Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F27 I0 R1
|
322 |
127.1 |
2757226 |
91.8% |
2531133 |
223.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
71,877 |
A→G |
20.8% |
E176G (GAG→GGG) |
yabI → |
DedA family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 71,877 | 0 | A | G | 20.8%
| 169.3
/ 4.9
| 87 | E176G (GAG→GGG) | yabI | DedA family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/57); new base G (19/2); total (28/59) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-11 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTG > NC_000913/71650‑72107
|
aaCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGTTCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGACG‑GGGCAGTTTAAATGGt > 1:1147127/1‑239 (MQ=255)
aaCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGGGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTTCTTCCTGCCAGGGGTTCTGGCGGGCGCGGGGGCCGAATTTCCTTCCGCAATG‑CAGGGC‑GGGGGGTTTAAAAGGt > 2:941939/1‑239 (MQ=255)
aaCGGAACATGGTTTGCAACAACCCAGCGTGTTC‑CCCTTTTGGTGGGGTCGTTTTTTTGGCCCGACGCGGCCGCTGGTGCAAA‑TGGTGGCGGGATTGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGt < 2:1048896/239‑1 (MQ=255)
aaCATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGGTCGATATTCCTGCCGGAATG‑CCGAGC‑GGGGGGTTTAAATTGTtgct > 1:1048896/1‑238 (MQ=255)
aaCATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGGGGCTAAATTTATTACGCCGCAAATTATCGGGTGCCTTCTGTGGCCCCCGTTTTACTTCCTGCCCGGGATTCTGGCGGGGGCGGGGATCGGTTTTCCTGCCGGAATG‑CCGAGG‑GGGGGGTTTTAATGGtggggg > 2:1374884/1‑234 (MQ=255)
gCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTAAGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGGTTTACTTCCTGCCCGGGATTCTGCCGGGCGCGGGGGGTGTTATTCTTGCCGGAATG‑CCACGC‑GGTGGGGTTATATGGTtggctcggggcacaa > 2:272294/1‑226 (MQ=255)
cgcacAACACAGCTGGGTCACCATTCGGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑GGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAg < 1:1284882/235‑1 (MQ=255)
gCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGGGGGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACACC‑GGGGTTTTtg > 1:943462/1‑239 (MQ=255)
cATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGCATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGGCCCCGTTTTACTTTCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCCGGGATGCATATTCCTTCCCGCATG‑CAGAGCTGGTGAGTTT‑AATGGTTGCTT‑CTGGCACCCCC‑GGGGttttttt > 2:801691/1‑237 (MQ=255)
cATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGGTCGATATTTCTGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGGGGGTTTAAATGGGTGCTG‑CTGGCAACAGG‑GGTGGTTTtgt > 1:1286554/1‑239 (MQ=255)
cATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGGGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAAAAGC‑GGGGgtttttt > 1:290828/1‑237 (MQ=255)
tGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGTTTCTTGCGGGCGCGGGGGTCGGTATTCCTGCCGGGATG‑CGGAGC‑GGTGGGTTTAAATGGTTTGTG‑CTGGCAAACGC‑GGGGTTTTTgggg > 2:147883/1‑239 (MQ=255)
atgttctccatgtggtgcggtggTTTTGTGGGCCCGTGTGGCCCGCTGGTGCCAG‑GGGGGGGGGGAATGGGGGTGCTGGCGGGGGCTAAATTTATTCATCCGAATATTACCGGCTGCCTGGGTGGGCCGCAGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGGTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTtgt < 2:883151/221‑1 (MQ=255)
ttctcctttgtgggtgggctttttGTTGGCCCGACTGTTCCGCGGGTGCCAA‑TGGGGGCGGTAAGGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTGCGCGGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGt < 2:1261614/219‑1 (MQ=255)
aTTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTTCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTtggtgg > 1:1310609/1‑239 (MQ=255)
tCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGGTATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGGTGGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGGGTTTTTGTGGGTtggtggtt > 1:385574/1‑237 (MQ=255)
tCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCCGAATG‑CAGAGC‑GGGGGGTTTAAATGGGTGCTG‑CTGGCCACCGG‑GGTGGTTTTGTGGGGTGGtggcg > 1:1069099/1‑238 (MQ=255)
agaagacaggtcgTTTTGTTGGCCCGACGGGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCTGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGtggc < 1:820312/231‑1 (MQ=255)
