Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,579,561 |
G→T |
100% |
G158C (GGC→TGC) |
narQ → |
sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,579,561 | 0 | G | T | 100.0%
| 588.4
/ NA
| 176 | G158C (GGC→TGC) | narQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (94/82); total (94/82) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > CP009273/2579416‑2579705
|
ataatCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCAt > 1:1403281/1‑148 (MQ=255)
taatCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATc < 1:539154/148‑1 (MQ=255)
taatCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATc > 1:2986287/1‑148 (MQ=255)
aatCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCg > 2:2167331/1‑148 (MQ=255)
atCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCgg > 2:2780882/1‑148 (MQ=255)
tCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGt < 1:1826961/148‑1 (MQ=255)
ggCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAt < 2:2910640/148‑1 (MQ=255)
ggCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAt < 2:2878686/148‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTc < 1:2138913/148‑1 (MQ=255)
aGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCa < 1:717355/148‑1 (MQ=255)
aGCAACGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCa < 2:3452347/148‑1 (MQ=255)
cAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACg > 2:2913984/1‑148 (MQ=255)
aaGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGc < 2:2661177/148‑1 (MQ=255)
ggCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTgg > 2:1547269/1‑148 (MQ=255)
gCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGt > 1:2850722/1‑148 (MQ=255)
gCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGt > 1:2198690/1‑148 (MQ=255)
cGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTc > 1:692323/1‑148 (MQ=255)
cGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTc < 2:892169/148‑1 (MQ=255)
gCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCtttttt < 1:896666/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTCTCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTAc < 2:2190646/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTAc > 2:2440229/1‑148 (MQ=255)
tGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACtt > 2:2189510/1‑148 (MQ=255)
gTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTg > 1:593782/1‑148 (MQ=255)
tCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTgcgc < 1:2977032/148‑1 (MQ=255)
gCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTTCTCCGCa > 2:3061278/1‑148 (MQ=255)
gCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCa > 1:1884680/1‑148 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCAt < 2:2420576/148‑1 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCAt < 2:2306859/148‑1 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCAt < 1:1528996/148‑1 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCAt < 2:3106059/148‑1 (MQ=255)
aaTATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATAc > 1:2339633/1‑148 (MQ=255)
atatTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACg > 2:126774/1‑148 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGcc > 2:823630/1‑148 (MQ=255)
ttAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCa < 1:2651658/148‑1 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt < 1:2872536/148‑1 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt > 2:1143086/1‑148 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt > 2:2744496/1‑148 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt > 1:1670616/1‑148 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt > 2:2343254/1‑148 (MQ=255)
ataatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCa > 1:1549483/1‑148 (MQ=255)
atTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggt > 1:1059591/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg < 1:652685/148‑1 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 1:793481/1‑148 (MQ=255)
tATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtgg < 2:2875231/148‑1 (MQ=255)
tATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtgg > 2:1420083/1‑148 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg > 2:193523/1‑148 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg > 2:578110/1‑148 (MQ=255)
ttAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGc < 1:3465889/148‑1 (MQ=255)
ttAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGc > 2:2501786/1‑148 (MQ=255)
aTCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGcccc > 2:122944/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCg > 2:798621/1‑148 (MQ=255)
cAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGc > 2:3447859/1‑148 (MQ=255)
cAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGc > 2:1105923/1‑148 (MQ=255)
aGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAt > 2:3368452/1‑148 (MQ=255)
aGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAt > 1:1082092/1‑148 (MQ=255)
aGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAt < 2:1127386/148‑1 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATc < 2:1234111/148‑1 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATc > 1:1072443/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAg > 1:3234337/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAg > 2:1021238/1‑148 (MQ=255)
cTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGc > 2:1331926/1‑148 (MQ=255)
cTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGc < 1:723290/148‑1 (MQ=255)
tGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCt < 1:2403151/148‑1 (MQ=255)
gTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTg > 1:3038048/1‑148 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg > 1:1137643/1‑148 (MQ=255)
tCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGt < 1:3412550/148‑1 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc > 1:3120034/1‑148 (MQ=255)
tGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGc > 1:103467/1‑148 (MQ=255)
cTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAg > 1:2511357/1‑148 (MQ=255)
tttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGt < 2:364994/148‑1 (MQ=255)
tttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGt < 2:364854/148‑1 (MQ=255)
ttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTc > 1:2634854/1‑148 (MQ=255)
ttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTc < 1:9479/148‑1 (MQ=255)
tACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCa > 2:418463/1‑148 (MQ=255)
cAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGc > 1:1578478/1‑148 (MQ=255)
cTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAaca < 2:1778697/148‑1 (MQ=255)
aaCGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACgg < 1:2315791/148‑1 (MQ=255)
aaCGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACgg < 1:1386197/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAg > 2:2703835/1‑148 (MQ=255)
aaaaTGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGt < 2:458282/148‑1 (MQ=255)
aaaaTGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGt < 1:393838/148‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCg < 2:628516/148‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGa < 2:2608630/148‑1 (MQ=255)
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GTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACC > SRR19973067.3139868/1‑150 (MQ=60)
ACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGC > SRR19973067.104501/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAG > SRR19973067.2527838/1‑150 (MQ=60)
CTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTC > SRR19973067.2651904/1‑150 (MQ=60)
TTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCA < SRR19973067.3020356/150‑1 (MQ=60)
TTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAG < SRR19973067.9630/150‑1 (MQ=60)
TTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAG > SRR19973067.3346169/1‑150 (MQ=60)
TACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGC > SRR19973067.1589129/1‑150 (MQ=60)
TACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGC > SRR19973067.1589284/1‑150 (MQ=60)
TACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGC > SRR19973067.1589288/1‑150 (MQ=60)
CACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATT > SRR19973067.2575940/1‑150 (MQ=60)
ACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTG < SRR19973067.2147551/150‑1 (MQ=60)
TGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGG > SRR19973067.916227/1‑150 (MQ=60)
AACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGC < SRR19973067.1395629/150‑1 (MQ=60)
AACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGC < SRR19973067.2331027/150‑1 (MQ=60)
AAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTC < SRR19973067.396593/150‑1 (MQ=60)
AAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCG > SRR19973067.670928/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGAC > SRR19973067.207299/1‑150 (MQ=60)
TGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACT < SRR19973067.718510/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCC < SRR19973067.2460390/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCC < SRR19973067.1985847/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCC < SRR19973067.595196/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCC < SRR19973067.1985803/150‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCT < SRR19973067.3469797/150‑1 (MQ=60)
GGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCT < SRR19973067.236622/150‑1 (MQ=60)
TCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATAAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAAA > SRR19973067.2755556/1‑150 (MQ=60)
CCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCT < SRR19973067.1236106/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTG < SRR19973067.2358577/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGC > SRR19973067.3137785/1‑150 (MQ=60)
GCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCG < SRR19973067.3450538/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > SRR19973067.1838162/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > SRR19973067.1838097/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > SRR19973067.73255/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > SRR19973067.843107/1‑150 (MQ=60)
CTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA > SRR19973067.3200413/1‑150 (MQ=60)
CTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA > SRR19973067.3200513/1‑150 (MQ=60)
TGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG > SRR19973067.3228127/1‑150 (MQ=60)
TGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG > SRR19973067.248479/1‑150 (MQ=60)
TGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG < SRR19973067.1557791/150‑1 (MQ=60)
TGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG < SRR19973067.1557599/150‑1 (MQ=60)
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GATGAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG > CP009273/2579413‑2579710
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |