Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,108,438 |
C→A |
noncoding (56/76 nt) |
pheV → |
tRNA‑Phe |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,108,438 | 0 | C | A | 100.0%
| 755.8
/ NA
| 208 | noncoding (56/76 nt) | pheV | tRNA‑Phe |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (78/130); total (78/130) |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA > NC_000913/3108348‑3108527
|
cgagacgagGCGAATCAGGTTTAATTCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTACAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGGGTCCTTGGTTAGa < 1:5991994/93‑1 (MQ=17)
gacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTc > 2:1833086/1‑93 (MQ=255)
gacgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTc > 2:2128370/1‑93 (MQ=255)
cgagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCg < 1:3199049/93‑1 (MQ=255)
gagGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGa < 2:37104/93‑1 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg < 1:4099630/93‑1 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg > 2:4415576/1‑93 (MQ=255)
agGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAg > 1:2590819/1‑93 (MQ=255)
ggCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTTCGAGt > 2:523601/1‑93 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTcc < 2:2187939/93‑1 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTcc < 1:2849563/93‑1 (MQ=255)
cGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGCCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTcc < 2:1333180/93‑1 (MQ=255)
gAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCg < 2:3236380/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGTTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATACCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 2:3173324/93‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 2:4137783/93‑1 (MQ=25)
aaTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg > 1:5608141/1‑93 (MQ=25)
aaTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAACCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCgg < 2:5946732/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCggg < 2:5533204/93‑1 (MQ=21)
tCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGc > 2:176393/1‑93 (MQ=18)
cAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGca < 2:6291092/93‑1 (MQ=17)
aGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGGTAGATTCCGAGTCCGGGcac > 1:4275671/1‑93 (MQ=9)
ttAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACt < 2:5477543/93‑1 (MQ=17)
aaTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTaa < 1:2435323/93‑1 (MQ=21)
aaTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTaa < 1:3515181/93‑1 (MQ=21)
aaTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTaa < 1:1389770/93‑1 (MQ=21)
aTGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAt < 2:4597644/93‑1 (MQ=25)
gcgcCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTc < 2:2942237/93‑1 (MQ=255)
gcCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCtt > 1:4746213/1‑93 (MQ=255)
ccccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTa < 2:1899317/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTaa < 1:2730527/93‑1 (MQ=255)
cccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTaa < 1:2902954/93‑1 (MQ=255)
ccGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAg > 1:4204406/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGa > 1:5840599/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGaa < 1:1490410/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAc > 2:3625543/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAccc < 1:6093727/93‑1 (MQ=255)
ccGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGc < 1:1411587/93‑1 (MQ=255)
ggATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGccc > 1:1704751/1‑93 (MQ=255)
gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCca > 1:4130057/1‑93 (MQ=255)
gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCca < 1:2039016/93‑1 (MQ=255)
aGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACaa < 2:611365/93‑1 (MQ=255)
gCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAg > 2:351021/1‑93 (MQ=255)
gCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAg < 2:4283229/93‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 1:5411896/93‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 2:2732596/93‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 2:4214435/93‑1 (MQ=255)
cTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAgg < 2:4794865/93‑1 (MQ=255)
cAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCg < 1:4532858/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCgg < 2:5292123/93‑1 (MQ=255)
aGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCgg < 1:4807504/93‑1 (MQ=255)
gTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCggg > 2:630503/1‑93 (MQ=255)
tCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGt < 1:5031221/93‑1 (MQ=255)
cGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGtt < 1:4415576/93‑1 (MQ=255)
gTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGtttt < 2:3912862/93‑1 (MQ=255)
agCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCAAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCt < 1:6188597/93‑1 (MQ=255)
agCAGGAGAATAAAAATCCCCGTGTACTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACAAATTCTTAAGATCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCt < 1:6303235/93‑1 (MQ=21)
gCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtt > 1:19607/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCttt > 1:1268203/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCttt > 1:5376473/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCttt < 2:3062565/93‑1 (MQ=255)
cgcggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCtttt < 1:2959499/90‑1 (MQ=255)
gggATTGAAAATCCCCGCGTCCTTGGGTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGACCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTgg > 2:6013733/1‑93 (MQ=25)
ggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa < 2:1557821/93‑1 (MQ=255)
ggATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGa < 1:2112510/93‑1 (MQ=255)
gATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAt < 1:6271911/93‑1 (MQ=255)
aTTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATc < 2:4923584/93‑1 (MQ=255)
aTTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATc < 2:4331188/93‑1 (MQ=255)
tGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTg < 2:6184729/93‑1 (MQ=255)
gAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGa > 2:6243968/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACa > 1:399353/1‑93 (MQ=255)
aTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAATGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAt > 1:692350/1‑93 (MQ=255)
aTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAt < 2:5180887/93‑1 (MQ=255)
aTCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAt < 1:850511/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa < 1:713468/93‑1 (MQ=255)
tCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATa < 1:1016359/93‑1 (MQ=255)
ccccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATaa < 1:5641749/93‑1 (MQ=255)
ccccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATaa < 2:148839/93‑1 (MQ=255)
ccccGTGTCCGTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAGCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATaa < 1:521360/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAc < 1:1227308/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAc < 1:1804466/93‑1 (MQ=255)
cGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCt > 2:6028840/1‑93 (MQ=255)
cGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCt > 1:3251752/1‑93 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCtt < 1:2482151/93‑1 (MQ=255)
gtgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCtt > 1:5519230/1‑93 (MQ=255)
tgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTc < 2:2556092/93‑1 (MQ=255)
tgtCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTc > 2:169160/1‑93 (MQ=255)
tCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc < 1:373023/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCTCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc > 1:3611177/1‑93 (MQ=255)
tCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc < 2:3382606/93‑1 (MQ=255)
tCCTTGGTGAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAc < 2:5325280/93‑1 (MQ=255)
ccTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACg < 1:3415774/93‑1 (MQ=255)
cTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGa > 2:791590/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGa < 2:2472806/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaa < 1:5267181/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaa > 1:254652/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaa > 2:5096721/1‑93 (MQ=255)
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGATCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa < 1:3217304/93‑1 (MQ=255)
ggTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaa < 1:354932/93‑1 (MQ=255)
gTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaaa < 1:3663550/93‑1 (MQ=255)
gTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGaaaaa > 2:1075304/1‑93 (MQ=255)
|
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA > NC_000913/3108348‑3108527
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > NC_000913/3108345‑3108531
|
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTA < SRR4302533.972896/94‑1 (MQ=52)
GACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAG < SRR4302533.2357265/94‑1 (MQ=49)
GACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAG > SRR4302533.200031/1‑94 (MQ=49)
ACGAGACGAGGCGAATCATGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGA < SRR4302533.3396649/94‑1 (MQ=34)
ACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGA > SRR4302533.91436/1‑94 (MQ=46)
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATTCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTACAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGGGTCCTTGGTTAGAT < SRR4302533.6028291/94‑1 (MQ=38)
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGAT < SRR4302533.3159165/94‑1 (MQ=43)
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGAT < SRR4302533.2893663/94‑1 (MQ=43)
CGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGAT > SRR4302533.347973/1‑94 (MQ=43)
GAGANGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATT < SRR4302533.5276631/94‑1 (MQ=35)
ACGAGGCGAATCACGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCG < SRR4302533.3622431/94‑1 (MQ=22)
CGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGA < SRR4302533.3218734/94‑1 (MQ=30)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAG < SRR4302533.6332238/94‑1 (MQ=28)
GAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAG > SRR4302533.2606741/1‑94 (MQ=28)
AGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT < SRR4302533.4124581/94‑1 (MQ=25)
AGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGT > SRR4302533.4946874/1‑94 (MQ=25)
CGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCG < SRR4302533.2867096/94‑1 (MQ=15)
CGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGACTCCGAGTCCG > SRR4302533.5881182/1‑94 (MQ=14)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGG > SRR4302533.5642029/1‑94 (MQ=12)
GAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGG > SRR4302533.3126965/1‑94 (MQ=12)
AATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGG < SRR4302533.5669489/94‑1 (MQ=10)
ATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGC < SRR4302533.1767116/94‑1 (MQ=7)
CAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGGTAGATTCCGAGTCCGGGCAC > SRR4302533.4301390/1‑94 (MQ=2)
GGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCA > SRR4302533.5631319/1‑94 (MQ=0)
TTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACT > SRR4302533.3815449/1‑94 (MQ=2)
AATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAT < SRR4302533.3536846/94‑1 (MQ=10)
AATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAT < SRR4302533.1398141/94‑1 (MQ=10)
AATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAAT < SRR4302533.2450364/94‑1 (MQ=10)
CGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTT > SRR4302533.4774991/1‑94 (MQ=23)
CGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAACCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTT > SRR4302533.3698037/1‑94 (MQ=22)
CCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAA < SRR4302533.5640517/94‑1 (MQ=28)
CCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAA < SRR4302533.1922113/94‑1 (MQ=28)
CCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAA < SRR4302533.2661242/94‑1 (MQ=28)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG < SRR4302533.2747278/94‑1 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302533.4229840/1‑94 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302533.815439/1‑94 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG < SRR4302533.2920784/94‑1 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302533.4256122/1‑94 (MQ=30)
CCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAG > SRR4302533.6038651/1‑94 (MQ=30)
CCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGA > SRR4302533.5875913/1‑94 (MQ=33)
CCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGA > SRR4302533.5977334/1‑94 (MQ=33)
CGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAA < SRR4302533.2798283/94‑1 (MQ=35)
GTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302533.1252583/94‑1 (MQ=38)
GTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAAC < SRR4302533.1499397/94‑1 (MQ=38)
GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCG < SRR4302533.2936280/94‑1 (MQ=45)
GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCG < SRR4302533.6130547/94‑1 (MQ=45)
CCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCC > SRR4302533.3268781/1‑94 (MQ=50)
CCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCC < SRR4302533.1420121/94‑1 (MQ=50)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCC > SRR4302533.3223623/1‑94 (MQ=53)
CGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCC > SRR4302533.1715076/1‑94 (MQ=53)
GGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCA > SRR4302533.4155127/1‑94 (MQ=55)
GATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCAC < SRR4302533.2051591/94‑1 (MQ=58)
ATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACA > SRR4302533.110851/1‑94 (MQ=60)
GCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGG < SRR4302533.4122595/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGC < SRR4302533.706164/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGC < SRR4302533.5444438/94‑1 (MQ=60)
CAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGG < SRR4302533.4560303/94‑1 (MQ=60)
AGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGG < SRR4302533.4836611/94‑1 (MQ=60)
AGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGG < SRR4302533.5873762/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTT < SRR4302533.5061685/94‑1 (MQ=60)
TCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTT < SRR4302533.1992273/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCGGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302533.2068003/94‑1 (MQ=60)
CGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTT < SRR4302533.4442241/94‑1 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGC > SRR4302533.4549102/1‑94 (MQ=60)
AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGC < SRR4302533.2556085/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTT > SRR4302533.19740/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCAAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTT > SRR4302533.4582082/1‑94 (MQ=60)
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AGCAGGAGAATAAAAATCCCCGTGTACTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACAAATTCTTAAGATCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTT < SRR4302533.6340907/94‑1 (MQ=59)
GCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT > SRR4302533.5408785/1‑94 (MQ=60)
GCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTT > SRR4302533.1275794/1‑94 (MQ=60)
cgcGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTG < SRR4302533.2977588/91‑1 (MQ=60)
AGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTG < SRR4302533.4417416/94‑1 (MQ=60)
AGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTG > SRR4302533.4137869/1‑94 (MQ=60)
GGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGG > SRR4302533.6278583/1‑94 (MQ=60)
GGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGG > SRR4302533.4790564/1‑94 (MQ=60)
GGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGAT < SRR4302533.2125542/94‑1 (MQ=60)
GATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATC < SRR4302533.6309374/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT < SRR4302533.5424513/94‑1 (MQ=60)
ATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT > SRR4302533.4188829/1‑94 (MQ=60)
ATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACACGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCT > SRR4302533.676593/1‑94 (MQ=60)
TTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTG < SRR4302533.5063688/94‑1 (MQ=60)
GAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGAC > SRR4302533.3558752/1‑94 (MQ=60)
AAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACA > SRR4302533.401765/1‑94 (MQ=60)
AAAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACA < SRR4302533.2569818/94‑1 (MQ=60)
AAATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAA > SRR4302533.2461055/1‑94 (MQ=60)
AATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAATGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAAT > SRR4302533.696439/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATA < SRR4302533.855490/94‑1 (MQ=60)
ATCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATA > SRR4302533.5310926/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAA < SRR4302533.717678/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAA < SRR4302533.1585595/94‑1 (MQ=60)
TCCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAA < SRR4302533.1022333/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAC < SRR4302533.6195933/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAC < SRR4302533.5675848/94‑1 (MQ=60)
CCCCGTGTCCGTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAGCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAAC < SRR4302533.524452/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACC < SRR4302533.1815450/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACC < SRR4302533.1234657/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCT > SRR4302533.3271802/1‑94 (MQ=60)
CGTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTT > SRR4302533.5552555/1‑94 (MQ=60)
GTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTC > SRR4302533.4925977/1‑94 (MQ=60)
GTGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTC < SRR4302533.2497456/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCA < SRR4302533.4009399/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCTCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC > SRR4302533.3633403/1‑94 (MQ=60)
GTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC < SRR4302533.2258546/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCAC > SRR4302533.1384529/1‑94 (MQ=60)
TCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGACCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG < SRR4302533.375276/94‑1 (MQ=60)
TCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG > SRR4302533.3353182/1‑94 (MQ=60)
TCCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACG < SRR4302533.1418559/94‑1 (MQ=60)
CCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGA > SRR4302533.1496888/1‑94 (MQ=60)
CCTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGA < SRR4302533.3436879/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAA > SRR4302533.2086772/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAA > SRR4302533.256213/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAA < SRR4302533.365015/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAA < SRR4302533.5298784/94‑1 (MQ=60)
GGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGATCCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA < SRR4302533.3237143/94‑1 (MQ=60)
GGTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAA < SRR4302533.357095/94‑1 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA < SRR4302533.5514948/94‑1 (MQ=60)
GTTAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAA < SRR4302533.3686071/94‑1 (MQ=60)
TAGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAAT > SRR4302533.4652934/1‑94 (MQ=60)
AGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > SRR4302533.1403361/1‑94 (MQ=60)
AGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGGTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > SRR4302533.5333731/1‑94 (MQ=60)
|
TGACGAGACGAGGCGAATCAGGTTTAATGCGCCCCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTAATTCTTAAGAACCCGCCCACAAGGCGGGTTTTTGCTTTTGGATCTGACAATAACCTTCACGAAAAAAATT > NC_000913/3108345‑3108531
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
