Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,718,414 |
A→T |
77.6% |
Y167N (TAT→AAT) |
sodC ← |
superoxide dismutase, Cu, Zn, periplasmic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,718,414 | 0 | A | T | 77.6%
| 598.0
/ 170.4
| 280 | Y167N (TAT→AAT) | sodC | superoxide dismutase, Cu, Zn, periplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/28); new base T (114/103); total (149/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TTGCGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTG > CP009273/1718267‑1718559
|
ttGCGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGc < 1:470668/150‑1 (MQ=255)
tGCGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCg < 2:2418850/150‑1 (MQ=255)
cGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGtt < 1:4045984/150‑1 (MQ=255)
cGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGtt > 1:1326109/1‑150 (MQ=255)
gACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCATCTTGAGAAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTc < 1:1679702/150‑1 (MQ=255)
aCAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTca < 2:149169/150‑1 (MQ=255)
aCAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATGACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTca > 1:5097140/1‑150 (MQ=255)
cTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgcc > 1:3515674/1‑150 (MQ=255)
ttGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgcca > 2:1294022/1‑150 (MQ=255)
ttGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTcaccgcca > 2:2775398/1‑150 (MQ=255)
tGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgccac < 1:1887163/150‑1 (MQ=255)
gCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgccacc < 2:4599985/150‑1 (MQ=255)
gCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgccacc < 1:4397518/150‑1 (MQ=255)
cGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCaccgccaccgcc > 2:4574295/1‑150 (MQ=255)
cGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCaccgccaccgcc < 2:4336586/150‑1 (MQ=255)
catcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAg < 2:1385826/150‑1 (MQ=255)
catcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAg < 2:3151715/150‑1 (MQ=255)
atcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGc > 1:52974/1‑150 (MQ=255)
aaCCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTa > 1:4600097/1‑150 (MQ=255)
aCCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAg < 1:1581205/150‑1 (MQ=255)
aCCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAg < 1:449222/150‑1 (MQ=255)
gccgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACCGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTg < 2:1229405/150‑1 (MQ=255)
gccgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTg < 2:1713201/150‑1 (MQ=255)
ccgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGa > 1:4760967/1‑150 (MQ=255)
cgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGAt < 2:4062711/150‑1 (MQ=255)
cgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGAt < 1:3980256/150‑1 (MQ=255)
gccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAATCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACATGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATc < 1:1039453/150‑1 (MQ=255)
gccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCACGGTACGCAGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCAGTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATc > 1:3440149/1‑150 (MQ=255)
gccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATc > 1:3224470/1‑150 (MQ=255)
gTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGAc < 1:2313291/150‑1 (MQ=255)
tGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACa > 1:3634655/1‑150 (MQ=255)
gAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACat > 2:2188614/1‑150 (MQ=255)
aGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACata > 2:4895866/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGGAAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGAGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtatt < 1:2575816/150‑1 (MQ=255)
tGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtatta > 2:1126615/1‑150 (MQ=255)
tGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACCtattc > 2:237689/1‑149 (MQ=255)
cggcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcg > 1:1213779/1‑150 (MQ=255)
gcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgcc < 1:3765969/150‑1 (MQ=255)
aaTTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATCTTATcgccgc > 2:4378202/1‑150 (MQ=255)
gTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTAACGCCGCCAAc > 1:1441996/1‑150 (MQ=255)
ggcggcTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTgg < 2:3863738/150‑1 (MQ=255)
ggcTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTGTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAcc > 2:3676523/1‑150 (MQ=255)
cTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCAt > 2:3327093/1‑150 (MQ=255)
gTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCa > 2:2540004/1‑150 (MQ=255)
tACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCCCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAg < 2:2356999/150‑1 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAgcg > 2:2877240/1‑150 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAgcg > 2:3113017/1‑150 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAgcg > 2:2480286/1‑150 (MQ=255)
cTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCtt < 1:2123979/150‑1 (MQ=255)
atCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCATCTTAATTACTTAATTACACAACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCTGTTTAGGTTGATCGGACATAATATCGCCTCCAAAGTGGACCATCAGCGCtt > 1:2631400/2‑150 (MQ=255)
tCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCtta < 1:2438145/150‑2 (MQ=255)
cGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTg > 1:4784352/1‑150 (MQ=255)
gCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGt > 2:3433784/1‑150 (MQ=255)
tttCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCt < 1:4221730/150‑1 (MQ=255)
tttCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCt > 1:2319237/1‑150 (MQ=255)
ttCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCtt > 1:1046312/1‑150 (MQ=255)
tCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCttt < 2:2847798/150‑1 (MQ=255)
gCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGa > 2:4283088/1‑150 (MQ=255)
aCTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGAttt > 1:4027082/1‑150 (MQ=255)
aCTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGAttt > 1:1593906/1‑150 (MQ=255)
gcaagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCa < 2:3821050/150‑1 (MQ=255)
caagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAg > 2:598896/1‑150 (MQ=255)
caagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTGTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCCTCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAg > 1:1762523/1‑150 (MQ=255)
caagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAg > 2:1663064/1‑150 (MQ=255)
aagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGt > 2:5132888/1‑150 (MQ=255)
caccacCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAt < 2:4697198/150‑1 (MQ=255)
caccacCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAt < 2:1924302/150‑1 (MQ=255)
accaccGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAtt < 2:3970157/150‑1 (MQ=255)
accaccGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAtt < 1:4204186/150‑1 (MQ=255)
accGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCa > 1:381402/1‑150 (MQ=255)
aGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAg < 2:2158722/150‑1 (MQ=255)
aGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAg < 2:480735/150‑1 (MQ=255)
tACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATCTTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGgcg > 2:5092318/1‑150 (MQ=255)
tACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGgcg < 1:1758529/150‑1 (MQ=255)
aCGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGgcgc > 1:1627237/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGa > 1:2958274/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGa > 2:1759247/1‑150 (MQ=255)
cTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGAt > 1:1548329/1‑150 (MQ=255)
ggCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGa < 1:3288449/150‑1 (MQ=255)
tctTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGc < 2:4224430/150‑1 (MQ=255)
tctTAAGTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGc < 2:2997990/150‑1 (MQ=255)
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TGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTG < SRR19973063.1632183/150‑1 (MQ=60)
TGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTATGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTG > SRR19973063.3517623/1‑150 (MQ=60)
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TGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCAT < SRR19973063.2838907/150‑1 (MQ=60)
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AGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCC > SRR19973063.4581018/1‑150 (MQ=60)
CAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAG > SRR19973063.1767930/1‑150 (MQ=60)
CAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTGTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCCTCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAG > SRR19973063.1767944/1‑150 (MQ=60)
CACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAT > SRR19973063.2492748/1‑150 (MQ=60)
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ACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATT < SRR19973063.4217600/150‑1 (MQ=60)
ACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCA > SRR19973063.382493/1‑150 (MQ=60)
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ATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGACGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGAC > SRR19973063.913946/1‑150 (MQ=60)
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ATTTGCGACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGACGA > CP009273/1718265‑1718563
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
