Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,568,720 |
C→T |
100% |
A33T (GCC→ACC) |
eutP ← |
putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,568,720 | 0 | C | T | 98.9%
| 593.4
/ ‑2.1
| 183 | A33T (GCC→ACC) | eutP | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (76/103); total (79/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
AACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAT > CP009273/2568575‑2568860
|
aCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtg < 2:3174993/148‑1 (MQ=255)
cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtgtg < 1:54554/148‑1 (MQ=255)
aCTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt > 2:1796997/1‑148 (MQ=255)
tttCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtttt > 2:3131267/1‑148 (MQ=255)
ttCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttttt < 2:268667/148‑1 (MQ=255)
gtCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttttt < 2:2187747/147‑1 (MQ=255)
ccGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCt < 2:482227/148‑1 (MQ=255)
cGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTg < 2:1351099/148‑1 (MQ=255)
ggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGc < 2:371433/148‑1 (MQ=255)
ggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGc > 2:1659249/1‑148 (MQ=255)
gTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCg > 2:163838/1‑148 (MQ=255)
aTTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAgg > 2:3303810/1‑148 (MQ=255)
aTTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATAGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAgg > 2:2639636/1‑148 (MQ=255)
tatccccATGGACATAGATCAGCATGTCTACATACTGTAGCTTCGTAAATAACGCCACATACCACCGGCCATGGAAAAAATAAACACCACGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACTCACTGTGTTAATCTCTCGAGGGt > 2:3403477/6‑148 (MQ=255)
tGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGta < 2:767278/148‑1 (MQ=255)
cgcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGtata < 1:3272736/148‑1 (MQ=255)
gACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcccc < 1:2646991/148‑1 (MQ=255)
aTAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGGGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCTAGGGTATAATTCCCCTGc < 2:2317515/148‑1 (MQ=255)
aTAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc > 1:2189430/1‑148 (MQ=255)
gATCAGCATGTCTACATCCTGTTGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAAc > 1:3020549/1‑148 (MQ=255)
gATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAAc > 2:2734030/1‑148 (MQ=255)
gATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAAc > 2:593813/1‑148 (MQ=255)
aTCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACg > 1:3010510/1‑148 (MQ=255)
aGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt < 1:1707267/148‑1 (MQ=255)
cacgTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTa > 2:2155126/4‑148 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTaaa > 1:3449635/1‑148 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTaaa > 1:1691005/1‑148 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTaaa < 1:163838/148‑1 (MQ=255)
tACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAc < 1:2508533/148‑1 (MQ=255)
tACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAc < 1:2508466/148‑1 (MQ=255)
aCATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACg < 1:2642918/148‑1 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttg < 1:3172520/148‑1 (MQ=255)
ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgt < 2:2333845/148‑1 (MQ=255)
ccTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgt < 2:811052/148‑1 (MQ=255)
cTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt > 1:2297290/1‑148 (MQ=255)
tGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGttt < 1:2373192/148‑1 (MQ=255)
gTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGtttt < 1:1611528/148‑1 (MQ=255)
gTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGccc < 1:3094408/148‑1 (MQ=255)
aTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGa > 1:1277653/1‑148 (MQ=255)
aTTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGa > 2:482020/1‑148 (MQ=255)
tAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACg > 2:2276374/1‑148 (MQ=255)
aGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCt < 1:3199732/148‑1 (MQ=255)
tACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACaa < 1:2755161/148‑1 (MQ=255)
tACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACaa < 1:1405435/148‑1 (MQ=255)
aCCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACaaa > 1:3375248/1‑148 (MQ=255)
gCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCa > 2:423744/1‑148 (MQ=255)
gCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCa > 2:3347503/1‑148 (MQ=255)
gCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTACTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCa > 2:2771050/1‑148 (MQ=255)
cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCaa > 2:2944899/1‑148 (MQ=255)
cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCaa < 1:2134209/148‑1 (MQ=255)
ggggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAAt < 1:3519390/148‑1 (MQ=255)
ggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTc < 1:2496441/148‑1 (MQ=255)
gATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCg > 2:1428203/1‑148 (MQ=255)
ggTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGttt < 1:341884/148‑1 (MQ=255)
ggTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGttt < 1:1433872/148‑1 (MQ=255)
gTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTc < 2:2731990/148‑1 (MQ=255)
ttAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCa > 1:1535882/1‑148 (MQ=255)
tAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCAt > 1:573794/1‑148 (MQ=255)
aaaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGa < 1:738423/148‑1 (MQ=255)
aaaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGa < 1:444943/148‑1 (MQ=255)
aaaTATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGa < 1:443191/148‑1 (MQ=255)
tatTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATg < 2:3249671/148‑1 (MQ=255)
atTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGc > 1:2715832/1‑148 (MQ=255)
atTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGc < 2:319863/148‑1 (MQ=255)
ttCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGcc < 2:1321040/148‑1 (MQ=255)
tCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGccg > 2:873646/1‑147 (MQ=255)
tCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCt < 1:2327174/148‑1 (MQ=255)
tCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCt > 2:2819407/1‑148 (MQ=255)
tCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCt < 1:541098/148‑1 (MQ=255)
aCCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCg > 1:1206079/1‑148 (MQ=255)
cGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTAt > 2:3406645/1‑148 (MQ=255)
aTCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtt < 1:202161/148‑1 (MQ=255)
aTCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtt < 2:2984742/148‑1 (MQ=255)
tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt < 2:3441913/148‑1 (MQ=255)
tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt < 1:1149519/148‑1 (MQ=255)
tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt > 1:193209/1‑148 (MQ=255)
cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCAGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtttt > 2:1127891/1‑148 (MQ=255)
atatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTgg < 2:2916203/148‑1 (MQ=255)
atatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTgg > 1:704463/1‑148 (MQ=255)
tatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGt < 1:2957618/148‑1 (MQ=255)
atCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTc > 2:3196569/1‑148 (MQ=255)
tCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCa > 1:896985/1‑148 (MQ=255)
gCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAtt < 2:1623643/148‑1 (MQ=255)
ccTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTc > 2:3082143/1‑148 (MQ=255)
cTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTca > 2:1696262/1‑148 (MQ=255)
aTCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaa < 2:1206079/148‑1 (MQ=255)
aTCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaa < 2:1206103/148‑1 (MQ=255)
tCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaaa < 2:2997630/148‑1 (MQ=255)
cATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAg > 1:3425014/1‑148 (MQ=255)
aTTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGc > 2:3425979/1‑148 (MQ=255)
aaaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGta < 2:1246137/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat < 1:954027/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat < 1:1655759/148‑1 (MQ=255)
aTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtata < 2:3492316/148‑1 (MQ=255)
aTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtata > 1:2810169/1‑148 (MQ=255)
ttCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa < 1:101845/148‑1 (MQ=255)
ttCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa > 1:781414/1‑148 (MQ=255)
ttCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa < 1:102074/148‑1 (MQ=255)
tCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAt < 1:3303810/148‑1 (MQ=255)
tCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTATTGGTCATTTCAAAAAGCGTATaaa > 2:195732/1‑147 (MQ=255)
|
AACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAT > CP009273/2568575‑2568860
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > CP009273/2568571‑2568868
|
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGT < SRR19973067.2100926/150‑1 (MQ=60)
GGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTC > SRR19973067.3221271/1‑150 (MQ=60)
CAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTG < SRR19973067.3076749/150‑1 (MQ=60)
AACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGT > SRR19973067.3224259/1‑150 (MQ=60)
ACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTG > SRR19973067.398442/1‑150 (MQ=60)
CGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTT < SRR19973067.55248/150‑1 (MQ=60)
CGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAT < SRR19973067.2290336/150‑1 (MQ=60)
CGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAT < SRR19973067.3293199/150‑1 (MQ=60)
TGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATAAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCC > SRR19973067.1581758/1‑150 (MQ=60)
GGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCT > SRR19973067.2542/1‑150 (MQ=60)
GACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTG < SRR19973067.2664078/150‑1 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC > SRR19973067.2204045/1‑150 (MQ=60)
ATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAA > SRR19973067.2358651/1‑150 (MQ=60)
TAGATCAGCATGTCTACATCCTGTTGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAAC > SRR19973067.3039781/1‑150 (MQ=60)
AGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACG > SRR19973067.995315/1‑150 (MQ=60)
AGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACG > SRR19973067.3029661/1‑150 (MQ=60)
CAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATT > SRR19973067.2155352/1‑150 (MQ=60)
CAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATT < SRR19973067.32291/150‑1 (MQ=60)
AGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTA < SRR19973067.1718976/150‑1 (MQ=60)
AGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTA < SRR19973067.1720498/150‑1 (MQ=60)
CATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAA > SRR19973067.1702645/1‑150 (MQ=60)
CATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAA > SRR19973067.3514477/1‑150 (MQ=60)
CATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAA > SRR19973067.3471577/1‑150 (MQ=60)
TGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATA < SRR19973067.165200/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATA < SRR19973067.165182/150‑1 (MQ=60)
CTACATACTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGAAACCAGCGGGGATGGTTAAAAAATTCACCCGGCGTATAAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGGATAATTCCCCTCCAACGCATAAAATAACG > SRR19973067.3451540/1‑150 (MQ=60)
TACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGT < SRR19973067.2524983/150‑1 (MQ=60)
TACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGT < SRR19973067.3063687/150‑1 (MQ=60)
TACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGT < SRR19973067.2524990/150‑1 (MQ=60)
TACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGT < SRR19973067.2524921/150‑1 (MQ=60)
ACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTT < SRR19973067.2659987/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTT < SRR19973067.3192605/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTT > SRR19973067.2312446/1‑150 (MQ=60)
CTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTT < SRR19973067.2964623/150‑1 (MQ=60)
TGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTT < SRR19973067.2388627/150‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTATAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTC < SRR19973067.1622599/150‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTC < SRR19973067.2726721/150‑1 (MQ=60)
GTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTC < SRR19973067.1622595/150‑1 (MQ=60)
TAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCC < SRR19973067.537974/150‑1 (MQ=60)
TAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCACTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCC < SRR19973067.564107/150‑1 (MQ=60)
TGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCC < SRR19973067.1394965/150‑1 (MQ=60)
GTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCG < SRR19973067.3114090/150‑1 (MQ=60)
TAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGA > SRR19973067.1286351/1‑150 (MQ=60)
AGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTAC < SRR19973067.3219916/150‑1 (MQ=60)
AGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGGCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTAC > SRR19973067.2110604/1‑150 (MQ=60)
ATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAA > SRR19973067.3396703/1‑150 (MQ=60)
ATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAA > SRR19973067.2982111/1‑150 (MQ=60)
TACCAGCGGTGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATTTCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAC < SRR19973067.2772915/150‑1 (MQ=60)
TACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAC < SRR19973067.2772965/150‑1 (MQ=60)
TACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAC < SRR19973067.1414968/150‑1 (MQ=60)
CGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATT < SRR19973067.2148461/150‑1 (MQ=60)
GGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTC < SRR19973067.3541656/150‑1 (MQ=60)
GGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGT < SRR19973067.2512835/150‑1 (MQ=60)
ATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTT > SRR19973067.919956/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA > SRR19973067.1546282/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA < SRR19973067.344239/150‑1 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA < SRR19973067.344305/150‑1 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA < SRR19973067.1443527/150‑1 (MQ=60)
GTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCAT > SRR19973067.577502/1‑150 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.2535656/150‑1 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.446264/150‑1 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.448034/150‑1 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.743547/150‑1 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.2002866/150‑1 (MQ=60)
AAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAAT < SRR19973067.1670693/150‑1 (MQ=60)
ATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAAAGCAATTCGTTTCATGAATGC > SRR19973067.2733336/1‑150 (MQ=60)
TATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTTTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTACTTCCCCGACGCTAACCACAAACGCAATACGTTACATCAATGCC > SRR19973067.84024/1‑150 (MQ=60)
TCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATTCCTCG > SRR19973067.1214005/1‑150 (MQ=60)
TCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCG < SRR19973067.2342458/150‑1 (MQ=60)
TCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCG > SRR19973067.1213980/1‑150 (MQ=60)
TCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCG < SRR19973067.544696/150‑1 (MQ=60)
TCACCCGGAGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCG < SRR19973067.544709/150‑1 (MQ=60)
CCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTAT < SRR19973067.737829/150‑1 (MQ=60)
GTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTT > SRR19973067.3420422/1‑150 (MQ=60)
TATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTT > SRR19973067.194702/1‑150 (MQ=60)
ATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTT < SRR19973067.203698/150‑1 (MQ=60)
TCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTG < SRR19973067.1157216/150‑1 (MQ=60)
atATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGG < SRR19973067.3313018/148‑1 (MQ=60)
CAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGG > SRR19973067.709331/1‑150 (MQ=60)
CAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGG > SRR19973067.707201/1‑150 (MQ=60)
TATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCA < SRR19973067.2976310/150‑1 (MQ=60)
TATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCA < SRR19973067.1502477/150‑1 (MQ=60)
TATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCA > SRR19973067.902906/1‑150 (MQ=60)
ATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAT > SRR19973067.2422222/1‑150 (MQ=60)
CGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTT < SRR19973067.1061199/150‑1 (MQ=60)
TATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAA < SRR19973067.3191891/150‑1 (MQ=60)
ATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAG > SRR19973067.3446812/1‑150 (MQ=60)
AAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATA > SRR19973067.2828281/1‑150 (MQ=60)
AAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATA > SRR19973067.2826432/1‑150 (MQ=60)
AATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAA < SRR19973067.960560/150‑1 (MQ=60)
AATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAA > SRR19973067.1186310/1‑150 (MQ=60)
AATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAA < SRR19973067.1667179/150‑1 (MQ=60)
AATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAA > SRR19973067.786821/1‑150 (MQ=60)
TTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATT < SRR19973067.103100/150‑1 (MQ=60)
TTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATT < SRR19973067.102869/150‑1 (MQ=60)
TCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTT < SRR19973067.3324641/150‑1 (MQ=60)
CGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATA > SRR19973067.2719976/1‑150 (MQ=60)
GTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > SRR19973067.2056157/1‑150 (MQ=60)
|
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > CP009273/2568571‑2568868
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
