Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,542,627 |
T→G |
100% |
I389M (ATT→ATG) |
yfeW → |
penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,542,627 | 0 | T | G | 98.9%
| 825.9
/ ‑3.6
| 205 | I389M (ATT→ATG) | yfeW | penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/3); new base G (88/113); total (89/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.34e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542482‑2542771
|
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGTGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtgt < 1:2197552/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGTGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtgt < 1:430389/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtgt < 1:1067132/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtgt < 1:2819205/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggt < 2:369028/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggt > 1:2525679/1‑148 (MQ=255)
tGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggtg > 2:3097427/1‑148 (MQ=255)
tGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggtg < 2:79137/148‑1 (MQ=255)
gCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGa > 1:1211549/1‑148 (MQ=255)
cACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATg > 1:2137680/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGt > 1:2508849/1‑148 (MQ=255)
cTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGtt < 1:2305146/148‑1 (MQ=255)
cTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGtt < 1:2921630/148‑1 (MQ=255)
tttGGCCTCGGCTAGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTaa > 2:1030336/1‑148 (MQ=255)
ccTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaac > 1:296972/1‑148 (MQ=255)
cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaaca < 1:525607/148‑1 (MQ=255)
tCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaacaa > 1:863847/1‑148 (MQ=255)
tCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaacaa > 2:307618/1‑148 (MQ=255)
cGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAg < 2:268146/148‑1 (MQ=255)
cGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAg < 1:2598075/148‑1 (MQ=255)
ggCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCcaca < 2:35502/148‑1 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGTACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAt < 1:386220/148‑1 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAt < 1:2086529/148‑1 (MQ=255)
tGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGcc < 2:3075084/148‑1 (MQ=255)
gAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCg > 2:1455666/1‑148 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCgg < 1:811619/148‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCgg < 2:1804821/148‑1 (MQ=255)
ggTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGca > 2:736334/1‑127 (MQ=255)
ggTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGca < 1:736334/127‑1 (MQ=255)
tAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTAGCCGGTTGcc > 2:2294482/1‑148 (MQ=255)
aaTGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCg < 1:3396757/148‑1 (MQ=255)
aTGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGACCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGa > 2:2485659/1‑148 (MQ=255)
tGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGAt > 1:2748048/1‑148 (MQ=255)
tGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGAt > 2:572252/1‑148 (MQ=255)
gCCACGATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAAGCTACGGTCACCCTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATGCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACTAGCCACATTCGGCTGTTGCCGATc < 2:2099889/148‑1 (MQ=255)
gCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATc < 2:1511537/148‑1 (MQ=255)
gCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATc < 2:1512363/148‑1 (MQ=255)
ccaccaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATcc > 1:1440137/1‑148 (MQ=255)
aCGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGa < 1:63641/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGa > 2:186562/1‑148 (MQ=255)
cGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGaa < 2:2000731/148‑1 (MQ=255)
cGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGaa < 2:1005160/148‑1 (MQ=255)
tGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATg < 2:919556/148‑1 (MQ=255)
tGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATg < 2:186133/148‑1 (MQ=255)
ggCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGACTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGt < 1:1495362/148‑1 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGtt > 1:1143907/1‑148 (MQ=255)
cGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGGGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCTCCGGTTGCCGATCCGCCAAAGAATCCCAATATGTTCGa > 2:1145686/1‑148 (MQ=255)
cTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGaaa < 2:564664/148‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTGACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAg > 2:3285067/1‑148 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATCTGTTCGAAAg > 2:2418503/1‑148 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAg > 1:690442/1‑148 (MQ=255)
gCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg < 1:2917168/148‑1 (MQ=255)
gCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg < 2:618834/148‑1 (MQ=255)
aaGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGt < 1:1104509/148‑1 (MQ=255)
gCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCa > 1:2021895/1‑148 (MQ=255)
gCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCa > 1:1316312/1‑148 (MQ=255)
cccGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAg < 1:3100086/148‑1 (MQ=255)
aCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGa < 2:558570/148‑1 (MQ=255)
aCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGa < 2:1087897/148‑1 (MQ=255)
aCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGa < 1:148909/148‑1 (MQ=255)
aCCTAAGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATAATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAGTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATACCTATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGa < 1:151022/148‑1 (MQ=255)
cGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCa < 2:2525679/148‑1 (MQ=255)
ggTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCaa < 1:1672279/148‑1 (MQ=255)
gTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAAc < 2:260766/148‑1 (MQ=255)
tCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACAGTTATCGATCCGGTGAATCATGTGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCCACt > 1:893855/1‑148 (MQ=255)
cacaCTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCACCtt > 2:2775144/1‑148 (MQ=255)
cacaCTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCACCtt > 2:1020982/1‑148 (MQ=255)
cacaCTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACtt > 2:282600/1‑148 (MQ=255)
tggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGACTCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGt > 1:3215529/1‑148 (MQ=255)
tggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGt < 1:228600/148‑1 (MQ=255)
tggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGt < 1:2346525/148‑1 (MQ=255)
ggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGt < 2:3080165/148‑1 (MQ=255)
gACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTa > 1:2580425/1‑148 (MQ=255)
ccGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGt < 1:2615154/148‑1 (MQ=255)
cGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGtt < 2:2860812/148‑1 (MQ=255)
gAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGa > 1:2773553/1‑148 (MQ=255)
aaCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGAt > 1:2826483/1‑148 (MQ=255)
aCGGTGATCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATc < 1:1836725/148‑1 (MQ=255)
aCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATc > 2:1441924/1‑148 (MQ=255)
aCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATc > 1:3502072/1‑148 (MQ=255)
gACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAggag > 2:2775796/1‑146 (MQ=255)
aCCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGgtgt > 2:299499/1‑148 (MQ=255)
ttATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCACAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgc > 2:628649/1‑148 (MQ=255)
tATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcg > 2:2435838/1‑148 (MQ=255)
cGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcggcg > 2:670940/1‑148 (MQ=255)
ccGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTaa < 2:949340/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTaa < 1:2708247/148‑1 (MQ=255)
ggTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAg < 2:1262828/148‑1 (MQ=255)
gAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAg > 1:3073232/1‑148 (MQ=255)
aaTCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGa < 1:2086845/148‑1 (MQ=255)
aTCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGaa > 1:2787059/1‑148 (MQ=255)
tCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAg > 1:1699723/1‑148 (MQ=255)
tatGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaa < 1:1245429/148‑1 (MQ=255)
tatGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaa < 1:1001559/148‑1 (MQ=255)
tatGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaa < 2:938891/148‑1 (MQ=255)
ttGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGAAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCATAAGtaat < 1:3457628/147‑1 (MQ=255)
atGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaat > 1:210753/1‑148 (MQ=255)
atGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaat > 1:210736/1‑148 (MQ=255)
cGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCACAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTGATGGTTGGGTAGTTGATCAGGGGAATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATaaaa > 2:3243135/1‑148 (MQ=255)
gATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATaaaaa < 1:3272118/148‑1 (MQ=255)
|
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542482‑2542771
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > CP009273/2542479‑2542775
|
AAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGG > SRR19973065.1095069/1‑150 (MQ=60)
AAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGG > SRR19973065.2857810/1‑150 (MQ=60)
AGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGT > SRR19973065.2541534/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGTGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGA < SRR19973065.433377/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGTGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGA < SRR19973065.2211627/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGA < SRR19973065.1074197/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGA < SRR19973065.2836621/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGA < SRR19973065.732228/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGA > SRR19973065.1219373/1‑150 (MQ=60)
GCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATG > SRR19973065.2151433/1‑150 (MQ=60)
CCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGT > SRR19973065.2525427/1‑150 (MQ=60)
CCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGT > SRR19973065.2524614/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAA < SRR19973065.3251516/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAA < SRR19973065.2319638/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAA < SRR19973065.2939390/150‑1 (MQ=60)
TTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGC < SRR19973065.3088785/150‑1 (MQ=60)
TTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCA < SRR19973065.406094/150‑1 (MQ=60)
TGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAA < SRR19973065.510926/150‑1 (MQ=60)
acgtgtgctcttccgatctATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAAC < SRR19973065.741258/131‑1 (MQ=60)
GGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAAC > SRR19973065.298888/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAA > SRR19973065.2322115/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAA > SRR19973065.3135167/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAA > SRR19973065.869402/1‑150 (MQ=60)
CTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAG < SRR19973065.529058/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCC < SRR19973065.2614148/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCC < SRR19973065.2614219/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCC > SRR19973065.265090/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCC < SRR19973065.845444/150‑1 (MQ=60)
GGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATT < SRR19973065.747382/150‑1 (MQ=60)
GGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATT < SRR19973065.127594/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGTACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.388915/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGTACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.388101/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.521631/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.317920/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.2099907/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973065.2099946/150‑1 (MQ=60)
CGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCG < SRR19973065.2890481/150‑1 (MQ=60)
CGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCG < SRR19973065.1129554/150‑1 (MQ=60)
AATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTT < SRR19973065.816973/150‑1 (MQ=60)
TAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGA > SRR19973065.2125218/1‑150 (MQ=60)
TAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGA > SRR19973065.1081168/1‑150 (MQ=60)
AATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGAT < SRR19973065.3417523/150‑1 (MQ=60)
AATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGAT > SRR19973065.2765151/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATC < SRR19973065.3418308/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATC < SRR19973065.2837630/150‑1 (MQ=60)
TGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCC > SRR19973065.1449470/1‑150 (MQ=60)
GACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAA > SRR19973065.2801130/1‑150 (MQ=60)
ACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAAT < SRR19973065.64321/150‑1 (MQ=60)
TTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGT < SRR19973065.1974615/150‑1 (MQ=60)
TGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCACAAGAATCCCAAGATGTT > SRR19973065.1152000/1‑150 (MQ=60)
TGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTT > SRR19973065.1151294/1‑150 (MQ=60)
GGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGACTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTC < SRR19973065.1504888/150‑1 (MQ=60)
GGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGACTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTC < SRR19973065.1504977/150‑1 (MQ=60)
CACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGA < SRR19973065.247900/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAG > SRR19973065.695040/1‑150 (MQ=60)
GGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGG < SRR19973065.624809/150‑1 (MQ=60)
GCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGT < SRR19973065.2934911/150‑1 (MQ=60)
GCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGT < SRR19973065.2934932/150‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA > SRR19973065.1325092/1‑150 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA < SRR19973065.1111754/150‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA > SRR19973065.1325018/1‑150 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA > SRR19973065.2034901/1‑150 (MQ=60)
GCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGT < SRR19973065.97853/150‑1 (MQ=60)
CCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGTAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTTATTTTAATCAACAAGCCACATTCGCAGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTT < SRR19973065.3115066/150‑1 (MQ=60)
CCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTT < SRR19973065.3119012/150‑1 (MQ=60)
CGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGC > SRR19973065.229132/1‑150 (MQ=60)
AAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGA > SRR19973065.672723/1‑150 (MQ=60)
AACCTACGGTCACACTGGCTGGACCTGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAT < SRR19973065.935584/150‑1 (MQ=60)
AACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAT > SRR19973065.1234368/1‑150 (MQ=60)
AACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAT > SRR19973065.1070207/1‑150 (MQ=60)
ACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATT < SRR19973065.2748415/150‑1 (MQ=60)
ACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATT < SRR19973065.150794/150‑1 (MQ=60)
ACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATT < SRR19973065.150165/150‑1 (MQ=60)
ACCTAAGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATAATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAGTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATACCTATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATT < SRR19973065.152292/150‑1 (MQ=60)
CGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAAC < SRR19973065.1661769/150‑1 (MQ=60)
GGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACT < SRR19973065.1683550/150‑1 (MQ=60)
GGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACT < SRR19973065.1683465/150‑1 (MQ=60)
GGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACAGTTATCGATCCGGTGAATCATGTGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCCACT > SRR19973065.899533/1‑150 (MQ=60)
TCACTCTGGCTGGACCGGAACTGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCTACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTA < SRR19973065.2769865/150‑1 (MQ=60)
TCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTA < SRR19973065.3316159/150‑1 (MQ=60)
CACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGG < SRR19973065.2114718/150‑1 (MQ=60)
ACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGACTCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGT > SRR19973065.3234867/1‑150 (MQ=60)
TGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTG < SRR19973065.1483125/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTG < SRR19973065.230274/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTG < SRR19973065.2361157/150‑1 (MQ=60)
TGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTA > SRR19973065.2596631/1‑150 (MQ=60)
TGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTA > SRR19973065.2596515/1‑150 (MQ=60)
TGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTA > SRR19973065.2596442/1‑150 (MQ=60)
CCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTG < SRR19973065.2631194/150‑1 (MQ=60)
CCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTG < SRR19973065.2631361/150‑1 (MQ=60)
CGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGA > SRR19973065.2790777/1‑150 (MQ=60)
GGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTCTGGTTGGGTAGTTGAT > SRR19973065.2843086/1‑150 (MQ=60)
GGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGAT > SRR19973065.2843929/1‑150 (MQ=60)
GAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATC > SRR19973065.3523177/1‑150 (MQ=60)
GAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATC > SRR19973065.3523339/1‑150 (MQ=60)
ACGGTGATCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAG < SRR19973065.1848839/150‑1 (MQ=60)
GTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCG < SRR19973065.1927161/150‑1 (MQ=60)
ATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCG > SRR19973065.2047880/1‑150 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA > SRR19973065.887297/1‑150 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTAGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA < SRR19973065.2308937/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAG < SRR19973065.2725080/150‑1 (MQ=60)
CGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCACCTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGC > SRR19973065.2160228/1‑150 (MQ=60)
CGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGC > SRR19973065.2160839/1‑150 (MQ=60)
CGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGC > SRR19973065.2807875/1‑150 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG > SRR19973065.3092014/1‑150 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG > SRR19973065.1336006/1‑150 (MQ=60)
GAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAA > SRR19973065.2804340/1‑150 (MQ=60)
AATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAG > SRR19973065.1711569/1‑150 (MQ=60)
AATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAG > SRR19973065.1711056/1‑150 (MQ=60)
AATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAG < SRR19973065.2100229/150‑1 (MQ=60)
ATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGT < SRR19973065.1567146/150‑1 (MQ=60)
ATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAAT > SRR19973065.212334/1‑150 (MQ=60)
ATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAAT > SRR19973065.212348/1‑150 (MQ=60)
ATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAAT > SRR19973065.212351/1‑150 (MQ=60)
TATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATA < SRR19973065.1008210/150‑1 (MQ=60)
TATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATA < SRR19973065.1253627/150‑1 (MQ=60)
TTGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGAAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCATAAGTAATAA < SRR19973065.3478698/150‑1 (MQ=60)
TGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAA > SRR19973065.2981940/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGG < SRR19973065.3291973/150‑1 (MQ=60)
TGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > SRR19973065.957524/1‑150 (MQ=60)
TGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC < SRR19973065.284468/150‑1 (MQ=60)
|
AAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > CP009273/2542479‑2542775
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
