Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I0 R1
|
54 |
59.4 |
1320120 |
91.9% |
1213190 |
218.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
71,877 |
A→G |
24.9% |
E176G (GAG→GGG) |
yabI → |
DedA family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 71,877 | 0 | A | G | 24.9%
| 59.7
/ 3.6
| 37 | E176G (GAG→GGG) | yabI | DedA family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/22); new base G (7/3); total (12/25) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.19e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAA > NC_000913/71660‑72099
|
gCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGTATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCCCAATTTATTCCGCCGACTA‑TTTACGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTTCTTCTTGCCAGGGATTTTGGCGGGCGCGGCCGT‑CGGATTTTCTTCCCGGAAT‑CAGAGCGGTGGGGTTTaaag > 1:209057/1‑226 (MQ=255)
cGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGGT‑C‑GCTATTCCTGCCGGAATGCCGAGCGGG‑GGGTTTAAATggc > 2:155575/1‑227 (MQ=255)
gCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAAGA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTTG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCCGGGATTCTGGCGGGGGCGGCGGT‑C‑CATATTCCTGCCGGAATGCAGAGGGGT‑GGGGGTAAATggggggg > 1:293514/1‑223 (MQ=255)
gCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCCATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCCAAATTTATTACCCCGAATA‑TTATCCGCTGCCTGCTGTTG‑CCGCCGGTTTACTTCCCTTCCGGGGTTCTGCCGGGCGCGGGGATCC‑GACA‑TCCGTCCGGAATGCCGAGAGGG‑GAGttttacagggtggcgctggcccacg > 1:432211/1‑206 (MQ=255)
gCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGGTTTTGGCGGGGGCGGCGGC‑C‑GATATTTCTTCCCGCAAGAGGAGCGGG‑GGGGTTAAAGGGTGGTGGGTGGCAAAAg > 1:304889/1‑228 (MQ=255)
ttGTTCCCCGTTTTGGGGGGTTTTTTTGTTGGCCGGGGGGGTCGGCTGGTGCCATGGGTGGCGGGAATG‑CTGGACCTCCGGGGGGTTGAGTTTATTCCGCCGAATA‑TTACCGGGTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGAGTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCg < 1:325177/227‑1 (MQ=255)
cTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGCTTCTGGCGGGCGCGGGGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGGGCGGG‑TGGTTTGAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGGGGTTTTgggg > 2:104262/1‑228 (MQ=255)
tGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTTTGG‑GCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGGGAT‑C‑GCAATTCCTTCCGGCATGCAGAGCCGG‑GCGGTTACATGGTGGCTGCTGGTAACAGCGGGGtgttttgggg > 1:189722/1‑223 (MQ=255)
gtcggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTTGCGGGCGCGGGGGT‑C‑CGTTATCCTCCCCGACAGCAGCGGGGT‑GGGGTTAAAGGGGTGTCGCGTGCAACACCGGGGttttttgggggg > 1:379966/1‑221 (MQ=255)
ggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGG‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGGGTTTTTGGGGGTtggt > 2:448242/1‑228 (MQ=255)
tcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTTGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGGATA‑TTATCGGCTGCCCGCTGTGG‑CCCCCGTTTTTATTCCTGCCCGGGATTCTGGCGGGCCCGGGGAT‑T‑GCTATTTCTGCCCGAATCGCGAACGGG‑GGGTTTTAATGGTTGTTTCATGCACCCACGGGGTTTTTTTGGGTtggggg > 1:175273/1‑228 (MQ=255)
cccGACGGGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCt < 2:432211/227‑1 (MQ=255)
gtgtgggccatgggtggGGGGAATG‑GTGGATCGGCCGGTGGCTAATTTTATTACGCCGAATA‑TTGTCGGCTGCCGGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 2:175273/216‑1 (MQ=255)
gtgggTGCAAATGGGGGCGGGAAGG‑CTGGATCGGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTGTCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 1:488268/225‑1 (MQ=255)
ggtGGTGCC‑ATGGTGGGGGGTATGTCTGGTCCTGCGGGTGCGAAAATTTTTTA‑GCCCAATATTTATGGGGTGCC‑GTTGTGGCCCGCGGTTTTTCTTCCGGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 1:345358/226‑1 (MQ=255)
tgtataagggccagggCTAAATTTATTCCGCCGAATA‑TTATCGGGTGCCTGCGGGGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGGTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGttt < 2:531130/213‑1 (MQ=255)
ggggtacTGCCGGGGGCTAAATTTTTTGCGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGGGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGttt < 2:209057/221‑1 (MQ=255)
cTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGGCGAATA‑TTAGCGGCTGCCTGGTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGttt < 2:452875/227‑1 (MQ=255)
tatttttATTACGCAGAATT‑GTAGCGGCTGCCTGCTGGGG‑CCGCAGTTTTACTTTCTGCCAGTGGTTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATACTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGATGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCcg < 1:330623/224‑1 (MQ=255)
aatttcagccggcGAATT‑TTATCGGCTGACGGGTGGGG‑CCGCCGTTTTACTGCCTGCCCGGGATGCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGGTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCcg‑cg < 2:555668/216‑1 (MQ=255)
aTTTATTACGCCGAATT‑TTACCGGCTGCCGGCGGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCcg‑cg < 2:341547/227‑1 (MQ=255)
ttaCGCCGAATA‑TTAGCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGGCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGt < 2:586567/227‑1 (MQ=255)
cctgcTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTTTGGGGCAGCGGGTAA‑GCGGCGGACCGGTTTAGTCATTATTTTTGCCC‑CGGGGGGTTGTTGTGGGTG‑GCGCCCtttgt > 2:520821/1‑225 (MQ=255)
ttACCTCCTGCCGGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggt < 2:201832/228‑1 (MQ=255)
ttctgccggCCAGGGATTTTGGGGGGCGGGGGTAT‑C‑GATTGTCCTGCCGGAATGTAGAGGGGG‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTGGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggt < 1:380458/219‑1 (MQ=255)
cTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtg < 2:806/228‑1 (MQ=255)
aGGGATTTTTGGTGGCGCGGGGGG‑T‑GATTTTCCGGCCGGAATGCAGGGGGGT‑GAGGTTAAATGGTTGCTGCTGGCAAGAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTggtggt < 1:104262/228‑1 (MQ=255)
cggcgAT‑C‑GATATTGCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGt < 2:379966/228‑1 (MQ=255)
cggtgatggtttttCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑TGGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTGTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGt < 1:566251/216‑1 (MQ=255)
t‑c‑gatATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTTGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTAATTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 2:428020/227‑1 (MQ=255)
ccTGCGGGAATGGAGGGTGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTTGTTTGGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGta < 2:608665/227‑1 (MQ=255)
tGCCGGAATGCAGGGCGGT‑GATTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGtata < 2:304889/227‑1 (MQ=255)
ccGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGGGGTGTTTTTGTGGGTTGGGTGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCg < 2:189722/228‑1 (MQ=255)
aTGGAGAGTGGT‑GGGTTTAAATGGTTGCGTCGGGCAACAGGGGGTTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATAtt < 1:493559/228‑1 (MQ=255)
ggggggT‑GGGTTTAAATGGTTGGTGCTGGCAACAGGGGGGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGTTGTGCGGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCg < 1:590194/224‑1 (MQ=255)
agCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTCTTTGGGCCGCGGGAAAGGCGTGGGACGGTTT‑AGTCCTTTTTTTTTCCGCCGCGGGTTGGTGGTGGCTGCGCGCGGGGGTTTTCT‑CCTCTGGCGCGGGGGGGGGGGTGGGGTTAATTTGCCACCCCTTGATGTCgggtgttagagcgtgtttgtg > 1:185722/1‑209 (MQ=255)
cGGT‑GAGTTTAAATGGGTGCTGCTGGCAACAGCGGTGGTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTaa < 2:293514/228‑1 (MQ=255)
|
GCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATG‑CTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATA‑TTATCGGCTGCCTGCTGTGG‑CCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGAT‑C‑GATATTCCTGCCGGAATGCAGAGCGGT‑GAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAA‑GCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCG‑CGGTCGTTTGTTGTGGCTG‑ACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAA > NC_000913/71660‑72099
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
