Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,168,795 |
C→A |
90.8% |
D336Y (GAT→TAT) |
gatZ ← |
D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,168,795 | 0 | C | A | 90.8%
| 733.4
/ 65.2
| 262 | D336Y (GAT→TAT) | gatZ | D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (13/11); new base A (115/123); total (128/134) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTA > CP009273/2168648‑2168938
|
gggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGtt < 1:3771505/150‑1 (MQ=255)
gggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGtt > 2:2890498/1‑150 (MQ=255)
gggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGtt > 2:68618/1‑150 (MQ=255)
gggAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGtt < 2:319728/150‑1 (MQ=255)
gAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaa < 2:4430021/150‑1 (MQ=255)
aaGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTaaa > 2:3893735/1‑150 (MQ=255)
aTACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAcc > 1:2116092/1‑150 (MQ=255)
tACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAAccc < 2:2976811/150‑1 (MQ=255)
cTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGt > 2:2436655/1‑150 (MQ=255)
tGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTa > 2:3942307/1‑150 (MQ=255)
aCTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACg > 1:3781945/1‑150 (MQ=255)
aCTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACg < 2:1948798/150‑1 (MQ=255)
tAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGat > 2:976232/1‑150 (MQ=255)
cATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGataata < 1:1071314/150‑1 (MQ=255)
aTGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAatat < 1:4296078/150‑1 (MQ=255)
gCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAttt > 2:2522158/1‑150 (MQ=255)
gCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCAAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAttt < 2:798564/150‑1 (MQ=255)
cccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttt > 1:2456619/1‑150 (MQ=255)
cccAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATAtttt < 1:3226781/150‑1 (MQ=255)
aGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 2:857091/1‑150 (MQ=255)
aGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTGAAAACCCGTACGATAATATTTTTTc > 2:930/1‑150 (MQ=255)
gTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTcc > 1:4495407/1‑150 (MQ=255)
gtgATGTCCACGCCTTCAAGAGTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAg < 2:4108217/148‑1 (MQ=255)
aTGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAt < 1:740418/150‑1 (MQ=255)
tGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTAtt < 1:1521107/150‑1 (MQ=255)
gCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtc < 1:4343977/150‑1 (MQ=255)
cTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgt > 2:2065434/1‑150 (MQ=255)
ttCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtc < 1:2005359/150‑1 (MQ=255)
tCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTtcgtcg < 2:2011595/150‑1 (MQ=255)
cAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGa < 1:4166886/150‑1 (MQ=255)
aaGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAg < 1:3718444/150‑1 (MQ=255)
aGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGc > 2:3259909/1‑150 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa < 1:3482010/150‑1 (MQ=255)
gATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCa < 1:1289120/150‑1 (MQ=255)
aTTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCAt > 2:748875/1‑150 (MQ=255)
catcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACttcttc < 1:3259909/150‑1 (MQ=255)
catcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACttcttc < 1:3259897/150‑1 (MQ=255)
catcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGAATTGCGGTTCGTCGAGCATCACttcttc > 2:1446568/1‑150 (MQ=255)
atcGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCa < 1:2687101/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAt < 1:2914932/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATACAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTCTTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAAt > 2:2934459/1‑150 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg < 1:1513648/150‑1 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg > 2:3562700/1‑150 (MQ=255)
cGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCg < 2:1451977/150‑1 (MQ=255)
aCGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGcc > 1:1009637/1‑150 (MQ=255)
cGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCa < 1:4196422/150‑1 (MQ=255)
cGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTATTCAATTACCGCCa < 1:4534286/150‑1 (MQ=255)
gCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAg > 1:2501867/1‑150 (MQ=255)
gCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAg > 2:3449571/1‑150 (MQ=255)
gCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAg > 2:3449704/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCa < 1:3715100/150‑1 (MQ=255)
ttttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAc < 1:3315860/150‑1 (MQ=255)
tttAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAAcc < 2:31492/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCt > 2:3715409/1‑150 (MQ=255)
aTCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTg < 1:3298885/150‑1 (MQ=255)
cGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGa > 1:4386635/1‑150 (MQ=255)
gACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAt < 1:2060945/150‑1 (MQ=255)
gACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAt < 1:3174230/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 1:236846/150‑1 (MQ=255)
aCTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtt < 1:3374277/150‑1 (MQ=255)
cTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAttt < 1:953395/150‑1 (MQ=255)
tATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtttt > 1:1069038/1‑150 (MQ=255)
tATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGAtttt < 1:990972/150‑1 (MQ=255)
tGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCa > 2:3969896/1‑150 (MQ=255)
gCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATTATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAg < 1:79500/150‑1 (MQ=255)
cGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAgg > 1:705524/1‑150 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 2:653277/1‑150 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 2:653186/1‑150 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa > 1:2319837/1‑150 (MQ=255)
aataaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATaa < 1:166874/150‑1 (MQ=255)
aaCGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGTTAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATGACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGtt < 1:2930335/150‑1 (MQ=255)
gAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGAAAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCt < 1:2924700/150‑1 (MQ=255)
aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTg > 2:4285555/1‑150 (MQ=255)
aaTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTg > 2:3299485/1‑150 (MQ=255)
aTACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGc < 2:2358294/150‑1 (MQ=255)
aCGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTc < 2:377861/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa > 1:3306641/1‑150 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 1:494845/150‑1 (MQ=255)
cGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCa < 2:1140969/150‑1 (MQ=255)
tCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAtt < 1:3893735/150‑1 (MQ=255)
ccGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAAttt < 2:1148038/150‑1 (MQ=255)
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gTAACGAATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGc > 1:1352583/1‑150 (MQ=255)
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ATATCCAGTAATGAATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATC < SRR19973076.2182033/150‑1 (MQ=60)
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ATAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGC < SRR19973076.1184951/150‑1 (MQ=60)
TAGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCA > SRR19973076.2812702/1‑150 (MQ=60)
|
TGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCA > CP009273/2168648‑2168943
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
