Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
580,366 |
G→T |
94.6% |
R242S (CGC→AGC) |
ompT ← |
DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 580,366 | 0 | G | T | 94.6%
| 730.3
/ 29.2
| 249 | R242S (CGC→AGC) | ompT | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/7); new base T (110/125); total (117/132) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TTATTGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGCCAATGTAGGGCATTTTAAAACGTTG > CP009273/580221‑580510
|
ttattGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGAt < 2:184620/148‑1 (MQ=255)
tattGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCtata > 2:2109102/1‑148 (MQ=255)
tattGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCtata > 2:165541/1‑148 (MQ=255)
tattGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATa > 2:2553990/1‑148 (MQ=255)
tgtgATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGt > 2:1705273/1‑148 (MQ=255)
cATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCt < 1:710943/148‑1 (MQ=255)
aTAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCtt < 2:1678577/148‑1 (MQ=255)
tAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCttt > 2:1120114/1‑148 (MQ=255)
aaaGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCtttt > 1:1662095/1‑148 (MQ=255)
aaGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCttttt > 1:385501/1‑148 (MQ=255)
aGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTc > 2:1430354/1‑148 (MQ=255)
aGTGAAGTATTACCATTTATATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGATAGTTGTGAAGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATCAGTGATTCTTTTTc > 2:3561247/1‑148 (MQ=255)
gTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTcc > 1:671723/1‑148 (MQ=255)
gTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTcc > 1:2550715/1‑148 (MQ=255)
gAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCg > 1:3010402/1‑148 (MQ=255)
gAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCg < 1:2873372/148‑1 (MQ=255)
ttttttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAgtgt < 2:2981679/148‑1 (MQ=255)
ttttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTc < 2:2296802/148‑1 (MQ=255)
tttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCa < 2:2953104/148‑1 (MQ=255)
ttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCAt < 2:3550630/148‑1 (MQ=255)
ttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCAt > 2:3083866/1‑148 (MQ=255)
ttATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCAt < 2:1441990/148‑1 (MQ=255)
ttATTCGTAACCCGAGTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCAt < 1:2786171/148‑1 (MQ=255)
ttCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGt > 1:2566882/1‑148 (MQ=255)
tCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGtt < 1:3087406/148‑1 (MQ=255)
tCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGtt > 1:1006448/1‑148 (MQ=255)
tCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGtt > 2:3322155/1‑148 (MQ=255)
tAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGCAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATc > 1:584352/1‑148 (MQ=255)
tAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGCAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATc > 1:3133949/1‑148 (MQ=255)
aCCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAg < 1:934573/148‑1 (MQ=255)
aCCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAg > 2:2072703/1‑148 (MQ=255)
cGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAgatg < 1:2332153/148‑1 (MQ=255)
cGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAgatg > 2:1751276/1‑148 (MQ=255)
gATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAgatga > 1:2921302/1‑148 (MQ=255)
aTTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAgatgat > 2:3453140/1‑148 (MQ=255)
ttCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGAtt < 1:3277111/148‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGGTTCCACCCa < 1:1798985/148‑1 (MQ=255)
cgcCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCa < 1:1324482/148‑1 (MQ=255)
tCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGc > 1:2439869/1‑148 (MQ=255)
aaCATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTg < 1:1910510/148‑1 (MQ=255)
cATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTa > 1:2803903/1‑148 (MQ=255)
cATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTa > 1:1893817/1‑148 (MQ=255)
aTAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTAt < 2:3135530/148‑1 (MQ=255)
tAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTAtt > 1:2213533/1‑148 (MQ=255)
aaCTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTa > 1:944380/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTaa > 2:474713/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTaa > 2:1948838/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTaa > 2:862086/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTaa < 1:139054/148‑1 (MQ=255)
cTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTaaa < 1:3410807/148‑1 (MQ=255)
ttttGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAAt < 1:375223/148‑1 (MQ=255)
tttGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAAtg < 2:318599/148‑1 (MQ=255)
tttGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCGTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAAtg < 2:3134014/148‑1 (MQ=255)
gCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGc > 1:1105782/1‑148 (MQ=255)
cGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGcc < 1:2109102/148‑1 (MQ=255)
cGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGcc < 2:1731740/148‑1 (MQ=255)
ttAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAc > 1:2817421/1‑148 (MQ=255)
ttAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAc > 1:2817991/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCg < 1:137705/148‑1 (MQ=255)
gtgtGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAg > 1:2282483/1‑148 (MQ=255)
gtgtGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAg < 2:565497/148‑1 (MQ=255)
gtgtGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAg < 1:1313396/148‑1 (MQ=255)
gACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCa > 2:426222/1‑148 (MQ=255)
aCGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCaa > 1:1725235/1‑148 (MQ=255)
taataaCCTTCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAAt < 2:2240699/148‑1 (MQ=255)
taataaCCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAAt < 1:11683/148‑1 (MQ=255)
taataaCCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAAt < 2:2722547/148‑1 (MQ=255)
aaCCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTc < 1:2256814/148‑1 (MQ=255)
aaCCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTc < 2:1533896/148‑1 (MQ=255)
cTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATa < 1:462877/148‑1 (MQ=255)
cTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATa < 2:2394326/148‑1 (MQ=255)
cTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATa < 2:3366753/148‑1 (MQ=255)
tGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTtaataa > 1:407386/1‑148 (MQ=255)
tGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATaa < 2:2648876/148‑1 (MQ=255)
gCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAAc > 2:2166219/1‑148 (MQ=255)
cATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACg < 2:2948398/148‑1 (MQ=255)
aTTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGa < 1:1992546/148‑1 (MQ=255)
tGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATa < 2:2527773/148‑1 (MQ=255)
gCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTc > 1:3129893/1‑148 (MQ=255)
gCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTc > 2:1150618/1‑148 (MQ=255)
cAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGt < 2:971580/148‑1 (MQ=255)
aGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGGTCAAAATCTTAATAACGATAACTTCCAGTc > 1:1548899/1‑148 (MQ=255)
gAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATTAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCTAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCa < 2:593323/148‑1 (MQ=255)
aaTAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCaa > 2:2885274/1‑148 (MQ=255)
tAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTTCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGc > 1:3451583/1‑148 (MQ=255)
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ACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAAT < SRR19973066.379679/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATG < SRR19973066.3433601/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATG < SRR19973066.782667/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATG < SRR19973066.543873/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCAGAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATG < SRR19973066.3433524/150‑1 (MQ=60)
TTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGT < SRR19973066.378173/150‑1 (MQ=60)
TTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGC > SRR19973066.1113795/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC > SRR19973066.2836361/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC > SRR19973066.2836400/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC > SRR19973066.2836933/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC > SRR19973066.2836938/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC < SRR19973066.2123657/150‑1 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC > SRR19973066.1937840/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCAC < SRR19973066.167038/150‑1 (MQ=60)
AGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTTCAACATAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAG < SRR19973066.139035/150‑1 (MQ=60)
AGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATTTGCCACCGAG > SRR19973066.2298158/1‑150 (MQ=60)
GGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGT > SRR19973066.1403430/1‑150 (MQ=60)
GTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTT < SRR19973066.1322923/150‑1 (MQ=60)
TGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAA > SRR19973066.1737716/1‑150 (MQ=60)
TAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCT > SRR19973066.1145812/1‑150 (MQ=60)
TAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCT < SRR19973066.11872/150‑1 (MQ=60)
AATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTT < SRR19973066.2886062/150‑1 (MQ=60)
AACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCAT < SRR19973066.2831982/150‑1 (MQ=60)
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CCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTAATAA > SRR19973066.410588/1‑150 (MQ=60)
CTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAAC < SRR19973066.466415/150‑1 (MQ=60)
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ATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATA < SRR19973066.2006568/150‑1 (MQ=60)
CTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTC > SRR19973066.3150788/1‑150 (MQ=60)
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AATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTTCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGC > SRR19973066.3474660/1‑150 (MQ=60)
AATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGGATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTACAGTCAAGA > SRR19973066.1541739/1‑150 (MQ=60)
TAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGCCA > SRR19973066.374791/1‑150 (MQ=60)
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GGTCTTTGACCTTACTGCTATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGCCAATGTAGGGCA < SRR19973066.3104469/150‑1 (MQ=60)
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GTTATTATTGTGATCATAAAGTGAAGTATTACCTTTTTTATTCGTAACCCGATTCCATGCGCCTTCAACATAAACTTTTGCGTTAGGTGTGACGTAATAACCTGCATTGACTGCAACAGAATAGTAATTTTGGTCTTTGACCTTACTGCGATAAGTGATTCTTTTTCCCGGGTCATAGTGTTCATCGTTATCAGATGATTCCACCCAGCCGCTGTATTTAAATGTGCCACCGAGTTCAAAATCTTCATAACGATAACTTCCAGTCAAGCCAATGTAGGGCATTTTAAAACGTTGTTT > CP009273/580217‑580513
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
