Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F54 I0 R1
|
640 |
319.5 |
10493376 |
95.3% |
10000187 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,587,029:1 |
+G |
63.7% |
coding (101/699 nt) |
ypfH ← |
palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,587,029 | 1 | . | G | 63.7%
| 745.1
/ inf
| 306 | coding (101/699 nt) | ypfH | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (61/50); new base G (105/90); total (166/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.05e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
GATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT > CP009273/2586881‑2587178
|
gATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑tttg > 1:3004297/1‑149 (MQ=255)
tCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gcc < 2:3850948/150‑1 (MQ=255)
gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gcccc > 1:3590661/1‑150 (MQ=255)
cATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑tttgacccc > 2:1858522/1‑144 (MQ=255)
cATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gccccc > 2:4700770/1‑149 (MQ=255)
aTCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gccccca > 2:2921819/1‑148 (MQ=255)
aTCCACACGCGCCTGGCGAGTATCTTCCGTAAGACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCAt < 2:2260214/150‑1 (MQ=255)
tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAt > 1:410348/1‑150 (MQ=255)
tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCAtt < 1:1102454/150‑1 (MQ=255)
ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAtt < 2:3779853/150‑1 (MQ=255)
ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAtt < 1:209845/150‑1 (MQ=255)
tcgcgGCTGGCGATGATCTTCCGTAATACCCGGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCTCGCCACCGACACTCACCAACAGCGCATCTGGTAACTGCGTTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGcct < 2:1672923/149‑2 (MQ=255)
tGGCGATTATCTTACTTAATACCCTGCTCCGTAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCTCCGACACTCACCACCATCGGATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGtt < 1:2813689/150‑1 (MQ=255)
gCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTAt < 2:4394889/150‑1 (MQ=255)
gCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATc < 2:2616854/150‑1 (MQ=255)
cGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATc > 2:549731/1‑150 (MQ=255)
gATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATccc < 2:2567447/150‑1 (MQ=255)
aTTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATccc < 1:2031053/150‑1 (MQ=255)
tATCTTCCGTAAGACCCGGCACCGCAAACCACCGCCGCCCCGCCGGATTACCGCGCGGCTCCGCGCCACCGACACTCCCCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCg < 2:321198/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 2:2971603/1‑150 (MQ=255)
cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 2:2214215/1‑150 (MQ=255)
ttCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGAcccc > 2:4245887/1‑150 (MQ=255)
ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCg > 1:4857815/1‑150 (MQ=255)
ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCg > 1:994672/1‑150 (MQ=255)
cGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGt > 1:2307514/1‑150 (MQ=255)
cGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg < 2:1373177/150‑1 (MQ=255)
gTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTgg < 2:4482200/150‑1 (MQ=255)
aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGa > 1:2662148/1‑150 (MQ=255)
aTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaa > 1:660189/1‑150 (MQ=255)
gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:1381707/1‑150 (MQ=255)
gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:4165274/1‑150 (MQ=255)
ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac > 2:4755037/1‑150 (MQ=255)
ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac < 1:3132144/150‑1 (MQ=255)
ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGGTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac > 2:2152303/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa > 1:2949955/1‑150 (MQ=255)
aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaac > 1:915845/1‑150 (MQ=255)
aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACt < 2:2774797/150‑1 (MQ=255)
aaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAATGCAGTAACAACt > 1:403837/1‑150 (MQ=255)
aaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTg > 1:1526081/1‑150 (MQ=255)
aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGt < 2:337586/150‑1 (MQ=255)
aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGtt > 1:1205174/1‑150 (MQ=255)
ccACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGtt < 1:2159094/150‑1 (MQ=255)
ccACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGAGGAAAAGCAGTAACAACTGtt > 1:3472329/1‑150 (MQ=255)
cACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTg > 1:508780/1‑150 (MQ=255)
gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGt > 1:2628455/1‑150 (MQ=255)
gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACAACGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGt > 2:2867672/1‑150 (MQ=255)
gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGtt > 2:315212/1‑150 (MQ=255)
cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt < 2:1972473/150‑1 (MQ=255)
cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt < 1:1805998/150‑1 (MQ=255)
ccgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt < 2:4658807/150‑1 (MQ=255)
cgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt > 1:4648259/1‑150 (MQ=255)
cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCg > 1:1442708/1‑150 (MQ=255)
cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCgg < 1:4189897/150‑1 (MQ=255)
gATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg > 1:3827666/1‑150 (MQ=255)
tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:4681195/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:4023333/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:462144/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 1:5156889/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCAACAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCAACCGGGTTATCCCCGACACCGTGTAAAAGCAGTAACAACTGTTCCGCAGCTTTATCCGGGCta > 2:1834719/1‑149 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt > 1:4515585/1‑150 (MQ=255)
gCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaa > 2:711559/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaaca > 2:2363982/1‑150 (MQ=255)
cGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaacaa > 2:4285470/1‑150 (MQ=255)
cGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaacaac > 1:3713412/1‑150 (MQ=255)
gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGt > 1:571179/1‑150 (MQ=255)
aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCGGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:4234649/150‑1 (MQ=255)
aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:814068/150‑1 (MQ=255)
aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:3437463/150‑1 (MQ=255)
gACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAGTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGtt < 2:36033/150‑1 (MQ=255)
gACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt < 1:2432967/150‑1 (MQ=255)
acacTCACCACCAGCGCATCAGGAATCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt < 2:2045958/150‑1 (MQ=255)
cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATg < 2:4992772/150‑1 (MQ=255)
tCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATg < 2:2126388/150‑1 (MQ=255)
caccacCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc < 2:3159468/150‑1 (MQ=255)
caacaccaGATCATCAGTAAACAGCGGTTCAAACCATTTGCATA‑TTTGCCCCAATTTCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATgg < 2:4529973/147‑1 (MQ=255)
caccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGa > 1:4425407/1‑150 (MQ=255)
caGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGTCACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACt < 2:410355/150‑1 (MQ=255)
caGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACt > 2:3901453/1‑150 (MQ=255)
gcgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTcc < 2:4323435/150‑1 (MQ=255)
cgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCtt > 1:972445/1‑150 (MQ=255)
gcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCtt < 2:3459090/150‑1 (MQ=255)
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CACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTG > SRR19973056.3785462/1‑150 (MQ=60)
CACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTG > SRR19973056.509476/1‑150 (MQ=60)
GCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGT > SRR19973056.2631855/1‑150 (MQ=60)
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GATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGG > SRR19973056.3832728/1‑150 (MQ=60)
TTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCT < SRR19973056.142960/150‑1 (MQ=60)
TACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTT < SRR19973056.5163750/150‑1 (MQ=60)
TACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTT < SRR19973056.5163727/150‑1 (MQ=60)
ACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTT > SRR19973056.4521542/1‑150 (MQ=60)
CTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAAC < SRR19973056.3155730/150‑1 (MQ=60)
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ACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAA > SRR19973056.2170123/1‑150 (MQ=60)
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CGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTT > SRR19973056.973639/1‑150 (MQ=60)
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TG‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAA > SRR19973056.890048/1‑150 (MQ=60)
TG‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAA > SRR19973056.890053/1‑150 (MQ=60)
TG‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAA > SRR19973056.890033/1‑150 (MQ=60)
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GATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑T‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAA > CP009273/2586881‑2587177
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |