Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,542,627 |
T→G |
100% |
I389M (ATT→ATG) |
yfeW → |
penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,542,627 | 0 | T | G | 99.2%
| 935.8
/ ‑4.0
| 231 | I389M (ATT→ATG) | yfeW | penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (101/128); total (102/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
GATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542481‑2542771
|
gATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggt > 1:3133429/1‑149 (MQ=255)
gATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggt > 2:3592929/1‑149 (MQ=255)
aTGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATggtg < 1:118806/149‑1 (MQ=255)
gCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGAt > 2:1584097/1‑149 (MQ=255)
cACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGt < 1:1892176/149‑1 (MQ=255)
cACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGt < 1:2382202/149‑1 (MQ=255)
aCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGtt < 1:2156231/149‑1 (MQ=255)
ggCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaa > 1:2756386/1‑149 (MQ=255)
gCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaac < 2:4017523/149‑1 (MQ=255)
ccTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaaca > 2:2853594/1‑149 (MQ=255)
cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaacaa > 2:4061115/1‑149 (MQ=255)
cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGcaacaa > 1:3468776/1‑149 (MQ=255)
cTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCcac < 2:1700448/149‑1 (MQ=255)
cTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCcac < 2:1274249/149‑1 (MQ=255)
tGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCcaca < 2:3698644/149‑1 (MQ=255)
ggCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAt > 2:3873705/1‑149 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAtt < 2:2080646/149‑1 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAtt < 1:308364/149‑1 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAtt > 1:1572363/1‑149 (MQ=255)
gcgcGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAtt < 1:112246/149‑1 (MQ=255)
cgcgTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTc < 1:1738467/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGt > 1:1632315/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGt > 1:1595240/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGt > 2:2429512/1‑149 (MQ=255)
aTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt > 1:1058159/1‑149 (MQ=255)
ggTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGc < 2:2642378/149‑1 (MQ=255)
ggTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGc < 2:576143/149‑1 (MQ=255)
gTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGcc < 2:1624564/149‑1 (MQ=255)
gCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATcc > 1:1584465/1‑149 (MQ=255)
gCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATcc > 1:298196/1‑149 (MQ=255)
caccaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGc < 2:1533241/149‑1 (MQ=255)
caccaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGc > 2:912714/1‑149 (MQ=255)
aTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCaaaa > 2:2849904/1‑149 (MQ=255)
aTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCaaaa > 2:3164992/1‑149 (MQ=255)
gCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATc < 2:3356289/149‑1 (MQ=255)
gCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATc < 1:3963844/149‑1 (MQ=255)
cGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATccc > 1:2248289/1‑149 (MQ=255)
gACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCa > 2:1253498/1‑149 (MQ=255)
aCGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCaa < 1:3695614/149‑1 (MQ=255)
cGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCaag > 1:1795367/1‑148 (MQ=255)
cGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAat > 1:3836495/1‑149 (MQ=255)
tttGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAatat > 1:579155/1‑149 (MQ=255)
ttGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATg < 2:1140283/149‑1 (MQ=255)
tGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGt < 1:912714/149‑1 (MQ=255)
ggCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGtt < 2:1166966/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTc < 2:3816352/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTc < 2:1276250/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTc > 2:1048862/1‑149 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGc < 1:4061115/149‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGc < 1:2126463/149‑1 (MQ=255)
ggCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg > 2:1317476/1‑149 (MQ=255)
taaGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACAGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGTTGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCTAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGt < 2:249961/148‑1 (MQ=255)
aaGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTc < 2:716155/149‑1 (MQ=255)
aaGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTc < 1:1819520/149‑1 (MQ=255)
aGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCa > 2:2945142/1‑149 (MQ=255)
cGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTg > 2:703528/1‑149 (MQ=255)
gCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGc > 1:1945112/1‑149 (MQ=255)
cAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGcc > 2:2009467/1‑149 (MQ=255)
aaCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGa > 2:3051767/1‑149 (MQ=255)
aCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAt < 2:3645077/149‑1 (MQ=255)
aCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAt < 1:3546899/149‑1 (MQ=255)
ccTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAtt > 2:350882/1‑149 (MQ=255)
ccTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAtt < 2:786503/149‑1 (MQ=255)
ggTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAAc > 2:4018224/1‑149 (MQ=255)
gTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACt < 1:256723/149‑1 (MQ=255)
gTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACt < 1:510522/149‑1 (MQ=255)
cacaCTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTa > 1:3222557/1‑149 (MQ=255)
acacTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAt < 1:1024157/149‑1 (MQ=255)
acacTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAt < 1:1023978/149‑1 (MQ=255)
cacTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATg > 2:125354/1‑149 (MQ=255)
ctggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGt < 1:3363009/149‑1 (MQ=255)
ggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTg > 1:2682222/1‑149 (MQ=255)
ctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTggg < 1:1303302/149‑1 (MQ=255)
gACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAg < 2:1156548/149‑1 (MQ=255)
gACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAGGGTTGGGTAg > 1:13638/1‑149 (MQ=255)
ggAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGa > 2:1724138/1‑149 (MQ=255)
ggAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGa > 2:3682612/1‑149 (MQ=255)
gAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGAt < 1:2009467/149‑1 (MQ=255)
aaCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATc > 2:127982/1‑149 (MQ=255)
ggTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAgg < 2:4066623/149‑1 (MQ=255)
ccGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTAt > 1:3738156/1‑149 (MQ=255)
cGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATg < 1:3768355/149‑1 (MQ=255)
ttATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcg < 2:722446/149‑1 (MQ=255)
tCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcggcg > 2:1132478/1‑149 (MQ=255)
cGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGt > 1:2894622/1‑149 (MQ=255)
cGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGt < 2:547300/149‑1 (MQ=255)
tCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAGGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTaa > 2:3253029/1‑149 (MQ=255)
ccGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTaaa < 2:2248289/149‑1 (MQ=255)
cGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAg < 1:2106119/149‑1 (MQ=255)
gTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCa > 1:2400754/1‑149 (MQ=255)
tGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAg > 1:758327/1‑149 (MQ=255)
tCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGt > 1:1480447/1‑149 (MQ=255)
cATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGta > 1:1513352/1‑149 (MQ=255)
cATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGta < 2:1611648/149‑1 (MQ=255)
tatGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaat < 2:1175445/149‑1 (MQ=255)
atGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaata > 2:3998148/1‑149 (MQ=255)
atGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaata > 2:139694/1‑149 (MQ=255)
tGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGtaataa < 2:3672276/149‑1 (MQ=255)
gACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATaaa < 2:467247/149‑1 (MQ=255)
cGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATaaaaa > 1:1170150/1‑149 (MQ=255)
|
GATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > CP009273/2542481‑2542771
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > CP009273/2542478‑2542775
|
GAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATG > SRR19973068.551078/1‑150 (MQ=60)
AGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGT > SRR19973068.3152632/1‑150 (MQ=60)
AGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGT < SRR19973068.849036/150‑1 (MQ=60)
AGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGT > SRR19973068.3152653/1‑150 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGA < SRR19973068.2169787/150‑1 (MQ=60)
ATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGA < SRR19973068.119931/150‑1 (MQ=60)
GCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATG > SRR19973068.1880555/1‑150 (MQ=60)
GCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATG > SRR19973068.208074/1‑150 (MQ=60)
CACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTT < SRR19973068.3115685/150‑1 (MQ=60)
CACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTT < SRR19973068.1904743/150‑1 (MQ=60)
CACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTT < SRR19973068.2397403/150‑1 (MQ=60)
CACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTT < SRR19973068.2397348/150‑1 (MQ=60)
ACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTA < SRR19973068.2170244/150‑1 (MQ=60)
ACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTA < SRR19973068.2170363/150‑1 (MQ=60)
TTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGC < SRR19973068.3408138/150‑1 (MQ=60)
TGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAA > SRR19973068.2773309/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAA > SRR19973068.1427297/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAA > SRR19973068.3489802/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCC < SRR19973068.1098142/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCAC < SRR19973068.3769663/150‑1 (MQ=60)
GGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATT > SRR19973068.1582698/1‑150 (MQ=60)
GGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGAGGTTCAGCAACAAGCCACATT > SRR19973068.1582100/1‑150 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973068.2881978/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973068.310403/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTC < SRR19973068.113326/150‑1 (MQ=60)
CGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCG < SRR19973068.1749497/150‑1 (MQ=60)
TGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGG < SRR19973068.3055311/150‑1 (MQ=60)
GAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGT > SRR19973068.1605611/1‑150 (MQ=60)
GAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGT > SRR19973068.1605698/1‑150 (MQ=60)
GAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGT > SRR19973068.1642957/1‑150 (MQ=60)
AATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTT > SRR19973068.1065053/1‑150 (MQ=60)
GTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCG < SRR19973068.2973500/150‑1 (MQ=60)
TGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCC > SRR19973068.1594872/1‑150 (MQ=60)
TGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCC < SRR19973068.1450811/150‑1 (MQ=60)
TGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCC > SRR19973068.300192/1‑150 (MQ=60)
CACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCA > SRR19973068.2864351/1‑150 (MQ=60)
ACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAA > SRR19973068.165202/1‑150 (MQ=60)
TGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGA > SRR19973068.564362/1‑150 (MQ=60)
GCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCC < SRR19973068.3987819/150‑1 (MQ=60)
CCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCC > SRR19973068.2262935/1‑150 (MQ=60)
CGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGAAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCA < SRR19973068.124684/150‑1 (MQ=60)
GACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAA > SRR19973068.3296872/1‑150 (MQ=60)
ACGTTTGGCACGCTGTAAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAAT > SRR19973068.3859528/1‑150 (MQ=60)
ACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAAT > SRR19973068.3859625/1‑150 (MQ=60)
ACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAAT < SRR19973068.3717879/150‑1 (MQ=60)
ACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAAG > SRR19973068.1807110/1‑150 (MQ=60)
GTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATAT > SRR19973068.583110/1‑150 (MQ=60)
GTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATAT > SRR19973068.3153828/1‑150 (MQ=60)
TGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTT < SRR19973068.918858/150‑1 (MQ=60)
GGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTC > SRR19973068.2596534/1‑150 (MQ=60)
GCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCG < SRR19973068.459825/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAG < SRR19973068.4074636/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAG < SRR19973068.1812342/150‑1 (MQ=60)
CTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGC > SRR19973068.1818164/1‑150 (MQ=60)
TGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCG < SRR19973068.4085535/150‑1 (MQ=60)
TGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCG < SRR19973068.2140367/150‑1 (MQ=60)
GCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGT < SRR19973068.1934514/150‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA < SRR19973068.1831479/150‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCA > SRR19973068.3670375/1‑150 (MQ=60)
CGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGC > SRR19973068.1958035/1‑150 (MQ=60)
ACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATT < SRR19973068.3568455/150‑1 (MQ=60)
CGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAAC > SRR19973068.1059518/1‑150 (MQ=60)
GTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTT < SRR19973068.258560/150‑1 (MQ=60)
GTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTT < SRR19973068.514075/150‑1 (MQ=60)
TCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTA > SRR19973068.3242371/1‑150 (MQ=60)
CACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAT < SRR19973068.2125016/150‑1 (MQ=60)
ACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATG < SRR19973068.1030605/150‑1 (MQ=60)
ACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATG < SRR19973068.1030785/150‑1 (MQ=60)
ACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATG < SRR19973068.1030756/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTT < SRR19973068.3383455/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTT < SRR19973068.995987/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTG > SRR19973068.2698929/1‑150 (MQ=60)
GGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGG > SRR19973068.1190354/1‑150 (MQ=60)
CTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGT < SRR19973068.1311839/150‑1 (MQ=60)
CTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGT < SRR19973068.1677119/150‑1 (MQ=60)
GGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAG > SRR19973068.1635436/1‑150 (MQ=60)
GGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTAGGGTTGGGTAG > SRR19973068.13849/1‑150 (MQ=60)
ACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTT < SRR19973068.1082994/150‑1 (MQ=60)
CCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTG > SRR19973068.3751740/1‑150 (MQ=60)
GGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGAT > SRR19973068.697938/1‑150 (MQ=60)
GAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATC < SRR19973068.2746101/150‑1 (MQ=60)
GAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATC < SRR19973068.2022686/150‑1 (MQ=60)
AACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCA > SRR19973068.3549330/1‑150 (MQ=60)
CGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGG < SRR19973068.2696558/150‑1 (MQ=60)
CGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGG < SRR19973068.1753386/150‑1 (MQ=60)
GTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTG < SRR19973068.1594170/150‑1 (MQ=60)
GTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTG < SRR19973068.1594503/150‑1 (MQ=60)
ACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTAT > SRR19973068.3760559/1‑150 (MQ=60)
CGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGC < SRR19973068.3790855/150‑1 (MQ=60)
TCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGT > SRR19973068.2912642/1‑150 (MQ=60)
CGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTT > SRR19973068.2336913/1‑150 (MQ=60)
CGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTT > SRR19973068.1999614/1‑150 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA > SRR19973068.3824943/1‑150 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA < SRR19973068.678586/150‑1 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA > SRR19973068.476528/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTGAATCATATGACGATGGTTATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAA < SRR19973068.2217839/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAA < SRR19973068.126517/150‑1 (MQ=60)
CGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGC < SRR19973068.2119864/150‑1 (MQ=60)
GGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCA > SRR19973068.2416012/1‑150 (MQ=60)
GGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCA > SRR19973068.2415704/1‑150 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG < SRR19973068.2444942/150‑1 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG > SRR19973068.763423/1‑150 (MQ=60)
AATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAG < SRR19973068.1335731/150‑1 (MQ=60)
ATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGT > SRR19973068.1490181/1‑150 (MQ=60)
TCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTA > SRR19973068.1523311/1‑150 (MQ=60)
TCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAGTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTA > SRR19973068.1522504/1‑150 (MQ=60)
CATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAA > SRR19973068.2211323/1‑150 (MQ=60)
CATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAA < SRR19973068.199949/150‑1 (MQ=60)
TATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATA < SRR19973068.3435773/150‑1 (MQ=60)
GACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAA < SRR19973068.843200/150‑1 (MQ=60)
ACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCACCTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > SRR19973068.3954426/1‑150 (MQ=60)
ACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > SRR19973068.1177969/1‑150 (MQ=60)
ACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAA > SRR19973068.1177865/1‑150 (MQ=60)
CGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAG < SRR19973068.3614752/150‑1 (MQ=60)
TGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC < SRR19973068.1710379/150‑1 (MQ=60)
|
GAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > CP009273/2542478‑2542775
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
