Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,108,438 |
C→A |
noncoding (56/76 nt) |
pheV → |
tRNA‑Phe |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,108,438 | 0 | C | A | 99.8%
| 1903.3
/ NA
| 499 | noncoding (56/76 nt) | pheV | tRNA‑Phe |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (246/251); total (247/252) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
TTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAAT > NC_000913/3108344‑3108530
|
ttacgagacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCTCGCGTCCTTGGTTAGa > 1:10582024/3‑96 (MQ=17)
tgaCGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGa > 1:9687030/1‑96 (MQ=255)
acgagacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGGAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGAtt < 1:6090743/96‑1 (MQ=255)
gagacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTcc < 2:3724987/96‑1 (MQ=255)
gagacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTcc > 2:2978925/1‑96 (MQ=255)
gacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGa > 2:8499865/1‑96 (MQ=255)
acgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg < 2:7076938/96‑1 (MQ=255)
acgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg < 2:2695849/96‑1 (MQ=255)
gagGCGTATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc > 1:12825981/1‑96 (MQ=255)
gagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAggc > 1:1000017/1‑94 (MQ=255)
gagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc > 2:12841980/1‑96 (MQ=255)
gagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc > 1:5424910/1‑96 (MQ=255)
gagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGGAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTc > 2:6468231/1‑96 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTcc < 2:9742709/96‑1 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTcc > 1:196333/1‑96 (MQ=255)
ggCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCg < 1:13501433/96‑1 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg < 2:1927393/96‑1 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg > 1:5809953/1‑96 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg > 2:8793978/1‑96 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTGGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg > 2:5447230/1‑96 (MQ=255)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGc > 1:3765756/1‑96 (MQ=37)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGc > 1:8590915/1‑96 (MQ=37)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGc > 1:7803945/1‑96 (MQ=37)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGGTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGGGTCCTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGc > 2:10105279/1‑96 (MQ=11)
aTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcac < 1:7066970/96‑1 (MQ=21)
cAGGTTTACTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcacca < 2:796967/96‑1 (MQ=12)
cAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGcacca < 2:4439922/96‑1 (MQ=17)
ggTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACt > 1:2413897/1‑96 (MQ=17)
ggTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACt > 2:12325937/1‑96 (MQ=17)
ggTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACt > 2:5782588/1‑96 (MQ=17)
gTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTa > 2:2243404/1‑96 (MQ=18)
ttAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTact < 1:10799706/96‑3 (MQ=16)
tAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAtt < 1:9880370/96‑1 (MQ=255)
aTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCt < 1:1798361/96‑1 (MQ=255)
tGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCtt < 1:11553149/96‑1 (MQ=255)
ccccGTTGCCCGGGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGa > 1:10970703/1‑96 (MQ=255)
ccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGa < 2:341623/96‑1 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGaa < 2:515665/96‑1 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCACAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGaa > 2:8227634/1‑96 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAc > 2:14292677/1‑96 (MQ=255)
ccGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCca < 2:7615610/96‑1 (MQ=255)
cGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCcac < 2:4230449/96‑1 (MQ=255)
cGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCcac > 2:3087886/1‑96 (MQ=255)
cGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTAAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCcac < 2:14128634/96‑1 (MQ=255)
ggATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCcaca < 2:6588573/96‑1 (MQ=255)
gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACaa < 1:8722564/96‑1 (MQ=255)
tAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTATATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCTCCCACAAgg > 1:11957814/1‑96 (MQ=255)
tAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 2:3881886/96‑1 (MQ=255)
aacTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGCACTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGc > 1:10151700/3‑96 (MQ=18)
gCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCg < 2:14009687/96‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCgg > 2:1660416/1‑96 (MQ=255)
cAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGt < 1:4701994/96‑1 (MQ=255)
cGGTAGAGGAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGttttt > 1:12987865/1‑96 (MQ=255)
gTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGATTTTGc > 2:12946818/1‑96 (MQ=255)
tAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCt > 1:2868066/1‑96 (MQ=255)
agagCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtt > 1:6839094/1‑96 (MQ=255)
agagCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtt < 1:6640922/96‑1 (MQ=255)
agCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtttt > 1:7409324/1‑96 (MQ=255)
agCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtttt > 1:11183331/1‑96 (MQ=255)
gCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTg > 1:1478252/1‑96 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTgg > 1:8973912/1‑96 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTgg > 2:10778627/1‑96 (MQ=255)
aGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa > 2:12024459/1‑96 (MQ=255)
aGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa > 1:9227247/1‑96 (MQ=255)
aGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa > 1:44405/1‑96 (MQ=255)
aGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa > 1:1034465/1‑96 (MQ=255)
aGGGGAGTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa > 2:13707626/1‑96 (MQ=255)
ggggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAt < 1:12145471/96‑1 (MQ=255)
ggggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAt > 1:1402549/1‑96 (MQ=255)
ggATTGAAAATCCACGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCCCCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCt < 1:4339308/96‑1 (MQ=255)
gATTGTAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGCCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg < 2:2442521/96‑1 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg > 2:6126818/1‑96 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg > 1:8403801/1‑96 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg > 1:3364974/1‑96 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg < 1:11781131/96‑1 (MQ=255)
aTTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGa < 1:13364745/96‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAc < 2:11418182/96‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAc < 2:9212917/96‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACAAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAc < 2:4791312/96‑1 (MQ=255)
tGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACa > 2:1382970/1‑96 (MQ=255)
tGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACa < 1:4928538/96‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACTACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa > 1:12629674/1‑96 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa < 2:13286303/96‑1 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa > 2:2094338/1‑96 (MQ=255)
aaTCCCCGTGTTCTTGGTTAGATGCCGAGTCCGGGCACCAATAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGTTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAtta < 1:14250530/96‑3 (MQ=37)
tCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAcc > 1:6251196/1‑96 (MQ=255)
cccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCtt > 1:13650068/1‑96 (MQ=255)
cccATGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCtt > 2:12569712/1‑96 (MQ=255)
ccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTc < 1:8145751/96‑1 (MQ=255)
ccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTc < 1:2727555/96‑1 (MQ=255)
cGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCa > 2:4087150/1‑96 (MQ=255)
cGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCa < 1:3087886/96‑1 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc > 2:11011223/1‑96 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc > 2:7346696/1‑96 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc > 2:10370549/1‑96 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc > 1:4122214/1‑96 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTACGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc < 1:5616247/96‑1 (MQ=255)
tCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaa < 2:13631743/96‑1 (MQ=255)
cTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 2:11718096/1‑96 (MQ=255)
cTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa > 1:3635232/1‑96 (MQ=255)
|
TTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAAT > NC_000913/3108344‑3108530
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 284 total aligned reads displayed.
ATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTA > NC_000913/3108338‑3108537
|
ATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTA > SRR4302518.103975/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCATTGGTTCG < SRR4302518.10995586/101‑1 (MQ=55)
CTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTNNN > SRR4302518.11922600/1‑101 (MQ=60)
TTGATAGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGA < SRR4302518.3129614/101‑1 (MQ=48)
TGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGAT < SRR4302518.6348714/101‑1 (MQ=59)
NNNTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATT < SRR4302518.12848475/101‑1 (MQ=48)
GATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGGAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATT > SRR4302518.1859820/1‑101 (MQ=54)
GATAGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGGAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATT < SRR4302518.6399930/101‑1 (MQ=43)
NNNGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTC < SRR4302518.9004601/101‑1 (MQ=45)
NNNGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATCC < SRR4302518.9792851/101‑1 (MQ=45)
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTNNN > SRR4302518.10153384/1‑101 (MQ=48)
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCG > SRR4302518.2811715/1‑101 (MQ=49)
NNNGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGA < SRR4302518.7570829/101‑1 (MQ=38)
NNNGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT < SRR4302518.11406834/101‑1 (MQ=33)
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT > SRR4302518.4437800/1‑101 (MQ=42)
NNNACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTC < SRR4302518.12106825/101‑1 (MQ=31)
GTGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGANNN > SRR4302518.12243869/1‑101 (MQ=33)
GAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTC > SRR4302518.4771175/1‑101 (MQ=39)
NNNCGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCC < SRR4302518.7856122/101‑1 (MQ=29)
NNNCGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATCCCGAGTCC < SRR4302518.11001392/101‑1 (MQ=28)
AGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCC < SRR4302518.4613147/101‑1 (MQ=37)
NNNGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCG < SRR4302518.14121377/101‑1 (MQ=26)
