Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,579,561 |
G→T |
100% |
G158C (GGC→TGC) |
narQ → |
sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,579,561 | 0 | G | T | 95.1%
| 547.3
/ 17.1
| 185 | G158C (GGC→TGC) | narQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarP (NarL) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/6); new base T (83/93); total (86/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGA > CP009273/2579416‑2579705
|
gAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTggctgc < 1:42229/148‑1 (MQ=255)
gAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTggctgc < 1:1846899/148‑1 (MQ=255)
tCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGt > 2:2642855/1‑148 (MQ=255)
ggCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAt < 1:202484/148‑1 (MQ=255)
ggCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAt < 1:962883/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGTCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTTGCTGCATCGGTAttt < 2:2987158/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt < 1:1365118/148‑1 (MQ=255)
cTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTAttt > 1:2570030/1‑148 (MQ=255)
aGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCa < 2:2759705/148‑1 (MQ=255)
gCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCAc > 2:525035/1‑148 (MQ=255)
gCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCAc > 2:304678/1‑148 (MQ=255)
ggCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTgg > 1:2293734/1‑148 (MQ=255)
cGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTc < 2:3072852/148‑1 (MQ=255)
gATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCt < 2:3223301/148‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCtt < 1:1591669/148‑1 (MQ=255)
tttGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCttt < 1:998403/148‑1 (MQ=255)
tttGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCttt < 1:3284774/148‑1 (MQ=255)
tttGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCttt < 1:3286505/148‑1 (MQ=255)
ttGCCGTGGTATCAGACCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCtttt > 2:251583/1‑148 (MQ=255)
ccGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTa < 2:844231/148‑1 (MQ=255)
ccGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTa > 2:3331681/1‑148 (MQ=255)
gTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACt < 2:1197991/148‑1 (MQ=255)
tGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACtt > 2:2229150/1‑148 (MQ=255)
tCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTgcgc > 1:985106/1‑148 (MQ=255)
aGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGcgccg < 2:210485/148‑1 (MQ=255)
gtccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGTTGGAGATTTCCCTGTCTGGCTGCATCGGTATTTTCACTCTGGTCTTTTTTACTTTGcgccgc > 2:1300899/3‑148 (MQ=255)
ggCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCTATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTAACGCTGGTCTTTTTTACTATGcgccgc > 1:2414229/1‑148 (MQ=255)
gCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCa > 2:1672539/1‑148 (MQ=255)
ccAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCAt < 2:182925/148‑1 (MQ=255)
cAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATa < 2:2667404/148‑1 (MQ=255)
atatTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACg > 1:1272695/1‑148 (MQ=255)
tatTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGc > 2:1717075/1‑148 (MQ=255)
tatTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGc > 1:49715/1‑148 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGcc < 2:3260025/148‑1 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGcc > 2:65953/1‑148 (MQ=255)
atTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGcc > 2:409920/1‑148 (MQ=255)
aataatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATc < 2:1922407/148‑1 (MQ=255)
ataatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCa < 1:3195893/148‑1 (MQ=255)
taatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCTATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAg > 2:2096280/1‑148 (MQ=255)
taatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAg > 1:419277/1‑148 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg < 1:1253363/148‑1 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg < 1:67613/148‑1 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg > 2:102144/1‑148 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg < 2:21577/148‑1 (MQ=255)
aatTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAgg > 1:2952731/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 2:600149/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 1:616920/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 2:2389792/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAggtg > 1:2408966/1‑148 (MQ=255)
tGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGtt > 1:1989348/1‑148 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg > 2:2898992/1‑148 (MQ=255)
gTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTGTCACGCTGGTCTTTTTTACTGTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTg > 2:537573/1‑148 (MQ=255)
aaTCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGccc < 2:2017708/148‑1 (MQ=255)
aaTCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGccc < 1:1121752/148‑1 (MQ=255)
aTCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGcccc > 1:227597/1‑148 (MQ=255)
tCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCg < 1:966836/148‑1 (MQ=255)
cAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGc > 2:2607518/1‑148 (MQ=255)
aTAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGa > 1:437957/1‑148 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATc < 1:1856041/148‑1 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATc < 1:50924/148‑1 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATc < 2:3045929/148‑1 (MQ=255)
gACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGCTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACCCTGGTCTTTTTTAATTTGCGCCGCATACCCCATCAGTTGGTTGCCCCGCTGAAta > 2:2258758/1‑147 (MQ=255)
cTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGc > 1:714492/1‑148 (MQ=255)
ttCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTgg < 2:3164513/148‑1 (MQ=255)
tCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGt > 2:441447/1‑148 (MQ=255)
tCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGt > 1:1926916/1‑148 (MQ=255)
tCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCAGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTCCCCCGCTGAATCACCTGGt > 2:1087854/1‑148 (MQ=255)
cGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGtt < 1:1014908/148‑1 (MQ=255)
tACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAc > 1:2321628/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTAcc < 1:2824157/148‑1 (MQ=255)
cTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCg > 2:1543460/1‑148 (MQ=255)
tGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGc > 1:3264013/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGcc > 1:1395715/1‑148 (MQ=255)
cTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAg > 2:3019434/1‑148 (MQ=255)
tttACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGt < 2:3524484/148‑1 (MQ=255)
gCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGt > 2:1415171/1‑148 (MQ=255)
aCTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAt < 2:3394514/148‑1 (MQ=255)
aCTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAt < 1:3563701/148‑1 (MQ=255)
cTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTCCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTAtt < 1:3566421/148‑1 (MQ=255)
cGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGaa < 1:349098/148‑1 (MQ=255)
gCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAac < 1:3246745/148‑1 (MQ=255)
gAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACg > 1:1996260/1‑148 (MQ=255)
gCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCa < 2:2225432/148‑1 (MQ=255)
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GCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGT < SRR19973066.620835/150‑1 (MQ=60)
TTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAG > SRR19973066.262828/1‑150 (MQ=60)
ACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCG < SRR19973066.998502/150‑1 (MQ=60)
ACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTG < SRR19973066.3587330/150‑1 (MQ=60)
CTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGA < SRR19973066.3590044/150‑1 (MQ=60)
CTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTCCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGA < SRR19973066.3590062/150‑1 (MQ=60)
CGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACA < SRR19973066.351822/150‑1 (MQ=60)
GCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACAC < SRR19973066.3268147/150‑1 (MQ=60)
GCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACAC < SRR19973066.3268111/150‑1 (MQ=60)
GCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACAC < SRR19973066.3268265/150‑1 (MQ=60)
CTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACG > SRR19973066.2010300/1‑150 (MQ=60)
CTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACG < SRR19973066.253508/150‑1 (MQ=60)
GAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGG > SRR19973066.983337/1‑150 (MQ=60)
AAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTC < SRR19973066.2565892/150‑1 (MQ=60)
AAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTC < SRR19973066.766046/150‑1 (MQ=60)
AAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCG < SRR19973066.2660626/150‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTC < SRR19973066.2005345/150‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTC < SRR19973066.188509/150‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTC < SRR19973066.188421/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGC > SRR19973066.384998/1‑150 (MQ=60)
TGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGC > SRR19973066.2579804/1‑150 (MQ=60)
TGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGC > SRR19973066.440237/1‑150 (MQ=60)
TGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGC > SRR19973066.67320/1‑150 (MQ=60)
GGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCT < SRR19973066.3003425/150‑1 (MQ=60)
GTGGCGATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTG > SRR19973066.3008247/1‑150 (MQ=60)
ATTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACC < SRR19973066.2763855/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCA < SRR19973066.1553611/150‑1 (MQ=60)
TTTCCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCA < SRR19973066.1552951/150‑1 (MQ=60)
CCCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACC < SRR19973066.1684729/150‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCT < SRR19973066.2851489/150‑1 (MQ=60)
CCTGGCTGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCT < SRR19973066.2851696/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAA > SRR19973066.3104769/1‑150 (MQ=60)
CTGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGA > SRR19973066.3182670/1‑150 (MQ=60)
TGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG < SRR19973066.1347090/150‑1 (MQ=60)
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AGATGAATAATCGGCTCAGCAAGGGCGATTTGCCGTGGTATCAGGCCAATATTAATAATTATGTTAATCAGATAGACCTGTTCGTACTGGCTTTACAGCACTACGCTGAACGCAAAATGCTGCTGGTGGTGGCGATTTCCCTGGCTGGCGGCATCGGTATTTTCACGCTGGTCTTTTTTACTTTGCGCCGCATACGCCATCAGGTGGTTGCCCCGCTGAATCAGCTGGTTACCGCCAGTCAGCGTATTGAACACGGGCAGTTCGACTCGCCGCCGCTGGATACCAACCTGCCGAATGAG > CP009273/2579412‑2579710
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |