Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,288,086 |
G→T |
100% |
F366L (TTC→TTA) |
fdhF ← |
formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,288,086 | 0 | G | T | 99.7%
| 961.9
/ ‑4.3
| 294 | F366L (TTC→TTA) | fdhF | formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (129/164); total (129/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
TACTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCA > CP009273/4287939‑4288231
|
cTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAtt < 2:4225098/150‑1 (MQ=255)
cTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAtt < 2:3661709/150‑1 (MQ=255)
ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTtct > 2:2055547/1‑150 (MQ=255)
ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTtct < 1:2216537/150‑1 (MQ=255)
cGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTtctc < 1:2917363/150‑1 (MQ=255)
cTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGtt > 1:2030726/1‑150 (MQ=255)
ccGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAg < 2:2241191/150‑1 (MQ=255)
ccGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAg < 2:2490071/150‑1 (MQ=255)
gTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCgg > 2:3132792/1‑150 (MQ=255)
tttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCtt < 1:3701085/150‑1 (MQ=255)
gTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCa < 1:2700981/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCAc > 1:1037049/1‑150 (MQ=255)
aGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACg > 2:3013505/1‑150 (MQ=255)
gCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGt < 2:3757804/150‑1 (MQ=255)
gATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACt < 1:2540252/150‑1 (MQ=255)
gATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACt < 1:2639833/150‑1 (MQ=255)
gATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACt > 1:3010751/1‑150 (MQ=255)
gATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTACACGTACt > 1:4580207/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCGCCCATAATGTACGCGGCAAGCTCTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTg < 2:2707343/150‑1 (MQ=255)
tCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTGTCACGTACTGGTAt > 2:2422269/1‑150 (MQ=255)
cGNCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc > 1:1921150/1‑150 (MQ=255)
cGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc < 1:4394318/150‑1 (MQ=255)
cGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc > 1:2522344/1‑150 (MQ=255)
gCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATcc > 2:1549618/1‑150 (MQ=255)
gCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATcc < 1:1122368/150‑1 (MQ=255)
cccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATccc > 1:4475196/1‑150 (MQ=255)
ccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCg > 1:4167923/1‑150 (MQ=255)
aaTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATa > 1:3880167/1‑150 (MQ=255)
aTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATAc > 2:1063540/1‑150 (MQ=255)
tGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACg < 1:3160234/150‑1 (MQ=255)
cgcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATc < 1:710505/150‑1 (MQ=255)
ggCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCgg < 1:1862652/150‑1 (MQ=255)
gcacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGc < 1:3695787/150‑1 (MQ=255)
cacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCAGGTATGCGCTGGCAGGATGTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTACTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATAATTATCCGGCa > 1:1746/1‑150 (MQ=255)
cgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgc < 1:967368/150‑1 (MQ=255)
gcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcg > 1:1024235/1‑150 (MQ=255)
cacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTCTCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc > 2:3417894/1‑150 (MQ=255)
cacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc < 2:4533617/150‑1 (MQ=255)
acTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgcg > 1:605899/1‑150 (MQ=255)
cTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgcgc > 2:17226/1‑150 (MQ=255)
cATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat < 1:2270421/150‑1 (MQ=255)
cATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat < 2:1638214/150‑1 (MQ=255)
cATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat > 1:478918/1‑150 (MQ=255)
gctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGTCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCAGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAg < 2:899348/150‑1 (MQ=255)
gctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAg < 2:3069694/150‑1 (MQ=255)
gcgGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAcc > 1:1626830/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAcc < 1:2825464/150‑1 (MQ=255)
cgGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAccc < 2:5184597/150‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCt < 2:2323821/150‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTTGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACTTACTGGTATCCCTGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTg < 1:4231556/150‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTg < 1:5048620/150‑1 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTg > 2:488188/1‑150 (MQ=255)
gTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTg < 1:4032686/150‑1 (MQ=255)
gCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGACGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGaa < 1:3724899/150‑1 (MQ=255)
cGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAAc < 1:783589/150‑1 (MQ=255)
cGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAAc < 1:8336/150‑1 (MQ=255)
cAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgtt < 1:4899469/150‑1 (MQ=255)
aGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttg > 2:544142/1‑150 (MQ=255)
gCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgt < 1:4288107/150‑1 (MQ=255)
cTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgtt < 1:2386584/150‑1 (MQ=255)
cGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCt < 2:3896891/150‑1 (MQ=255)
gCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTg < 1:2807697/150‑1 (MQ=255)
cTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTGTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGACCGTTGTTCTGa > 2:3291246/1‑150 (MQ=255)
tGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGAc < 1:1328535/150‑1 (MQ=255)
gCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACg > 2:1456602/1‑150 (MQ=255)
aTAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAAc > 1:3052327/1‑150 (MQ=255)
aTAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAAc > 2:2865320/1‑150 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAAcc > 1:4765580/1‑150 (MQ=255)
tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAAcc > 2:3223730/1‑150 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATCTCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCCCGAACCGGGtt > 2:2184279/1‑150 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGtt > 1:5294243/1‑150 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGtt < 1:1438330/150‑1 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGtt < 1:1533476/150‑1 (MQ=255)
ggTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGtt > 2:1138269/1‑150 (MQ=255)
gTATGCGCTGGCATGCTTTACACGACCCAGTCTTTGGCTTATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACTTACTGGTATCCCGGATAAGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa < 1:1481248/150‑1 (MQ=255)
gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa > 2:2779790/1‑150 (MQ=255)
gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa > 2:4076442/1‑150 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCTGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAac > 2:4362289/1‑150 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAac < 2:4146363/150‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAac < 2:1225169/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACAcc < 1:3548446/150‑1 (MQ=255)
ggCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCa > 1:4675642/1‑150 (MQ=255)
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CGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATC < SRR19973062.713772/150‑1 (MQ=60)
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GGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGG < SRR19973062.3704141/150‑1 (MQ=60)
GGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGG < SRR19973062.2880843/150‑1 (MQ=60)
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GCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACC < SRR19973062.4221223/150‑1 (MQ=60)
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AGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTG > SRR19973062.1931632/1‑150 (MQ=60)
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GGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCG > SRR19973062.4812235/1‑150 (MQ=60)
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TTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCT < SRR19973062.3689054/150‑1 (MQ=60)
CACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACC < SRR19973062.3550783/150‑1 (MQ=60)
CACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACC < SRR19973062.2708154/150‑1 (MQ=60)
ACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCG > SRR19973062.1797339/1‑150 (MQ=60)
ACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCG > SRR19973062.5264348/1‑150 (MQ=60)
ACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCG > SRR19973062.1143451/1‑150 (MQ=60)
GCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAG > SRR19973062.3504524/1‑150 (MQ=60)
CCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTT < SRR19973062.3367912/150‑1 (MQ=60)
AGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTAC > SRR19973062.947508/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACC < SRR19973062.3243586/150‑1 (MQ=60)
GGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACC < SRR19973062.2184538/150‑1 (MQ=60)
CTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCTCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGG > SRR19973062.2273604/1‑150 (MQ=60)
CTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGG > SRR19973062.3996437/1‑150 (MQ=60)
TTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGT < SRR19973062.2605362/150‑1 (MQ=60)
TGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCA < SRR19973062.1565470/150‑1 (MQ=60)
TGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCA < SRR19973062.1182381/150‑1 (MQ=60)
TGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCA < SRR19973062.339436/150‑1 (MQ=60)
GCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCAGC < SRR19973062.2450980/150‑1 (MQ=60)
CTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCAGCA > SRR19973062.1617225/1‑150 (MQ=60)
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GTACTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTCAGCA > CP009273/4287938‑4288234
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |