Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,168,795 |
C→A |
93.3% |
D336Y (GAT→TAT) |
gatZ ← |
D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,168,795 | 0 | C | A | 93.3%
| 951.0
/ 53.7
| 309 | D336Y (GAT→TAT) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/14); new base A (134/153); total (141/168) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
TTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG > CP009273/2168647‑2168941
|
ggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTa > 2:3202522/1‑150 (MQ=255)
aaGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaa < 1:2428998/150‑1 (MQ=255)
aGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaaa < 1:1029298/150‑1 (MQ=255)
aGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaaa < 2:4478235/150‑1 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc < 1:4345929/150‑1 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc > 1:1539462/1‑150 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc > 1:3846921/1‑150 (MQ=255)
aCTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCg > 1:2384235/1‑150 (MQ=255)
tGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTa > 2:769146/1‑150 (MQ=255)
gACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTAc > 1:518321/1‑150 (MQ=255)
cTAATAATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGa < 2:4088460/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataa > 1:2056319/1‑150 (MQ=255)
tCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataat < 2:3903064/150‑1 (MQ=255)
aTGCCCAGTGGGATGTCCACTCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAatat < 1:402265/150‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtt < 1:310385/150‑1 (MQ=255)
gCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATAttt < 2:4429756/150‑1 (MQ=255)
cccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttt > 2:1645633/1‑150 (MQ=255)
cccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttt < 2:1793203/150‑1 (MQ=255)
aGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 2:4278890/1‑150 (MQ=255)
aGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 1:5036373/1‑150 (MQ=255)
gTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTcc < 2:4611985/150‑1 (MQ=255)
tGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCa < 1:901574/150‑1 (MQ=255)
gggATGTCCACGCATTCAAGATTAACCATCATCGTTTCGAAGCTATTTTTAATCAGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATGCGACAGGGTTTAACGATTATCCAGTTATGAATAGTTAAAACCCTTACGATAATATTTTTTCCAg < 2:1114435/150‑1 (MQ=255)
tGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAtt < 2:1782651/150‑1 (MQ=255)
tGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAtt < 2:197316/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGt > 2:2685911/1‑150 (MQ=255)
ccTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcg < 1:4814025/150‑1 (MQ=255)
ttCTAGATTCACCTTCATCGTTTCGTCGCTATTTTTTATCCGACTATGCGTACAGTAATAACGAATACTTTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCATTAATTATTTGTTAATTCCCGTACGTTAATTTTTTTTCCAGTATAGCGGTtcgtc < 1:1487233/150‑1 (MQ=255)
cAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGa < 2:898547/150‑1 (MQ=255)
aGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGc < 1:2873810/150‑1 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa > 2:2797212/1‑150 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa > 2:813422/1‑150 (MQ=255)
cACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCAAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCAc < 1:3169350/150‑1 (MQ=255)
aCCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCAct > 2:1291416/1‑150 (MQ=255)
catcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACttcttc > 1:1917697/1‑150 (MQ=255)
atcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCa > 1:16018/1‑150 (MQ=255)
atcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCa > 1:15991/1‑150 (MQ=255)
gTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAtt > 2:2519997/1‑150 (MQ=255)
gTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAtt > 2:3673335/1‑150 (MQ=255)
tCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAcc < 1:221272/150‑1 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg < 1:1733472/150‑1 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg < 1:4518841/150‑1 (MQ=255)
cGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCa < 1:1104011/150‑1 (MQ=255)
cGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCa < 1:4569258/150‑1 (MQ=255)
ttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAc < 2:1013780/150‑1 (MQ=255)
tttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAcc < 2:2024514/150‑1 (MQ=255)
tAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGc < 1:3241526/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTACTGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCt < 2:3852208/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCt > 1:2587600/1‑150 (MQ=255)
aTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTg > 2:1195705/1‑150 (MQ=255)
tCCGACTATGCGGACAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGc < 1:352010/150‑1 (MQ=255)
cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGa > 2:1903025/1‑150 (MQ=255)
gACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAt > 1:1430317/1‑150 (MQ=255)
gACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAt > 2:3223450/1‑150 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 1:3396836/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 2:3116120/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 1:2840145/150‑1 (MQ=255)
tATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtttt < 2:4544446/150‑1 (MQ=255)
tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCa > 1:597435/1‑150 (MQ=255)
ccAGTAATAACGAAAACGATCCGACAGGCTGTAACGAATAACCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTATTTCCAGTATTGCGGAACGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGc > 2:1483651/1‑150 (MQ=255)
aGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGa > 1:509647/1‑150 (MQ=255)
aGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGa > 2:624010/1‑150 (MQ=255)
taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGt > 1:343342/1‑150 (MQ=255)
aCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTc > 2:2831911/1‑150 (MQ=255)
cGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTcc > 1:2082471/1‑150 (MQ=255)
cGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTcc < 2:705259/150‑1 (MQ=255)
tACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCt < 1:1835687/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 2:2915713/150‑1 (MQ=255)
gATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCaa > 1:1655638/1‑150 (MQ=255)
gATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCaa < 2:3467670/150‑1 (MQ=255)
aTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAt > 2:4799829/1‑150 (MQ=255)
aTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAt > 2:5073862/1‑150 (MQ=255)
tCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAtt < 2:2238929/150‑1 (MQ=255)
cGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtg < 1:4918842/150‑1 (MQ=255)
gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgt > 1:2474880/1‑150 (MQ=255)
cAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGc > 2:3061998/1‑150 (MQ=255)
ggCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCa < 1:822493/150‑1 (MQ=255)
cTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGt < 2:2953737/150‑1 (MQ=255)
gTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATACGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGc > 2:4060741/1‑150 (MQ=255)
gTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGc < 2:892448/150‑1 (MQ=255)
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tAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTCCGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCa < 1:1715039/150‑1 (MQ=255)
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TTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAC > SRR19973077.5135023/1‑150 (MQ=60)
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ATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATC > SRR19973077.2906624/1‑150 (MQ=60)
ATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATC > SRR19973077.2906367/1‑150 (MQ=60)
ATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATC > SRR19973077.2906345/1‑150 (MQ=60)
TATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCG > SRR19973077.788779/1‑150 (MQ=60)
TATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCG < SRR19973077.3032053/150‑1 (MQ=60)
TATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATAACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCG > SRR19973077.788758/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGC > SRR19973077.451670/1‑150 (MQ=60)
TCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCC > SRR19973077.4030698/1‑150 (MQ=60)
CCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCT < SRR19973077.3325486/150‑1 (MQ=60)
CCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCT < SRR19973077.2600417/150‑1 (MQ=60)
CCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCT < SRR19973077.3325497/150‑1 (MQ=60)
CAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTC > SRR19973077.1725421/1‑150 (MQ=60)
CAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTC > SRR19973077.1728040/1‑150 (MQ=60)
AATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGT > SRR19973077.3150768/1‑150 (MQ=60)
AATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGT < SRR19973077.3707868/150‑1 (MQ=60)
AATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCACGCGT > SRR19973077.3151132/1‑150 (MQ=60)
ATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTA < SRR19973077.421339/150‑1 (MQ=60)
GAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAA > SRR19973077.4345325/1‑150 (MQ=60)
AATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG > SRR19973077.866751/1‑150 (MQ=60)
AATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG < SRR19973077.3037268/150‑1 (MQ=60)
AATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG < SRR19973077.1794550/150‑1 (MQ=60)
AATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG < SRR19973077.1794785/150‑1 (MQ=60)
TAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCA < SRR19973077.4471739/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA > SRR19973077.5058295/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA < SRR19973077.1211747/150‑1 (MQ=60)
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TTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA > CP009273/2168646‑2168944
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
