Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
300 |
54.7 |
1718999 |
98.4% |
1691495 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
944,703 |
G→A |
G224D (GGT→GAT) |
dmsC → |
dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 944,703 | 0 | G | A | 98.4%
| 229.7
/ NA
| 63 | G224D (GGT→GAT) | dmsC | dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (29/33); total (29/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGGTGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCG > NC_000913/944558‑944849
|
atCGATTGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGTCACTGGTAGTGCGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTTGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATTATgcg > 1:149895/2‑150 (MQ=255)
cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCt < 2:585535/150‑1 (MQ=255)
cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCt < 1:570610/150‑1 (MQ=255)
cGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTg > 1:633294/1‑151 (MQ=255)
aTGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGAt < 2:184414/151‑1 (MQ=255)
gggCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCt < 1:690415/150‑1 (MQ=255)
cGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCg > 1:814496/1‑151 (MQ=255)
gTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGt > 2:53464/1‑151 (MQ=255)
tCTGCTTCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGGGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTg > 1:59305/1‑151 (MQ=255)
cAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGc > 1:405925/1‑151 (MQ=255)
gCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCg > 1:640224/1‑151 (MQ=255)
gCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCg > 2:5075/1‑151 (MQ=255)
aaTTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGtt < 1:354017/151‑1 (MQ=255)
tttCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTg > 1:225886/1‑150 (MQ=255)
tCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGccc > 1:469159/1‑151 (MQ=255)
gTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCtgt < 2:117917/151‑1 (MQ=255)
gTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTAAGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCt < 2:468095/149‑1 (MQ=255)
tGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCtt > 1:508831/1‑151 (MQ=255)
gttgtgagtgGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCTACTCTTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGGCTATGGTGCGCTGATGGTCTGGCGGATCTTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGAtt < 1:602952/147‑1 (MQ=255)
tAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGc > 2:598026/1‑151 (MQ=255)
gagtgGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGcacca < 1:79073/151‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAg < 1:18092/150‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGc < 2:586244/151‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGc > 1:767775/1‑151 (MQ=255)
gtggtgTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaa < 1:125421/151‑1 (MQ=255)
ggtgTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaaa > 2:661456/1‑150 (MQ=255)
gtgtCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTaaa > 2:216054/1‑149 (MQ=255)
cAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGtt < 2:802022/150‑1 (MQ=255)
gTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATc < 2:315835/151‑1 (MQ=255)
tGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGcc > 1:778320/1‑151 (MQ=255)
gCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGcc < 1:53442/150‑1 (MQ=255)
ggCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCgg > 1:65888/1‑151 (MQ=255)
gagCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGc < 2:158534/151‑1 (MQ=255)
gCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTa < 1:234938/151‑1 (MQ=255)
gACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCt < 2:237247/151‑1 (MQ=255)
tATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGt > 1:842329/1‑150 (MQ=255)
aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattca < 1:210719/151‑1 (MQ=255)
aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattc > 1:759258/1‑150 (MQ=255)
aGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattc < 2:56002/150‑1 (MQ=255)
gTTCTTTGCAGCAGGACGCAGAGCTGGTGACGGACTATGATGCGCTGGTGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGTCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattcat > 1:791950/1‑151 (MQ=255)
gTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTAtcattcat < 2:640266/151‑1 (MQ=255)
gtgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCt < 2:800683/149‑1 (MQ=255)
gtgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTg < 2:225910/150‑1 (MQ=255)
tgCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAATGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTg < 1:696840/149‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTc < 1:858111/151‑1 (MQ=255)
cagcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTc < 2:763450/151‑1 (MQ=255)
gcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTg < 2:363896/151‑1 (MQ=255)
gcagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGGTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCt > 1:251288/1‑150 (MQ=255)
cagGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTgg < 2:778584/151‑1 (MQ=255)
cGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAggg < 2:359274/151‑1 (MQ=255)
gCAGCGCTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAgggg > 1:58180/1‑151 (MQ=255)
tcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGaa > 1:709524/2‑148 (MQ=255)
gcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAAtt > 2:58865/1‑150 (MQ=255)
gcTGGTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTa < 1:30827/151‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTaa < 2:684895/149‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAAt < 2:41385/150‑1 (MQ=255)
tGCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCgg > 2:509018/1‑151 (MQ=255)
gCCGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCgg < 1:210439/150‑1 (MQ=255)
ccGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTc > 1:395383/1‑151 (MQ=255)
ccGGACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTc > 1:338441/1‑151 (MQ=255)
gACTATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTcgcg < 2:469376/151‑1 (MQ=255)
tATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg > 1:219360/1‑151 (MQ=255)
tATGATGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg > 1:712750/1‑151 (MQ=255)
atgatgCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCgcggcg < 2:759315/150‑1 (MQ=255)
|
GTCGATGGCTGGGCGATGCGTCTGCTGCCAGCAATTTCTGTACTGGCACTGGTAGTGAGTGGCGTGGTGTCAGTGATGCAGGGCGCAGAGCTGGCGACTATTCATAGTTCTGTGCAGCAGGCCGCAGCGCTGGTGCCGGACTATGGTGCGCTGATGTCCTGGCGGATCGTGCTTTTGGCCGTTGCCCTGTGCTTGTGGATTGCACCACAGCTAAAAGGTTATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCG > NC_000913/944558‑944849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
