATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGC < SRR19973069.463951/150‑1 (MQ=60)
AATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGC < SRR19973069.464420/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCG < SRR19973069.2429417/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCG < SRR19973069.2429202/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTGTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCG > SRR19973069.562069/1‑150 (MQ=60)
CTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCC < SRR19973069.3221082/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGC > SRR19973069.2463540/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGC > SRR19973069.354221/1‑150 (MQ=60)
TGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTA < SRR19973069.478532/150‑1 (MQ=60)
CACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCG > SRR19973069.2272928/1‑150 (MQ=60)
CGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTT > SRR19973069.3156093/1‑150 (MQ=60)
CGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTT > SRR19973069.3156777/1‑150 (MQ=60)
GGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCagatcggaagagcacacgtctgaactccagt > SRR19973069.1225013/1‑119 (MQ=60)
GGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTG > SRR19973069.2954411/1‑150 (MQ=60)
ACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCA < SRR19973069.2146800/150‑1 (MQ=60)
ACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCGAT > SRR19973069.559213/1‑150 (MQ=60)
GCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCNGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCGGTTGTCCTGCCcgcaatatcccccccac > SRR19973069.1947206/1‑133 (MQ=60)
GCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCNGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCGGTTGTCCTGCCAGCgatatcccgccccg > SRR19973069.1948449/1‑136 (MQ=60)
AACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAAC < SRR19973069.367195/150‑1 (MQ=60)
AACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAAC < SRR19973069.2618550/150‑1 (MQ=60)
CCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGA < SRR19973069.3716590/150‑1 (MQ=60)
CTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAA < SRR19973069.3593678/150‑1 (MQ=60)
CTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAA < SRR19973069.3593696/150‑1 (MQ=60)
CTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAA > SRR19973069.304827/1‑150 (MQ=60)
CTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAA < SRR19973069.1687574/150‑1 (MQ=60)
CTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAAAGAA > SRR19973069.2069265/1‑150 (MQ=60)
CGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACT < SRR19973069.1455331/150‑1 (MQ=60)
GCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTT < SRR19973069.984578/150‑1 (MQ=60)
GCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTT < SRR19973069.3064464/150‑1 (MQ=60)
CGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTC < SRR19973069.1729461/150‑1 (MQ=60)
CGGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCAT < SRR19973069.247831/150‑1 (MQ=60)
GGCGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCGATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATT > SRR19973069.827876/1‑150 (MQ=60)
CGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCCGCCCAGAAACCAACACaacagaccccatcaatcg > SRR19973069.1723714/1‑132 (MQ=60)
CGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCG > SRR19973069.2079596/1‑150 (MQ=60)
CGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCG < SRR19973069.176795/150‑1 (MQ=60)
CGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCG > SRR19973069.2380056/1‑150 (MQ=60)
CGATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCACCTATAGCCACCCCAGAAACCAACACaaaagaccccttcaatag > SRR19973069.1429575/1‑132 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCCGCTATAGCCAGCCCAGAAACCAACACAACTGACCGCTTCATTCGGC > SRR19973069.2967883/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGC > SRR19973069.301834/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTAGGC > SRR19973069.2243598/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCGTCATTCGGC > SRR19973069.2243985/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACAACTGACCGCTTCATTCGGC > SRR19973069.3347921/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACAACAGACCGCTTCAATAGGC > SRR19973069.3627858/1‑150 (MQ=60)
ATATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCGGTTGTGCTGCCCGCAATAGCCAccccccaaacgaaaacaacagaccccgtacataggc > SRR19973069.1370107/1‑114 (MQ=60)
TATGCAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTGCTGCCACCTATATCCAGCCCAcaaaacaaaacaacttaccccatcaaaaggcg > SRR19973069.3215627/1‑118 (MQ=60)
CAACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTT < SRR19973069.602397/150‑1 (MQ=60)
ACTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTGCTGCCCGCTAAAGCCAGCCCACAAACCAACACaacagaccgcatcaaaaggcgccttta > SRR19973069.1830814/1‑123 (MQ=60)
CTTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCCGAAACGAACACAACAGACCGCGTCATTAGGCGCTTTTAC > SRR19973069.835986/1‑150 (MQ=60)
TTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACT < SRR19973069.2157570/150‑1 (MQ=60)
TTAATGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACT < SRR19973069.2645209/150‑1 (MQ=60)
TGGTGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCA < SRR19973069.603045/150‑1 (MQ=60)
TGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTGCGACCCGCGATAGCCCGCCCCGAAACGAACACAACAGACCGCTTCATTCGGGGCGTTGTCGTCCAGAC > SRR19973069.1435475/1‑150 (MQ=60)
TGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTACCAGCTATAGCCCGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCGTTGACTTCCAGAC > SRR19973069.3349059/1‑150 (MQ=60)
TGTAGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTACCAGCTATAGCCCGCCCACAAACGAACACTACTGACCGCGTCATTAGGCGCTTTGTCTTCCAGAC > SRR19973069.3349064/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCGTTGACTTCCAGACGAT > SRR19973069.556154/1‑150 (MQ=60)
|
ACGATTCCAGGTTTTATCGACCGGAATCGTCAGATCCAGCCCTTGAGCCCGAACATCAATCTCTTGCCACCACAGCGGCCCTTCACTGGACTCGACCATCGCATAACCTTTACCCGCCGTTGGCGCGGCGATATGCAACTTAATGGTGTCGCCAGGGCGATAACTGGCTTTATCCAGTTTCAGCGTGACACGGTCGGGTCGCACTGCGCCGCTACCGTCGCTGTTGTCCTGCCAGCTATAGCCAGCCCAGAAACGAACACTACTGACCGCTTCATTCGGCGCTTTGACTTCCAGACGAT > CP009273/2643187‑2643485
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |