Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,268,357 |
C→A |
100% |
intergenic (‑91/‑284) |
garP ← / → garD |
putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,268,357 | 0 | C | A | 99.6%
| 740.8
/ ‑4.4
| 222 | intergenic (‑91/‑284) | garP/garD | putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (113/108); total (114/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
ATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268211‑3268501
|
atTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAgg < 2:2230897/149‑1 (MQ=255)
aaaTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGaa > 2:3243877/1‑149 (MQ=255)
aaTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt > 1:836243/1‑149 (MQ=255)
aTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAtt > 1:1424569/1‑149 (MQ=255)
aGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAg < 1:3168492/149‑1 (MQ=255)
aGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAg > 1:2340799/1‑149 (MQ=255)
gCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGt > 1:3872135/1‑149 (MQ=255)
gCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGt < 2:216035/149‑1 (MQ=255)
cGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGta < 1:1697674/149‑1 (MQ=255)
cGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGta < 1:2132192/149‑1 (MQ=255)
aTGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagc > 1:3649283/1‑149 (MQ=255)
aTGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagc > 1:1603470/1‑149 (MQ=255)
tGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagca < 2:2511299/149‑1 (MQ=255)
tGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagca > 1:2110083/1‑149 (MQ=255)
tGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCAAGAATCATTTTATTTACCTCGTGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagca < 2:2609354/149‑1 (MQ=255)
gCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAagcag < 1:2963722/149‑1 (MQ=255)
gCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGcgcg < 2:3657060/149‑1 (MQ=255)
ccTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCga > 2:3993419/1‑149 (MQ=255)
ctttctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCgag > 1:516229/1‑149 (MQ=255)
tttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataa > 1:1550470/1‑149 (MQ=255)
ttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataataa < 1:1056276/149‑1 (MQ=255)
ttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATc < 1:728101/149‑1 (MQ=255)
ttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATc < 2:1328964/149‑1 (MQ=255)
gTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCAtt < 1:2625430/149‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGc > 2:206631/1‑149 (MQ=255)
ggTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaa < 2:1519501/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGTGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 2:1923995/149‑1 (MQ=255)
tgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAt < 2:3929449/149‑1 (MQ=255)
tgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAt < 1:2579822/149‑1 (MQ=255)
cAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCta < 1:1953117/149‑1 (MQ=255)
gAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaat < 1:2836913/149‑1 (MQ=255)
aTCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaattt < 2:2642016/149‑1 (MQ=255)
cATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaa < 2:1891956/149‑1 (MQ=255)
ttttATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaatt < 2:80679/149‑1 (MQ=255)
ttatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaattaa < 1:3949349/149‑1 (MQ=255)
tatttaCCTCTGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTtaattaat > 2:3750852/1‑149 (MQ=255)
tatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTtaattaat > 2:1026242/1‑149 (MQ=255)
atttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa < 1:1684455/149‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCAGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCATCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAc > 2:1432595/1‑149 (MQ=255)
taCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTa < 2:595686/149‑1 (MQ=255)
aCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTAt > 2:575252/1‑149 (MQ=255)
aCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTAt > 2:2866592/1‑149 (MQ=255)
cTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTAttt < 1:2614631/149‑1 (MQ=255)
tCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTa > 2:2957611/1‑149 (MQ=255)
tCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTa > 1:3037965/1‑149 (MQ=255)
tCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTa > 1:3498422/1‑149 (MQ=255)
cGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaa > 2:2382309/1‑149 (MQ=255)
cGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaa > 1:3336587/1‑149 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa > 2:336689/1‑149 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa > 2:856359/1‑149 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATATaaa > 2:2582625/1‑149 (MQ=255)
ggTACTTATTCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAat < 2:740988/149‑1 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata < 2:2194611/149‑1 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata < 1:146573/149‑1 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata < 2:2111804/149‑1 (MQ=255)
tACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat > 1:954209/1‑149 (MQ=255)
tACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat > 1:2064494/1‑149 (MQ=255)
cTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatta > 2:1781678/1‑149 (MQ=255)
tGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTAtttt > 1:2343627/1‑149 (MQ=255)
gCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTg > 1:1762696/1‑149 (MQ=255)
gCTGATTTTTATTATTAAGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATCAACTAGGGAATTAGTATAATCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTg > 2:3497692/1‑149 (MQ=255)
cTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGa < 1:4005849/149‑1 (MQ=255)
gATTTTTATTATTATGGGGATGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAATATTTAAATATTATTTTGAGc < 1:3744901/149‑1 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTTAGCata > 2:2475180/1‑149 (MQ=255)
ttttATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAATATTTTGAGCata < 2:2320119/149‑1 (MQ=255)
attattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGca < 1:823503/149‑1 (MQ=255)
attattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGca < 2:1754034/149‑1 (MQ=255)
tattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca > 1:3738369/1‑149 (MQ=255)
tattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca < 2:3189715/149‑1 (MQ=255)
tattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca > 1:3100998/1‑149 (MQ=255)
attatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGAACAt > 1:3223523/1‑149 (MQ=255)
ttatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATa < 1:2565199/149‑1 (MQ=255)
atGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAg < 2:2999697/149‑1 (MQ=255)
ggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTg > 1:2669011/1‑149 (MQ=255)
ggTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcg > 2:3810688/1‑149 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc > 2:2297179/1‑149 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc > 1:3491384/1‑149 (MQ=255)
tgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCt < 1:1482972/149‑1 (MQ=255)
gtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTa > 2:3512335/1‑149 (MQ=255)
tatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcac > 2:1176361/1‑149 (MQ=255)
tatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcac < 1:3454321/149‑1 (MQ=255)
atGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcaca > 2:1229760/1‑149 (MQ=255)
atGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcaca < 1:274519/149‑1 (MQ=255)
tGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAg > 1:2223685/1‑149 (MQ=255)
aGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGAt > 2:3231322/1‑149 (MQ=255)
tttCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGAttt > 1:287859/1‑149 (MQ=255)
ttCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTg < 2:1550488/149‑1 (MQ=255)
ttCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTg < 2:2110083/149‑1 (MQ=255)
tttATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCt > 1:3257450/1‑149 (MQ=255)
tAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTttaccttac > 1:2465356/1‑149 (MQ=255)
aCAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggc > 2:445770/1‑149 (MQ=255)
aCAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggc > 2:1076897/1‑149 (MQ=255)
cAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcg > 2:1581509/1‑149 (MQ=255)
aaTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcgg > 1:532950/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcggc > 1:99613/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcggc > 1:100326/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTAGGGAATAAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATATTGAGCATATGCACATAAGTTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTTCGCTTTACCTTAACGggaggc > 2:902255/1‑149 (MQ=255)
gAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCAc < 1:858356/149‑1 (MQ=255)
gAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCAc > 1:2496576/1‑149 (MQ=255)
aaCTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACt > 2:3793149/1‑149 (MQ=255)
|
ATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268211‑3268501
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268208‑3268501
|
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTA > SRR19973068.3209365/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTA > SRR19973068.3209353/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAG > SRR19973068.2436500/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAG > SRR19973068.2436746/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAG > SRR19973068.2436688/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAAGAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAG < SRR19973068.3521437/150‑1 (MQ=60)
TAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAA > SRR19973068.1023067/1‑150 (MQ=60)
AAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAT > SRR19973068.841926/1‑150 (MQ=60)
AATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATT > SRR19973068.1433845/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAG > SRR19973068.2355830/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAG > SRR19973068.2356226/1‑150 (MQ=60)
TAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAG > SRR19973068.3948385/1‑150 (MQ=60)
AGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGT < SRR19973068.3187974/150‑1 (MQ=60)
AGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGT > SRR19973068.3895515/1‑150 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.2867448/150‑1 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.2146137/150‑1 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.2145722/150‑1 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.1711208/150‑1 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.1708544/150‑1 (MQ=60)
CGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTAT < SRR19973068.1707960/150‑1 (MQ=60)
GTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAG < SRR19973068.1147389/150‑1 (MQ=60)
GTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAG < SRR19973068.2565298/150‑1 (MQ=60)
TATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGC > SRR19973068.3671382/1‑150 (MQ=60)
TATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGC > SRR19973068.1613985/1‑150 (MQ=60)
TATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGC > SRR19973068.3284284/1‑150 (MQ=60)
ATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCA > SRR19973068.2123842/1‑150 (MQ=60)
ATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCA > SRR19973068.2123858/1‑150 (MQ=60)
GCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGC < SRR19973068.2982098/150‑1 (MQ=60)
ACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGC < SRR19973068.2688311/150‑1 (MQ=60)
CCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAG > SRR19973068.519765/1‑150 (MQ=60)
CCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAG > SRR19973068.519813/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAA < SRR19973068.2612884/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAA > SRR19973068.1560675/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAA > SRR19973068.1560693/1‑150 (MQ=60)
TTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAAT < SRR19973068.1063154/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCA < SRR19973068.732892/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCA < SRR19973068.1795236/150‑1 (MQ=60)
TTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCA < SRR19973068.1792469/150‑1 (MQ=60)
GTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTG < SRR19973068.2641942/150‑1 (MQ=60)
GGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAA > SRR19973068.826646/1‑150 (MQ=60)
TGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATG < SRR19973068.2596134/150‑1 (MQ=60)
CAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAA < SRR19973068.1966081/150‑1 (MQ=60)
GAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATT < SRR19973068.2854597/150‑1 (MQ=60)
GAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATT > SRR19973068.2677924/1‑150 (MQ=60)
TTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAAT < SRR19973068.3973254/150‑1 (MQ=60)
ATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAC < SRR19973068.836434/150‑1 (MQ=60)
ATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAC < SRR19973068.1695285/150‑1 (MQ=60)
TTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACT < SRR19973068.150350/150‑1 (MQ=60)
CCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTT > SRR19973068.1528119/1‑150 (MQ=60)
CCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTT > SRR19973068.343558/1‑150 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA > SRR19973068.3056613/1‑150 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA > SRR19973068.3519684/1‑150 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA > SRR19973068.3519677/1‑150 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA < SRR19973068.2632538/150‑1 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA < SRR19973068.2631099/150‑1 (MQ=60)
TCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAA > SRR19973068.3356941/1‑150 (MQ=60)
GGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATA < SRR19973068.3263812/150‑1 (MQ=60)
GTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAT > SRR19973068.2077902/1‑150 (MQ=60)
GTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAT > SRR19973068.960577/1‑150 (MQ=60)
GTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAT < SRR19973068.147843/150‑1 (MQ=60)
GTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAT > SRR19973068.961164/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTT > SRR19973068.2358671/1‑150 (MQ=60)
TGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTG > SRR19973068.35391/1‑150 (MQ=60)
TGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTG > SRR19973068.2349657/1‑150 (MQ=60)
TGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTG > SRR19973068.1774066/1‑150 (MQ=60)
CTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAG < SRR19973068.4030051/150‑1 (MQ=60)
GATTTTTATTATTATGGGGATGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAATATTTAAATATTATTTTGAGCA < SRR19973068.3767323/150‑1 (MQ=60)
TATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCA > SRR19973068.717762/1‑150 (MQ=60)
ATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATtaac > SRR19973068.147579/1‑146 (MQ=60)
ATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCAC < SRR19973068.829102/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA < SRR19973068.1654917/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973068.3760774/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA < SRR19973068.4017557/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973068.3119868/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973068.3119652/1‑150 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973068.3760797/1‑150 (MQ=60)
TATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACAT > SRR19973068.3243361/1‑150 (MQ=60)
TATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGAACAT > SRR19973068.3243343/1‑150 (MQ=60)
TTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAA < SRR19973068.386018/150‑1 (MQ=60)
TTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAA < SRR19973068.2404882/150‑1 (MQ=60)
TTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAA < SRR19973068.2581448/150‑1 (MQ=60)
TTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAA < SRR19973068.2582130/150‑1 (MQ=60)
TATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAG < SRR19973068.3721293/150‑1 (MQ=60)
TGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGT > SRR19973068.3033094/1‑150 (MQ=60)
GGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTT < SRR19973068.990226/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG > SRR19973068.2685674/1‑150 (MQ=60)
AAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGC > SRR19973068.319305/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973068.3512400/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973068.3512597/1‑150 (MQ=60)
GTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCT < SRR19973068.2983797/150‑1 (MQ=60)
TGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTA < SRR19973068.1492723/150‑1 (MQ=60)
TTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCA > SRR19973068.3137133/1‑150 (MQ=60)
TATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACA < SRR19973068.266410/150‑1 (MQ=60)
TATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACA < SRR19973068.3475205/150‑1 (MQ=60)
ATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAG < SRR19973068.276425/150‑1 (MQ=60)
ATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAG > SRR19973068.3952269/1‑150 (MQ=60)
ATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAG > SRR19973068.2236788/1‑150 (MQ=60)
ATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAG > SRR19973068.2238215/1‑150 (MQ=60)
TGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGA > SRR19973068.897647/1‑150 (MQ=60)
TGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGA < SRR19973068.2794168/150‑1 (MQ=60)
TGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGA > SRR19973068.204842/1‑150 (MQ=60)
GTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTT > SRR19973068.289819/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCT > SRR19973068.2555749/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCT > SRR19973068.3277463/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACC > SRR19973068.2975683/1‑150 (MQ=60)
GTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTAC > SRR19973068.2481089/1‑150 (MQ=60)
TAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACC < SRR19973068.775955/150‑1 (MQ=60)
CGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGG > SRR19973068.2207558/1‑150 (MQ=60)
GACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGC > SRR19973068.3645456/1‑150 (MQ=60)
ACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCG < SRR19973068.1480263/150‑1 (MQ=60)
CAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGG > SRR19973068.536626/1‑150 (MQ=60)
CAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGG > SRR19973068.536631/1‑150 (MQ=60)
AATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGC > SRR19973068.101327/1‑150 (MQ=60)
AATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGC > SRR19973068.100605/1‑150 (MQ=60)
TGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCAC > SRR19973068.2511874/1‑150 (MQ=60)
TGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCAC > SRR19973068.2512485/1‑150 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT < SRR19973068.864183/150‑1 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT < SRR19973068.862175/150‑1 (MQ=60)
|
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268208‑3268501
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
