Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
433,551 |
G→T |
100% |
S14Y (TCC→TAC) |
yajO ← |
2‑carboxybenzaldehyde reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 433,551 | 0 | G | T | 100.0%
| 858.2
/ NA
| 255 | S14Y (TCC→TAC) | yajO | 2‑carboxybenzaldehyde reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (138/117); total (138/117) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
AGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTT > CP009273/433406‑433696
|
gAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAc > 2:1146755/1‑149 (MQ=255)
aaTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcg > 2:2065182/1‑149 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgc < 2:2260071/149‑1 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgc < 2:2218479/149‑1 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgc < 2:3225481/149‑1 (MQ=255)
aTAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAAcgc > 1:1522754/1‑149 (MQ=255)
aaCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGa > 1:624863/1‑149 (MQ=255)
aaCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGa > 1:1903810/1‑149 (MQ=255)
aaCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGa < 2:1300679/149‑1 (MQ=255)
aCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGaa > 2:1114899/1‑149 (MQ=255)
aCTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGaa > 1:1415869/1‑149 (MQ=255)
gTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGt < 1:3902944/149‑1 (MQ=255)
gTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGt < 1:3415827/149‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTc > 1:2430875/1‑149 (MQ=255)
ttGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTc > 2:3913215/1‑149 (MQ=255)
ggCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCgg < 2:3190137/149‑1 (MQ=255)
ggCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCgg < 2:803309/149‑1 (MQ=255)
gCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGt < 1:3284144/149‑1 (MQ=255)
ggTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGttt < 2:325893/149‑1 (MQ=255)
tATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCCGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTACACGCGAAGGTCGGttttt > 1:145393/1‑149 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTa > 1:3997480/1‑149 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTa > 2:3023107/1‑149 (MQ=255)
aaaGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTa > 2:454375/1‑149 (MQ=255)
aGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAg > 2:3095487/1‑149 (MQ=255)
aGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAg > 1:2538563/1‑149 (MQ=255)
aGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAg > 2:3085235/1‑149 (MQ=255)
gAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAgg < 2:3741676/149‑1 (MQ=255)
aaaTTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAggg < 2:749428/149‑1 (MQ=255)
aaTTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAgggg < 1:2511783/149‑1 (MQ=255)
aTTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGt > 1:2385087/1‑149 (MQ=255)
tttATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGtt < 1:1727131/149‑1 (MQ=255)
tATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGt < 1:4089492/149‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACAGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTAt < 2:212900/149‑1 (MQ=255)
gccgccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTAtt < 2:1760728/149‑1 (MQ=255)
cgccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGc > 1:1611101/1‑149 (MQ=255)
cgccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGc < 2:2345121/149‑1 (MQ=255)
gccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCa < 1:1617554/149‑1 (MQ=255)
gccTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCa > 2:1147589/1‑149 (MQ=255)
ttCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgc > 1:3555781/1‑149 (MQ=255)
ttCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgc > 1:2957491/1‑149 (MQ=255)
cAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCAtgctgc > 2:610355/1‑149 (MQ=255)
gCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACt > 1:2975843/1‑149 (MQ=255)
cACGTTTAATTCTGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTc < 1:818462/149‑1 (MQ=255)
aCGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTcc > 1:913843/1‑149 (MQ=255)
aTTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCtata > 1:3333499/1‑149 (MQ=255)
ttATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATAc < 1:2349575/149‑1 (MQ=255)
ttATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATAc < 2:3816410/149‑1 (MQ=255)
gggACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGt < 1:3956893/149‑1 (MQ=255)
ggACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTc > 1:166650/1‑149 (MQ=255)
ggACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTc < 1:2865354/149‑1 (MQ=255)
gACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCa < 1:3571736/149‑1 (MQ=255)
gACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATAATCGTCa > 2:946674/1‑149 (MQ=255)
tgctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 2:398607/1‑149 (MQ=255)
tgctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 2:1560807/1‑149 (MQ=255)
ngctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTc > 1:2021640/2‑149 (MQ=255)
tcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCa < 1:3334924/149‑1 (MQ=255)
tcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCa < 1:1103704/149‑1 (MQ=255)
cAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgc < 2:2485179/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctg > 2:2773940/1‑149 (MQ=255)
gtgtCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctg < 1:1560807/149‑1 (MQ=255)
tgtCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctgc > 1:941892/1‑149 (MQ=255)
tCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCgg > 1:1044035/1‑149 (MQ=255)
ccATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGc < 2:1780623/149‑1 (MQ=255)
ccATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGc < 1:733231/149‑1 (MQ=255)
aTGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTg > 1:1336443/1‑149 (MQ=255)
gTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCAtt > 2:2660705/1‑149 (MQ=255)
ttACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGtt > 1:2520976/1‑149 (MQ=255)
aCCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCa > 1:1269471/1‑149 (MQ=255)
aCCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCa < 1:3023107/149‑1 (MQ=255)
gcgATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCAccc < 1:2800143/149‑1 (MQ=255)
gATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCAGTCGTTCACCCCa > 2:190568/1‑149 (MQ=255)
tGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCa < 2:3088228/149‑1 (MQ=255)
tGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCa > 1:3853383/1‑149 (MQ=255)
ggCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCac > 2:3859645/1‑149 (MQ=255)
ggCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCac > 2:3465180/1‑149 (MQ=255)
tCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCactta < 1:1146823/149‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCacttact > 2:142496/1‑149 (MQ=255)
cAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCActtactta > 1:2761264/1‑149 (MQ=255)
aaaGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTAt > 1:1337036/1‑149 (MQ=255)
aGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGt > 2:3610538/1‑149 (MQ=255)
ggTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTa > 1:3813/1‑149 (MQ=255)
aTACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCt > 1:3951113/1‑149 (MQ=255)
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tACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTc < 2:2430875/149‑1 (MQ=255)
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AATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATA > SRR19973068.3353839/1‑150 (MQ=60)
AATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATA > SRR19973068.3024356/1‑150 (MQ=60)
AATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATA > SRR19973068.3353478/1‑150 (MQ=60)
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GGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTC > SRR19973068.168020/1‑150 (MQ=60)
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TTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTT < SRR19973068.1797563/150‑1 (MQ=60)
CTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGC > SRR19973068.431164/1‑150 (MQ=60)
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TCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCAT < SRR19973068.1111052/150‑1 (MQ=60)
AGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTG > SRR19973068.327411/1‑150 (MQ=60)
GTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGC < SRR19973068.401392/150‑1 (MQ=60)
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CATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTG > SRR19973068.1345087/1‑150 (MQ=60)
CGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATT < SRR19973068.3936893/150‑1 (MQ=60)
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ATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTT > SRR19973068.2537014/1‑150 (MQ=60)
ATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTT > SRR19973068.2537011/1‑150 (MQ=60)
TACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCA > SRR19973068.1278253/1‑150 (MQ=60)
TACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCA > SRR19973068.2194576/1‑150 (MQ=60)
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ACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCAC < SRR19973068.3041709/150‑1 (MQ=60)
GCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCC < SRR19973068.2817529/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCA > SRR19973068.1265314/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCA > SRR19973068.3876652/1‑150 (MQ=60)
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CCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTA > SRR19973068.2778245/1‑150 (MQ=60)
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CAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTAT > SRR19973068.1345683/1‑150 (MQ=60)
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CAAAGTCGGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCAC > SRR19973068.4127935/1‑150 (MQ=60)
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GGTAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTG > SRR19973068.3475498/1‑150 (MQ=60)
TAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCC < SRR19973068.3245849/150‑1 (MQ=60)
TAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCC < SRR19973068.3245652/150‑1 (MQ=60)
|
CGTCAGAATAACTGTTGGCGGTATCAAAGAAATTTATGCCGCCTTCCAGTGCACGTTTAATTATGGGACGGCTGCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCC > CP009273/433402‑433700
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
