Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,268,357 |
C→A |
91.5% |
intergenic (‑91/‑284) |
garP ← / → garD |
putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,268,357 | 0 | C | A | 91.5%
| 650.7
/ 50.3
| 232 | intergenic (‑91/‑284) | garP/garD | putative (D)‑galactarate transporter/(D)‑galactarate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/11); new base A (100/112); total (109/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
ATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268211‑3268501
|
tAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTGTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGa > 1:2100470/1‑149 (MQ=255)
aaTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt < 2:92244/149‑1 (MQ=255)
aaTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt > 2:184166/1‑149 (MQ=255)
aaTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATAATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAt > 2:2139993/1‑149 (MQ=255)
aTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAtt < 2:1256874/149‑1 (MQ=255)
aTAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAtt > 1:747807/1‑149 (MQ=255)
tAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTa > 1:4098880/1‑149 (MQ=255)
tAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTa > 2:461487/1‑149 (MQ=255)
ggTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGtata < 2:4471870/149‑1 (MQ=255)
ggTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGtata > 1:779957/1‑149 (MQ=255)
gTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATaa > 2:4562991/1‑149 (MQ=255)
gTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATaa < 1:308227/149‑1 (MQ=255)
gTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATaa > 1:1320672/1‑149 (MQ=255)
aTGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAagc > 2:3470408/1‑149 (MQ=255)
ctttctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCgag < 1:3222865/149‑1 (MQ=255)
ttctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaa < 2:4554862/149‑1 (MQ=255)
ttctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaa > 2:1220174/1‑149 (MQ=255)
tctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaat < 1:2331523/149‑1 (MQ=255)
tctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaat > 2:4349491/1‑149 (MQ=255)
ctttTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaata < 2:2046921/149‑1 (MQ=255)
tttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataa < 1:1241947/149‑1 (MQ=255)
tttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataa > 2:1365612/1‑149 (MQ=255)
ttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataat < 1:2275573/149‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataat < 2:1703530/149‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataat < 2:3552176/149‑1 (MQ=255)
ttttttCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGG‑AGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGaataata < 1:4238448/149‑1 (MQ=255)
cGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCAt < 1:3477753/149‑1 (MQ=255)
cGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCAt < 2:2515077/149‑1 (MQ=255)
cAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATtgt < 1:1008909/149‑1 (MQ=255)
aaCGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATtgtg < 2:166857/149‑1 (MQ=255)
aCGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGc > 1:2807291/1‑149 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 2:3823732/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 2:1949673/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 1:4471878/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 2:3823781/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 1:2242439/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa < 1:3787683/149‑1 (MQ=255)
gtgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGAGCGAGAATAATAATCATTGTGCaaa > 2:2130592/1‑149 (MQ=255)
tgtCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAt < 2:234651/149‑1 (MQ=255)
cAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCta > 2:3162370/1‑149 (MQ=255)
gAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaat < 1:1175659/149‑1 (MQ=255)
aTCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGACGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaattt > 2:3139746/1‑149 (MQ=255)
cATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCtaatttaa > 1:3169330/1‑149 (MQ=255)
ttatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaattaa > 1:1757978/1‑149 (MQ=255)
ttatttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATttaattaa > 1:3397900/1‑149 (MQ=255)
tatttaCCTCTGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTtaattaat < 1:4342039/149‑1 (MQ=255)
atttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATa > 2:81726/1‑149 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAc < 2:2470946/149‑1 (MQ=255)
tttaCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATAc > 2:740552/1‑149 (MQ=255)
taCCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAataata < 2:1157548/149‑1 (MQ=255)
ccTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTAtt < 2:1981126/149‑1 (MQ=255)
cTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTAttt < 1:245366/149‑1 (MQ=255)
tCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTa > 1:1967162/1‑149 (MQ=255)
cGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaa > 2:2906074/1‑149 (MQ=255)
cGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaa > 2:2907323/1‑149 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa > 2:4628161/1‑149 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 2:1026515/149‑1 (MQ=255)
gggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTaaa < 2:3415575/149‑1 (MQ=255)
ggTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAat < 1:1540619/149‑1 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAGTCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata > 2:2653201/1‑149 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata < 1:3653505/149‑1 (MQ=255)
gTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAata > 2:2652973/1‑149 (MQ=255)
tACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAatat < 2:596559/149‑1 (MQ=255)
aCTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatt > 1:4684597/1‑149 (MQ=255)
aCTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAAtatt > 2:4072332/1‑149 (MQ=255)
tATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATattatt < 1:3833882/149‑1 (MQ=255)
gCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTg > 1:47789/1‑149 (MQ=255)
tGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAg > 1:2548567/1‑149 (MQ=255)
tGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAg < 1:3047118/149‑1 (MQ=255)
aTTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCa > 2:3318999/1‑149 (MQ=255)
aTTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCa < 1:3996745/149‑1 (MQ=255)
tattattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGc < 1:4379450/149‑1 (MQ=255)
tattatGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGcaca > 1:1288941/1‑149 (MQ=255)
ctgtggAAGTTGTTATTGATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACACTGATCTAGGGAATTAGTATAAGAAGCGCTAGAATAATTATGATTGTGCAAATGCTATTTTAATTAATTCTATTTCAATATTATTTTGAGCTTATGCACATAAg < 2:3294071/145‑1 (MQ=255)
tGGGGTAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAgg < 2:2265515/149‑1 (MQ=255)
ggggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGt > 1:2752848/1‑149 (MQ=255)
ggAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTg < 2:2937282/149‑1 (MQ=255)
aaGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcg > 2:4542358/1‑149 (MQ=255)
aGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgc > 2:1180611/1‑149 (MQ=255)
aGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgc > 2:3095673/1‑149 (MQ=255)
aGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATCTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgc > 2:673660/1‑149 (MQ=255)
aGGGGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgc > 1:1423421/1‑149 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc < 1:539848/149‑1 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc > 1:1853832/1‑149 (MQ=255)
gtgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTgcgcgc > 1:1457050/1‑149 (MQ=255)
tgtTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCt > 1:4607922/1‑149 (MQ=255)
ttatttatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTaa > 1:930572/1‑149 (MQ=255)
ttatttatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTaa > 2:4145180/1‑149 (MQ=255)
tatttatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTaaa < 1:4708552/149‑1 (MQ=255)
tatGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcac < 1:1039038/149‑1 (MQ=255)
atGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGcaca < 2:476838/149‑1 (MQ=255)
gAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGa > 1:1443387/1‑149 (MQ=255)
tCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTgc < 2:3664107/149‑1 (MQ=255)
aTTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTgcgc < 2:3794333/149‑1 (MQ=255)
cAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcg > 1:2059746/1‑149 (MQ=255)
aaTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcgg > 2:2310393/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcggc > 2:1888496/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcggc > 2:3927293/1‑149 (MQ=255)
aTGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGggcggc > 2:1875527/1‑149 (MQ=255)
aaCTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGTACt > 1:3459499/1‑149 (MQ=255)
|
ATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268211‑3268501
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268208‑3268501
|
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTC < SRR19973071.4290816/150‑1 (MQ=60)
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTA > SRR19973071.4034897/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTA > SRR19973071.4035753/1‑150 (MQ=60)
TTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTGTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGA > SRR19973071.2108214/1‑150 (MQ=60)
AAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAAT < SRR19973071.1292989/150‑1 (MQ=60)
AAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAT > SRR19973071.396389/1‑150 (MQ=60)
AAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAAT < SRR19973071.4790341/150‑1 (MQ=60)
AATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATT > SRR19973071.750813/1‑150 (MQ=60)
AATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATT > SRR19973071.750374/1‑150 (MQ=60)
ATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTA > SRR19973071.4113446/1‑150 (MQ=60)
GGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATA < SRR19973071.951293/150‑1 (MQ=60)
GGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATA > SRR19973071.782576/1‑150 (MQ=60)
GGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAA > SRR19973071.1325524/1‑150 (MQ=60)
GTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAG > SRR19973071.4567806/1‑150 (MQ=60)
GTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAG < SRR19973071.309309/150‑1 (MQ=60)
GTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGCCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAG > SRR19973071.3846646/1‑150 (MQ=60)
ATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCA < SRR19973071.4702596/150‑1 (MQ=60)
CCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAG < SRR19973071.3443918/150‑1 (MQ=60)
CTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGA < SRR19973071.3234184/150‑1 (MQ=60)
CTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGA < SRR19973071.3234069/150‑1 (MQ=60)
TTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAAT > SRR19973071.239836/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATA < SRR19973071.2339998/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAAT < SRR19973071.1246407/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAAT < SRR19973071.1246369/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAAT < SRR19973071.761234/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATA < SRR19973071.2283934/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGG‑AGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAA < SRR19973071.4253510/150‑1 (MQ=60)
CGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATT < SRR19973071.3489999/150‑1 (MQ=60)
CAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTG > SRR19973071.4555797/1‑150 (MQ=60)
CAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTG < SRR19973071.1012586/150‑1 (MQ=60)
CAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTG < SRR19973071.1012573/150‑1 (MQ=60)
AACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGC < SRR19973071.3998233/150‑1 (MQ=60)
AACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGC > SRR19973071.2817185/1‑150 (MQ=60)
GTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAT < SRR19973071.3801141/150‑1 (MQ=60)
GTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAT < SRR19973071.927343/150‑1 (MQ=60)
GTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAT < SRR19973071.4487733/150‑1 (MQ=60)
GTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAT < SRR19973071.2250710/150‑1 (MQ=60)
GTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAAT < SRR19973071.2250712/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGC > SRR19973071.11983/1‑150 (MQ=60)
AGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAAT < SRR19973071.1160869/150‑1 (MQ=60)
GAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATT < SRR19973071.1179710/150‑1 (MQ=60)
TCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAA > SRR19973071.3180392/1‑150 (MQ=60)
TCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAA > SRR19973071.4807247/1‑150 (MQ=60)
CATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAAT < SRR19973071.1915376/150‑1 (MQ=60)
TTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAA > SRR19973071.3409941/1‑150 (MQ=60)
TTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAA > SRR19973071.1764540/1‑150 (MQ=60)
TATTTACCTCTGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATA < SRR19973071.4357349/150‑1 (MQ=60)
TATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATA > SRR19973071.1723588/1‑150 (MQ=60)
TATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATA < SRR19973071.4357434/150‑1 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA < SRR19973071.246301/150‑1 (MQ=60)
CTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTA > SRR19973071.1974296/1‑150 (MQ=60)
GGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATA < SRR19973071.1546058/150‑1 (MQ=60)
GGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATA < SRR19973071.1546139/150‑1 (MQ=60)
GTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATAT < SRR19973071.3666361/150‑1 (MQ=60)
TACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATT > SRR19973071.4701252/1‑150 (MQ=60)
TTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATT < SRR19973071.3694579/150‑1 (MQ=60)
TTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATT < SRR19973071.2935712/150‑1 (MQ=60)
TTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATT < SRR19973071.1295654/150‑1 (MQ=60)
TATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTT > SRR19973071.3624758/1‑150 (MQ=60)
TATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTT < SRR19973071.3847475/150‑1 (MQ=60)
TGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTG > SRR19973071.316587/1‑150 (MQ=60)
TGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTG > SRR19973071.48071/1‑150 (MQ=60)
CTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAG > SRR19973071.2557836/1‑150 (MQ=60)
CTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAG > SRR19973071.2557097/1‑150 (MQ=60)
CTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAG > SRR19973071.2023667/1‑150 (MQ=60)
TGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGC < SRR19973071.3057945/150‑1 (MQ=60)
TGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGC < SRR19973071.3057944/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCAT < SRR19973071.2281980/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCAT > SRR19973071.3198558/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCAT < SRR19973071.4010766/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCAT < SRR19973071.4010720/150‑1 (MQ=60)
TTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGC < SRR19973071.2069134/150‑1 (MQ=60)
TTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGC < SRR19973071.2781359/150‑1 (MQ=60)
TATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCA < SRR19973071.4394831/150‑1 (MQ=60)
TTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACA > SRR19973071.1293629/1‑150 (MQ=60)
TATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACAT < SRR19973071.254135/150‑1 (MQ=60)
TTTTGGGGAAGTTGTTATTTATGAGTTTAATTTAGGCCGTAAAGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTTATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAA < SRR19973071.4115950/150‑1 (MQ=60)
TATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAAATAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAG > SRR19973071.3257855/1‑150 (MQ=60)
TGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGT > SRR19973071.2762584/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG < SRR19973071.161453/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG < SRR19973071.1433487/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTG < SRR19973071.1433481/150‑1 (MQ=60)
AAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGC > SRR19973071.1428194/1‑150 (MQ=60)
AAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGC > SRR19973071.4253660/1‑150 (MQ=60)
AAGGGGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGC > SRR19973071.1428657/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973071.1860691/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973071.1462294/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGC > SRR19973071.1462378/1‑150 (MQ=60)
GTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCT < SRR19973071.541874/150‑1 (MQ=60)
GTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCT > SRR19973071.4624354/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAA > SRR19973071.933957/1‑150 (MQ=60)
TATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAG < SRR19973071.4725257/150‑1 (MQ=60)
ATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGC > SRR19973071.747975/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGC > SRR19973071.2725598/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGC > SRR19973071.1982136/1‑150 (MQ=60)
TATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACA < SRR19973071.1042783/150‑1 (MQ=60)
ATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAG > SRR19973071.1796304/1‑150 (MQ=60)
TGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGA > SRR19973071.1448676/1‑150 (MQ=60)
TTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTG < SRR19973071.4681155/150‑1 (MQ=60)
TGCCGTAACGACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACC > SRR19973071.2304234/1‑150 (MQ=60)
ACAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCG > SRR19973071.2067316/1‑150 (MQ=60)
CAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGG < SRR19973071.2892104/150‑1 (MQ=60)
CAATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGG < SRR19973071.3565556/150‑1 (MQ=60)
ATGAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCA < SRR19973071.213322/150‑1 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGTACT > SRR19973071.3471704/1‑150 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGTACT > SRR19973071.3471716/1‑150 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > SRR19973071.4781564/1‑150 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT < SRR19973071.4472236/150‑1 (MQ=60)
GAACTAGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGAAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACA > SRR19973071.4273048/1‑150 (MQ=60)
|
AATATTAAATAGCGGGTATGCACGCCTTTCTTTTTTTCGTCAACGGTGTCCAGAATCATTTTATTTACCTCGGGTACTTATGCTGATTTTTATTATTATGGGGAAGGTGTTATTTATGAGTTTCATTTATGCCGTAACGACAATGAACTCGGGAATTAGTATAAGCAGCGCGAGAATAATAATCATTGTGCAAATGCTAATTTAATTAATACTATTTAAATATTATTTTGAGCATATGCACATAAGGTTGCGCGCTAAAGCACAGATTTGCGCTTTACCTTACCGGGCGGCACT > CP009273/3268208‑3268501
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |