Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,579,561 |
G→T |
100% |
G158C (GGC→TGC) |
narQ → |
sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,579,561 | 0 | G | T | 98.9%
| 606.1
/ ‑1.7
| 186 | G158C (GGC→TGC) | narQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (103/81); total (103/83) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGC > CP009273/2579416‑2579702
|
ataatCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCAt < 1:3397424/148‑1 (MQ=255)
atCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCgg > 1:2047180/1‑148 (MQ=255)
cGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTa > 2:201426/1‑148 (MQ=255)
gCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAtt < 2:425311/148‑1 (MQ=255)
gCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAtt < 2:1121407/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt < 2:2498767/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt < 2:2777566/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt > 1:3434870/1‑148 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt > 1:3434737/1‑148 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAtttt < 1:1164376/148‑1 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAtttt < 1:3359735/148‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTc < 2:3308791/148‑1 (MQ=255)
cAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTc < 2:365175/148‑1 (MQ=255)
gggCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTg > 2:2197524/1‑148 (MQ=255)
ggCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTgg > 1:2987203/1‑148 (MQ=255)
ggCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTgg > 1:648408/1‑148 (MQ=255)
gCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCTATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGt < 2:3107153/148‑1 (MQ=255)
cGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTc < 2:2964598/148‑1 (MQ=255)
tttGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCttt < 2:723935/148‑1 (MQ=255)
ttGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCtttt < 2:1238354/148‑1 (MQ=255)
gTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACt < 1:3451086/148‑1 (MQ=255)
tGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACtt < 2:52015/148‑1 (MQ=255)
gTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTg > 1:2518781/1‑148 (MQ=255)
aTCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTgcg < 1:2623003/148‑1 (MQ=255)
aTCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTgcg > 1:1934288/1‑148 (MQ=255)
tCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTgcgc > 1:723411/1‑148 (MQ=255)
gCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCa < 2:2447229/148‑1 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGACGCAt > 2:2307399/1‑148 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTAACGCTGGTCTTTTTTAATTTGAGACGCAt > 2:2705822/1‑148 (MQ=255)
tatTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGc < 1:441117/148‑1 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGcc > 1:2232927/1‑148 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCACATACGcc > 1:1697252/1‑148 (MQ=255)
ttAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCa > 2:2365114/1‑148 (MQ=255)
ttAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCa > 1:1582528/1‑148 (MQ=255)
taataaTTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCAt > 2:2594949/1‑148 (MQ=255)
aataatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATc > 1:2282894/1‑148 (MQ=255)
ataatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCa < 2:662320/148‑1 (MQ=255)
taatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAg > 1:2685064/1‑148 (MQ=255)
taatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAg > 1:2684449/1‑148 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg > 1:2792494/1‑148 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg > 1:3167474/1‑148 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg < 2:3100047/148‑1 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 2:3348184/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg < 2:3435835/148‑1 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 2:907758/1‑148 (MQ=255)
aTGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtggt < 1:3248622/148‑1 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg < 1:2131146/148‑1 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg > 1:2796067/1‑148 (MQ=255)
ttAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGc > 1:2765445/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCg < 1:857188/148‑1 (MQ=255)
tCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCg > 2:2042524/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCg > 2:2042424/1‑148 (MQ=255)
gATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTg < 1:1285840/148‑1 (MQ=255)
gATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTg > 2:1575385/1‑148 (MQ=255)
aTAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGa > 2:137930/1‑148 (MQ=255)
aGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAt > 1:2724509/1‑148 (MQ=255)
aGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAt > 1:2185605/1‑148 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg > 2:3326671/1‑148 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg < 1:221191/148‑1 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg < 2:2792494/148‑1 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg < 1:182212/148‑1 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg > 2:891025/1‑148 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCAATGGCTGGCTGCATCGGTATTATCACGCTGGTCTTTTTTAATTTGCGCCGCATACGCAATCATGTGGTTGCCCAGAAGAATCAGCTgg > 1:47398/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc > 2:170518/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc > 2:170387/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc > 2:459949/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc > 2:450030/1‑148 (MQ=255)
tGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGc < 2:878565/148‑1 (MQ=255)
tGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGc < 2:2635678/148‑1 (MQ=255)
ggCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGcc > 1:1520254/1‑148 (MQ=255)
tttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGt < 1:312484/148‑1 (MQ=255)
tttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGt < 1:927776/148‑1 (MQ=255)
ttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTc > 1:2775852/1‑148 (MQ=255)
ttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTc > 1:174669/1‑148 (MQ=255)
aCAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAg < 2:551509/148‑1 (MQ=255)
aCAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAg < 2:1142705/148‑1 (MQ=255)
gCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGt < 1:370322/148‑1 (MQ=255)
cTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAtt > 1:1422467/1‑148 (MQ=255)
cTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAtt > 1:2377894/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGa < 1:113735/148‑1 (MQ=255)
aCGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGa < 2:1824706/148‑1 (MQ=255)
cTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAaca < 1:1045522/148‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGtt > 1:3198515/1‑148 (MQ=255)
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GATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAA < SRR19973065.1294318/150‑1 (MQ=60)
ATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAT > SRR19973065.638650/1‑150 (MQ=60)
ATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAT > SRR19973065.2199627/1‑150 (MQ=60)
ATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAAT > SRR19973065.2741457/1‑150 (MQ=60)
AGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCA > SRR19973065.3384009/1‑150 (MQ=60)
TGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCAATGGCTGGCTGCATCGGTATTATCACGCTGGTCTTTTTTAATTTGCGCCGCATACGCAATCATGTGGTTGCCCAGAAGAATCAGCTGG > SRR19973065.47941/1‑150 (MQ=60)
GTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGT < SRR19973065.1810229/150‑1 (MQ=60)
TTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTT < SRR19973065.183652/150‑1 (MQ=60)
TTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTT < SRR19973065.222834/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCC > SRR19973065.1530213/1‑150 (MQ=60)
CTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTC > SRR19973065.2782989/1‑150 (MQ=60)
CTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTC > SRR19973065.176061/1‑150 (MQ=60)
CTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTC > SRR19973065.2793082/1‑150 (MQ=60)
TTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCA < SRR19973065.314593/150‑1 (MQ=60)
TTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCA < SRR19973065.933875/150‑1 (MQ=60)
GCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAT < SRR19973065.372919/150‑1 (MQ=60)
CACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATT > SRR19973065.2392757/1‑150 (MQ=60)
CACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATT > SRR19973065.1431742/1‑150 (MQ=60)
ACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAAC < SRR19973065.114745/150‑1 (MQ=60)
CTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACG > SRR19973065.3489082/1‑150 (MQ=60)
CTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACG < SRR19973065.1052436/150‑1 (MQ=60)
GCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGT < SRR19973065.2211599/150‑1 (MQ=60)
CAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTT > SRR19973065.3444176/1‑150 (MQ=60)
CAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTT > SRR19973065.3217783/1‑150 (MQ=60)
CAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTT > SRR19973065.690622/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCG > SRR19973065.2006258/1‑150 (MQ=60)
GCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTC < SRR19973065.2607614/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGGAGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTATGCGCCGCATACGCCATCAGTTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAACGCCAGTCAGCGTATAGAACACGGGCAGATCGACTCG > SRR19973065.3170969/1‑150 (MQ=60)
GGTGGCGATGTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCT < SRR19973065.2783124/150‑1 (MQ=60)
GTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTG < SRR19973065.1260996/150‑1 (MQ=60)
GTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTG < SRR19973065.2393135/150‑1 (MQ=60)
GTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTG < SRR19973065.2393148/150‑1 (MQ=60)
CGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATA < SRR19973065.1193714/150‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCT > SRR19973065.1836957/1‑150 (MQ=60)
GGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAAT > SRR19973065.962107/1‑150 (MQ=60)
CTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA < SRR19973065.420444/150‑1 (MQ=60)
CTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA < SRR19973065.1598757/150‑1 (MQ=60)
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GATGAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA > CP009273/2579413‑2579709
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |