Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
433,551 |
G→T |
100% |
S14Y (TCC→TAC) |
yajO ← |
2‑carboxybenzaldehyde reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 433,551 | 0 | G | T | 97.5%
| 823.8
/ 10.1
| 243 | S14Y (TCC→TAC) | yajO | 2‑carboxybenzaldehyde reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/2); new base T (116/121); total (120/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTT > CP009273/433406‑433697
|
aGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAc < 2:1619108/150‑1 (MQ=255)
aGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAc < 2:1738051/150‑1 (MQ=255)
aGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAc < 2:2880812/150‑1 (MQ=255)
gAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAATGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcg > 1:1631008/1‑150 (MQ=255)
aaTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgc > 2:247319/1‑150 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgcg > 2:1758822/1‑150 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgcg > 1:2865546/1‑150 (MQ=255)
aaCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGaa > 1:788830/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAg < 2:778641/150‑1 (MQ=255)
ggCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGt > 2:1470501/1‑150 (MQ=255)
gCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtt < 2:4256267/150‑1 (MQ=255)
gCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtt > 1:1732641/1‑150 (MQ=255)
cGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGttt < 2:849273/150‑1 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtttt > 1:4325392/1‑150 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtttt > 2:1536605/1‑150 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtttt > 2:485522/1‑150 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtttt < 1:1665593/150‑1 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGtttt < 2:2246242/150‑1 (MQ=255)
cAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTa > 2:2630671/1‑150 (MQ=255)
cAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTa < 1:834406/150‑1 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTaa > 2:4635500/1‑150 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTaa > 2:2078645/1‑150 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTaa > 2:2987494/1‑150 (MQ=255)
tATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTa < 1:468385/150‑1 (MQ=255)
tATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTa < 1:653494/150‑1 (MQ=255)
tATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTa > 1:2028878/1‑150 (MQ=255)
aTGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTAt < 1:1792112/150‑1 (MQ=255)
gccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAt < 1:1378728/150‑1 (MQ=255)
ccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtg < 2:719921/150‑1 (MQ=255)
cTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgc > 1:219346/1‑150 (MQ=255)
tCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgctg < 2:3212774/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGcc > 1:12284/1‑150 (MQ=255)
aCGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCt < 1:1097428/150‑1 (MQ=255)
cGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTg < 2:4458563/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCta < 1:3277266/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCta < 2:2970154/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCta > 2:4098392/1‑150 (MQ=255)
aaTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtata > 2:1443937/1‑150 (MQ=255)
aaTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtata < 2:2764399/150‑1 (MQ=255)
aaTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtata < 2:1298386/150‑1 (MQ=255)
aTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATAc > 1:3402913/1‑150 (MQ=255)
aTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATAc < 1:2354849/150‑1 (MQ=255)
tGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACACCTGCTATACTCGt > 1:3517024/1‑150 (MQ=255)
gggACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTc < 2:3654139/150‑1 (MQ=255)
gggACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTc > 1:496081/1‑150 (MQ=255)
gACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCAt < 2:3773004/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATa < 1:3647782/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATa < 1:4590592/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATAc > 2:3185106/1‑150 (MQ=255)
cGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATAc > 2:4274895/1‑150 (MQ=255)
ctgctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 2:3519750/1‑150 (MQ=255)
ctgcaTTCTTACGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGTCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTACCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 2:1406887/1‑150 (MQ=255)
tgctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCa > 1:2230359/1‑150 (MQ=255)
tgctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCa < 1:305977/150‑1 (MQ=255)
gctTTCTTCAGGCAGTGTCAATTCGTGATTACCGCGATCTTGATCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGTTAAACGCGTAGGTCGGTTTTTCCTTAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCaa < 2:4032176/150‑1 (MQ=255)
tttCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGt > 2:2393980/1‑150 (MQ=255)
tttCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGACATACTTCAAGt < 1:293848/150‑1 (MQ=255)
ttcttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGtt < 1:2732660/150‑1 (MQ=255)
ttcttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGtt < 2:4621318/150‑1 (MQ=255)
ttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCa > 1:282452/1‑150 (MQ=255)
ttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCa > 1:2002921/1‑150 (MQ=255)
tcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCAt < 2:1385407/150‑1 (MQ=255)
ccGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCAtg < 1:3473728/150‑1 (MQ=255)
ccGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCAtg < 1:919630/150‑1 (MQ=255)
gCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgc < 2:1208655/150‑1 (MQ=255)
cAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgct < 2:4371702/150‑1 (MQ=255)
cAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgct > 2:92488/1‑150 (MQ=255)
tCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGc < 1:1801702/150‑1 (MQ=255)
cATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTg > 2:2551076/1‑150 (MQ=255)
tACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCa < 2:2270790/150‑1 (MQ=255)
aCCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCAc > 2:2867827/1‑150 (MQ=255)
aCCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGGTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCAc > 2:2634642/1‑150 (MQ=255)
gATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAg > 1:4093307/1‑150 (MQ=255)
gATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAg > 1:4093574/1‑150 (MQ=255)
ggCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCact < 2:613355/150‑1 (MQ=255)
ggCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCact > 2:1840765/1‑150 (MQ=255)
ggCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCact < 1:1470501/150‑1 (MQ=255)
gCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCactt < 2:1872318/150‑1 (MQ=255)
gCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCactt < 2:3145299/150‑1 (MQ=255)
cGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCacttact < 1:471859/150‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCacttactt > 1:2916631/1‑150 (MQ=255)
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aaaGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATg > 1:4213526/1‑150 (MQ=255)
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TTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTT < SRR19973072.2738489/150‑1 (MQ=60)
TCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTG < SRR19973072.3414459/150‑1 (MQ=60)
TTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCA > SRR19973072.283113/1‑150 (MQ=60)
TTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCA > SRR19973072.2007232/1‑150 (MQ=60)
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TTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCA < SRR19973072.2755003/150‑1 (MQ=60)
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TCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCAT < SRR19973072.1762667/150‑1 (MQ=60)
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CCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATG < SRR19973072.921628/150‑1 (MQ=60)
CCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATG < SRR19973072.3480988/150‑1 (MQ=60)
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ACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCAC > SRR19973072.87074/1‑150 (MQ=60)
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GCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTT > SRR19973072.2922878/1‑150 (MQ=60)
CCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTA > SRR19973072.3866092/1‑150 (MQ=60)
AAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATG > SRR19973072.4222325/1‑150 (MQ=60)
AAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGT > SRR19973072.3582887/1‑150 (MQ=60)
TCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGC < SRR19973072.1056034/150‑1 (MQ=60)
CATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCT < SRR19973072.4427856/150‑1 (MQ=60)
ATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTC < SRR19973072.245578/150‑1 (MQ=60)
ATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTC < SRR19973072.247917/150‑1 (MQ=60)
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TACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCC > SRR19973072.1639542/1‑150 (MQ=60)
TACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCC < SRR19973072.130094/150‑1 (MQ=60)
TACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCC > SRR19973072.3212099/1‑150 (MQ=60)
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AAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACT < SRR19973072.2568620/150‑1 (MQ=60)
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AGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCG > SRR19973072.4278239/1‑150 (MQ=60)
CGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTT < SRR19973072.3956059/150‑1 (MQ=60)
GTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGC > SRR19973072.2586102/1‑150 (MQ=60)
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GTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGC > CP009273/433403‑433699
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
