Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,940,498 |
G→T |
100% |
intergenic (‑61/‑10) |
yobI ← / → yebB |
uncharacterized protein/DUF830 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,940,498 | 0 | G | T | 99.2%
| 1190.2
/ ‑0.2
| 372 | intergenic (‑61/‑10) | yobI/yebB | uncharacterized protein/DUF830 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (184/183); total (188/184) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
CAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACG > CP009273/1940351‑1940643
|
caGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTaa > 2:2378354/1‑150 (MQ=255)
aGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAAt > 1:1031320/1‑150 (MQ=255)
aGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAAt > 1:4299919/1‑150 (MQ=255)
gTATAATTTATTCTACAGTTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATg < 1:1623269/150‑1 (MQ=255)
gTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATg > 1:1848576/1‑150 (MQ=255)
ataATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGAc > 1:3244340/1‑150 (MQ=255)
ataATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGAc < 1:5194508/150‑1 (MQ=255)
taATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACa > 2:5018423/1‑150 (MQ=255)
taATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACa < 1:3637238/150‑1 (MQ=255)
aaTTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACaa > 2:256831/1‑150 (MQ=255)
tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACg < 2:4823629/150‑1 (MQ=255)
tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACg < 2:3949758/150‑1 (MQ=255)
ttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGt > 2:1800208/1‑150 (MQ=255)
aTTCTACAGGTTATATTGGAAGCAACTATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGa < 2:3170314/150‑1 (MQ=255)
aTTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGa < 2:4747918/150‑1 (MQ=255)
tCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAat < 1:640767/150‑1 (MQ=255)
cTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAata > 1:1332999/1‑150 (MQ=255)
tACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAatat < 2:877758/150‑1 (MQ=255)
aCAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatt < 2:3752145/150‑1 (MQ=255)
aCAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatt < 2:4671450/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatta > 1:4012115/1‑150 (MQ=255)
aGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa < 1:5029105/150‑1 (MQ=255)
aGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa > 2:1589129/1‑150 (MQ=255)
ggTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaat < 1:2091483/150‑1 (MQ=255)
gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatt < 1:959037/150‑1 (MQ=255)
gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatt < 1:3560626/150‑1 (MQ=255)
ttATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatta < 2:4985020/150‑1 (MQ=255)
tataTTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAc > 1:3341130/1‑150 (MQ=255)
atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAcc > 1:3196698/1‑150 (MQ=255)
atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAcc < 1:2607169/150‑1 (MQ=255)
atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATAGTAATTAcc > 2:2836761/1‑150 (MQ=255)
tatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAccc > 2:3697711/1‑150 (MQ=255)
atTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCct > 1:377764/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTCATGACAACGAGAATATTAATTACCctgct > 1:794437/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCctgct < 1:1240644/150‑1 (MQ=255)
cAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAata < 2:2077483/150‑1 (MQ=255)
cAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAata < 1:4573983/150‑1 (MQ=255)
atatTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGa < 2:4238379/150‑1 (MQ=255)
tatTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGaa > 1:113745/1‑150 (MQ=255)
tttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAAtt < 1:4849785/150‑1 (MQ=255)
tAATATTACATATTCAGTTAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTgg < 2:3062779/150‑1 (MQ=255)
tAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTgg > 2:1061145/1‑150 (MQ=255)
atatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag < 1:4717373/150‑1 (MQ=255)
atatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag < 1:2436579/150‑1 (MQ=255)
atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGat < 1:3502915/150‑1 (MQ=255)
atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATCGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGat < 2:1296514/150‑1 (MQ=255)
ttACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGata > 2:3616055/1‑150 (MQ=255)
tACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGAAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGatat > 1:2852020/1‑150 (MQ=255)
atatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGt > 2:935818/1‑150 (MQ=255)
tatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc < 1:1014869/150‑1 (MQ=255)
tatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc > 2:4432037/1‑150 (MQ=255)
atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCt < 2:838925/150‑1 (MQ=255)
atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCt > 1:3398411/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCTTCTTTACAt > 2:4109657/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACAt < 1:5300890/150‑1 (MQ=255)
aagaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt < 1:4173884/150‑1 (MQ=255)
aagaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATAGTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACACTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt > 2:3825691/1‑150 (MQ=255)
tGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGt < 1:2367367/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:2142707/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:2011767/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:4494861/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 2:2683860/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 2:216966/150‑1 (MQ=255)
aaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTa < 2:1480615/150‑1 (MQ=255)
aaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTa < 1:4410977/150‑1 (MQ=255)
aaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAt < 1:722999/150‑1 (MQ=255)
aaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAtt > 1:4809591/1‑150 (MQ=255)
atatACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAttt > 2:5248567/1‑150 (MQ=255)
atatACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAttt < 2:1150193/150‑1 (MQ=255)
ataCATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATTAATAGGTGCTGCCTTATTTgg > 2:4335893/1‑150 (MQ=255)
gcgcCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata > 2:2932144/1‑150 (MQ=255)
cgcCTCCTGAAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata > 2:552100/1‑150 (MQ=255)
cctG‑AAAATATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCt < 2:4544462/150‑1 (MQ=255)
tG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGc < 1:1407306/150‑1 (MQ=255)
g‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCa > 2:1953913/1‑150 (MQ=255)
g‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCa < 1:4549723/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt < 2:3032939/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt < 2:1182444/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCAATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATATGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt > 1:893421/1‑150 (MQ=255)
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aaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCa > 2:3661615/1‑150 (MQ=255)
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AAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCA > SRR19973062.5008930/1‑150 (MQ=60)
AAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCA > SRR19973062.3466443/1‑150 (MQ=60)
AAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAA > SRR19973062.5116543/1‑150 (MQ=60)
AAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAA > SRR19973062.381726/1‑150 (MQ=60)
AATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAA > SRR19973062.1869650/1‑150 (MQ=60)
AATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAA > SRR19973062.3531368/1‑150 (MQ=60)
AATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAA > SRR19973062.5019809/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAAT > SRR19973062.4297365/1‑150 (MQ=60)
AAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTG < SRR19973062.1672714/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCT < SRR19973062.2048225/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTG > SRR19973062.1077445/1‑150 (MQ=60)
TTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTG > SRR19973062.1077490/1‑150 (MQ=60)
TTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTG > SRR19973062.1122515/1‑150 (MQ=60)
TTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGG < SRR19973062.3118518/150‑1 (MQ=60)
TTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGA < SRR19973062.509572/150‑1 (MQ=60)
TTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAG < SRR19973062.1289661/150‑1 (MQ=60)
TTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAG < SRR19973062.1795791/150‑1 (MQ=60)
TATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACTTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGAATCAAATTGCTGGAGTA > SRR19973062.4523700/1‑150 (MQ=60)
TATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTA > SRR19973062.461670/1‑150 (MQ=60)
TATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTA > SRR19973062.4523707/1‑150 (MQ=60)
ATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCTATGTTATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTTTAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAA < SRR19973062.1403521/150‑1 (MQ=60)
ATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAA > SRR19973062.2958958/1‑150 (MQ=60)
TGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAAT > SRR19973062.2726670/1‑150 (MQ=60)
TGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAAT > SRR19973062.4962225/1‑150 (MQ=60)
GCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATC > SRR19973062.226793/1‑150 (MQ=60)
CTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCA < SRR19973062.867885/150‑1 (MQ=60)
CTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCA > SRR19973062.1633249/1‑150 (MQ=60)
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CTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCA > SRR19973062.3711508/1‑150 (MQ=60)
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ATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACAGTTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACG > SRR19973062.2257706/1‑150 (MQ=60)
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GTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGG > SRR19973062.396945/1‑150 (MQ=60)
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CACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTGAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACGGTGA > CP009273/1940349‑1940647
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
