Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
254 |
498.2 |
21552474 |
99.3% |
21401606 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
757,675 |
A→G |
T671A (ACC→GCC) |
fusA → |
elongation factor G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 757,675 | 0 | A | G | 98.0%
| 1479.6
/ 13.6
| 395 | T671A (ACC→GCC) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/4); new base G (167/220); total (171/224) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
GGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT > NC_008463/757527‑757821
|
ggTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggcc < 1:7813440/151‑1 (MQ=255)
gTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggccg > 2:2913609/1‑151 (MQ=255)
gagGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACg < 2:395292/151‑1 (MQ=255)
gagGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACg < 1:3103843/151‑1 (MQ=255)
agGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGt > 2:1599550/1‑151 (MQ=255)
ggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGt < 1:1402677/151‑1 (MQ=255)
ggggACTCCTGAGGAATACATGGGTGACGTGCTGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGt < 2:10578516/148‑1 (MQ=255)
aCTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCa > 1:5537043/1‑151 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATg > 1:9082257/1‑151 (MQ=255)
aGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCa > 2:8670326/1‑151 (MQ=255)
gACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAgg < 2:2998549/151‑1 (MQ=255)
gACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGGAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAgg > 1:3944472/1‑151 (MQ=255)
aCTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTGTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAggg < 2:1082990/151‑1 (MQ=255)
cTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGt > 1:7228385/1‑151 (MQ=255)
cATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgc < 2:3749070/151‑1 (MQ=255)
aTGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcg < 2:7393251/151‑1 (MQ=255)
gggTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcgcg > 1:2596099/1‑151 (MQ=255)
gTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACt > 1:8932285/1‑151 (MQ=255)
tGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTc < 2:7778425/151‑1 (MQ=255)
tGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCAt < 2:5158902/151‑1 (MQ=255)
tGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCAt > 1:604712/1‑151 (MQ=255)
aCCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAtt < 1:6739574/151‑1 (MQ=255)
aCCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAAtt > 2:6888098/1‑151 (MQ=255)
ccTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGGCGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtc > 2:2085048/1‑151 (MQ=255)
aaCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCa < 1:6627461/151‑1 (MQ=255)
aaCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCa > 1:5066248/1‑151 (MQ=255)
ccGTCGTCGTGGTCTGATTCATGGGATGGAGGACTAGGTGTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATTCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGATCTACTCCATGGAATTCTCCaaa < 2:2261418/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAAt < 1:5305470/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAAt < 1:1509255/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg > 1:3756660/1‑151 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGaa < 1:5916135/151‑1 (MQ=255)
gTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGc > 1:2495160/1‑151 (MQ=255)
tCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCt < 2:6219290/151‑1 (MQ=255)
cTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTc > 1:8829124/1‑151 (MQ=255)
aTTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGt < 1:9485675/151‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTc < 1:4361401/151‑1 (MQ=255)
cAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGa < 2:317175/151‑1 (MQ=255)
cAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGa > 2:6400772/1‑151 (MQ=255)
aGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGaa > 1:3520438/1‑151 (MQ=255)
aGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGaa > 2:4113036/1‑151 (MQ=255)
ggggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGTAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAAc < 2:7181113/151‑1 (MQ=255)
gggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACa < 1:1002458/151‑1 (MQ=255)
gATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtc > 2:9263649/1‑151 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 1:8554846/151‑1 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 2:4365585/151‑1 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt > 2:7001311/1‑151 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtc < 2:593079/151‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtc < 2:4819419/151‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtc < 1:4049293/151‑1 (MQ=255)
gaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAg > 2:9578719/1‑151 (MQ=255)
acacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgc < 2:8862194/151‑1 (MQ=255)
cacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcg < 1:3209029/151‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGACGAAGCGCTg > 2:6004843/1‑151 (MQ=255)
tttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGt > 1:6185481/1‑151 (MQ=255)
tttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCAACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgcagtt > 2:9774619/1‑147 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 1:8643313/151‑1 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTa < 1:9728910/151‑1 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaa > 1:5010056/1‑151 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaa < 2:3816695/151‑1 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaa < 2:3492186/151‑1 (MQ=255)
aaGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAc > 2:9043150/1‑151 (MQ=255)
aaGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAc < 2:1435641/151‑1 (MQ=255)
aaGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAAc < 1:4251931/151‑1 (MQ=255)
ggTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACaa > 1:3037318/1‑151 (MQ=255)
ggTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACaa > 2:8426604/1‑151 (MQ=255)
gTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAg < 2:8960687/151‑1 (MQ=255)
gTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAg > 2:5469581/1‑151 (MQ=255)
tcaTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAgg < 1:8999795/149‑1 (MQ=255)
aTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGtt < 1:8278690/151‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 1:3388974/151‑1 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCa < 2:7325210/151‑1 (MQ=255)
ccGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAg < 1:2752471/151‑1 (MQ=255)
ccGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAg > 1:10765065/1‑151 (MQ=255)
aGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGccc > 1:5159563/1‑151 (MQ=255)
gTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCtt > 1:7539618/1‑151 (MQ=255)
gTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCtt < 1:2111051/151‑1 (MQ=255)
tgcGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGGTCCATGTCCCAGTGTCGCGCGAGCTTCTCGATGGAATTCTCCAAATACGCCGTAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGATGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTta < 2:8551442/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa < 1:10184910/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa > 1:5685613/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaagt < 1:9238534/151‑1 (MQ=255)
cTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTAtaagta > 2:7939995/1‑151 (MQ=255)
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TGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTC > SRR18135094.8887782/1‑151 (MQ=60)
TGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTC < SRR18135094.3403950/151‑1 (MQ=60)
GCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCA < SRR18135094.2267833/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG < SRR18135094.2764633/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135094.10809357/1‑151 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG < SRR18135094.8385702/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135094.5036034/1‑151 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATACAG < SRR18135094.4316/151‑1 (MQ=60)
CGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGC < SRR18135094.10580901/151‑1 (MQ=60)
AGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCC < SRR18135094.4887471/151‑1 (MQ=60)
AGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCC > SRR18135094.5182422/1‑151 (MQ=60)
GGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTTGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCT > SRR18135094.2976607/1‑151 (MQ=60)
GTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTT < SRR18135094.2120390/151‑1 (MQ=60)
GTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTT > SRR18135094.7571680/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT > SRR18135094.10654580/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT < SRR18135094.336189/151‑1 (MQ=60)
TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT < SRR18135094.336097/151‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTA > SRR18135094.4188947/1‑151 (MQ=60)
TCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTA < SRR18135094.5751188/151‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTA < SRR18135094.6033979/151‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTA < SRR18135094.87661/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA < SRR18135094.10227116/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA < SRR18135094.3492271/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA > SRR18135094.5710743/1‑151 (MQ=60)
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TGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAACGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAA > SRR18135094.2549839/1‑151 (MQ=60)
GGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAA < SRR18135094.6701430/151‑1 (MQ=60)
GGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAG > SRR18135094.3831268/1‑151 (MQ=60)
GGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGA < SRR18135094.296816/151‑1 (MQ=60)
GTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAG > SRR18135094.6344513/1‑151 (MQ=60)
GTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTTGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAG < SRR18135094.7140090/151‑1 (MQ=60)
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TGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGACTCAGCCCTTTAAGTAAGAGG < SRR18135094.1048928/151‑1 (MQ=60)
GAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGT > SRR18135094.8594324/1‑151 (MQ=60)
AGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTT > SRR18135094.2270134/1‑151 (MQ=60)
AGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTT > SRR18135094.3087019/1‑151 (MQ=60)
ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGGGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA < SRR18135094.6343137/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA < SRR18135094.10399690/151‑1 (MQ=60)
TCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGT < SRR18135094.2836106/151‑1 (MQ=60)
CGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTC > SRR18135094.2642285/1‑151 (MQ=60)
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|
AGGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAGG > NC_008463/757526‑757825
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
