Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,168,795 |
C→A |
100% |
D336Y (GAT→TAT) |
gatZ ← |
D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,168,795 | 0 | C | A | 97.4%
| 782.0
/ 8.5
| 233 | D336Y (GAT→TAT) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/3); new base A (120/107); total (123/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG > CP009273/2168650‑2168941
|
aaGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaa > 2:1240115/1‑150 (MQ=255)
aaGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaa > 1:4064044/1‑150 (MQ=255)
aGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGTATGTACACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACTCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaaa > 2:1169717/1‑150 (MQ=255)
aGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaaa > 2:450928/1‑150 (MQ=255)
aGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaaa < 2:4007694/150‑1 (MQ=255)
aTACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAcc > 1:1479151/1‑150 (MQ=255)
gACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTAc < 1:905338/150‑1 (MQ=255)
gACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTAc > 1:3228833/1‑150 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGat < 2:2290736/150‑1 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGat > 2:3055819/1‑150 (MQ=255)
aaTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGata < 1:95897/150‑1 (MQ=255)
aaTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGata > 1:741543/1‑150 (MQ=255)
tCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataat < 2:1084061/150‑1 (MQ=255)
cATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataata < 1:2989612/150‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtt < 1:2872168/150‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtt < 1:3098954/150‑1 (MQ=255)
gCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACAATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAttt < 1:509029/150‑1 (MQ=255)
cAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttttt > 2:1664957/1‑150 (MQ=255)
cAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttttt > 2:624249/1‑150 (MQ=255)
cAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttttt > 1:2801958/1‑150 (MQ=255)
aGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 1:3901791/1‑150 (MQ=255)
gTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTcc < 1:3471958/150‑1 (MQ=255)
gATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTa > 1:3030894/1‑150 (MQ=255)
aTGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAt > 2:3395898/1‑150 (MQ=255)
tGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAtt < 1:60311/150‑1 (MQ=255)
gTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTg > 1:1075665/1‑150 (MQ=255)
tCCAAGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGc > 2:1418836/1‑150 (MQ=255)
ccACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCg < 2:326039/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGt < 1:2235826/150‑1 (MQ=255)
cGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGtt < 2:3790818/150‑1 (MQ=255)
gCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtc > 1:3038912/1‑150 (MQ=255)
gCCTTCAAGAGTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtc < 2:2869624/150‑1 (MQ=255)
ccTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcg > 2:394085/1‑150 (MQ=255)
cTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgt > 1:1591123/1‑150 (MQ=255)
cTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgt < 1:1409985/150‑1 (MQ=255)
ttCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtc < 1:241869/150‑1 (MQ=255)
cAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGa > 1:566012/1‑150 (MQ=255)
aaGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAg > 1:3523821/1‑150 (MQ=255)
aaGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGAGAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAg > 2:2584144/1‑150 (MQ=255)
aGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGc > 1:613915/1‑150 (MQ=255)
aGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGAATATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGTTTCGTCGAGc > 1:771943/1‑150 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa > 1:2592875/1‑150 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa > 1:1953823/1‑150 (MQ=255)
catcatCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAAGAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtc < 2:4008824/150‑1 (MQ=255)
catcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACttcttc > 1:3818158/1‑150 (MQ=255)
tcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCaa < 1:809410/150‑1 (MQ=255)
gTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAtt < 2:2886834/150‑1 (MQ=255)
tttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTa < 2:1282264/150‑1 (MQ=255)
tttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTa < 2:3785342/150‑1 (MQ=255)
tCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAcc > 1:1161385/1‑150 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg > 1:2731373/1‑150 (MQ=255)
gACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGc > 2:2625156/1‑150 (MQ=255)
gACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGc > 1:1933198/1‑150 (MQ=255)
gCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAg < 1:1296295/150‑1 (MQ=255)
ttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAc > 1:2652737/1‑150 (MQ=255)
tttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAcc > 2:784151/1‑150 (MQ=255)
ttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCg > 2:2185014/1‑150 (MQ=255)
aTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTg > 2:2917502/1‑150 (MQ=255)
gACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCATCCGCTGCGAt < 2:3742004/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGTCCAGTAATAAAGAATAAGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCTAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 2:2367362/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt > 1:1726604/1‑150 (MQ=255)
aTGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTc < 2:3070779/150‑1 (MQ=255)
aTGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTc > 2:1864696/1‑150 (MQ=255)
tgaggCTAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCATTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCa < 1:3602060/147‑1 (MQ=255)
cAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCg > 2:1830956/1‑150 (MQ=255)
taataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATa < 2:2133204/150‑1 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 2:2160475/1‑150 (MQ=255)
taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGt < 2:3995062/150‑1 (MQ=255)
taaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGt < 1:470507/150‑1 (MQ=255)
aaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGtt > 1:2931912/1‑150 (MQ=255)
gAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCt < 1:63933/150‑1 (MQ=255)
tACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCt > 2:4169299/1‑150 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 2:1557111/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 2:1017849/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 2:3109446/150‑1 (MQ=255)
aTCCGATAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAt < 1:3353163/150‑1 (MQ=255)
tCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAtt < 1:397904/150‑1 (MQ=255)
gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgt < 1:1433246/150‑1 (MQ=255)
gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgt > 1:416157/1‑150 (MQ=255)
aCAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgtg < 1:2103499/150‑1 (MQ=255)
tGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTg < 2:3505688/150‑1 (MQ=255)
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tGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTg < 2:2044517/150‑1 (MQ=255)
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|
GGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA > CP009273/2168650‑2168944
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
