Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,279,816 |
G→T |
72.8% |
A27A (GCG→GCT) |
nrfC → |
formate‑dependent nitrite reductase, 4Fe4S subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,279,816 | 0 | G | T | 72.8%
| 398.0
/ 290.4
| 332 | A27A (GCG→GCT) | nrfC | formate‑dependent nitrite reductase, 4Fe4S subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/51); new base T (117/124); total (156/176) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.37e-01 |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
GCCACAGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAGCCGCA > CP009273/4279669‑4279965
|
gCCACAGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTaa < 2:645520/150‑1 (MQ=255)
acaGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTNGTGGCGAAAAc < 1:2765111/150‑1 (MQ=255)
acaGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAAc < 1:295143/150‑1 (MQ=255)
caGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACg < 2:3555845/150‑1 (MQ=255)
cGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTg < 2:1703663/150‑1 (MQ=255)
gATCAGCGCACCAATCCGAACTATAACCCGGCGTCTGATCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCAAGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGAGGCTAAAACGTTGa > 2:2119448/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGaa > 1:4413056/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGaa > 1:2071310/1‑150 (MQ=255)
tCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAat < 1:4542991/150‑1 (MQ=255)
aGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAatat > 2:2710640/1‑150 (MQ=255)
gcgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGACTATc > 1:1915578/1‑150 (MQ=255)
gcgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCCAAAACGTTGAATATc < 1:941551/150‑1 (MQ=255)
cgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCa > 2:1836848/1‑150 (MQ=255)
cgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCa > 1:18386/1‑150 (MQ=255)
cACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAAt < 1:2266723/150‑1 (MQ=255)
cACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAAt < 1:1350933/150‑1 (MQ=255)
cAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATggg < 1:4285908/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATgggg > 2:4558006/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATgggg > 2:1205566/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATgggg < 2:2007818/150‑1 (MQ=255)
tCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTg > 2:2085686/1‑150 (MQ=255)
ccGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGc < 2:4948766/150‑1 (MQ=255)
aaCTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCACTGGGGTGCGtt > 2:1101117/1‑150 (MQ=255)
aCTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTa > 2:35284/1‑150 (MQ=255)
aCCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCAt < 2:3210151/150‑1 (MQ=255)
cGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGt > 1:2440747/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGt < 2:2029414/150‑1 (MQ=255)
cGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCa > 1:4069101/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCAt > 2:456651/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCAt > 1:2132474/1‑150 (MQ=255)
gTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCAt > 1:630959/1‑150 (MQ=255)
tCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATg < 2:557567/150‑1 (MQ=255)
cTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGa < 1:3970063/150‑1 (MQ=255)
tGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGAc > 2:1321709/1‑150 (MQ=255)
tGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGAc > 2:1352821/1‑150 (MQ=255)
tCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAg < 1:3841159/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTc < 2:3054976/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCg > 1:431797/1‑150 (MQ=255)
gTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCg > 1:3419504/1‑150 (MQ=255)
tGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTATGGCATGGTGCATGACGAGTCGtt > 1:984816/1‑150 (MQ=255)
gCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTa > 1:4771702/1‑150 (MQ=255)
cTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTAt < 2:4141882/150‑1 (MQ=255)
cTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTAt < 2:1420961/150‑1 (MQ=255)
aGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCAt < 1:1952393/150‑1 (MQ=255)
gAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCg > 2:2383913/1‑150 (MQ=255)
gcCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGt > 2:3803776/1‑150 (MQ=255)
cATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTAc < 2:3152474/150‑1 (MQ=255)
tGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCg < 1:2615929/150‑1 (MQ=255)
gACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGc > 2:2868688/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCt < 2:1251235/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCt > 2:3477379/1‑150 (MQ=255)
cTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTg < 2:673918/150‑1 (MQ=255)
cTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTg < 1:3144151/150‑1 (MQ=255)
gTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGAATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTAt < 2:2220820/150‑1 (MQ=255)
tctcGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATg < 1:2831279/150‑1 (MQ=255)
cgtcgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGAt < 1:3776015/150‑1 (MQ=255)
cgtcgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGAt < 2:4631355/150‑1 (MQ=255)
cgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAACACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCt < 2:483918/150‑1 (MQ=255)
cgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCt > 1:1986400/1‑150 (MQ=255)
cgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGACAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCt > 2:2927118/1‑150 (MQ=255)
cgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCt < 2:4268609/150‑1 (MQ=255)
gCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCtt > 2:4317858/1‑150 (MQ=255)
ttCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCggg < 1:2399903/150‑1 (MQ=255)
aCCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTg < 2:2772042/150‑1 (MQ=255)
cggcgtcggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGaa < 2:4976163/150‑1 (MQ=255)
gtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCg > 1:1080528/1‑150 (MQ=255)
tGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTTTGCATCGGCTGTACCGCCGGGATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGTAg > 2:875515/1‑150 (MQ=255)
ggCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAgg > 2:4474799/1‑150 (MQ=255)
gCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGc < 2:2350471/150‑1 (MQ=255)
gCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGc < 1:4897363/150‑1 (MQ=255)
cAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCg < 2:1971349/150‑1 (MQ=255)
aGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGt < 2:3258194/150‑1 (MQ=255)
gCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGtc < 2:5267986/150‑1 (MQ=255)
ccGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGtct < 1:517607/150‑1 (MQ=255)
cGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGtctc > 1:4164438/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGtctc > 1:720062/1‑150 (MQ=255)
gTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTcg < 1:1497429/150‑1 (MQ=255)
aGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCgcgc > 2:4997156/1‑150 (MQ=255)
cGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATTCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTAGCGCCt > 1:35809/1‑150 (MQ=255)
cGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCt < 2:936648/150‑1 (MQ=255)
cACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGAc > 2:4101549/1‑150 (MQ=255)
cGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGat < 2:1583025/150‑1 (MQ=255)
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GTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCG > SRR19973062.433644/1‑150 (MQ=60)
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TTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGT > SRR19973062.1390025/1‑150 (MQ=60)
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TGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTATGGCATGGTGCATGACGAGTCGTT > SRR19973062.989382/1‑150 (MQ=60)
TGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTT < SRR19973062.2180648/150‑1 (MQ=60)
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TGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTT < SRR19973062.1889615/150‑1 (MQ=60)
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GCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCATCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTA < SRR19973062.1835844/150‑1 (MQ=60)
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AGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGG > SRR19973062.283660/1‑150 (MQ=60)
CAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCT < SRR19973062.577156/150‑1 (MQ=60)
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TGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCG > SRR19973062.4444624/1‑150 (MQ=60)
GTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG < SRR19973062.1606417/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG < SRR19973062.814153/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG < SRR19973062.847275/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG < SRR19973062.4055560/150‑1 (MQ=60)
GCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAGCCG > SRR19973062.5069492/1‑150 (MQ=60)
GAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAGCCGCA > SRR19973062.5315948/1‑150 (MQ=60)
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TTGCCACAGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAGCCGCA > CP009273/4279667‑4279965
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |