Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,718,414 |
A→T |
94.1% |
Y167N (TAT→AAT) |
sodC ← |
superoxide dismutase, Cu, Zn, periplasmic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,718,414 | 0 | A | T | 94.1%
| 523.0
/ 18.3
| 170 | Y167N (TAT→AAT) | sodC | superoxide dismutase, Cu, Zn, periplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/4); new base T (66/94); total (72/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGA > CP009273/1718271‑1718560
|
gACAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGt > 2:1075105/1‑148 (MQ=255)
aGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTca > 2:3039628/1‑148 (MQ=255)
cTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccg > 1:2522584/1‑148 (MQ=255)
ttGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgc < 2:403778/148‑1 (MQ=255)
tGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgcc > 1:830464/1‑148 (MQ=255)
tGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTcaccgcc < 2:1959589/148‑1 (MQ=255)
gTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTcaccgccaccgc > 2:838482/1‑148 (MQ=255)
tcatcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCaccgccaccgcc < 2:2777522/148‑1 (MQ=255)
catcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGccc > 1:450606/1‑148 (MQ=255)
catcatcaACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGccc > 1:20716/1‑148 (MQ=255)
aaCCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGtt < 2:111336/148‑1 (MQ=255)
aCCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGttt > 1:562654/1‑148 (MQ=255)
ccTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTa > 2:2088041/1‑148 (MQ=255)
ccTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTa < 1:3087946/148‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTa < 1:1923447/148‑1 (MQ=255)
cTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAg < 2:2911208/148‑1 (MQ=255)
cTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAg < 1:1067092/148‑1 (MQ=255)
gccgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGt < 1:806303/148‑1 (MQ=255)
ccgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGtt < 1:3087743/148‑1 (MQ=255)
cgggcGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGGGTCTTTTATGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCTAGCACCTCCGCTTGTTAATGTGGCCTGTTTATTAGTTAATTACACCCCAGGCAGTGGTTTAACCGCCAAAGCCGAGCGGTTTAGGTTg < 2:112981/144‑1 (MQ=255)
cgccCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTg < 1:1093135/148‑1 (MQ=255)
ccGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATc < 1:1759146/148‑1 (MQ=255)
tGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGa < 2:915600/148‑1 (MQ=255)
tGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGa < 2:523283/148‑1 (MQ=255)
gAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGAc < 2:2950972/148‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGCAATTGTCTGGCGTCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACat < 2:103621/148‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACat < 2:2481537/148‑1 (MQ=255)
cTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACata < 2:3223286/148‑1 (MQ=255)
gcggcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTACTTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtatta > 2:1375202/1‑148 (MQ=255)
cggcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtattat > 2:529092/1‑148 (MQ=255)
cggcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtattat < 1:3351302/148‑1 (MQ=255)
cggcAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACAtattat < 1:393971/148‑1 (MQ=255)
cAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgc > 2:1905597/1‑148 (MQ=255)
cAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgc > 2:2544344/1‑148 (MQ=255)
aaTTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgcc > 1:3259440/1‑148 (MQ=255)
ttGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgccgc > 1:2895199/1‑148 (MQ=255)
ttGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATcgccgc < 1:1558321/148‑1 (MQ=255)
tCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCaa > 2:3419920/1‑148 (MQ=255)
tCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCaa > 2:1170605/1‑148 (MQ=255)
gcTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc < 1:2269059/148‑1 (MQ=255)
gcTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGAc > 2:500802/1‑148 (MQ=255)
tGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCa > 2:257231/1‑148 (MQ=255)
tGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCa > 2:256959/1‑148 (MQ=255)
gTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCAt < 1:3197617/148‑1 (MQ=255)
tACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATc < 2:450606/148‑1 (MQ=255)
tACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATc < 1:3286508/148‑1 (MQ=255)
tACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATc < 1:310973/148‑1 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAg < 1:2318271/148‑1 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAg > 2:2063775/1‑148 (MQ=255)
cTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAg < 2:3268999/148‑1 (MQ=255)
cTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTg < 1:1367252/148‑1 (MQ=255)
cTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTg > 1:2799293/1‑148 (MQ=255)
tttCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGt < 2:788855/148‑1 (MQ=255)
ttCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTc > 1:349134/1‑148 (MQ=255)
tCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCt < 1:102692/148‑1 (MQ=255)
cGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCtt < 1:1063367/148‑1 (MQ=255)
cAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTg < 1:72419/148‑1 (MQ=255)
cAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTg < 2:2423577/148‑1 (MQ=255)
aCTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGAt < 2:2354135/148‑1 (MQ=255)
ttGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGAttt > 2:541875/1‑148 (MQ=255)
tGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTTATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTc < 2:234295/148‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTc < 2:1485253/148‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTc < 1:2412056/148‑1 (MQ=255)
tGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTc < 2:124179/148‑1 (MQ=255)
caagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATcc < 1:351074/148‑1 (MQ=255)
caagcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATcc > 1:553075/1‑148 (MQ=255)
agcaCCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAg < 2:3139116/148‑1 (MQ=255)
ccaccGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAt < 1:1458064/148‑1 (MQ=255)
caccGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAtt > 2:3254909/1‑148 (MQ=255)
accGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGAttt < 2:477836/148‑1 (MQ=255)
gCAAGTTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAg < 2:3399480/148‑1 (MQ=255)
gCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAg < 2:1661385/148‑1 (MQ=255)
aGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACg < 1:468380/148‑1 (MQ=255)
ggTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGa > 2:1274786/1‑148 (MQ=255)
gTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAg > 1:2794024/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGgc > 2:803495/1‑148 (MQ=255)
cGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGgcg < 1:700171/148‑1 (MQ=255)
ggCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGAt > 1:3234747/1‑148 (MQ=255)
gCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATg < 1:610731/148‑1 (MQ=255)
gCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATg < 2:1632394/148‑1 (MQ=255)
tctTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACg < 2:3315620/148‑1 (MQ=255)
cttaattacttaattaCACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACgg > 1:1135499/1‑148 (MQ=255)
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CGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCG < SRR19973065.704830/150‑1 (MQ=60)
CTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGAT > SRR19973065.3254207/1‑150 (MQ=60)
GCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGAC < SRR19973065.614627/150‑1 (MQ=60)
CTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGG > SRR19973065.1142860/1‑150 (MQ=60)
CTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCA > SRR19973065.494523/1‑150 (MQ=60)
TTAATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCAT > SRR19973065.2946936/1‑150 (MQ=60)
TAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCTGTTTATGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATACAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGAATC > SRR19973065.1806997/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGG > SRR19973065.3077435/1‑150 (MQ=60)
ATTACTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGG > SRR19973065.3077384/1‑150 (MQ=60)
CTTAATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGC > SRR19973065.3063609/1‑150 (MQ=60)
ATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTG < SRR19973065.3232037/150‑1 (MQ=60)
ATTACACCACAGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTG < SRR19973065.285358/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT > SRR19973065.484573/1‑150 (MQ=60)
AGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT < SRR19973065.2260979/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT > SRR19973065.1740264/1‑150 (MQ=60)
AGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT < SRR19973065.1298221/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT < SRR19973065.1297427/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTGCGGTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTAT < SRR19973065.1298225/150‑1 (MQ=60)
GCATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTG < SRR19973065.1918117/150‑1 (MQ=60)
ATTGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGAC < SRR19973065.3447046/150‑1 (MQ=60)
TAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGACG < SRR19973065.843944/150‑1 (MQ=60)
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CAGCCTTGCCCGTCATCATCAACCTGCCGCCCGTGAGCTGGCGGCAATTGTCTGGCGGCTGTACTGCTCGCTTTCGCAACTTGAGCAAGCACCACCGCAAGGTACGCTGGCCTCTTAATTACTTAATTACACCACAGGCATAGCGTTCACCGCCACCGCCCAGCGGTTTAGGTTGATCGGACATATTATCGCCGCCAACGTGGACCATCAGCGCTTTGTCTTTGATTTCATCCAGTGATTTCAGACGAGGCGCGATGACGGCATCGGTAGCTTTGCCGTCATTATTGACG > CP009273/1718273‑1718562
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
