Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,940,498 |
G→T |
100% |
intergenic (‑61/‑10) |
yobI ← / → yebB |
uncharacterized protein/DUF830 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,940,498 | 0 | G | T | 98.6%
| 664.5
/ 0.5
| 208 | intergenic (‑61/‑10) | yobI/yebB | uncharacterized protein/DUF830 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (118/87); total (119/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
GTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAAC > CP009273/1940353‑1940642
|
gTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTaa < 1:1900041/148‑1 (MQ=255)
tataATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAAt > 2:1721676/1‑148 (MQ=255)
taATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGa < 1:143112/148‑1 (MQ=255)
aTTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACa < 2:966732/148‑1 (MQ=255)
tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACaa > 2:3081561/1‑148 (MQ=255)
tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACaa > 2:1110144/1‑148 (MQ=255)
tATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACg < 2:597144/148‑1 (MQ=255)
aTTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGt > 2:1795609/1‑148 (MQ=255)
tCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGa < 1:1319113/148‑1 (MQ=255)
aCAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAata > 2:1854345/1‑148 (MQ=255)
cAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAatat < 2:654423/148‑1 (MQ=255)
ggTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATAGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatta < 2:2292501/148‑1 (MQ=255)
gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa > 2:742598/1‑148 (MQ=255)
gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa < 1:1090694/148‑1 (MQ=255)
atTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAcc < 1:1367386/148‑1 (MQ=255)
tGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCct > 2:1906603/1‑148 (MQ=255)
gAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCctgc < 2:3434335/148‑1 (MQ=255)
gAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCctgc < 2:1451665/148‑1 (MQ=255)
aaGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCctgct > 1:636334/1‑148 (MQ=255)
tcAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGa < 2:2013239/147‑1 (MQ=255)
cAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGaa > 2:3374532/1‑148 (MQ=255)
aaTATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTAAATTTAATGACAACGTGAATATTAATTACACTGCTGAata > 1:3369659/1‑148 (MQ=255)
atatTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAatat > 2:155015/1‑148 (MQ=255)
ttttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGaa < 2:2056450/148‑1 (MQ=255)
tttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGaaa < 1:1520724/148‑1 (MQ=255)
ttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAAt > 2:1292701/1‑148 (MQ=255)
ttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAAt < 2:2728996/148‑1 (MQ=255)
tAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAAtt < 1:2002338/148‑1 (MQ=255)
atatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTgg < 2:890204/148‑1 (MQ=255)
tatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGga > 1:3396344/1‑148 (MQ=255)
atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag < 1:1680330/148‑1 (MQ=255)
atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag > 2:2266193/1‑148 (MQ=255)
ttACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgaga > 2:1803832/1‑148 (MQ=255)
ttACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgaga > 2:3312288/1‑148 (MQ=255)
tACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGat > 1:2800729/1‑148 (MQ=255)
aCATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGata < 2:95423/148‑1 (MQ=255)
aCATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGata < 1:2149510/148‑1 (MQ=255)
atatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATc > 1:2754085/1‑148 (MQ=255)
atatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATc > 1:2849686/1‑148 (MQ=255)
tatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCg > 1:1668628/1‑148 (MQ=255)
atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGt > 1:2291149/1‑148 (MQ=255)
atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGt > 2:1230934/1‑148 (MQ=255)
ttCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc < 1:2884286/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc < 1:1133374/148‑1 (MQ=255)
tCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCt < 2:3015505/148‑1 (MQ=255)
gaagaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACa < 2:396092/148‑1 (MQ=255)
agaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATg > 2:494261/1‑148 (MQ=255)
gaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt > 1:3025209/1‑148 (MQ=255)
gaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt > 1:1719523/1‑148 (MQ=255)
gaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCATGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt > 1:3456667/1‑148 (MQ=255)
aaTGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGtat < 1:1795609/148‑1 (MQ=255)
aataaAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGtgct > 1:899255/1‑148 (MQ=255)
taaAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGtgctgc < 1:2635728/148‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGGAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGcc > 2:2521004/1‑148 (MQ=255)
aaaTATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt > 2:718695/1‑148 (MQ=255)
aCATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTgg > 2:1030165/1‑148 (MQ=255)
aTTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTc > 1:383309/1‑148 (MQ=255)
ttGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCa < 1:2263006/148‑1 (MQ=255)
cgcCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTAAGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGATGAAGATGAAATTGTAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTAATTTGTTCAAat > 1:763539/1‑148 (MQ=255)
gcCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata < 2:1362664/148‑1 (MQ=255)
gcCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata < 1:309086/148‑1 (MQ=255)
ctcctGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATc > 1:1484465/1‑148 (MQ=255)
tcctGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCa > 1:1845957/1‑148 (MQ=255)
cctGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAg < 1:3128987/148‑1 (MQ=255)
gAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTg > 1:2738570/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGc < 1:2329402/148‑1 (MQ=255)
aaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATGTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt < 2:1271580/148‑1 (MQ=255)
ataaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCaa > 2:1947249/1‑148 (MQ=255)
aaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCaaag > 2:2643070/1‑147 (MQ=255)
aaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAt < 2:2206580/148‑1 (MQ=255)
aaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAt < 2:2814772/148‑1 (MQ=255)
aaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAt > 1:2217837/1‑148 (MQ=255)
aatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAtt > 2:1035704/1‑148 (MQ=255)
aatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAtt > 1:1966859/1‑148 (MQ=255)
ttttttATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGc > 1:2530976/1‑148 (MQ=255)
ttATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGa < 2:3454433/148‑1 (MQ=255)
gCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTaa > 1:1375165/1‑148 (MQ=255)
gCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTaa < 2:1655864/148‑1 (MQ=255)
cTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAAt < 2:427903/148‑1 (MQ=255)
tATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATc < 1:1822400/148‑1 (MQ=255)
tATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATc > 1:735453/1‑148 (MQ=255)
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atatTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCggg > 2:1827428/1‑148 (MQ=255)
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ACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTC > SRR19973065.385988/1‑150 (MQ=60)
TTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAA < SRR19973065.2277315/150‑1 (MQ=60)
TTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAA < SRR19973065.2277311/150‑1 (MQ=60)
TGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTAAGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGATGAAGATGAAATTGTAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTAATTTGTTCAAAT > SRR19973065.768619/1‑150 (MQ=60)
GCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATC < SRR19973065.311160/150‑1 (MQ=60)
GCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATC < SRR19973065.2888655/150‑1 (MQ=60)
GCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATC > SRR19973065.1493932/1‑150 (MQ=60)
CCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCA > SRR19973065.1858123/1‑150 (MQ=60)
CCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCT < SRR19973065.3148031/150‑1 (MQ=60)
CCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCT < SRR19973065.3342487/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTG > SRR19973065.2755650/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTG < SRR19973065.2987312/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTG > SRR19973065.2755607/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTG > SRR19973065.2755605/1‑150 (MQ=60)
AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAT < SRR19973065.2343974/150‑1 (MQ=60)
AAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCA > SRR19973065.2496291/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAT > SRR19973065.2231998/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAT > SRR19973065.1413403/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAT > SRR19973065.1711261/1‑150 (MQ=60)
TAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATT < SRR19973065.1806715/150‑1 (MQ=60)
TAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATT > SRR19973065.1979694/1‑150 (MQ=60)
AATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGC > SRR19973065.2546863/1‑150 (MQ=60)
ATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAA > SRR19973065.1384239/1‑150 (MQ=60)
TGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAAT > SRR19973065.199443/1‑150 (MQ=60)
GCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATC > SRR19973065.740369/1‑150 (MQ=60)
TATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCAC < SRR19973065.1834401/150‑1 (MQ=60)
ATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACG > SRR19973065.1569630/1‑150 (MQ=60)
GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973065.422215/1‑150 (MQ=60)
GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973065.422224/1‑150 (MQ=60)
GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973065.1079598/1‑150 (MQ=60)
GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973065.2465672/1‑150 (MQ=60)
GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973065.2195587/1‑150 (MQ=60)
TATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGA > SRR19973065.3425034/1‑150 (MQ=60)
TATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGA > SRR19973065.1678022/1‑150 (MQ=60)
ATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCA > SRR19973065.435735/1‑150 (MQ=60)
TTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCAT < SRR19973065.1733108/150‑1 (MQ=60)
TGTATCTATTTCAATGTAATTACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTA > SRR19973065.1329281/1‑150 (MQ=60)
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TATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATC > SRR19973065.1086778/1‑150 (MQ=60)
CTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGT < SRR19973065.2726136/150‑1 (MQ=60)
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CAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAAC > SRR19973065.915934/1‑150 (MQ=60)
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CAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAAC > SRR19973065.1302303/1‑150 (MQ=60)
CAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAAC > SRR19973065.3061031/1‑150 (MQ=60)
CAATGTAATGACAAAGTGAATATTAATTACCCAGCTGAATATGAAATTGGAGATATCTTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTTCTGGAGTAATCACTTCGGGATCATTATCGGTCATAAC > SRR19973065.2543436/1‑150 (MQ=60)
GTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACGGTG > SRR19973065.515942/1‑150 (MQ=60)
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CAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACGGTG > CP009273/1940351‑1940646
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
