Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,168,795 |
C→A |
88.7% |
D336Y (GAT→TAT) |
gatZ ← |
D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,168,795 | 0 | C | A | 88.7%
| 618.1
/ 64.9
| 223 | D336Y (GAT→TAT) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/10); new base A (103/94); total (119/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG > CP009273/2168648‑2168941
|
ggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTa > 1:3473848/1‑150 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc > 2:2030800/1‑150 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc < 1:3557851/150‑1 (MQ=255)
aCTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCg > 2:478911/1‑150 (MQ=255)
cTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAAAATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGt > 2:606756/1‑150 (MQ=255)
gACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTAc < 2:2877200/150‑1 (MQ=255)
cTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGa > 2:3487351/1‑150 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGat < 1:3594017/150‑1 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGat < 2:1315790/150‑1 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTACGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACTATCCGACAGGCTGTAACGAATATCAAGTAATGAATAGTTAAAACACGAACGat > 1:903386/1‑150 (MQ=255)
aaTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGata < 2:2972896/150‑1 (MQ=255)
aaTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGata < 2:6463/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGataa < 2:1126902/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataa < 1:2383044/150‑1 (MQ=255)
aTGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAatat > 1:244446/1‑150 (MQ=255)
aTGCCCAGTGGGATGACCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAatat < 2:3564208/150‑1 (MQ=255)
tGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtt < 2:1325580/150‑1 (MQ=255)
cccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttt < 2:2299233/150‑1 (MQ=255)
ccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAttttt < 2:789685/150‑1 (MQ=255)
cAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttttt < 2:2846663/150‑1 (MQ=255)
tGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCa > 2:3517631/1‑150 (MQ=255)
tGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCa > 1:1904595/1‑150 (MQ=255)
aTGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAt < 2:3179178/150‑1 (MQ=255)
aTGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAt < 2:1424378/150‑1 (MQ=255)
tGTCCACGCCTTCAAGATTCACCAGCATCGTATCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGAAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGAACGATAATATTTTTTCCAGTAtt > 2:1161900/1‑150 (MQ=255)
cACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCgg > 1:516492/1‑150 (MQ=255)
cACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCgg > 1:2518597/1‑150 (MQ=255)
aCGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGt < 1:1449944/150‑1 (MQ=255)
cGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGtt < 1:1749220/150‑1 (MQ=255)
ccTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcg > 2:3328031/1‑150 (MQ=255)
cTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgt < 2:2750082/150‑1 (MQ=255)
cTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgt > 2:3039493/1‑150 (MQ=255)
ttCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGGACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtc > 1:2568734/1‑150 (MQ=255)
tCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtcg > 1:2630570/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCa > 2:569166/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCa > 1:2654243/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCa < 1:467103/150‑1 (MQ=255)
tCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCa > 2:1225345/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCa > 2:2739851/1‑150 (MQ=255)
aCCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCAct < 1:2016476/150‑1 (MQ=255)
ccATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActt < 1:218301/150‑1 (MQ=255)
catcatCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGACTAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtc > 1:2776449/1‑150 (MQ=255)
catcatCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtc > 2:2459705/1‑150 (MQ=255)
atcatcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtct < 1:2628393/150‑1 (MQ=255)
atcatcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtct > 2:68780/1‑150 (MQ=255)
atcatcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCActtct > 2:2797809/1‑150 (MQ=255)
tcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCaa > 1:2043156/1‑150 (MQ=255)
cGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAt > 2:1957419/1‑150 (MQ=255)
tttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTa < 1:829253/150‑1 (MQ=255)
ttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAc < 2:3365236/150‑1 (MQ=255)
ttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAc < 1:2299936/150‑1 (MQ=255)
ttCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAc > 1:737605/1‑150 (MQ=255)
gACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGc > 2:3686456/1‑150 (MQ=255)
gACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGc > 2:3918594/1‑150 (MQ=255)
cGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCa < 2:2126096/150‑1 (MQ=255)
ccGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCg > 1:379604/1‑150 (MQ=255)
cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGa > 2:31928/1‑150 (MQ=255)
cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGa > 2:2053245/1‑150 (MQ=255)
cTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAttt > 2:2156303/1‑150 (MQ=255)
cTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTAACGCCAGGCAACCGCTGCGAttt > 2:2694225/1‑150 (MQ=255)
tATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtttt > 1:988039/1‑150 (MQ=255)
tATGAGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCTTCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtttt < 1:3526279/150‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAgg < 2:1007009/150‑1 (MQ=255)
ggCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAggg < 1:3299642/150‑1 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 1:1495769/1‑150 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 1:4341856/1‑150 (MQ=255)
aaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGtt > 2:2625293/1‑150 (MQ=255)
aaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGtt < 1:2934669/150‑1 (MQ=255)
gAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCt < 1:3959507/150‑1 (MQ=255)
gAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCt > 1:2616865/1‑150 (MQ=255)
aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTg < 2:2393217/150‑1 (MQ=255)
aTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAt < 2:12564/150‑1 (MQ=255)
aTCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAt < 2:1521167/150‑1 (MQ=255)
tCCGACAGGATGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTAAAAACCCGTACGATAATATTATTTACAGTATTTCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACAGCCAGGCAACCGCAGCGAGTTACATGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAtt > 2:3740908/1‑150 (MQ=255)
gACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgt < 2:1452478/150‑1 (MQ=255)
aCAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgtg > 2:1843105/1‑150 (MQ=255)
aCAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTtgtg < 2:67704/150‑1 (MQ=255)
cAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGCTTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGc > 2:4215515/1‑150 (MQ=255)
cAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGc < 2:1229152/150‑1 (MQ=255)
aGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGcc < 1:1039190/150‑1 (MQ=255)
cTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGt > 2:1694752/1‑150 (MQ=255)
tAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCa > 1:4232040/1‑150 (MQ=255)
tAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCa > 1:4231824/1‑150 (MQ=255)
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ACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATT > SRR19973079.2639372/1‑150 (MQ=60)
TATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTT < SRR19973079.3543977/150‑1 (MQ=60)
TATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTT > SRR19973079.993631/1‑150 (MQ=60)
TATGAGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCTTCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTT < SRR19973079.3544378/150‑1 (MQ=60)
GGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGG < SRR19973079.3316443/150‑1 (MQ=60)
AATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAA > SRR19973079.1503999/1‑150 (MQ=60)
AATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAA > SRR19973079.4363639/1‑150 (MQ=60)
ATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAG < SRR19973079.2575420/150‑1 (MQ=60)
AACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTT < SRR19973079.2949672/150‑1 (MQ=60)
GAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCT < SRR19973079.3979443/150‑1 (MQ=60)
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TAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCA > SRR19973079.4253488/1‑150 (MQ=60)
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AATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAG > SRR19973079.3264006/1‑150 (MQ=60)
ATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGC < SRR19973079.938452/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA < SRR19973079.2061404/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA < SRR19973079.4257635/150‑1 (MQ=60)
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TTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAA > CP009273/2168646‑2168944
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
