Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F56 I0 R1
|
543 |
285.0 |
9366284 |
95.7% |
8963533 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
542,200 |
Δ1 bp |
69.9% |
coding (65/1668 nt) |
fdrA → |
putative NAD(P)‑binding acyl‑CoA synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 542,200 | 0 | G | . | 69.9%
| 522.1
/ inf
| 269 | coding (65/1668 nt) | fdrA | putative NAD(P)‑binding acyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/39); new base . (118/70); total (160/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TTTACTCGTTGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAA > CP009273/542053‑542348
|
tttACTCGTTGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGCTCAGTTTAATGATTATTTCACGa > 1:1240102/1‑149 (MQ=255)
aCTCGTTGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACaaaac > 1:725893/1‑148 (MQ=255)
cTCGTTGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAAc < 2:3567354/149‑1 (MQ=255)
tGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGc < 1:4490875/149‑1 (MQ=255)
gTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTACAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCg > 2:4451738/1‑149 (MQ=255)
tCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGa > 1:2413116/1‑149 (MQ=255)
tCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGaa > 2:2271588/1‑149 (MQ=255)
aTACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGaa < 2:2873922/149‑1 (MQ=255)
aTACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGaa > 2:2059965/1‑149 (MQ=255)
aCCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGaaaa < 1:1476634/149‑1 (MQ=255)
gTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGt < 2:1440621/149‑1 (MQ=255)
tCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTtgat < 2:1118857/149‑1 (MQ=255)
caTTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGtt < 2:1460800/149‑1 (MQ=255)
caTTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGtt < 1:946835/149‑1 (MQ=255)
ttAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGttt > 1:1086609/1‑149 (MQ=255)
ttAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGttt > 1:1572953/1‑149 (MQ=255)
ttAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTc < 2:1939814/149‑1 (MQ=255)
ttAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTc < 2:372250/149‑1 (MQ=255)
ttAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTc < 2:4273877/149‑1 (MQ=255)
acacTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGt > 1:1414290/1‑149 (MQ=255)
tGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatg > 2:1546691/1‑149 (MQ=255)
gCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatga < 1:2963365/149‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatga < 2:4024080/149‑1 (MQ=255)
cTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatga < 1:4045316/149‑1 (MQ=255)
tCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatgat < 2:97989/149‑1 (MQ=255)
tCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatgat > 2:2512140/1‑149 (MQ=255)
tCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatgatg < 1:2806881/149‑1 (MQ=255)
tCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatgatg < 2:870951/149‑1 (MQ=255)
cGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAatgatg < 1:3897765/149‑1 (MQ=255)
tGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATggg > 2:1808047/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTAcg > 1:2326812/1‑149 (MQ=255)
aTTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTAcgc > 2:53606/1‑149 (MQ=255)
gCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTAcgccc > 1:3404492/1‑149 (MQ=255)
cATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTAcgcccgcc > 1:2051036/1‑149 (MQ=255)
aTGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGAGGTTTCCGTCATGATGGGTACGCCCGCCa > 2:4406524/1‑149 (MQ=255)
aTGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACACAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCa > 2:4406505/1‑149 (MQ=255)
gggTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAAt < 2:1392707/149‑1 (MQ=255)
gggTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAAt > 1:4546409/1‑149 (MQ=255)
ggTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATa < 1:2602247/149‑1 (MQ=255)
gTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATaa < 1:4628097/149‑1 (MQ=255)
cAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGc < 1:1764673/149‑1 (MQ=255)
gttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACcac < 2:1216008/149‑1 (MQ=255)
gttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACcaca > 1:2682098/1‑149 (MQ=255)
ttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAg > 2:3237157/1‑149 (MQ=255)
ttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAg > 1:4278688/1‑149 (MQ=255)
ttATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAg < 2:844833/149‑1 (MQ=255)
tATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAgg > 1:4193608/1‑149 (MQ=255)
aTGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGt > 1:284602/1‑149 (MQ=255)
tGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGtt > 1:4468867/1‑149 (MQ=255)
tGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGtt < 1:1940422/149‑1 (MQ=255)
gATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGttt > 2:1615795/1‑149 (MQ=255)
gATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACAACAGGttt > 2:3332160/1‑149 (MQ=255)
aTCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTc < 1:3849069/149‑1 (MQ=255)
cACGCCTTTATTAAAAAAGTGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTgg < 2:2585782/149‑1 (MQ=255)
cACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTgg > 2:954929/1‑149 (MQ=255)
cACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTgg < 2:245024/149‑1 (MQ=255)
cGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGc > 1:3957908/1‑149 (MQ=255)
ccTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATg < 1:4117671/149‑1 (MQ=255)
tttATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGa < 1:3310889/149‑1 (MQ=255)
tttATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCAGTAAAGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGAc > 1:661952/1‑149 (MQ=255)
ttattaAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGAc > 1:3595897/1‑149 (MQ=255)
attaAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGa > 1:4623650/1‑149 (MQ=255)
taAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGAtt < 1:2472056/149‑1 (MQ=255)
aaaaaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGAtttt > 2:1862635/1‑149 (MQ=255)
aaaaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTta > 1:4525838/1‑149 (MQ=255)
aaaaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTta > 1:2184866/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaa > 2:3405961/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaat > 2:1676098/1‑149 (MQ=255)
aaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaat < 2:2937815/149‑1 (MQ=255)
aaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaat < 2:598723/149‑1 (MQ=255)
aaaGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaat > 1:3551628/1‑149 (MQ=255)
aGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTtaataa > 1:3425504/1‑149 (MQ=255)
gtgtTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacg > 2:3786285/1‑149 (MQ=255)
gtTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgcc > 1:3862543/1‑149 (MQ=255)
ttttCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccac > 1:2385060/1‑149 (MQ=255)
tttCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacg > 1:586606/1‑149 (MQ=255)
tttCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacg > 1:1895630/1‑149 (MQ=255)
ttCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacgc < 1:4424916/149‑1 (MQ=255)
tCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacgcc > 1:2333470/1‑149 (MQ=255)
tCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCAC‑AAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacgcc > 2:2059040/1‑149 (MQ=255)
cAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAacgccacgcc < 1:772995/149‑1 (MQ=255)
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GAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAG > SRR19973085.2879560/1‑150 (MQ=60)
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ATTTACTCGTTGTCATCGATACCGTAATCGCCACATTAACACTGCTCGTGCAATTGCCATGGGTGCAATTTTTAAGGAGTTGTTATGATCCACGCCTTTATTAAAAAAGGGTGTTTTCAGGATTCGGTCAGTTTAATGATTATTTCACGAAAACTCAGCGAATCAGAAAATGTTGATGATGTTTCCGTAATGATGGGTACGCCCGCCAATAAAGCGTTATTAGATACCACAGGTTTCTGGCATGACGATTTTAATAACGCCACGCCGAACGATATTTGCGTGGCAATTCGTAGCGAAG > CP009273/542052‑542349
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
