Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22386308 |
99.2% |
22207217 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
757,675 |
A→G |
T671A (ACC→GCC) |
fusA → |
elongation factor G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 757,675 | 0 | A | G | 99.8%
| 1643.1
/ NA
| 421 | T671A (ACC→GCC) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (189/231); minor base T (1/0); total (190/231) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.51e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
GTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGC > NC_008463/757528‑757820
|
gTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggcc > 1:2491268/1‑150 (MQ=255)
agGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACg < 1:3994097/150‑1 (MQ=255)
ggtggtGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGt < 2:8774995/150‑1 (MQ=255)
ggtggtGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACAGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGTGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGt < 2:7101981/150‑1 (MQ=255)
tggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACCCGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTCTGCGGCCGACGTGc > 2:1015935/1‑150 (MQ=255)
ggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCg < 1:10008940/150‑1 (MQ=255)
aCTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTcc > 1:6813292/1‑150 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCAt < 1:10167958/150‑1 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCAt > 1:5319745/1‑150 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCAt > 1:3444171/1‑150 (MQ=255)
tGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTc < 1:1964805/150‑1 (MQ=255)
tGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTc > 2:3944895/1‑150 (MQ=255)
caaCATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAggg > 1:6981815/3‑150 (MQ=255)
cATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcg > 1:1607996/1‑150 (MQ=255)
aTGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgc < 2:889296/150‑1 (MQ=255)
aTGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgc < 1:1088673/150‑1 (MQ=255)
tGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcg > 1:8876367/1‑150 (MQ=255)
ggTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcgcg < 1:3239008/150‑1 (MQ=255)
aCGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCt > 2:10862942/1‑150 (MQ=255)
gATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTc < 1:2929987/150‑1 (MQ=255)
aTGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTcc > 1:1738179/1‑150 (MQ=255)
ggCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATg < 1:9128208/150‑1 (MQ=255)
gACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGaa < 1:4180256/150‑1 (MQ=255)
gACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGaa > 2:6031572/1‑150 (MQ=255)
aCCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAt > 1:2807896/1‑150 (MQ=255)
aCCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAt < 2:10640494/150‑1 (MQ=255)
aCCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAt < 1:7468253/150‑1 (MQ=255)
aCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCa < 2:3145186/150‑1 (MQ=255)
cgtcgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACTCGGTTTCCGGTAAGGTTTTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTAGGTTTTGCGGCCGACGTGCGTTCCTTGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaaa < 2:340506/150‑1 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg < 1:8234792/150‑1 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg > 1:210576/1‑150 (MQ=255)
tcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc < 1:3686194/150‑1 (MQ=255)
gtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGACTTCTCCAAATACGCCg > 1:6639252/1‑150 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 1:10561933/150‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 1:6143448/150‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 1:10711652/150‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 1:1678222/150‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCACAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa > 2:4152734/1‑150 (MQ=255)
gTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAg < 2:7543314/150‑1 (MQ=255)
tCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGc > 2:1463645/1‑150 (MQ=255)
cTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCt < 2:1717478/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTcc < 2:4283860/150‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCg > 2:10452829/1‑150 (MQ=255)
aTTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCg > 2:9388601/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGt < 1:704065/150‑1 (MQ=255)
ggggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGGGCGTTCCTTGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGac > 2:9643111/1‑149 (MQ=255)
ggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACa < 2:2530794/150‑1 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtc > 2:2624340/1‑150 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtc < 1:6441770/150‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 2:9516249/150‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 2:9745583/150‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 2:5320000/150‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 1:9926754/150‑1 (MQ=255)
gaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtc > 2:8142893/1‑150 (MQ=255)
aggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtcg > 1:2687014/1‑150 (MQ=255)
acacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAg < 2:11076977/150‑1 (MQ=255)
acacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAg < 2:215324/150‑1 (MQ=255)
cacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgc > 2:1935740/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgc > 2:5084349/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgc < 2:2863340/150‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCt < 1:1310322/150‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTAATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTTAGAAGTTCGGTTATGCGGCCTACGTGCTTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCTAGCTACTCCAAGTAATTCTCCAAAAACGCAGAAGCTCAGTCGAACATCGACGAAgcgcag > 2:6436107/1‑148 (MQ=255)
tttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTgg > 2:4716224/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGt < 1:3530023/150‑1 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGt < 1:9504528/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 2:6774701/150‑1 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaa > 2:5643702/1‑150 (MQ=255)
ggTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa < 2:1558340/150‑1 (MQ=255)
ggTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa > 2:1483262/1‑150 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaa > 2:3709697/1‑150 (MQ=255)
aaGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaaa < 2:4844656/150‑1 (MQ=255)
ttCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGtt < 2:6071402/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGAt < 2:6245905/150‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCTGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGAtt < 2:837318/150‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTACGGTTATGCGGCCGACGTGCGTACCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAAAACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGAtt > 2:6978084/1‑150 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 1:8646717/150‑1 (MQ=255)
ccGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCa < 1:3018949/150‑1 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAg > 2:10318586/1‑150 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAg > 1:5038557/1‑150 (MQ=255)
gAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGc > 1:7087005/1‑150 (MQ=255)
aGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc > 1:9345041/1‑150 (MQ=255)
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AAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAC > SRR18135095.1866300/1‑151 (MQ=60)
AAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAC > SRR18135095.7482516/1‑151 (MQ=60)
AAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAC > SRR18135095.2435417/1‑151 (MQ=60)
AGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACA > SRR18135095.4980135/1‑151 (MQ=60)
AGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACA > SRR18135095.8279243/1‑151 (MQ=60)
GGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAA < SRR18135095.3109371/151‑1 (MQ=60)
GGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAA < SRR18135095.6544258/151‑1 (MQ=60)
GTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAG < SRR18135095.8236873/151‑1 (MQ=60)
TATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGT > SRR18135095.5110251/1‑151 (MQ=60)
ATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTT < SRR18135095.10038320/151‑1 (MQ=60)
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TCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGA < SRR18135095.9430874/151‑1 (MQ=60)
CGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGAT > SRR18135095.7800444/1‑151 (MQ=60)
GCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCA < SRR18135095.3717030/151‑1 (MQ=60)
GCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCA < SRR18135095.8685985/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135095.8053235/1‑151 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG < SRR18135095.3033435/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135095.5062874/1‑151 (MQ=60)
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TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT > SRR18135095.2805369/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT > SRR18135095.2754208/1‑151 (MQ=60)
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TGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAA < SRR18135095.1625844/151‑1 (MQ=60)
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GGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAG < SRR18135095.2843145/151‑1 (MQ=60)
GGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAG > SRR18135095.266769/1‑151 (MQ=60)
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TGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGG > SRR18135095.4128290/1‑151 (MQ=60)
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TGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT < SRR18135095.5999826/151‑1 (MQ=60)
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AAGGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT > NC_008463/757525‑757821
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
