Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,568,720 |
C→T |
100% |
A33T (GCC→ACC) |
eutP ← |
putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,568,720 | 0 | C | T | 98.8%
| 818.0
/ ‑0.6
| 245 | A33T (GCC→ACC) | eutP | putative P‑loop NTPase ethanolamine utilization protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (83/157); total (86/159) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATA > CP009273/2568573‑2568866
|
gcaACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCt > 1:1413116/1‑150 (MQ=255)
aaCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtgt > 2:88588/1‑150 (MQ=255)
aaCCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCtgt < 1:3952903/150‑1 (MQ=255)
cGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtt < 2:4632019/150‑1 (MQ=255)
gACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttt < 2:3545750/150‑1 (MQ=255)
gACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGttt > 2:4874905/1‑150 (MQ=255)
aCTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGtttt < 1:604357/150‑1 (MQ=255)
gggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCg > 2:3792984/1‑150 (MQ=255)
ggTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGa < 2:1114516/150‑1 (MQ=255)
gTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAg < 2:3349799/150‑1 (MQ=255)
cATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAggg > 1:4637161/1‑150 (MQ=255)
cATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAggg < 1:3558276/150‑1 (MQ=255)
tGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGtata > 1:4876925/1‑150 (MQ=255)
gcgcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATaa < 1:1595173/150‑1 (MQ=255)
gcgcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATaa < 2:1078231/150‑1 (MQ=255)
gcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATGAtt > 2:4215011/1‑150 (MQ=255)
gcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAtt < 2:407304/150‑1 (MQ=255)
gcCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAtt < 1:3920607/150‑1 (MQ=255)
cATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcc < 2:1702627/150‑1 (MQ=255)
cATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcc < 1:4161808/150‑1 (MQ=255)
cATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcc < 2:2150997/150‑1 (MQ=255)
tGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTcccc < 1:4514931/150‑1 (MQ=255)
ggACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCt < 2:2886642/150‑1 (MQ=255)
aCATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc < 1:2500152/150‑1 (MQ=255)
aCATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc > 1:159608/1‑150 (MQ=255)
aCATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc < 1:34325/150‑1 (MQ=255)
aCATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGc > 1:2336600/1‑150 (MQ=255)
aTAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCaa > 2:2898436/1‑150 (MQ=255)
aTAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCaa > 2:2898557/1‑150 (MQ=255)
tAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGGATAATTCCCCTGCAAc > 1:4353238/1‑150 (MQ=255)
tCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTTGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCTGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt < 1:2573808/150‑1 (MQ=255)
tCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt > 2:1207126/1‑150 (MQ=255)
tCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAt < 2:642968/150‑1 (MQ=255)
cAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAtt < 2:4065901/150‑1 (MQ=255)
aTGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAt < 1:144457/150‑1 (MQ=255)
aTGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTGTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAt < 1:2157302/150‑1 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATa < 1:891341/150‑1 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATa < 1:570681/150‑1 (MQ=255)
tGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATa < 1:2577936/150‑1 (MQ=255)
gTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATaa < 2:711119/150‑1 (MQ=255)
gTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATaa < 1:1864022/150‑1 (MQ=255)
tCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAc > 2:3186403/1‑150 (MQ=255)
aCATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgtt < 1:2105230/150‑1 (MQ=255)
cagccTGTAGCGTGGTAATACAGGCGTGAGACCAGCGGGGATGGTTAAAATATGCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCAGTAAATTCCACGGGCTGTTTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttg < 2:1833191/147‑1 (MQ=255)
cATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGNGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttg < 1:2678732/150‑1 (MQ=255)
aTCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgt > 1:1689710/1‑150 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt < 1:4107815/150‑1 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt < 1:4081358/150‑1 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgtt < 2:2511247/150‑1 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACgttgta < 1:628013/150‑2 (MQ=255)
tAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTcc < 1:3217104/150‑1 (MQ=255)
aGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCt < 1:4962645/150‑1 (MQ=255)
gCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTg < 2:3405862/150‑1 (MQ=255)
gTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGcc < 2:5017673/150‑1 (MQ=255)
ggTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGAGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGcccc < 1:120212/150‑1 (MQ=255)
gTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCTTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCg < 2:2004263/150‑1 (MQ=255)
gTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCg < 2:1467856/150‑1 (MQ=255)
gTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCg < 2:1407507/150‑1 (MQ=255)
tAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGa > 1:5101515/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTa > 2:3250104/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTa < 2:3134675/150‑1 (MQ=255)
ggCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTAcc < 1:993838/150‑1 (MQ=255)
gtgtTAACAGCTGGGATGTTTAAAATATTCACCCGTCGTATCAATATCGCCATTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCcac < 1:1583286/150‑1 (MQ=255)
gTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCcac < 2:748035/150‑1 (MQ=255)
gATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACaa > 2:4083427/1‑150 (MQ=255)
gATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACaa > 2:3740609/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGc > 1:286529/1‑150 (MQ=255)
cAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCa < 1:3110024/150‑1 (MQ=255)
cGGGTATGGTTAACATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCAACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTAACCACAAACGCTAtt < 2:2083048/150‑1 (MQ=255)
cGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAAtt < 1:1108468/150‑1 (MQ=255)
ggggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTc < 1:1229559/150‑1 (MQ=255)
ggggATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTc > 2:4442757/1‑150 (MQ=255)
gATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGtt < 1:1791743/150‑1 (MQ=255)
ggTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCa < 1:2534971/150‑1 (MQ=255)
tAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGa < 1:4711038/150‑1 (MQ=255)
tatTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGcc < 1:3687974/150‑1 (MQ=255)
ttCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTc < 2:4637225/150‑1 (MQ=255)
aCCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTa < 1:1620703/150‑1 (MQ=255)
gTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACtt > 1:3843578/1‑150 (MQ=255)
tATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACttt < 2:461939/150‑1 (MQ=255)
tCATTATCGCCCTTATCATTAAATTCCACTGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCATCGCATTAAATTACGTTGTTTTTCCTGCCCCGTCGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg < 1:4264486/150‑1 (MQ=255)
tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg < 1:3606152/150‑1 (MQ=255)
tCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTg < 2:4047753/150‑1 (MQ=255)
cAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTgg < 1:464644/150‑1 (MQ=255)
atatCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTc > 2:4526163/1‑150 (MQ=255)
cGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAttt < 1:3302144/150‑1 (MQ=255)
cGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAttt < 2:2095124/150‑1 (MQ=255)
cGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCAttt > 2:1149051/1‑150 (MQ=255)
gCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTc < 1:2030292/150‑1 (MQ=255)
cccTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTca > 1:4415496/1‑150 (MQ=255)
cTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTcaca < 2:2275411/150‑1 (MQ=255)
ttATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACaa > 2:398030/1‑150 (MQ=255)
tAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtat > 2:625639/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGtata < 2:2362111/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa > 1:2968022/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATaa > 2:129405/1‑150 (MQ=255)
aTTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAAGTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAt < 2:5132613/150‑1 (MQ=255)
cACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaa > 1:2598662/1‑150 (MQ=255)
cGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaata > 1:4053210/1‑150 (MQ=255)
cGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTtaata > 2:3924385/1‑150 (MQ=255)
|
GCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATA > CP009273/2568573‑2568866
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAGC > CP009273/2568571‑2568869
|
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGT < SRR19973063.39132/150‑1 (MQ=60)
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGT > SRR19973063.704334/1‑150 (MQ=60)
GCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCT > SRR19973063.1417406/1‑150 (MQ=60)
AACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGT < SRR19973063.3965544/150‑1 (MQ=60)
CGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTT < SRR19973063.724822/150‑1 (MQ=60)
CGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTT < SRR19973063.1258599/150‑1 (MQ=60)
CGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTT < SRR19973063.2936609/150‑1 (MQ=60)
GACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTT > SRR19973063.1210183/1‑150 (MQ=60)
ACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTT < SRR19973063.606070/150‑1 (MQ=60)
ACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTT < SRR19973063.2598313/150‑1 (MQ=60)
ACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTT < SRR19973063.606132/150‑1 (MQ=60)
GGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGA < SRR19973063.511815/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGG < SRR19973063.3569682/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGG < SRR19973063.2554782/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGG > SRR19973063.4651976/1‑150 (MQ=60)
CATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGG > SRR19973063.4652040/1‑150 (MQ=60)
TGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTTGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATA < SRR19973063.4840943/150‑1 (MQ=60)
TGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATA > SRR19973063.4892646/1‑150 (MQ=60)
GCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAA < SRR19973063.1600067/150‑1 (MQ=60)
GCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAA < SRR19973063.1600424/150‑1 (MQ=60)
GCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATT < SRR19973063.3933115/150‑1 (MQ=60)
GCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATT < SRR19973063.425636/150‑1 (MQ=60)
CATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCC < SRR19973063.4175115/150‑1 (MQ=60)
TGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCC > SRR19973063.4063870/1‑150 (MQ=60)
TGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCC < SRR19973063.4529425/150‑1 (MQ=60)
TGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTAGAATTCCCC > SRR19973063.4063854/1‑150 (MQ=60)
GACATAGATCAGCTTGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTG < SRR19973063.4194577/150‑1 (MQ=60)
GACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGGAGCGTGGTAATTAAGGCGTGAGACCAGCGGGGATGGTTAAAATAGTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTG < SRR19973063.142684/150‑1 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC > SRR19973063.160101/1‑150 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC > SRR19973063.160103/1‑150 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC < SRR19973063.2508125/150‑1 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC > SRR19973063.2344072/1‑150 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC < SRR19973063.34463/150‑1 (MQ=60)
ACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCAGTCGTATCAATATCGCCATTATCATTAAATTCCACGGTCTTTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGC < SRR19973063.2508169/150‑1 (MQ=60)
ATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAA > SRR19973063.3144757/1‑150 (MQ=60)
TAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGGATAATTCCCCTGCAAC > SRR19973063.4367142/1‑150 (MQ=60)
GATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGC > SRR19973063.31655/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTTTTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCTGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAT < SRR19973063.2581998/150‑1 (MQ=60)
TCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAT > SRR19973063.3384687/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAT > SRR19973063.3384786/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAT > SRR19973063.1618853/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCAT < SRR19973063.2582100/150‑1 (MQ=60)
CAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATT > SRR19973063.4125381/1‑150 (MQ=60)
AGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTCTAATTCCCCTGCAACGCATTA > SRR19973063.1497591/1‑150 (MQ=60)
AGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTNTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTA < SRR19973063.2684188/150‑1 (MQ=60)
CATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAA > SRR19973063.2887980/1‑150 (MQ=60)
ATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAT < SRR19973063.2473587/150‑1 (MQ=60)
ATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAT < SRR19973063.144901/150‑1 (MQ=60)
ATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTGTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAAT < SRR19973063.2164061/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATA < SRR19973063.572366/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATA < SRR19973063.893928/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATA < SRR19973063.2586137/150‑1 (MQ=60)
GTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAA < SRR19973063.1869772/150‑1 (MQ=60)
GTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAA < SRR19973063.1869848/150‑1 (MQ=60)
ACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTT < SRR19973063.2111858/150‑1 (MQ=60)
ACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTT > SRR19973063.1762831/1‑150 (MQ=60)
ACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTT < SRR19973063.4680751/150‑1 (MQ=60)
ACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTT < SRR19973063.2111813/150‑1 (MQ=60)
CATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGNGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTG < SRR19973063.2687350/150‑1 (MQ=60)
ATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGT > SRR19973063.1694858/1‑150 (MQ=60)
TCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTT < SRR19973063.4094427/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTT < SRR19973063.4120970/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTA < SRR19973063.629861/150‑1 (MQ=60)
ctttagagttGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCATTATCATTAAATTACACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTT < SRR19973063.2129462/140‑1 (MQ=60)
CTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCATCGGGGATGGGTAAAATATAAACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCAACGGTCTGTGTTTTTCTGTCGAGGGTATAATTACCCTGAAACGCATAAAATAACGTTGTTTT > SRR19973063.4896984/1‑150 (MQ=60)
TGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTT < SRR19973063.4098515/150‑1 (MQ=60)
TGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTT < SRR19973063.4098654/150‑1 (MQ=60)
TAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCC < SRR19973063.3227446/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCT < SRR19973063.4978689/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCT < SRR19973063.2410595/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCT > SRR19973063.5101177/1‑150 (MQ=60)
GCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTG < SRR19973063.1182689/150‑1 (MQ=60)
GGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGAGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCC < SRR19973063.120611/150‑1 (MQ=60)
GTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCG < SRR19973063.3953964/150‑1 (MQ=60)
GTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCA < SRR19973063.979764/150‑1 (MQ=60)
TAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGA > SRR19973063.5117934/1‑150 (MQ=60)
TAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGA < SRR19973063.3919462/150‑1 (MQ=60)
AATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGAC > SRR19973063.1598797/1‑150 (MQ=60)
GGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACC < SRR19973063.996837/150‑1 (MQ=60)
GCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCC < SRR19973063.1677935/150‑1 (MQ=60)
CGTTATACCAGCGGTGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCA < SRR19973063.165474/150‑1 (MQ=60)
CGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCA < SRR19973063.502979/150‑1 (MQ=60)
GTGTTAACAGCTGGGATGTTTAAAATATTCACCCGTCGTATCAATATCGCCATTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCAC < SRR19973063.1588137/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACG < SRR19973063.3453103/150‑1 (MQ=60)
CCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGC < SRR19973063.1468032/150‑1 (MQ=60)
CCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGC > SRR19973063.287374/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCA < SRR19973063.3120032/150‑1 (MQ=60)
CGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATT < SRR19973063.1111839/150‑1 (MQ=60)
CGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATT < SRR19973063.3807588/150‑1 (MQ=60)
GGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTC < SRR19973063.1233233/150‑1 (MQ=60)
GGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCG < SRR19973063.2322864/150‑1 (MQ=60)
GATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTT < SRR19973063.1797288/150‑1 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA < SRR19973063.2545615/150‑1 (MQ=60)
GGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCA < SRR19973063.2543053/150‑1 (MQ=60)
TAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGA < SRR19973063.4084980/150‑1 (MQ=60)
TAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGA < SRR19973063.4726049/150‑1 (MQ=60)
AATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATG > SRR19973063.4629115/1‑150 (MQ=60)
TATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCC < SRR19973063.3699782/150‑1 (MQ=60)
CACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGT > SRR19973063.2699688/1‑150 (MQ=60)
ACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTA < SRR19973063.1625654/150‑1 (MQ=60)
CCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTAT < SRR19973063.4414483/150‑1 (MQ=60)
CGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACT < SRR19973063.3046601/150‑1 (MQ=60)
CGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACT < SRR19973063.4890618/150‑1 (MQ=60)
GTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTT > SRR19973063.3855799/1‑150 (MQ=60)
TCATTATCGCCCTTATCATTAAATTCCACTGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCATCGCATTAAATTACGTTGTTTTTCCTGCCCCGTCGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTG < SRR19973063.4278048/150‑1 (MQ=60)
TCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTG < SRR19973063.3617729/150‑1 (MQ=60)
CAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGG < SRR19973063.465884/150‑1 (MQ=60)
CAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGG < SRR19973063.465954/150‑1 (MQ=60)
TCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATT > SRR19973063.970607/1‑150 (MQ=60)
CGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTT < SRR19973063.2049589/150‑1 (MQ=60)
CGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTT < SRR19973063.3312711/150‑1 (MQ=60)
CGCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTT > SRR19973063.3621609/1‑150 (MQ=60)
GCCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTC < SRR19973063.2036633/150‑1 (MQ=60)
CCCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCA > SRR19973063.4429668/1‑150 (MQ=60)
CCTTATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCAC < SRR19973063.3260534/150‑1 (MQ=60)
ATCATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAG < SRR19973063.579978/150‑1 (MQ=60)
CATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCG > SRR19973063.1887031/1‑150 (MQ=60)
ATTAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGT > SRR19973063.4451506/1‑150 (MQ=60)
TAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTAT < SRR19973063.3595746/150‑1 (MQ=60)
TAAATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCATCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTAT < SRR19973063.3595442/150‑1 (MQ=60)
AATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAA > SRR19973063.2977510/1‑150 (MQ=60)
ATTCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAAAGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGACTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAAT < SRR19973063.4314925/150‑1 (MQ=60)
TCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTT < SRR19973063.626379/150‑1 (MQ=60)
TCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTT > SRR19973063.3919800/1‑150 (MQ=60)
TCCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTT < SRR19973063.4383922/150‑1 (MQ=60)
CCACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTA < SRR19973063.19141/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAA < SRR19973063.1378123/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAA > SRR19973063.2606904/1‑150 (MQ=60)
CACGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAA > SRR19973063.2606923/1‑150 (MQ=60)
CGGTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATA > SRR19973063.4066206/1‑150 (MQ=60)
GTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > SRR19973063.5092014/1‑150 (MQ=60)
GTCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAG > SRR19973063.5091961/1‑150 (MQ=60)
TCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAGC > SRR19973063.2044516/1‑150 (MQ=60)
|
AGGCAACCGACTTTCCGGGTCATTTGCGCCATGGACATAGATCAGCATGTCTACATCCTGTAGCGTGGTAATTAAGGCGTGATACCAGCGGGGATGGTTAAAATATTCACCCGGCGTATCAATATCGCCCTTATCATTAAATTCCACGGCCTGTGTTTTTCTGGCGAGGGTATAATTCCCCTGCAACGCATTAAATAACGTTGTTTTTCCTGCCCCGACGCTACCCACAAACGCAATTCGTTTCATGAATGCCTCGTATTAACTTTTGGTCATTTCACAAAGCGTATAATTTAATAAGC > CP009273/2568571‑2568869
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
