Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I0 R1
|
54 |
59.4 |
1320120 |
91.9% |
1213190 |
218.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,609,768 |
T→G |
22.4% |
G118G (GGT→GGG) |
prfC → |
peptide chain release factor RF‑3 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,609,768 | 0 | T | G | 22.4%
| 81.5
/ 2.4
| 59 | G118G (GGT→GGG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/23); new base G (12/3); total (33/26) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609552‑4609990
|
aaaaGGCCGTGGGTCCAACCAGTCCGGTAAGGCGGGCTGGATGGAGGTGGAAAAGCAGCGTGGGATCGCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCg < 1:642081/228‑1 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGTTGGTTTTCGACGCCGCCAAGGGGGTGGAAGATCGTACCCCTaa > 1:119087/1‑228 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTCCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCAAAAGGGGTTGAGGATCGTAccccaca > 2:651544/1‑224 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTAACGGCGTTGGACGGCTGCCTGATGGTTACCGACCCCGCAAAAGGGGTTGAGAATCGTACCCGTaa > 1:651452/1‑228 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCCGACGGCGGTGGCATTCTGACGTGTGGTGATGGACGCTGCAAAAGGCGTTGCAGAGCgacccccg > 2:364884/1‑219 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGCACCCTGACGGCGGTGGACGGCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCACAAGGGTTTGCAGATCGTACCCGGaa > 2:83436/1‑228 (MQ=255)
cACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGtt > 2:557843/1‑228 (MQ=255)
aCTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGCGGACTGCTGCCTGCTGGTTATCGACGCCGCCAAAGGAGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTccgc > 2:343102/1‑227 (MQ=255)
tggagatggaAAAGGGGGGGGGGTCCTCCATTTCTTCGCCTGGGATTCAGTTTCCGT‑TCACCGATTGCCGGGTTAACCGGCTCCACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCCGGAAGTTACCTATCTTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGc < 1:557340/228‑1 (MQ=255)
gagatggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCGGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGcc < 2:32956/227‑1 (MQ=255)
atggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGTTGGTTATCGACGCCGCACAAGGTGGTGCAGATCGAACCCCTAAGCGGATGGAAGTTACCC‑TCAGcgcggaaaccccacac > 1:423108/1‑216 (MQ=255)
gaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGCCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTTGGCGGGACACGCCGGTCCTc > 2:241131/1‑228 (MQ=255)
aaaaGCAGCGTGGGATCCCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAGGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 2:119087/228‑1 (MQ=255)
aaaaGCAGCGTGGAATCTCCATTACTTCGTCTGGTATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTTGTTAACCTGCTAGACACCCCGGTGCACGAAGACTTCTCGGAAGATTCCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 2:358794/228‑1 (MQ=255)
gTGGGATCTCCATTACGACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATg < 2:382743/185‑1 (MQ=255)
ggctctcCTTTACTTCGGTTGTGGTGCGTGTTCCGTATCC‑CGCTTCCCTGGTTACCCGGCTCGCCACCCCGGGGATCGAAGTTGTCTCGGACTATATCGATCGTACCTGTACTGCGTTTGACTGCTGCCTGATGGTGATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCTTAATCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCGCCTTTATGAAc < 1:435966/224‑1 (MQ=255)
ctcCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGCCTGATGCCCGATTGTTATCGACTCCGCAAAAGGTGTTGACGAGCGCACCCGTAAGCTGACGGAAGTTACCAGTCTGCGCGCAACGCCCACTCTGCCCCTTCAGAACAAACt > 1:239820/1‑228 (MQ=255)
tatttagggttgggagggggTTTCCGTAGCC‑CGCTTGCCGGGTGAACCGGTTGGACACCCCGGGGCACGAAGCTTTCACGGAAGATACATATCGTCCCCTGACGGCGGTGGCCGGTGGCTGGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTCCCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGAc < 1:567417/208‑1 (MQ=255)
ttcttcGTCTGGTATGGAGTTCCCGTATCA‑CGTTTGCCTGGTTACCCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGGCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCg < 1:607790/223‑1 (MQ=255)
cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGCGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGCCACCCCGCTCCCCCCCTTTTTGAAACAAATTTACCgggtaa > 1:445492/1‑223 (MQ=255)
cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCACAACGCCAATCCCAACCATTATGAAAAAAATTGAcctgacaa > 1:11400/1‑222 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACACGTCTGCTCGACACGCCGATCCTCACCCTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATc > 2:362558/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGAAAGTTACCCGTCTGCCGGACCCGCCGTTCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATc > 2:468743/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGGAGATCGTACCCCTAAGCTGATGGAAGTTACCCGCCTGCGCGCCCCCCCGAGCCCCACCTTTTTGAACAAACTTCACCGGGAAATc > 1:599114/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCCGATGGTTATCGACGCCCCAAAAGGTGTTGACGATCGTACCCGGAAGCCGATGGAAGCTCCCCGCCTACGCGAAACCCCCCACCACACATTTATGACCAAACTTGACCGCGATATc > 1:55621/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATTGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGACGTTACCCGTACGGCCGCCACGCCGACCCCCCCCTTTATGAACCAACTTAACCGGGATATc > 1:394446/1‑228 (MQ=255)
tgATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCACCGCCGCAAAAGTGGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCCGCGCTAAACACCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATcgcc > 2:352612/1‑224 (MQ=255)
tgATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGACTGCGCGACACGCCGATCCTCACCCTTATTAACAAACTTTAACGTGATACCcgc > 2:412222/1‑227 (MQ=255)
tCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTTACCGTGATATCGACGACCCGATggc > 2:340991/1‑227 (MQ=255)
gctATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCCCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTTTCGTTCCCTGACGGCGTTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAAGGAg < 2:484370/225‑1 (MQ=255)
a‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCCATGGAGCTGCTCg > 2:49246/1‑228 (MQ=255)
gATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCg < 2:11400/226‑1 (MQ=255)
ctttGCTTGGTTACCCTTCCCGCCCCCCCGGGTACCGAAGCCTTCTCGGAAGATACCGATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGAAGGTTGTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCGGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 1:309160/226‑1 (MQ=255)
aatggCCGGGTTAACCTCGTGAACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCAGGAAGGTACCTACCGTGCCCTGACGCGGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTTTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAGCCGATGGAGCTGCGCGAt < 1:390490/224‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 2:423108/227‑1 (MQ=255)
gTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGGCCTTCTCGATGAAGTTggg > 2:148189/1‑226 (MQ=255)
ttACCCTGTTCGACCCCTCGGGGCACGAAGACTTCTGGGAAGATCCCTATCGTGCCCGGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTgaga < 1:412222/228‑1 (MQ=255)
cccTGCCCGACACCCGGGGGCAGGAAGACTTCGCGGAAGATACCAGCCTTACCGTGAGGGCGGTGGCAGGCTGCCTGATGGTTAGCGAGGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCTACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACg < 1:455621/227‑1 (MQ=255)
aCCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGCCGCCGCAAACGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCCGGATATCCGCGACCCGATGGAGACGCTCGATGAAGTTGGGAACGAGCTGAAAATAGGCtggaggccgacaacccagccggtt > 1:211893/1‑203 (MQ=255)
tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGCACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCCGGTCCCCCGGCCGATTgggcgggg > 2:306128/1‑222 (MQ=255)
tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGAAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAGGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGCCCGATCACCTGGCCGATTGACTGCgg > 2:73296/1‑228 (MQ=255)
cctgggcgggggTGGCCTGCTCCCGTAGGGTTATCGGCGCCGAAAAGGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTAGGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 1:651544/221‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGCTGTGGACTGCGGCCTTATTGTTAGCGACGCAGAAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTTATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 2:223238/227‑1 (MQ=255)
cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGACGTTGGAAGCGAGATGCAAATCGGCTGTGACCCGACCACCTGGCGGATTGGCGGGGGCacca > 1:240443/1‑225 (MQ=255)
cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAACTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGTTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCGGAGAACCTGCCCGATGGGCGGAGGAAAGc > 1:269992/1‑228 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGGAGGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGtt > 2:357315/1‑227 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGACCTGaaaa > 2:29098/1‑181 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGGTGAGAACGAGCTGAAAAACCGCAGTGCGCCGGTCACCTGGCCGATTGGGCGCGGCAACCCGttt > 1:579154/1‑228 (MQ=255)
tgctgcctatctgttgccgtcgccgcAAAAGGTGTTGACGGTCGTACCGTGAAGCAGAGGGAAGTTCCCCGTCGGCGCTACACGCCGATCCTCACCGTTATGAACAAACGTGACCGTGATATCCGAGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 1:557843/208‑1 (MQ=255)
tgctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 2:445492/228‑1 (MQ=255)
gttcgcgtagggTTATCGCCCCCGCAAAGGGGGGTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCCGAGCGCCACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 1:49246/217‑1 (MQ=255)
ctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTCCTCGATGAAATTGGGAACGAGCTGAAAATCGCCTGTGCGCCGATTACCTGGCGGATTGGGTGCGGCAAAAGGTTTAAAGGGGTTTaca > 1:600999/1‑226 (MQ=255)
cctgtaTGTTTTTCGACGCGGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTaccac < 1:241131/222‑1 (MQ=255)
aTCGATGCCGCAAAGGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGGTGAGGGAAGTTCCCCGTCTGGGCGGCCCGGCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGAc < 1:148189/228‑1 (MQ=255)
aTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGAGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCAGCTGTGCGCCGAGCACCTGGCTGATTGGCTGCGGCAAGCGTGTTAAAGCCCTTTa > 2:137793/1‑212 (MQ=255)
tggACCCCTCAAAAGGTGTTGAAGATCTTCCCCGTAAGCGGATGAAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACCTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACg < 2:225100/226‑1 (MQ=255)
gcctcAAAAGGTGTTGAAGCTCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAAc < 2:599114/227‑1 (MQ=255)
cgcAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCTGTTACACCCTTTTTAAAAACGAAAccat > 1:442262/1‑226 (MQ=255)
aaaGGTTGTGAAGTTCTTCCCCGTAAGGTTATGGAGATTCCCCGTCGGGCCACCCCGCCGCTCCCCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAGGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTAtctc < 1:357315/228‑1 (MQ=255)
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AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609552‑4609990
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
