Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,416,101 |
C→A |
89.7% |
intergenic (+21/+27) |
yfcH → / ← yfcI |
putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase/transposase_31 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,416,101 | 0 | C | A | 89.7%
| 784.5
/ 75.8
| 267 | intergenic (+21/+27) | yfcH/yfcI | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase/transposase_31 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (14/14); new base A (120/119); total (134/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
CTGTTAATGGGCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCAATACGCAGGGCTTCTTCGTGTTTGCC > CP009273/2415952‑2416247
|
cTGTTAATGGGCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATcc < 2:106502/150‑1 (MQ=255)
gTTAATGGGCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGc < 1:2812729/150‑1 (MQ=255)
tGGGCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACACCGCGCGCTGCCTACACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGtt < 1:1157844/150‑1 (MQ=255)
gggCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTa < 1:1878678/150‑1 (MQ=255)
ggCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTaa > 1:1533520/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACt < 2:1588971/150‑1 (MQ=255)
cGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACt > 2:2770662/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACt > 2:1763094/1‑150 (MQ=255)
cGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACt > 1:3512914/1‑150 (MQ=255)
gAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTc > 1:3998963/1‑150 (MQ=255)
gAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTc > 1:2432010/1‑150 (MQ=255)
tCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCg < 1:2846001/150‑1 (MQ=255)
cTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCgg < 2:1207417/150‑1 (MQ=255)
cTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCgg < 1:458544/150‑1 (MQ=255)
aGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGtt > 1:3143637/1‑150 (MQ=255)
aGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGtt > 2:290890/1‑150 (MQ=255)
aGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGtt > 2:212591/1‑150 (MQ=255)
gTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTa > 2:55574/1‑150 (MQ=255)
tGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 2:3494243/150‑1 (MQ=255)
tGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg > 1:598590/1‑150 (MQ=255)
gTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAt > 2:834153/1‑150 (MQ=255)
gTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAt > 2:3043304/1‑150 (MQ=255)
aTTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTa > 1:179426/1‑150 (MQ=255)
aGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTg > 1:3760095/1‑150 (MQ=255)
aGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTg > 2:2267106/1‑150 (MQ=255)
ggTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTgg > 1:1329953/1‑150 (MQ=255)
ggTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTgg < 1:1812828/150‑1 (MQ=255)
tGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCt < 1:43978/150‑1 (MQ=255)
ggACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCtt > 1:325055/1‑150 (MQ=255)
gACAACGCGCGCTGCCTACACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCttt < 1:3609321/150‑1 (MQ=255)
aCAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTg < 1:4338110/150‑1 (MQ=255)
aCAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTg > 1:241940/1‑150 (MQ=255)
aCAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTg > 2:1660200/1‑150 (MQ=255)
catcgcgcgCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTTGTGGCTTTgc < 2:2375581/147‑1 (MQ=255)
aaCGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTgcg > 1:1441120/1‑150 (MQ=255)
cgcgcTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGAt < 1:2470183/150‑1 (MQ=255)
cgcTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATaa > 2:4228751/1‑150 (MQ=255)
gcTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAg < 1:3709625/150‑1 (MQ=255)
tGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGAt > 2:1358698/1‑150 (MQ=255)
tGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGAt > 2:2858086/1‑150 (MQ=255)
tAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTc < 1:802465/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 2:477047/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGt < 2:1151720/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTg > 1:67779/1‑150 (MQ=255)
tGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGaaa > 1:1350828/1‑150 (MQ=255)
tGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGaaa > 2:3116199/1‑150 (MQ=255)
ggTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCAcc < 1:1011926/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACca > 1:1290248/1‑150 (MQ=255)
tGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACcatcat > 1:2724447/1‑150 (MQ=255)
tGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACcatcat > 2:4098780/1‑150 (MQ=255)
tGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACcatcat < 1:4161478/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCAtaa > 2:2332842/1‑150 (MQ=255)
cGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCAtaa < 2:4201205/150‑1 (MQ=255)
tttCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCAtaact < 1:2218342/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCAtaactaac < 2:4002441/150‑1 (MQ=255)
cTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAActc < 1:2132608/150‑1 (MQ=255)
tGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAActct < 1:2121961/150‑1 (MQ=255)
gTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAActctct > 2:3025373/1‑150 (MQ=255)
gTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAActctct < 1:1687622/150‑1 (MQ=255)
gTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAActctct > 2:109192/1‑150 (MQ=255)
tACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTg > 1:3212008/1‑150 (MQ=255)
aCGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGt > 1:278364/1‑150 (MQ=255)
gATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATAGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACAAACTCTCTGTCt > 1:981682/1‑150 (MQ=255)
aTTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTa < 2:3760095/150‑1 (MQ=255)
tttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGCCTaa < 2:1290248/150‑1 (MQ=255)
agaagaGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAAcc < 2:3279844/150‑1 (MQ=255)
gagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTa > 2:1946438/1‑150 (MQ=255)
agGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGACAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTAt < 2:2214612/150‑1 (MQ=255)
gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAg < 1:2653015/150‑1 (MQ=255)
tGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCa < 1:2497065/150‑1 (MQ=255)
ggCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCAt > 2:2664404/1‑150 (MQ=255)
cGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCAtct < 1:3043304/150‑1 (MQ=255)
cGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCAtct > 2:1385694/1‑150 (MQ=255)
gATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTcc > 2:258154/1‑150 (MQ=255)
aTGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCt < 2:2135802/150‑1 (MQ=255)
tGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTg > 1:1901356/1‑150 (MQ=255)
gTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGa < 2:4440943/150‑1 (MQ=255)
tCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAg < 1:1538881/150‑1 (MQ=255)
tCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATGAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAg < 2:2465427/150‑1 (MQ=255)
gTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCa > 2:950071/1‑150 (MQ=255)
gTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCa < 2:3340527/150‑1 (MQ=255)
ttCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCaa > 1:2461401/1‑150 (MQ=255)
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tCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCAAt < 2:3167427/150‑1 (MQ=255)
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GCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAG < SRR19973080.4451683/150‑1 (MQ=60)
GCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAG > SRR19973080.685938/1‑150 (MQ=60)
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AGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGT > SRR19973080.3908246/1‑150 (MQ=60)
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TACAGCAAACATCAGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCAATACGCAGGGCTTCTT > SRR19973080.2781252/1‑150 (MQ=60)
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AGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCAATACGCAGGGCTTCTTCGTGTTTGCCCTG < SRR19973080.754978/150‑1 (MQ=60)
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CTGTTAATGGGCGAATCTTCAGTACTGGTATTAGGTGGACAACGCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTCACCATCATAACTAACTCTCTGTCTAAACCTCTATCCAGCATCTCCTGAGCAATACGCAGGGCTTCTTCGTGTTTGCCCTG > CP009273/2415952‑2416250
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |