Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,476,524 |
T→A |
100% |
N99Y (AAT→TAT) |
emrK ← |
EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,476,524 | 0 | T | A | 98.2%
| 726.2
/ 1.8
| 225 | N99Y (AAT→TAT) | emrK | EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/4); new base A (102/119); total (102/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTG > CP009273/2476378‑2476669
|
aCCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTAtattt < 2:1835382/149‑1 (MQ=255)
aCCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTAtattt < 2:532358/149‑1 (MQ=255)
ccccTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAg > 1:2800398/1‑149 (MQ=255)
ccccTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAg < 1:3489193/149‑1 (MQ=255)
ccccTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAg < 2:2682561/149‑1 (MQ=255)
cTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCtt > 1:3548152/1‑149 (MQ=255)
gCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTa < 2:2624309/149‑1 (MQ=255)
gCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTa > 1:3767549/1‑149 (MQ=255)
gCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTa < 1:3894235/149‑1 (MQ=255)
cTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTAt < 1:552369/149‑1 (MQ=255)
cTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTAt < 1:228455/149‑1 (MQ=255)
cTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTAt < 2:3494487/149‑1 (MQ=255)
ttCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTAtt < 1:3238612/149‑1 (MQ=255)
cTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGt > 1:1119973/1‑149 (MQ=255)
cGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGa < 2:1746500/149‑1 (MQ=255)
cGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGa < 1:2953293/149‑1 (MQ=255)
ggCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGAt < 1:3641787/149‑1 (MQ=255)
aCTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGt < 1:1405635/149‑1 (MQ=255)
cGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGc > 1:398844/1‑149 (MQ=255)
ggTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCa < 2:505332/149‑1 (MQ=255)
ggTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAAGACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCa < 2:1419665/149‑1 (MQ=255)
tataATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGtt < 1:4044231/149‑1 (MQ=255)
tataATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGtt < 1:3952574/149‑1 (MQ=255)
tataATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGtt < 1:1914836/149‑1 (MQ=255)
ataATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGttt > 2:2429659/1‑149 (MQ=255)
taATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGtttt > 2:2151862/1‑149 (MQ=255)
aaTCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTa < 1:2637091/149‑1 (MQ=255)
aaTCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTAGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTa < 2:1108587/149‑1 (MQ=255)
aaTCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTAGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTa < 2:3160594/149‑1 (MQ=255)
tcttctAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCATGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATc < 1:3532646/149‑1 (MQ=255)
tctAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAg < 2:3181400/149‑1 (MQ=255)
tAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTAGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGTACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTTCGATAGTGGGATCAGTTTTTTCCAGTg < 2:433016/149‑1 (MQ=255)
aaaGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGa > 1:1150488/1‑149 (MQ=255)
aGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGaaa > 1:3797324/1‑149 (MQ=255)
aTTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACt < 1:3720987/149‑1 (MQ=255)
aTTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTGTTATCCAGTGAAACt > 2:2548061/1‑149 (MQ=255)
ttgATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTaaaa > 1:487918/1‑149 (MQ=255)
ttgATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTaaaa < 1:154541/149‑1 (MQ=255)
tgATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAt > 1:879706/1‑149 (MQ=255)
cTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCAc < 1:3449933/149‑1 (MQ=255)
cTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCAc < 1:1030423/149‑1 (MQ=255)
cTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCAc < 1:3327938/149‑1 (MQ=255)
tGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCAcc < 2:1702327/149‑1 (MQ=255)
gAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTCTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCt < 2:1368649/149‑1 (MQ=255)
aaTACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCtt > 1:2171554/1‑149 (MQ=255)
aaTACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCtt < 2:2240920/149‑1 (MQ=255)
tACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGACGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGt < 1:31029/149‑1 (MQ=255)
cGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCg > 2:1573546/1‑149 (MQ=255)
tGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGaa < 2:3331121/149‑1 (MQ=255)
tGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGaa < 2:1346213/149‑1 (MQ=255)
gCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAAc < 1:1093297/149‑1 (MQ=255)
aGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGt < 1:986473/149‑1 (MQ=255)
gCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGtt < 1:3567628/149‑1 (MQ=255)
gCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGtt < 2:1476266/149‑1 (MQ=255)
gACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCg < 1:3758643/149‑1 (MQ=255)
aCTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGt > 1:1970354/1‑149 (MQ=255)
aCTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGt > 1:2057442/1‑149 (MQ=255)
cTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTa < 2:2467677/149‑1 (MQ=255)
cTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTa < 2:4059945/149‑1 (MQ=255)
cTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTa < 1:1881811/149‑1 (MQ=255)
ggCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTTAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCtt > 1:1474119/1‑149 (MQ=255)
ggCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTGTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCtt < 2:1782129/149‑1 (MQ=255)
gCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCttt > 2:3034646/1‑149 (MQ=255)
aCTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTAt > 2:2091930/1‑149 (MQ=255)
aCTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTAt > 1:2426005/1‑149 (MQ=255)
aCTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTAt < 2:3756686/149‑1 (MQ=255)
tGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACATTGTCGAACTTAGTTCGTATCTTTATGa > 1:1322856/1‑149 (MQ=255)
gTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGAt > 2:30157/1‑149 (MQ=255)
tGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAAc < 2:3346249/149‑1 (MQ=255)
gTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACg > 2:887481/1‑149 (MQ=255)
gTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACg > 2:885348/1‑149 (MQ=255)
gTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACg > 1:3347268/1‑149 (MQ=255)
tttATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGa < 1:3691126/149‑1 (MQ=255)
ttATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGAc < 2:461678/149‑1 (MQ=255)
ttATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGAc < 1:475852/149‑1 (MQ=255)
tATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACa < 1:1798744/149‑1 (MQ=255)
tCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGt > 2:3843114/1‑149 (MQ=255)
tCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGt > 2:3841802/1‑149 (MQ=255)
tCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGt > 2:3590721/1‑149 (MQ=255)
aaGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACt > 2:4075324/1‑149 (MQ=255)
tttATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTgaga > 2:2027777/1‑149 (MQ=255)
tttATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTgaga > 1:747178/1‑149 (MQ=255)
tATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACt > 1:1712598/1‑149 (MQ=255)
ttCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATATTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTtg < 1:3112625/149‑1 (MQ=255)
tttGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCa > 1:2547445/1‑149 (MQ=255)
tttGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCa > 2:2925015/1‑149 (MQ=255)
tGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGa > 2:358516/1‑149 (MQ=255)
tGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGa > 2:1957613/1‑149 (MQ=255)
cGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAAt > 1:1680497/1‑149 (MQ=255)
gAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAAtt > 1:1761555/1‑149 (MQ=255)
aaCAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTg > 2:3410763/1‑149 (MQ=255)
aCAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTgg < 1:683290/149‑1 (MQ=255)
aCAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTgg > 2:1195128/1‑149 (MQ=255)
aaTATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGAt < 2:3198944/149‑1 (MQ=255)
tgtGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTCTCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGc < 1:2364656/147‑1 (MQ=255)
tGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCAt < 1:2377466/149‑1 (MQ=255)
gATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTcccc < 1:1527337/149‑1 (MQ=255)
gATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTcacc > 2:2407573/1‑149 (MQ=255)
attataTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCg > 2:83516/1‑149 (MQ=255)
tataTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTg > 1:3493572/1‑149 (MQ=255)
|
AACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTG > CP009273/2476378‑2476669
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACAT > CP009273/2476376‑2476673
|
ATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATAT > SRR19973068.1485973/1‑150 (MQ=60)
ATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATAT > SRR19973068.2526779/1‑150 (MQ=60)
TAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATT < SRR19973068.801076/150‑1 (MQ=60)
TAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATT < SRR19973068.801062/150‑1 (MQ=60)
AACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTT < SRR19973068.1378158/150‑1 (MQ=60)
CCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAG > SRR19973068.2817788/1‑150 (MQ=60)
CCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGC < SRR19973068.2842910/150‑1 (MQ=60)
CCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGC < SRR19973068.3511022/150‑1 (MQ=60)
CCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGC < SRR19973068.3510391/150‑1 (MQ=60)
CCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCT < SRR19973068.3714387/150‑1 (MQ=60)
CCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCT < SRR19973068.1656696/150‑1 (MQ=60)
CCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTT > SRR19973068.3569717/1‑150 (MQ=60)
CCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTT > SRR19973068.3568893/1‑150 (MQ=60)
TGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTA > SRR19973068.3790047/1‑150 (MQ=60)
TGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTA > SRR19973068.3446326/1‑150 (MQ=60)
TGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTA > SRR19973068.402753/1‑150 (MQ=60)
TGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTA > SRR19973068.402734/1‑150 (MQ=60)
GCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTAT < SRR19973068.3917790/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATT < SRR19973068.556118/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATT < SRR19973068.2333824/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATT < SRR19973068.2322889/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATT < SRR19973068.230150/150‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATT < SRR19973068.556179/150‑1 (MQ=60)
TTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTG < SRR19973068.3838409/150‑1 (MQ=60)
TTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTG < SRR19973068.3838381/150‑1 (MQ=60)
TTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTG < SRR19973068.3258519/150‑1 (MQ=60)
GCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGT > SRR19973068.1127456/1‑150 (MQ=60)
CTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTG > SRR19973068.3610720/1‑150 (MQ=60)
CGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGAT < SRR19973068.2971611/150‑1 (MQ=60)
GGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATA < SRR19973068.3663811/150‑1 (MQ=60)
GGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATA < SRR19973068.3663853/150‑1 (MQ=60)
ACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTG < SRR19973068.1542235/150‑1 (MQ=60)
ACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTG < SRR19973068.1414691/150‑1 (MQ=60)
TCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGC > SRR19973068.401633/1‑150 (MQ=60)
TATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTT < SRR19973068.2020559/150‑1 (MQ=60)
TATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTT < SRR19973068.1927562/150‑1 (MQ=60)
TATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTT < SRR19973068.3976491/150‑1 (MQ=60)
TATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTT < SRR19973068.4068594/150‑1 (MQ=60)
ATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTT < SRR19973068.904569/150‑1 (MQ=60)
ATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTT > SRR19973068.3816228/1‑150 (MQ=60)
AATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTAT < SRR19973068.2653653/150‑1 (MQ=60)
TCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCC < SRR19973068.3167067/150‑1 (MQ=60)
TCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGAACTGTATTGTTTATCATGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCC < SRR19973068.3554136/150‑1 (MQ=60)
CTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCA > SRR19973068.998232/1‑150 (MQ=60)
cgacAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTG < SRR19973068.3519386/146‑1 (MQ=60)
CTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTG < SRR19973068.2860257/150‑1 (MQ=60)
TAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGA > SRR19973068.1158190/1‑150 (MQ=60)
AAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAA > SRR19973068.3820081/1‑150 (MQ=60)
ATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTA > SRR19973068.1830981/1‑150 (MQ=60)
ATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTA < SRR19973068.3743332/150‑1 (MQ=60)
GTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAA > SRR19973068.491341/1‑150 (MQ=60)
GTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAA > SRR19973068.491376/1‑150 (MQ=60)
TTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAT < SRR19973068.155845/150‑1 (MQ=60)
TTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAT > SRR19973068.884982/1‑150 (MQ=60)
TTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAT > SRR19973068.885668/1‑150 (MQ=60)
TTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAT < SRR19973068.2035211/150‑1 (MQ=60)
CTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACC < SRR19973068.3470764/150‑1 (MQ=60)
CTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACC < SRR19973068.3348255/150‑1 (MQ=60)
CTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACC < SRR19973068.1037065/150‑1 (MQ=60)
GAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTT < SRR19973068.3770500/150‑1 (MQ=60)
GAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTT > SRR19973068.3499057/1‑150 (MQ=60)
GAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTT > SRR19973068.379315/1‑150 (MQ=60)
GAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTT > SRR19973068.2185772/1‑150 (MQ=60)
GAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTT > SRR19973068.2185719/1‑150 (MQ=60)
gcCGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTC < SRR19973068.31452/148‑1 (MQ=60)
TACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGACGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTC < SRR19973068.31448/150‑1 (MQ=60)
GCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACG < SRR19973068.1100149/150‑1 (MQ=60)
GCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACG < SRR19973068.1100568/150‑1 (MQ=60)
AGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTT < SRR19973068.992970/150‑1 (MQ=60)
AGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTT > SRR19973068.1108869/1‑150 (MQ=60)
AGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTT > SRR19973068.1959364/1‑150 (MQ=60)
AGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTT < SRR19973068.3394754/150‑1 (MQ=60)
GCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTC < SRR19973068.1531590/150‑1 (MQ=60)
GCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTC < SRR19973068.3589301/150‑1 (MQ=60)
GCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTC < SRR19973068.2431281/150‑1 (MQ=60)
CGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCG > SRR19973068.3588059/1‑150 (MQ=60)
GACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGT < SRR19973068.3781107/150‑1 (MQ=60)
GACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGT > SRR19973068.1983410/1‑150 (MQ=60)
GACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGT > SRR19973068.2070827/1‑150 (MQ=60)
CTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTAT < SRR19973068.1213656/150‑1 (MQ=60)
CTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTAT < SRR19973068.1894306/150‑1 (MQ=60)
CTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTAT < SRR19973068.3277215/150‑1 (MQ=60)
CGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTTAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTT > SRR19973068.1483808/1‑150 (MQ=60)
CACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTAT > SRR19973068.2441398/1‑150 (MQ=60)
CACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTAT > SRR19973068.352577/1‑150 (MQ=60)
CTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACATTGTCGAACTTAGTTCGTATCTTTATGA > SRR19973068.1331459/1‑150 (MQ=60)
TTTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGACGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGTTAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTTACACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTCTGAT < SRR19973068.3947175/150‑1 (MQ=60)
TGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGAT < SRR19973068.1897577/150‑1 (MQ=60)
TGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACG < SRR19973068.475985/150‑1 (MQ=60)
TGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACG > SRR19973068.3367656/1‑150 (MQ=60)
GTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGA > SRR19973068.1155317/1‑150 (MQ=60)
GTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGA > SRR19973068.3218619/1‑150 (MQ=60)
GTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGA > SRR19973068.740017/1‑150 (MQ=60)
GTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGA > SRR19973068.1178723/1‑150 (MQ=60)
TTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGAC < SRR19973068.3713373/150‑1 (MQ=60)
TTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACA < SRR19973068.479300/150‑1 (MQ=60)
TTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACA < SRR19973068.479211/150‑1 (MQ=60)
TATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAG < SRR19973068.1810520/150‑1 (MQ=60)
CTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCCAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGAC < SRR19973068.2383048/150‑1 (MQ=60)
TAAGTATAGTTTATTCGTTGGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGGGTTAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTATTTCTTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACT < SRR19973068.2241562/150‑1 (MQ=60)
AGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTAC > SRR19973068.1514460/1‑150 (MQ=60)
GTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACC > SRR19973068.1760788/1‑150 (MQ=60)
TATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCT > SRR19973068.799853/1‑150 (MQ=60)
AGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAG > SRR19973068.3773695/1‑150 (MQ=60)
GTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGA > SRR19973068.752170/1‑150 (MQ=60)
TTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAAGGTAGTTCGTATCTTTATGATTCACGACAGTGACACTACCTGAGACT < SRR19973068.1475453/150‑1 (MQ=60)
TTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACT > SRR19973068.1723516/1‑150 (MQ=60)
tttttttgctgaacaatattttatattTTATTTTTAGCTTTTTTGTGTGCTATTGTGGCATCAGTTTTATCCTGTTAAAATAAAATGTCAACTTGTCGAACTTTGTTCTTATATTTTTGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGT < SRR19973068.585061/123‑1 (MQ=58)
TTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATATTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGT < SRR19973068.3131638/150‑1 (MQ=60)
TCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTG < SRR19973068.3672006/150‑1 (MQ=60)
CGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGC > SRR19973068.2630037/1‑150 (MQ=60)
GTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCA > SRR19973068.2563608/1‑150 (MQ=60)
GTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCA > SRR19973068.2563530/1‑150 (MQ=60)
CCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAAT > SRR19973068.1692509/1‑150 (MQ=60)
CCGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAAT > SRR19973068.1691312/1‑150 (MQ=60)
CGAACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATT > SRR19973068.1772910/1‑150 (MQ=60)
ACAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGA < SRR19973068.687618/150‑1 (MQ=60)
CAATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGAT > SRR19973068.1694235/1‑150 (MQ=60)
AATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATC > SRR19973068.1792180/1‑150 (MQ=60)
ATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCT > SRR19973068.1884736/1‑150 (MQ=60)
ATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCT < SRR19973068.2711583/150‑1 (MQ=60)
ATATTTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCT > SRR19973068.3362748/1‑150 (MQ=60)
TATTTGCCATATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTG < SRR19973068.2981475/150‑1 (MQ=60)
TGTGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTCTCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCA < SRR19973068.2379785/150‑1 (MQ=60)
TGCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATT < SRR19973068.2392650/150‑1 (MQ=60)
GCCAGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTC < SRR19973068.251376/150‑1 (MQ=60)
AGATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCC < SRR19973068.3992692/150‑1 (MQ=60)
GATTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCG < SRR19973068.1537387/150‑1 (MQ=60)
TTATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTG > SRR19973068.3514800/1‑150 (MQ=60)
TATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGA > SRR19973068.781615/1‑150 (MQ=60)
TATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGA > SRR19973068.782390/1‑150 (MQ=60)
ATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTGACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGAC > SRR19973068.258736/1‑150 (MQ=60)
ATATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGAC > SRR19973068.2346270/1‑150 (MQ=60)
TATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACA > SRR19973068.2731297/1‑150 (MQ=60)
TATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACA > SRR19973068.2773722/1‑150 (MQ=60)
TATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACA > SRR19973068.2773786/1‑150 (MQ=60)
ATTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACAT > SRR19973068.3655792/1‑150 (MQ=60)
|
ATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACGTAGTTCGTATCTTTATGATTAACGACAGTGACACTACCTGAGACTTGTGCAGAAATTGGATCTGCATTCCCCGTGACAT > CP009273/2476376‑2476673
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |