Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F159 I0 R1
|
879 |
305.9 |
9588012 |
96.6% |
9262019 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,542,627 |
T→G |
49.5% |
I389M (ATT→ATG) |
yfeW → |
penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,542,627 | 0 | T | G | 49.5%
| 101.4
/ inf
| 334 | I389M (ATT→ATG) | yfeW | penicillin binding protein PBP4B; weak DD‑carboxypeptidase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/99); new base G (67/98); total (137/197) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.12e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
GAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGG > CP009273/2542478‑2542773
|
gAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGAtt < 1:4719461/150‑1 (MQ=255)
gAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGAtt < 2:3456949/150‑1 (MQ=255)
aaGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtg > 1:752976/1‑150 (MQ=255)
aaGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATtg > 1:2072088/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTa < 1:1883017/150‑1 (MQ=255)
gCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGcaaca < 2:4513194/150‑1 (MQ=255)
ccTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGcaacaa > 2:1901969/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAg > 2:3823196/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAg > 2:3644597/1‑150 (MQ=255)
cGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGcc > 2:4601797/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCca < 2:2617289/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCca < 1:2199745/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCcaca < 2:2767556/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCcaca < 2:3274166/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAt > 1:161245/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCATGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATAATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACAtt < 1:15029/150‑1 (MQ=255)
gcgTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGc > 1:1095847/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt < 2:3887771/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt < 1:101037/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt < 2:1233707/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt > 2:2493406/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt < 1:538778/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGtt < 2:1403169/150‑1 (MQ=255)
aTGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTg < 2:2446290/150‑1 (MQ=255)
tGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGc > 1:841271/1‑150 (MQ=255)
ggTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGcc < 1:3224185/150‑1 (MQ=255)
gTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCg < 2:749878/150‑1 (MQ=255)
tGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATcc < 1:4111833/150‑1 (MQ=255)
caccaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGACTCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCa > 2:531949/1‑150 (MQ=255)
accaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCaa > 2:442685/1‑150 (MQ=255)
ccaTGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCaaa < 2:1265974/150‑1 (MQ=255)
gACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGaa > 1:514151/1‑150 (MQ=255)
cGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATc < 1:4249428/150‑1 (MQ=255)
cGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATc > 2:215475/1‑150 (MQ=255)
cGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCa < 2:1452155/150‑1 (MQ=255)
cGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCa < 1:3316019/150‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCaa > 2:2945586/1‑150 (MQ=255)
gACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCaa > 2:1768319/1‑150 (MQ=255)
gACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCaa > 2:912341/1‑150 (MQ=255)
aCGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAat < 1:2699998/150‑1 (MQ=255)
cGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCAGATCCGCAAAAGAATCCCAata < 2:170460/150‑1 (MQ=255)
gTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAatat > 2:1209133/1‑150 (MQ=255)
tttGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATg < 1:2666874/150‑1 (MQ=255)
tttGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATg < 1:275968/150‑1 (MQ=255)
tGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGtt > 2:953824/1‑150 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCg < 1:2338465/150‑1 (MQ=255)
gCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCg < 2:3127738/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg < 2:4070768/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg > 2:1648366/1‑150 (MQ=255)
tGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCg < 2:2110408/150‑1 (MQ=255)
gCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGt < 1:4724590/150‑1 (MQ=255)
aaGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCTTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCa > 2:4343746/1‑150 (MQ=255)
aGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAg > 2:3943062/1‑150 (MQ=255)
gCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGt < 2:618104/150‑1 (MQ=255)
gCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGcc < 1:2264849/150‑1 (MQ=255)
cAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCg < 1:3377102/150‑1 (MQ=255)
aaCCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGAt > 1:2031460/1‑150 (MQ=255)
ccTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTg > 1:1254791/1‑150 (MQ=255)
cTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGc < 2:883083/150‑1 (MQ=255)
ggTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACt > 1:361486/1‑150 (MQ=255)
acacTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGGTGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATg > 2:2661133/1‑150 (MQ=255)
acacTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATg > 2:513042/1‑150 (MQ=255)
ctggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGtt < 2:4694076/150‑1 (MQ=255)
ggctggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTgg > 2:4085021/1‑150 (MQ=255)
tggACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGGTGGGTa > 2:4761262/1‑150 (MQ=255)
gACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGt < 1:3886830/150‑1 (MQ=255)
gACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGt < 1:929825/150‑1 (MQ=255)
aCCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGtt < 2:1095847/150‑1 (MQ=255)
aCCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGtt < 1:1706307/150‑1 (MQ=255)
ccGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTg < 1:297395/150‑1 (MQ=255)
cGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGa < 2:689829/150‑1 (MQ=255)
cGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAAGATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGa > 1:1107804/1‑150 (MQ=255)
aaCGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCa > 2:3582745/1‑150 (MQ=255)
gACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTa > 1:1509481/1‑150 (MQ=255)
ccGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATg < 1:447975/150‑1 (MQ=255)
tATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcggc > 1:3830399/1‑150 (MQ=255)
aTCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATgcggcg < 1:1671818/150‑1 (MQ=255)
tCGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGt > 1:3745365/1‑150 (MQ=255)
cGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGtt > 1:24416/1‑150 (MQ=255)
cGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCAGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGtt > 1:2831503/1‑150 (MQ=255)
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CGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTT > SRR19973078.1151558/1‑150 (MQ=60)
CGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCAGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTT > SRR19973078.2847455/1‑150 (MQ=60)
CGATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTT > SRR19973078.4734159/1‑150 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGCCGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA < SRR19973078.4628589/150‑1 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA < SRR19973078.4627868/150‑1 (MQ=60)
GATCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTA < SRR19973078.4627765/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAA > SRR19973078.3404882/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAA < SRR19973078.1395378/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAG < SRR19973078.2698854/150‑1 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG < SRR19973078.2944378/150‑1 (MQ=60)
GTGAATCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAG < SRR19973078.3204696/150‑1 (MQ=60)
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ATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGT < SRR19973078.790671/150‑1 (MQ=60)
TCATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTA > SRR19973078.1857717/1‑150 (MQ=60)
CATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAA > SRR19973078.660794/1‑150 (MQ=60)
CATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAA > SRR19973078.3062253/1‑150 (MQ=60)
ATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAAT < SRR19973078.2962397/150‑1 (MQ=60)
ATATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAAT > SRR19973078.4352258/1‑150 (MQ=60)
ATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAA > SRR19973078.3673559/1‑150 (MQ=60)
ATGACGATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAA < SRR19973078.4064220/150‑1 (MQ=60)
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GATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGG < SRR19973078.2202809/150‑1 (MQ=60)
GATGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGG < SRR19973078.4348813/150‑1 (MQ=60)
TGGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAATAAGAAGTAATAAAAAGGCC > SRR19973078.2806016/1‑150 (MQ=60)
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GAAGATGCCACTTTTGGCCTCGGCTGGCGCGTGAATGGTAATGCCACCATGACGCCGACGTTTGGCACGCTGGCAAGCCCGCAAACCTACGGTCACACTGGCTGGACCGGAACGGTGACCGTTATCGATCCGGTGAATCATATGACGATTGTGATGTTAAGCAACAAGCCACATTCGCCGGTTGCCGATCCGCAAAAGAATCCCAATATGTTCGAAAGCGGTCAGTTGCCGATTGCAACTTATGGTTGGGTAGTTGATCAGGTGTATGCGGCGTTAAAGCAGAAGTAATAAAAAGGCC > CP009273/2542478‑2542775
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