GACGGGGCGTATCAGGTTTAATGCGCCCCCTGGGCCGGCTTGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATCGAAAATCAC‑CGAGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCG > SRR4302518.4378360/1‑101 (MQ=4)
GACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTNNN > SRR4302518.10230440/1‑101 (MQ=33)
GACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCG < SRR4302518.2934251/101‑1 (MQ=34)
GACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCG > SRR4302518.7164993/1‑101 (MQ=34)
ATGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCNNN > SRR4302518.11662420/1‑101 (MQ=26)
AGGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCNNN > SRR4302518.9855468/1‑101 (MQ=26)
ACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGG > SRR4302518.1790607/1‑101 (MQ=32)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGNNN > SRR4302518.14534854/1‑101 (MQ=26)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGNNN > SRR4302518.8093413/1‑101 (MQ=26)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC > SRR4302518.2985460/1‑101 (MQ=27)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC > SRR4302518.1419083/1‑101 (MQ=27)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC > SRR4302518.5701841/1‑101 (MQ=27)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGC > SRR4302518.1039087/1‑101 (MQ=26)
NNNAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCACGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAGAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGccatc < SRR4302518.10631552/101‑6 (MQ=8)
CGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCANNN > SRR4302518.9569444/1‑101 (MQ=14)
CGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCA > SRR4302518.6104206/1‑101 (MQ=14)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACNNN > SRR4302518.8197717/1‑101 (MQ=11)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCAC > SRR4302518.3943207/1‑101 (MQ=14)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGCCACNNN > SRR4302518.9009564/1‑101 (MQ=11)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGGTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATACC‑CGTGTACTGGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACNNN > SRR4302518.14013303/1‑101 (MQ=9)
AATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACT > SRR4302518.2180813/1‑101 (MQ=14)
ATCAGGTTTAATGCGCCGCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTACTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCCCTA < SRR4302518.6919857/101‑1 (MQ=6)
ATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTA > SRR4302518.3123138/1‑101 (MQ=14)
NNNGTTTCATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAT < SRR4302518.9651411/101‑1 (MQ=8)
NNNGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTACT < SRR4302518.11306936/101‑1 (MQ=4)
CAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTNNN > SRR4302518.11014315/1‑101 (MQ=7)
CAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTNNN > SRR4302518.9141645/1‑101 (MQ=7)
NNNTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATT < SRR4302518.10352199/101‑1 (MQ=11)
AGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTANNN > SRR4302518.8791209/1‑101 (MQ=7)
AGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTANNN > SRR4302518.9311578/1‑101 (MQ=7)
AGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAATCCGGGCACCACTAATT > SRR4302518.5010439/1‑101 (MQ=13)
AGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGGTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATT > SRR4302518.6172035/1‑101 (MQ=13)
NNNTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTT < SRR4302518.11855048/101‑1 (MQ=11)
NNNTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTC < SRR4302518.12484959/101‑1 (MQ=14)
GGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTC > SRR4302518.2530717/1‑101 (MQ=14)
NNNTAATGCGCCCCGTTGCACGGATAGCTCAGCCGGTAGAGCCGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGCCCGGGCACCACTAATTTT < SRR4302518.11608320/101‑1 (MQ=9)
GTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCT < SRR4302518.1879094/101‑1 (MQ=20)
NNNAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTT < SRR4302518.12096852/101‑1 (MQ=21)
TAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGCACCACTAATTCTNNN > SRR4302518.13382869/1‑101 (MQ=18)
TAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGCCCGGGCACCACTAATTCTTAA > SRR4302518.5732563/1‑101 (MQ=26)
AATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302518.2264072/1‑101 (MQ=29)
AATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG < SRR4302518.3258234/101‑1 (MQ=29)
AATGCGCCCCGGTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG < SRR4302518.3912414/101‑1 (MQ=28)
ATGCGCCCCGTTACCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGA < SRR4302518.7223635/101‑1 (MQ=31)
NNNCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302518.8369453/101‑1 (MQ=36)
GCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302518.202866/101‑1 (MQ=37)
NNNCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCC < SRR4302518.9783364/101‑1 (MQ=41)
GCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCC < SRR4302518.265721/101‑1 (MQ=42)
CCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCG < SRR4302518.7104234/101‑1 (MQ=44)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGC < SRR4302518.5680106/101‑1 (MQ=46)
CCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCC < SRR4302518.6780415/101‑1 (MQ=49)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGNNN > SRR4302518.11394387/1‑101 (MQ=43)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCC > SRR4302518.1472225/1‑101 (MQ=51)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGACCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCC > SRR4302518.6519707/1‑101 (MQ=49)
CGATGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATCCCGAGTCCGGGCACCCCTAATTCTTAAGAACCCGCCC < SRR4302518.3602087/101‑1 (MQ=37)
GTTGCCCGGAAAGCTCAGTCGGTAGGGCAGGGGATTGTAAATCCC‑CGGGACCTTGGTTAGATTCGGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTTAGAACCCGCCCA > SRR4302518.5430327/1‑101 (MQ=60)
TTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCAC > SRR4302518.4889357/1‑101 (MQ=56)
NNNCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACA < SRR4302518.14153935/101‑1 (MQ=57)
NNNCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAA < SRR4302518.8580196/101‑1 (MQ=60)
GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAA > SRR4302518.1157203/1‑101 (MQ=60)
nnngtATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.8826627/96‑1 (MQ=60)
NNNGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.14973922/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.11424376/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.7438360/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.12516263/101‑1 (MQ=60)
CCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACNNN > SRR4302518.15025347/1‑101 (MQ=55)
CCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.2485217/101‑1 (MQ=60)
CCCGGATAGCTCAGTCGGGAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG > SRR4302518.1961697/1‑101 (MQ=60)
CCCGAATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAG < SRR4302518.1790246/101‑1 (MQ=60)
NNNGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGT < SRR4302518.11947706/101‑1 (MQ=48)
CCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACANNN > SRR4302518.12669408/1‑101 (MQ=57)
CCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGG > SRR4302518.4029772/1‑101 (MQ=60)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATGCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAANNN > SRR4302518.13532710/1‑101 (MQ=57)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAANNN > SRR4302518.13841143/1‑101 (MQ=60)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGC < SRR4302518.5805522/101‑1 (MQ=60)
GGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGNNN > SRR4302518.7517253/1‑101 (MQ=60)
GGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGNNN > SRR4302518.10425310/1‑101 (MQ=60)
GGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCG > SRR4302518.588824/1‑101 (MQ=60)
GGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGGGTCCTTGGTTAGAGTCCGGGGCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCG > SRR4302518.6502253/1‑101 (MQ=60)
GGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGNNN > SRR4302518.14922191/1‑101 (MQ=60)
TAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTATATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCTCCCACAAGGCGNNN > SRR4302518.12528058/1‑101 (MQ=53)
TAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGT > SRR4302518.2637669/1‑101 (MQ=60)
TAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGT < SRR4302518.4949011/101‑1 (MQ=60)
AGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAATAACCCGCCCACAAGGCGGGGT > SRR4302518.3159971/1‑101 (MQ=60)
AGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTT > SRR4302518.3459135/1‑101 (MQ=60)
AACTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGCACTTGGTTAGATTCCGAGGCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGNNN > SRR4302518.10631607/1‑101 (MQ=60)
CTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGgnnn > SRR4302518.7388779/1‑97 (MQ=60)
CTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTT < SRR4302518.6305493/101‑1 (MQ=60)
TCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTT < SRR4302518.4973073/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTT < SRR4302518.13569076/101‑1 (MQ=60)
CAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTG < SRR4302518.4632712/101‑1 (MQ=60)
NNNCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGC < SRR4302518.10333428/101‑1 (MQ=60)
GTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCT > SRR4302518.5054796/1‑101 (MQ=60)
TCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTT < SRR4302518.6983515/101‑1 (MQ=60)
NNNGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTT < SRR4302518.14415674/101‑1 (MQ=60)
NNNTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT < SRR4302518.7677474/101‑1 (MQ=60)
NNNTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT < SRR4302518.10720122/101‑1 (MQ=60)
NNNTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT < SRR4302518.9161187/101‑1 (MQ=60)
NNNTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCGTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGATCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT < SRR4302518.12607776/101‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGGAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCNNN > SRR4302518.13589675/1‑101 (MQ=60)
NNNAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTT < SRR4302518.8243132/101‑1 (MQ=60)
GGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTNNN > SRR4302518.14699555/1‑101 (MQ=60)
TAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGG > SRR4302518.3003223/1‑101 (MQ=60)
TAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTACGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCGGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTNNN > SRR4302518.11300826/1‑101 (MQ=60)
TAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGGCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACTCGCCCACATGGCGGGTTTTTGCTTTNNN > SRR4302518.10593013/1‑101 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTNNN > SRR4302518.9116430/1‑101 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGA < SRR4302518.583782/101‑1 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGA > SRR4302518.7200933/1‑101 (MQ=60)
GAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGNNN > SRR4302518.12255890/1‑101 (MQ=60)
GAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAT < SRR4302518.147937/101‑1 (MQ=60)
GAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAT < SRR4302518.4054212/101‑1 (MQ=60)
AGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGNNN > SRR4302518.7792406/1‑101 (MQ=60)
AGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGNNN > SRR4302518.11706876/1‑101 (MQ=60)
NNNGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT < SRR4302518.9542281/101‑1 (MQ=60)
NNNGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT < SRR4302518.10683089/101‑1 (MQ=60)
GCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTGTGCTTTTGGANNN > SRR4302518.10949097/1‑101 (MQ=60)
NNNGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTG < SRR4302518.12338830/101‑1 (MQ=60)
CAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATNNN > SRR4302518.9407824/1‑101 (MQ=60)
CAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTG > SRR4302518.4358215/1‑101 (MQ=60)
NNNGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGA < SRR4302518.13979615/101‑1 (MQ=60)
AGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGA > SRR4302518.1075213/1‑101 (MQ=60)
AAGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCNNN > SRR4302518.11150356/1‑101 (MQ=60)
GGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAC > SRR4302518.1461123/1‑101 (MQ=60)
GGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACA < SRR4302518.5185181/101‑1 (MQ=60)
GGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAA > SRR4302518.6943544/1‑101 (MQ=60)
NNNTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAT < SRR4302518.13427376/101‑1 (MQ=60)
GATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTTGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGGACCCGGCCACAAGGAGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACNNN > SRR4302518.13325074/1‑101 (MQ=60)
GATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAT > SRR4302518.6097837/1‑101 (MQ=60)
GATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAT > SRR4302518.3521682/1‑101 (MQ=60)
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TTTAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAA < SRR4302518.1624710/101‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAANNN > SRR4302518.12791561/1‑101 (MQ=60)
NNNAAAATCCC‑CGTGTTCTTGGTTAGATGCCGAGTCCGGGCACCAATAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGTTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATTA < SRR4302518.14907500/101‑1 (MQ=60)
NNNAAAATCCC‑AGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAA < SRR4302518.14095557/101‑1 (MQ=60)
TGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTTGATCTGACAATNNN > SRR4302518.13690189/1‑101 (MQ=60)
TGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAgatcgga > SRR4302518.4564059/1‑94 (MQ=60)
GGAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACC < SRR4302518.7153804/101‑1 (MQ=60)
GAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATANNN > SRR4302518.13378465/1‑101 (MQ=60)
NNNATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCT < SRR4302518.9380623/101‑1 (MQ=60)
AAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACTACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACNNN > SRR4302518.13221133/1‑101 (MQ=60)
NNNCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTC < SRR4302518.8549542/101‑1 (MQ=60)
AATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTC > SRR4302518.348969/1‑101 (MQ=60)
AATCCC‑CGTGGCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACTAGGCGGGTCTTTGCTTTTGGATCTGACGATAACCNNN > SRR4302518.14237169/1‑101 (MQ=60)
NNNCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCA < SRR4302518.8734348/101‑1 (MQ=60)
ATCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCA < SRR4302518.3232846/101‑1 (MQ=60)
TCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC < SRR4302518.3909769/101‑1 (MQ=60)
TCCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC > SRR4302518.6569922/1‑101 (MQ=60)
NNNC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC < SRR4302518.10342859/101‑1 (MQ=60)
CCCACGTGTCCTTGGTTAGATTACGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC < SRR4302518.5901003/101‑1 (MQ=60)
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CCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG < SRR4302518.4629079/101‑1 (MQ=60)
CCC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG < SRR4302518.358803/101‑1 (MQ=60)
CC‑CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCANNN > SRR4302518.10500860/1‑101 (MQ=60)
N‑NNTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCCCCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGGCAATAACCTTCACGTA < SRR4302518.12222059/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAA < SRR4302518.13046100/101‑1 (MQ=60)
CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAA < SRR4302518.4402998/101‑1 (MQ=60)
CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAA > SRR4302518.81724/1‑101 (MQ=60)
NNNTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAA < SRR4302518.8836177/101‑1 (MQ=60)
GTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAA > SRR4302518.4322147/1‑101 (MQ=60)
CCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAANNN > SRR4302518.9104177/1‑101 (MQ=60)
CCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAAT > SRR4302518.6764761/1‑101 (MQ=60)
NNNGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGCACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT < SRR4302518.10580463/101‑1 (MQ=60)
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CTCGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTGTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > SRR4302518.5284191/1‑101 (MQ=60)
TTGGTTAGATTACGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAANNN > SRR4302518.14035545/1‑101 (MQ=60)
GGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGC > SRR4302518.6496091/1‑101 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCCCCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGAT < SRR4302518.4714031/101‑1 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCT < SRR4302518.6571266/101‑1 (MQ=60)
NNNGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACTATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTT < SRR4302518.13960753/101‑1 (MQ=60)
NNNGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTT < SRR4302518.13944360/101‑1 (MQ=60)
TAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCNNN > SRR4302518.8861582/1‑101 (MQ=60)
NNNATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTA < SRR4302518.14276418/101‑1 (MQ=60)
|
ATTTGATTGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCC‑CGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATTAGCTTA > NC_000913/3108338‑3108537
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
