Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,587,029:1 |
+G |
86.4% |
coding (101/699 nt) |
ypfH ← |
palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,587,029 | 1 | . | G | 86.4%
| 937.5
/ 158.1
| 273 | coding (101/699 nt) | ypfH | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (19/18); new base G (117/119); total (136/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.61e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TGATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT > CP009273/2586880‑2587178
|
tGATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAtt‑t < 1:2249591/150‑1 (MQ=255)
gATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAtt‑tg < 1:1806534/150‑2 (MQ=255)
tCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑gcc > 1:1831393/1‑150 (MQ=255)
ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCAtt < 2:1849275/150‑1 (MQ=255)
ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCAtt < 2:3101327/150‑1 (MQ=255)
cacaCGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTg > 2:1431051/1‑150 (MQ=255)
cacGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGcc < 1:3781993/150‑1 (MQ=255)
cgcCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCg > 1:4179284/1‑150 (MQ=255)
cgcCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCg < 2:774038/150‑1 (MQ=255)
tGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGtt > 1:2034046/1‑150 (MQ=255)
tGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGtt > 2:2360109/1‑150 (MQ=255)
ggCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTa > 2:4275256/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 1:1608179/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa < 2:2804365/150‑1 (MQ=255)
cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGaca < 1:3160982/150‑1 (MQ=255)
cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac < 1:2543000/150‑1 (MQ=255)
ttCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 2:3176210/1‑150 (MQ=255)
tCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACAcc > 1:3822453/1‑150 (MQ=255)
ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCg < 2:4241292/150‑1 (MQ=255)
cGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGt > 1:418357/1‑150 (MQ=255)
tAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTgg < 2:1696323/150‑1 (MQ=255)
aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGa > 2:3967955/1‑150 (MQ=255)
aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGa < 1:3365245/150‑1 (MQ=255)
aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaa < 1:4410235/150‑1 (MQ=255)
tACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaaa > 1:302144/1‑150 (MQ=255)
ccTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGc < 1:4022577/150‑1 (MQ=255)
cTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCa < 1:1148287/150‑1 (MQ=255)
gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt < 1:4363838/150‑1 (MQ=255)
aCCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaa < 2:2767632/150‑1 (MQ=255)
aCCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaa < 2:3342215/150‑1 (MQ=255)
gAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa < 1:2810128/150‑1 (MQ=255)
aaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTCACAACt > 2:4343605/1‑150 (MQ=255)
aaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACt < 1:2340743/150‑1 (MQ=255)
aCCACTGCCGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGt < 1:963593/150‑1 (MQ=255)
cACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTg > 1:4317946/1‑150 (MQ=255)
aCTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgc < 2:873326/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcg > 2:2866969/1‑150 (MQ=255)
tGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcgc > 2:4229229/1‑150 (MQ=255)
tGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcgc > 2:1570606/1‑150 (MQ=255)
tGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCACATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCa < 1:1393801/150‑1 (MQ=255)
gACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCa < 1:892210/150‑1 (MQ=255)
aCGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAg < 1:640474/150‑1 (MQ=255)
ccccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGACACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGtt > 1:1962817/1‑150 (MQ=255)
ccccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt > 2:2096369/1‑150 (MQ=255)
cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt > 1:2690553/1‑150 (MQ=255)
ccgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTa > 2:3415733/1‑150 (MQ=255)
cgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt > 1:543075/1‑150 (MQ=255)
gATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGc > 2:115892/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTCACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt > 1:4273100/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 2:3407664/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 2:1120833/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTg < 1:3445243/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGGTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 2:3175510/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCCCCCGCGCATCCGGACACAGCGGTGCACCCCAGGTGCCTATTGG‑CCCCCCTTGCCACCGGGTGATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGGAACAACTGGTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTg < 2:1781788/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTg < 1:1443759/150‑1 (MQ=255)
cGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaa < 1:1277824/150‑1 (MQ=255)
cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaac > 2:4104762/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaaca > 2:2462286/1‑150 (MQ=255)
ccGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACaaaa < 1:2160772/150‑1 (MQ=255)
cgcgCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCTTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAAt < 2:2205987/150‑1 (MQ=255)
cgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATgg > 1:332888/1‑150 (MQ=255)
gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGt < 1:3663939/150‑1 (MQ=255)
gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGt < 1:4465118/150‑1 (MQ=255)
cGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGt < 2:3478559/150‑1 (MQ=255)
cGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGt < 2:18126/150‑1 (MQ=255)
cGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGt > 2:458564/1‑150 (MQ=255)
acacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt < 1:4160644/150‑1 (MQ=255)
acacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt > 2:1017601/1‑150 (MQ=255)
acacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt > 2:2928270/1‑150 (MQ=255)
acacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTc > 1:844529/1‑150 (MQ=255)
cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt < 1:4229548/150‑1 (MQ=255)
cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt < 1:3877209/150‑1 (MQ=255)
accaccAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc < 1:2434843/150‑1 (MQ=255)
accaccAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc < 1:2747622/150‑1 (MQ=255)
caccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGa > 1:3793857/1‑150 (MQ=255)
aGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTc > 1:732046/1‑150 (MQ=255)
cgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCt > 2:4093822/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTaa < 1:2574109/150‑1 (MQ=255)
aGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTg < 1:1930529/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGt > 2:1619700/1‑150 (MQ=255)
aaCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATT‑TGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGt > 2:1679039/1‑150 (MQ=255)
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CGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGG > SRR19973080.4532375/1‑150 (MQ=60)
CGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGG > SRR19973080.4390663/1‑150 (MQ=60)
CCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGACACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTT > SRR19973080.1973948/1‑150 (MQ=60)
CCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTT > SRR19973080.1973957/1‑150 (MQ=60)
CCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTT > SRR19973080.2705257/1‑150 (MQ=60)
CCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTT < SRR19973080.4056416/150‑1 (MQ=60)
CCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTT > SRR19973080.1501710/1‑150 (MQ=60)
CGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAT > SRR19973080.546534/1‑150 (MQ=60)
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CGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCG < SRR19973080.418679/150‑1 (MQ=60)
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GGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGG > SRR19973080.694847/1‑150 (MQ=60)
TTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCT > SRR19973080.2207126/1‑150 (MQ=60)
TTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCT < SRR19973080.2582982/150‑1 (MQ=60)
TTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCT < SRR19973080.3224740/150‑1 (MQ=60)
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ACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTG < SRR19973080.3464059/150‑1 (MQ=60)
CCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTG > SRR19973080.2738302/1‑150 (MQ=60)
CCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTG < SRR19973080.1452166/150‑1 (MQ=60)
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GCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGT < SRR19973080.4489204/150‑1 (MQ=60)
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TGCCT‑ATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTG > SRR19973080.2715662/1‑150 (MQ=60)
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ATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCAC > SRR19973080.4542630/1‑150 (MQ=60)
TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGTTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCAC < SRR19973080.874023/150‑1 (MQ=60)
TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCAC < SRR19973080.874008/150‑1 (MQ=60)
T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT < SRR19973080.1042880/150‑1 (MQ=60)
T‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT < SRR19973080.1042849/150‑1 (MQ=60)
G‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT < SRR19973080.3694481/150‑1 (MQ=60)
G‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT < SRR19973080.3964363/150‑1 (MQ=60)
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TGATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCT‑ATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT > CP009273/2586880‑2587178
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |