Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,017,285 |
G→T |
100% |
D871Y (GAC→TAC) |
xdhD → |
putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,017,285 | 0 | G | T | 96.7%
| 895.0
/ 16.1
| 272 | D871Y (GAC→TAC) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/4); new base T (146/117); total (151/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
AACACGCGTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCGGT > CP009273/3017138‑3017431
|
aaCACGCGTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTAc > 1:1078501/1‑150 (MQ=255)
acacGCGTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACg < 2:2987550/150‑1 (MQ=255)
acGCGTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGcc < 1:3189874/150‑1 (MQ=255)
gcgTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGa > 2:418258/1‑150 (MQ=255)
gcgTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGa < 1:3878067/150‑1 (MQ=255)
gcgTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGa < 1:557899/150‑1 (MQ=255)
gcgTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGa < 2:3400344/150‑1 (MQ=255)
cgTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGaa < 2:2911670/150‑1 (MQ=255)
gggTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCa > 1:319377/1‑150 (MQ=255)
gTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCAcc > 1:3759749/1‑150 (MQ=255)
tGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCAccc < 2:4436884/150‑1 (MQ=255)
tGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCAccc < 1:2059153/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCCTTGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGtt < 2:417400/150‑1 (MQ=255)
ccTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAAcgcg > 2:3723966/1‑150 (MQ=255)
cTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGt > 2:2158589/1‑150 (MQ=255)
gATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGAt > 2:3990576/1‑150 (MQ=255)
tAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGAttt > 2:3715417/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTa > 2:3431410/1‑150 (MQ=255)
ttCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGc < 1:1027447/150‑1 (MQ=255)
cTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGACACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAg > 2:762699/1‑150 (MQ=255)
tACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGt > 2:3513923/1‑150 (MQ=255)
aCGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGtt > 1:291993/1‑150 (MQ=255)
aCGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGtt > 1:1539738/1‑150 (MQ=255)
cGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTa > 2:2021099/1‑150 (MQ=255)
cGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTa < 1:2673792/150‑1 (MQ=255)
gCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTAc < 2:1354154/150‑1 (MQ=255)
ccTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACg > 2:1728264/1‑150 (MQ=255)
ccTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACg < 2:3436135/150‑1 (MQ=255)
ccTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACg > 2:368645/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGgc > 1:4292573/1‑150 (MQ=255)
cTGGACTGCGGTACACCGGTAAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCa > 2:2120271/1‑150 (MQ=255)
tGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCAc > 2:871265/1‑150 (MQ=255)
ggACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCAcc > 1:4035259/1‑150 (MQ=255)
ggACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCAcc > 1:1133003/1‑150 (MQ=255)
gACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCg > 2:1172262/1‑150 (MQ=255)
gACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCg < 1:8175/150‑1 (MQ=255)
gACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTCGGACAACTCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGACGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACCCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCg < 2:1934343/150‑1 (MQ=255)
gACAGCGGTACCCCGGTCACACCAGAGATAGCGTTGGGCCAAAGCTACGCTGCCACCCTGCGAGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAACAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCg < 2:1811203/150‑1 (MQ=255)
aCTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGa > 1:846348/1‑150 (MQ=255)
cGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAAt > 2:3274307/1‑150 (MQ=255)
ggTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAAtt > 1:3821264/1‑150 (MQ=255)
ggTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAAtt > 1:3821374/1‑150 (MQ=255)
ggTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAAtt > 1:525496/1‑150 (MQ=255)
gTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTg < 1:2002485/150‑1 (MQ=255)
acacCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGt > 2:1381051/1‑150 (MQ=255)
acacCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGt < 1:4212370/150‑1 (MQ=255)
acacCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGt > 2:2288709/1‑150 (MQ=255)
agagTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGa > 2:536579/1‑150 (MQ=255)
gTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGAttt > 1:606148/1‑150 (MQ=255)
ttAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTc > 2:2699240/1‑150 (MQ=255)
ttAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTc > 2:4500632/1‑150 (MQ=255)
tAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTcc < 1:3472166/150‑1 (MQ=255)
aGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCcg < 1:3114854/150‑1 (MQ=255)
cGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCcgcg < 2:2922398/150‑1 (MQ=255)
tGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCtg < 2:4420748/150‑1 (MQ=255)
ggACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCtgtg > 1:1272088/1‑150 (MQ=255)
cAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTg > 1:273421/1‑150 (MQ=255)
aaaTCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTgg > 2:2625224/1‑150 (MQ=255)
aTCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTg > 2:962151/1‑150 (MQ=255)
aTCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTg < 1:1746314/150‑1 (MQ=255)
aTCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTg < 1:624461/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGa < 1:1607871/150‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGa < 2:2011086/150‑1 (MQ=255)
cGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAATTTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAg > 1:1739987/1‑150 (MQ=255)
gCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGcgac < 1:4020851/150‑1 (MQ=255)
ccACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGcgacg < 1:2414777/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATaa > 2:2907069/1‑150 (MQ=255)
cTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATaaa > 1:396890/1‑150 (MQ=255)
cTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATaaa > 1:1630064/1‑150 (MQ=255)
tGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAg > 2:1608321/1‑150 (MQ=255)
gTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCg < 1:368645/150‑1 (MQ=255)
tATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGccc > 1:3166291/1‑150 (MQ=255)
aTCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCg < 1:3723946/150‑1 (MQ=255)
cGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGtt > 1:2288118/1‑150 (MQ=255)
ggCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTc > 1:177257/1‑150 (MQ=255)
gCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCg < 2:2224334/150‑1 (MQ=255)
gCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCg > 2:314169/1‑150 (MQ=255)
gCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCg > 2:313878/1‑150 (MQ=255)
gCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCg > 2:2037937/1‑150 (MQ=255)
cacaGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCggg < 2:2820631/150‑1 (MQ=255)
cacaGTATGAGCGAAGAGATCATTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCggg < 2:791975/150‑1 (MQ=255)
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TTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCG < SRR19973076.1241240/150‑1 (MQ=60)
TTTATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCG < SRR19973076.1241203/150‑1 (MQ=60)
ATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCGGTG > SRR19973076.1790197/1‑150 (MQ=60)
ATTACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCGGTG > SRR19973076.1790081/1‑150 (MQ=60)
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CAACACGCGTACGGGTGAAATCCGCCTGGATAAATTCTACGCCTTGCTGGACTGCGGTACACCGGTCAATCCAGAGTTAGCGTTGGGACAAATCTACGGTGCCACCCTGCGTGCTATCGGCCACAGTATGAGCGAAGAGATCATTTATGACGCCGAAGGTCACCCGTTAACGCGTGATTTACGCAGTTACGGCGCACCGAAAATTGGTGACATTCCGCGTGATTTCCGCGCTGTGCTGGTGCCGAGCGACGATAAAGTCGGCCCGTTCGGGGCGAAATCGATCTCGGAAATCGGTG > CP009273/3017137‑3017432
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
