Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,288,086 |
G→T |
100% |
F366L (TTC→TTA) |
fdhF ← |
formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,288,086 | 0 | G | T | 100.0%
| 512.4
/ NA
| 153 | F366L (TTC→TTA) | fdhF | formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (71/82); total (71/82) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTC > CP009273/4287941‑4288230
|
cTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTaa > 1:3184884/1‑148 (MQ=255)
ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 1:2332609/148‑1 (MQ=255)
ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 1:3478508/148‑1 (MQ=255)
cAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTcg > 1:1818854/1‑148 (MQ=255)
cAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTcg > 1:1397836/1‑148 (MQ=255)
gCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTcgcg < 1:2149305/148‑1 (MQ=255)
gCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTcgcg < 1:2145197/148‑1 (MQ=255)
cTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCgg < 1:235915/148‑1 (MQ=255)
tCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCg < 2:2341945/148‑1 (MQ=255)
cAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCgg > 2:3465676/1‑148 (MQ=255)
cAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCgg > 2:907678/1‑148 (MQ=255)
cAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGACAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCgg > 2:3820067/1‑148 (MQ=255)
gTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGAt < 1:2822173/148‑1 (MQ=255)
gTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGAt < 2:833940/148‑1 (MQ=255)
gTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGAt > 2:1193749/1‑148 (MQ=255)
gTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGAt > 2:1324750/1‑148 (MQ=255)
tttGTAGCGGATCTTCGCCCATCATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc < 2:3380130/148‑1 (MQ=255)
tttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc > 1:1381780/1‑148 (MQ=255)
gTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCttt < 2:2718736/148‑1 (MQ=255)
gTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCttt < 1:1337439/148‑1 (MQ=255)
cGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGAGGTGCGGCAGATCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTGTCACg > 1:193779/1‑148 (MQ=255)
gATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTa < 2:3754966/148‑1 (MQ=255)
cccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc < 1:72052/148‑1 (MQ=255)
aTAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCg > 2:33933/1‑148 (MQ=255)
tAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCgg > 1:1684164/1‑148 (MQ=255)
tAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCgg > 1:1683615/1‑148 (MQ=255)
tAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCgg > 1:3046560/1‑148 (MQ=255)
tAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCgg > 1:3045901/1‑148 (MQ=255)
aTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGAt < 1:3536142/148‑1 (MQ=255)
tGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATa > 1:878514/1‑148 (MQ=255)
tACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACg > 2:72449/1‑148 (MQ=255)
gcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTAt < 2:2682039/148‑1 (MQ=255)
gcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTAt < 2:516127/148‑1 (MQ=255)
cacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCgg > 2:3187866/1‑148 (MQ=255)
cacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCgg < 1:61601/148‑1 (MQ=255)
cacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCgg < 1:61583/148‑1 (MQ=255)
cgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCa > 1:2721196/1‑148 (MQ=255)
gcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAg > 2:225496/1‑148 (MQ=255)
cacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgc > 1:708320/1‑148 (MQ=255)
cacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgc > 1:3332625/1‑148 (MQ=255)
acTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcg > 1:3566422/1‑148 (MQ=255)
cTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc > 1:1148308/1‑148 (MQ=255)
cTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc > 1:1049928/1‑148 (MQ=255)
cTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc > 1:1050408/1‑148 (MQ=255)
ttCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgcg > 1:3408954/1‑148 (MQ=255)
ccATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCa > 1:457292/1‑148 (MQ=255)
cATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCat < 1:2014267/148‑1 (MQ=255)
cATGCGCTGCGCGGTGCGACAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCat < 1:3820067/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCata < 2:3472687/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCata < 2:83459/148‑1 (MQ=255)
tgcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat < 2:3670908/148‑1 (MQ=255)
gcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATc > 1:1642477/1‑148 (MQ=255)
ggTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATTTCGCAGGCAcc < 1:3531274/148‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAcc < 1:2736910/148‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTTTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAccc < 2:2543162/148‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAccc < 1:2771269/148‑1 (MQ=255)
cAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACg < 2:1099773/148‑1 (MQ=255)
gCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgtt > 1:3599697/1‑148 (MQ=255)
tCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgt < 1:1418383/148‑1 (MQ=255)
cGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgtt < 2:2880296/148‑1 (MQ=255)
cGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgtt < 2:2880269/148‑1 (MQ=255)
gCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTc < 2:2999797/148‑1 (MQ=255)
gCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTc < 1:2123537/148‑1 (MQ=255)
gATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGa < 1:2319070/148‑1 (MQ=255)
gATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGa < 1:2319079/148‑1 (MQ=255)
aTGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGAc < 1:3254026/148‑1 (MQ=255)
aTAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGa < 2:2546828/148‑1 (MQ=255)
aTAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGa > 2:293169/1‑148 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 1:3187673/148‑1 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 2:1204148/148‑1 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 2:642658/148‑1 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 2:3185249/148‑1 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 2:3184884/148‑1 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCggg < 2:3642439/148‑1 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCggg < 2:1360301/148‑1 (MQ=255)
gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGt < 2:3156629/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa < 1:2071102/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa > 2:3053843/1‑148 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa > 2:3053714/1‑148 (MQ=255)
cTGGCAGGCTGTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCAGCTCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACAcc < 2:3774183/148‑1 (MQ=255)
gCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGc > 2:2596556/1‑148 (MQ=255)
cAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCa < 2:3313252/148‑1 (MQ=255)
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tttCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCgg < 2:1523205/148‑1 (MQ=255)
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GATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACC < SRR19973069.2334851/150‑1 (MQ=60)
ATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCA < SRR19973069.3275337/150‑1 (MQ=60)
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TAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACC < SRR19973069.3208378/150‑1 (MQ=60)
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ATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAAC < SRR19973069.2085453/150‑1 (MQ=60)
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TTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTT < SRR19973069.3816751/150‑1 (MQ=60)
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GCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAG < SRR19973069.2773140/150‑1 (MQ=60)
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CCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTT < SRR19973069.2184220/150‑1 (MQ=60)
AGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTAC > SRR19973069.1156623/1‑150 (MQ=60)
GCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCG > SRR19973069.1303297/1‑150 (MQ=60)
GCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCCGC > SRR19973069.2499095/1‑150 (MQ=60)
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CGTACTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCAGC > CP009273/4287937‑4288233
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |