Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,268,357 |
C→A |
100% |
intergenic (‑91/‑284) |
garP ← / → garD |
putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,268,357 | 0 | C | A | 98.6%
| 683.2
/ 0.4
| 212 | intergenic (‑91/‑284) | garP/garD | putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base A (92/117); total (94/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268213‑3268501
|
tAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAggg < 2:3375430/148‑1 (MQ=255)
aTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt < 2:304865/148‑1 (MQ=255)
aTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt > 2:2406726/1‑148 (MQ=255)
tAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAtt < 2:2485729/148‑1 (MQ=255)
aGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTa < 2:429792/148‑1 (MQ=255)
gTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGtata > 1:1779080/1‑148 (MQ=255)
aTGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAag > 1:1281541/1‑148 (MQ=255)
aTGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAag > 1:2246082/1‑148 (MQ=255)
tGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagc < 1:1977186/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAgcgc > 1:681618/1‑148 (MQ=255)
ccTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGACTCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGcgcg < 1:3259877/148‑1 (MQ=255)
ccTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGcgcg > 2:1950927/1‑148 (MQ=255)
ctttctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCga > 2:71843/1‑148 (MQ=255)
tctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaa > 1:2444969/1‑148 (MQ=255)
tttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaata < 2:808803/148‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataa < 2:1343080/148‑1 (MQ=255)
tttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataataa < 2:1751521/148‑1 (MQ=255)
cGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCa < 1:2524304/148‑1 (MQ=255)
tCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCAtt > 1:1996828/1‑148 (MQ=255)
tCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCAtt > 1:2828223/1‑148 (MQ=255)
ccaCGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATtg < 1:2210909/146‑1 (MQ=255)
tgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTAGGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 2:1385738/148‑1 (MQ=255)
tCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATg < 1:2951003/148‑1 (MQ=255)
aGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCta < 1:134140/148‑1 (MQ=255)
aGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCta > 1:2862813/1‑148 (MQ=255)
aGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGAAATTTATGAGTTTCATTTATTCCGAAACGACAATGAACTAGTGAATTAGTATAAGCATCGCGAGAATAATAATCATTGTTCAAATGAta > 2:553210/1‑148 (MQ=255)
gAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaa < 2:1235437/148‑1 (MQ=255)
aTTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaa < 2:915837/148‑1 (MQ=255)
aTTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaa < 1:243265/148‑1 (MQ=255)
tttatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaatt < 1:1130765/148‑1 (MQ=255)
ttatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaatta < 1:1622287/148‑1 (MQ=255)
tatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaattaa < 1:277659/148‑1 (MQ=255)
tatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaattaa < 2:3113631/148‑1 (MQ=255)
atttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTtaattaat < 2:1937341/148‑1 (MQ=255)
atttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTtaattaat < 2:1673178/148‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa < 2:1915353/148‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa < 2:3418036/148‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa < 2:1546542/148‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa > 2:2241558/1‑148 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTATATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa < 2:485638/148‑1 (MQ=255)
taCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACt < 1:3413464/148‑1 (MQ=255)
cGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTa > 2:1452820/1‑148 (MQ=255)
ggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 1:42486/148‑1 (MQ=255)
ggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 2:2917384/148‑1 (MQ=255)
ggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 2:797069/148‑1 (MQ=255)
ggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 2:2444969/148‑1 (MQ=255)
tACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata > 2:1909236/1‑148 (MQ=255)
tACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata < 2:540398/148‑1 (MQ=255)
tcTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat < 2:1993301/147‑1 (MQ=255)
aCTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat > 2:103153/1‑148 (MQ=255)
aCTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat > 1:3251543/1‑148 (MQ=255)
ttATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatta < 2:612197/148‑1 (MQ=255)
ttATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatta < 1:3385062/148‑1 (MQ=255)
ttATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatta < 1:3292792/148‑1 (MQ=255)
ttATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatta < 1:2517472/148‑1 (MQ=255)
tATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtattat > 2:2637594/1‑148 (MQ=255)
tATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtattat < 2:1788705/148‑1 (MQ=255)
aTGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATattatt < 1:1496599/148‑1 (MQ=255)
gCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTAtttt > 2:2166983/1‑148 (MQ=255)
gCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTAtttt > 2:3449740/1‑148 (MQ=255)
cTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTg > 1:2645674/1‑148 (MQ=255)
tGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGa < 2:2971279/148‑1 (MQ=255)
gATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAg < 1:1463992/148‑1 (MQ=255)
gATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAg > 1:1721805/1‑148 (MQ=255)
aTTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGc < 2:1188364/148‑1 (MQ=255)
ttttATTATTATTGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat < 1:958678/148‑1 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat < 2:1942213/148‑1 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat > 1:312027/1‑148 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat < 2:3299038/148‑1 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat > 1:708069/1‑148 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCat > 2:2100232/1‑148 (MQ=255)
tattattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATg > 2:1046125/1‑148 (MQ=255)
attattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGc > 1:921951/1‑148 (MQ=255)
attatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca > 1:2500585/1‑148 (MQ=255)
attatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca < 2:3255229/148‑1 (MQ=255)
atGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATaa < 2:2254812/148‑1 (MQ=255)
ggggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAgg < 1:2406726/148‑1 (MQ=255)
ggggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAgg < 2:3175915/148‑1 (MQ=255)
gggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGt < 1:71843/148‑1 (MQ=255)
ggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGtt > 2:1538969/1‑148 (MQ=255)
gAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTg > 2:2574064/1‑148 (MQ=255)
aaGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgc > 1:356375/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcg < 1:1205433/148‑1 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcg > 2:1559880/1‑148 (MQ=255)
tgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc > 1:3142181/1‑148 (MQ=255)
gtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCt > 2:662746/1‑148 (MQ=255)
tatttatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTaa > 1:2906615/1‑148 (MQ=255)
atttatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTaaa > 2:1400554/1‑148 (MQ=255)
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TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973065.2516308/1‑150 (MQ=60)
GGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTT < SRR19973065.2421870/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG < SRR19973065.72592/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG < SRR19973065.1488807/150‑1 (MQ=60)
GGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATTCAGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGAAGCGCGAGAATAATAATAATTGTGAAAATGCTAAATTAATAAATAATATTTAAATATTATTATTAGCATATGCACATAATGTTGC > SRR19973065.358743/1‑150 (MQ=60)
GGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGC > SRR19973065.358884/1‑150 (MQ=60)
AGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCG < SRR19973065.3143513/150‑1 (MQ=60)
AGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCG < SRR19973065.1213185/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973065.3161276/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973065.2560284/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973065.3340938/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAA > SRR19973065.2924326/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATATAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAATGTTGAGCGCTAA > SRR19973065.2924327/1‑150 (MQ=60)
TATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAG > SRR19973065.2909763/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGC > SRR19973065.1124888/1‑150 (MQ=60)
TTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCA > SRR19973065.1211903/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCTCT > SRR19973065.3000997/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCT > SRR19973065.2981289/1‑150 (MQ=60)
TTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTT < SRR19973065.99345/150‑1 (MQ=60)
ATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTAC > SRR19973065.2594558/1‑150 (MQ=60)
CCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTCTGTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTT < SRR19973065.1818158/150‑1 (MQ=60)
AACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCTCGCTAAAGCACAGATTTGATCTTTACCTTACCG > SRR19973065.1095534/1‑150 (MQ=60)
GACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGC > SRR19973065.3182908/1‑150 (MQ=60)
GACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGC > SRR19973065.2100017/1‑150 (MQ=60)
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TAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAA > SRR19973065.1492296/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAAT > SRR19973065.705003/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAAT > SRR19973065.705052/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAAT > SRR19973065.2197008/1‑150 (MQ=60)
AGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAAT > SRR19973065.1646746/1‑150 (MQ=60)
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ATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACTGCAAT > CP009273/3268209‑3268506
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