tGGT‑CGGTCGTTTGGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑GGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGtggctgg < 1:941939/239‑1 (MQ=255)
ggt‑cggtcGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGtggctggc < 1:22085/239‑1 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGGATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTTCCAGGGGTTTCTGCGGGGGCGGCGGTCGGAATTCCCTCCCGAATGCCGGAGG‑GGTG‑GTTTAAAAGGGTGTTGTGTGACAACAGG‑GGGGttttttgggggggggggggggg > 2:187175/1‑222 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGGATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGGTTCTGGCGGGCGCGGCGGTCGATATTCCTGCCGGAATG‑CGGAGC‑GGGGGGTGTAAATGGTTGCTG‑CTGGCGACACA‑GGGGGTTTTGTGGGTTGgtgggtgggt > 2:563728/1‑237 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCCGGGGTTCTGGCGGGCGCGGCGGTCGATATTTCTGCCCGGATG‑CAGAGG‑GGGGGGGTTAAATGGTTGTTGTCTGGAAAAACG‑GGGGTTTTTGGGGGTggggggtgggg > 2:17716/1‑234 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCCGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGGTATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGGGGTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCCACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGGTGGtggctg > 1:258108/1‑236 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGGTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGGGGGGGCCGGTATTTCTGCCCGAATG‑CAGGGG‑CGTGGGTTTAAATGGTTGTGT‑CTGGGCACAGC‑GGGGGTTTTGTGGGTGGGggggtgggg > 2:184497/1‑237 (MQ=255)
gt‑cggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGCCTGCCTGCCGTGGCCGCCGGTTTACTTCCTGCCCGGGGTTCTGGTGGGCGCGGCGAGCGATATTCCCGCCGGAATG‑CACGCC‑GGTGGGTTTAAATGGTAGCTG‑CGGGCAAACGCGGGGGTTTTTGggggggggggcgggag > 2:508254/1‑227 (MQ=255)
gtgggttgTTTTGGTGGCCCGACGCGCCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCGGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGtggctggc < 1:850959/235‑1 (MQ=255)
gttttttttGTTGGCCCGGCG‑GGCCGGTTGGGCCAAGTGGGGGGGGGAATTGTGGATCGGCGGGTGGCTAAATTTATTCCGCCGAATATTAGCGGCTGCCTGCTGGGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCtgtg < 2:1165383/234‑1 (MQ=255)
ggtcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGGGGTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGGGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCtgtg > 1:774223/1‑239 (MQ=255)
tcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGCATATTATCGGCTGCCTGCTGCGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTTGCGGGCGCGGCGATCCATATTTCTGCCGGAAGG‑CACAGG‑CGTGGGCTTCAATGGGTGCTG‑CGGCGAACAGC‑GGGGGTTTTTTGGGTtggggggagggcgggcg > 2:1029839/1‑228 (MQ=255)
tcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGGGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACACC‑GGGGTTTTTGTGGGTTGGGGGTTGGCtgtgtt > 1:851803/1‑237 (MQ=255)
tcgTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGGTTTACTTCCCGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGTGGGTTTAAATGGTTGTCG‑CGTGCAACAGC‑GGGGTGTTTTGGGGTGGGGGGGTGGGtgtggg > 2:1313883/1‑237 (MQ=255)
ctgtttGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCAAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCt < 1:547731/235‑1 (MQ=255)
ttttttTGCCCCGGCGGGTCCTCGGGTGGCGG‑GGGGGGGTGGAAGTCTGGTTCGGCCGGTGGCTAAATTTATTCCGCCGAATTTTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGc < 2:113052/239‑1 (MQ=255)
ttttGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGGGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGc < 1:428044/239‑1 (MQ=255)
tttgGTTAGCCCGGCGGTTCCGCTGGTGCCAA‑TGGGGGCGGGAATGCGGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCGGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGc < 1:681124/239‑1 (MQ=255)
ggCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGGCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTTCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGGGGTCGATATTCCTTCCGGGAGT‑CAGTGG‑GGTGGGGTTTAAAGGGTGCTG‑GTGGCGACAAC‑GGGGGTTTTGTGGGTGGGGGgctggttggggggggggctttt > 2:820312/1‑225 (MQ=255)
ccccgggtcccGTTGGTGCCAT‑TGTTGGGGGAATTGTTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACCCCGAATATTATCGGCTGCCTGCGGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 2:774223/230‑1 (MQ=255)
ccGACGGGTCCGCTGGTGCGAG‑TGGTGGCGGAAATGCTGGTTCTGCCGGTGGCTAAATTTTTTACGCCGAATTTTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 1:272294/239‑1 (MQ=255)
aCGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGGATG‑CAGAGC‑GGGGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGGGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCgggttttgggcag > 1:715866/1‑228 (MQ=255)
tCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CCGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGG‑GGGGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGGGGGTAttggggggggggg > 1:1344721/1‑227 (MQ=255)
cgtgggggacAA‑GGGTGGGGGGAAGGGTTGATCGGCCGGTGGCTAAATTTATGACGCGGAATATTATCGGCTGCCTGCGGGGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTaaa < 2:943462/230‑1 (MQ=255)
gCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTGTTTACCCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGGGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAGAGCGACt < 1:560291/238‑1 (MQ=255)
gCCAA‑GGGTGGAGGGAATGCTGGATTTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATTTTACCGGCTGCCTGCTGGGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACt < 1:52778/238‑1 (MQ=255)
tggtggCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGGGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGGGcggcggggaagaggcgggcc > 1:63455/1‑223 (MQ=255)
tggCGGGAAGTCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACCCCGAATATTATCGGCTGCCTGCGGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGttt < 1:147883/238‑1 (MQ=255)
tggCGGAAATGCGGGCTCTGCCGGGGGCTAAATTTAGTCCGCCGAATTTTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGttt < 1:59856/238‑1 (MQ=255)
gggggagtggtggtcttGCCGGGGGGTAAATTTTTTACGCCAAATTTTATCGGTGCCCTGCGGGGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGa < 2:1099979/222‑1 (MQ=255)
aagtcTGGATCTGCCGGGGGATAACTTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCat < 1:40326/234‑1 (MQ=255)
ggCCGGTGGCAAAATTGTTTACTCCGAATATTAGCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCcg < 1:1029839/237‑1 (MQ=255)
tggtgtataagagacagattatCGGCTGCCGGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCGGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGATGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGAAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTttgtt < 1:534499/221‑1 (MQ=255)
tgatttttttgggCTGCCTGCTGGGGCCCGCGTTTTTCTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGGGCGGCGATCGATATTCCGGCCGGAATG‑CAGAGG‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCg < 2:918233/228‑1 (MQ=255)
cgagtttttccggggtccggtggtgGCCGCGTTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCGGGCGGGCGCGGCGATCGATCTTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCg < 2:1286554/217‑1 (MQ=255)
gattagtcgcgcgtgcctgcTGTGGCGGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATGCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGTCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGt < 1:677716/226‑1 (MQ=255)
aaTTTTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTa < 1:313935/178‑1 (MQ=255)
ggCTGCCGGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGgcg < 1:791000/161‑1 (MQ=255)
gtgtggataagagccagccgTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGc < 1:1251781/222‑1 (MQ=255)
tgtctgtgttggggcgcggTTTTTCTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGcc < 2:1276237/224‑1 (MQ=255)
ttctcgctgGGGCCCCCTTTTTACTTCCTGCCAGGGTTTCTGGGGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGGGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACGGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCAt < 2:980135/234‑1 (MQ=255)
tgcctgcTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAAGG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCAt < 1:681382/239‑1 (MQ=255)
gtcctgtTTTGCCCGGCGTTTTGCTTCCTGGCCGGGATGCGGGCGGGCGGGGCGATCGGTATTCCGGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGTGAGTTTAAAGGGTTGCTG‑CGGGCAACGGC‑GGTGTGTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCAt < 2:1069099/237‑1 (MQ=255)
cctgcTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTGGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGGGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGGGCTGGGGGGTTTGGCGGGCGGGGGAAACGACGGGCCGTTTTGGGCATTATTTTTTCCGCGGGCGGTTTTTGGGGGTgggggccggtgttttttttcagc > 2:1051612/1‑217 (MQ=255)
gccgGTTTACGTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGgcgc < 1:1051612/239‑1 (MQ=255)
gTTTTACTTCCTGCCAGGGATTTCGGCGGGCCGGGCGATCGATATGCCGGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTT‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtgg < 1:508254/239‑1 (MQ=255)
ttttttttcttggcgggggTTTTGGCGTGCGCAGCGCTCGGTATTGCTGCCGGAATG‑AAGGGC‑GGTTGGTTTAAATGGGTGGTG‑CTGTCAACAGG‑GGTGTTTTTGGGGGTTGGGGGTGGGCTGTGGTGGCGGTTATGGCGCAGAGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggt < 2:468790/224‑1 (MQ=255)
ttttGCTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGtt < 1:774671/163‑1 (MQ=255)
ttACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGGGCGGCGAGCGTAATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggtgg < 1:1282216/239‑1 (MQ=255)
gggcgCGGGGATCGATTTTCCTGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 2:725515/238‑1 (MQ=255)
gggcgCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 1:500308/238‑1 (MQ=255)
gggcgCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 1:1313883/238‑1 (MQ=255)
gggcgCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 1:1272449/238‑1 (MQ=255)
gggcgCCGCGATCGATATGCCTGCCGGAATT‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATg < 1:801691/238‑1 (MQ=255)
gggccgggggttcgatTTTCCTGCCGGAATG‑CAGGGG‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGAAACAGC‑GGTGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGc < 2:715866/228‑1 (MQ=255)
gcgcGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGcc < 1:17716/238‑1 (MQ=255)
cgcgGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCg < 1:187175/238‑1 (MQ=255)
cggggttcgtttttCCCGCCGGAATT‑GAGGGG‑GGTGGGTTTAAATGGTTGTGG‑CTGGCAACAGG‑GGTGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGgtg < 2:1147127/227‑1 (MQ=255)
cgatcgatATTCCTGCCGGAATG‑CAGGGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGta < 1:563728/238‑1 (MQ=255)
actG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTGTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGCCCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTaaa < 1:873966/236‑1 (MQ=255)
aaTG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGTTTTCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTaaa < 1:218261/238‑1 (MQ=255)
cAGAGG‑GGTTAGTTTAAATGTTGTCGG‑GTGGCAACGGG‑GGTGTTTTTGGGGGTTGGTGGCTGGCTGGGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGt < 2:258108/239‑1 (MQ=255)
agagC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑GTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGt < 1:1278485/238‑1 (MQ=255)
agagC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCTGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGt < 1:425466/238‑1 (MQ=255)
agagC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGt < 1:1374884/238‑1 (MQ=255)
agagC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGt < 1:729813/238‑1 (MQ=255)
acagggTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACCGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGtt < 1:1131831/234‑1 (MQ=255)
gggggTGATTTTTAATGGTTGCTG‑CTGGGCACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTTTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTg < 2:290828/235‑1 (MQ=255)
gC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTg < 1:84812/237‑1 (MQ=255)
|
AACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGT‑CGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAA‑TGGTGGCGGGAATGCTGGATCTGCCGGTGGCTAAATTTATTACGCCGAATATTATCGGCTGCCTGCTGTGGCCGCCGTTTTACTTCCTGCCAGGGATTCTGGCGGGCGCGGCGATCGATATTCCTGCCGGAATG‑CAGAGC‑GGTGAGTTTAAATGGTTGCTG‑CTGGCAACAGC‑GGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTG > NC_000913/71650‑72107
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
