Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,497,946 |
G→T |
100% |
L7I (CTC→ATC) |
fryA ← |
putative PTS enzyme, Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,497,946 | 0 | G | T | 97.7%
| 526.1
/ 3.6
| 172 | L7I (CTC→ATC) | fryA | putative PTS enzyme, Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/4); new base T (76/92); total (76/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
GTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAAT > CP009273/2497801‑2498090
|
gtgccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATaa < 2:1143277/148‑1 (MQ=255)
gccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAAt < 2:2462482/148‑1 (MQ=255)
gccAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAAt < 1:2936919/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa > 1:2595246/1‑148 (MQ=255)
aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa > 2:3433404/1‑148 (MQ=255)
aTCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGaa < 1:354319/148‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt < 2:3287469/148‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt < 2:1642814/148‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAAt > 1:3304404/1‑148 (MQ=255)
aGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCg > 1:881263/1‑148 (MQ=255)
gcgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGt < 1:1963838/148‑1 (MQ=255)
cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt < 1:1396617/148‑1 (MQ=255)
cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt > 1:3103582/1‑148 (MQ=255)
cgcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGtt > 1:3743380/1‑148 (MQ=255)
gcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTa < 1:605658/148‑1 (MQ=255)
gcCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTa < 1:53339/148‑1 (MQ=255)
gAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATaa < 2:975560/148‑1 (MQ=255)
ttttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGc > 1:3812012/1‑148 (MQ=255)
tttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCt > 1:1090745/1‑148 (MQ=255)
tttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCt > 1:1090428/1‑148 (MQ=255)
tttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTCAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCt < 2:3334503/148‑1 (MQ=255)
ttCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTc < 1:1609513/148‑1 (MQ=255)
cATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCggg < 2:2822942/148‑1 (MQ=255)
tCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGtt > 2:2923543/1‑148 (MQ=255)
tGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTaa < 2:2991852/148‑1 (MQ=255)
tGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTaa < 2:790958/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAACAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAAt < 2:590200/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAAt < 2:590241/148‑1 (MQ=255)
ccTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATc > 1:2987050/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCa < 1:2340801/148‑1 (MQ=255)
tttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAg > 2:2793906/1‑148 (MQ=255)
ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg > 1:3232665/1‑148 (MQ=255)
ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg < 2:1315265/148‑1 (MQ=255)
ttGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAgg > 1:3233848/1‑148 (MQ=255)
cTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGatcat < 1:2015775/148‑1 (MQ=255)
tGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGatcatc < 1:416182/148‑1 (MQ=255)
tGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAAt < 2:3792493/148‑1 (MQ=255)
taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt > 1:2106779/1‑148 (MQ=255)
taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt < 1:2314767/148‑1 (MQ=255)
taataaAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGt < 1:116442/148‑1 (MQ=255)
aaaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGt > 1:2940540/1‑148 (MQ=255)
aaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGtt < 2:1798632/148‑1 (MQ=255)
aaaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGtt < 2:1798644/148‑1 (MQ=255)
aaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTg > 1:772398/1‑148 (MQ=255)
aaGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTg > 1:1564641/1‑148 (MQ=255)
aGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGa > 1:1849710/1‑148 (MQ=255)
aGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGa > 1:2512434/1‑148 (MQ=255)
gTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGaa > 1:2732502/1‑148 (MQ=255)
ttCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGGAATCCGTCAGTTGAACAAcc > 2:3230063/1‑148 (MQ=255)
ttCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAAcc < 2:128429/148‑1 (MQ=255)
cGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGt < 1:710783/148‑1 (MQ=255)
cTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGtct < 1:1746433/148‑1 (MQ=255)
cTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGtct < 2:3677394/148‑1 (MQ=255)
aCTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGt > 2:3800705/1‑148 (MQ=255)
cTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTa > 1:181466/1‑148 (MQ=255)
cTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTa < 2:1025657/148‑1 (MQ=255)
cTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGAc > 2:890348/1‑148 (MQ=255)
cTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGAc < 2:578513/148‑1 (MQ=255)
cACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGtt > 1:721961/1‑148 (MQ=255)
cTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGa < 1:239308/148‑1 (MQ=255)
cTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGa < 1:3379517/148‑1 (MQ=255)
ttCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATa > 1:1152719/1‑148 (MQ=255)
ttCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATa > 2:3080645/1‑148 (MQ=255)
tCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATaa > 2:2185137/1‑148 (MQ=255)
cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg > 2:1980613/1‑148 (MQ=255)
cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:3812012/148‑1 (MQ=255)
cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:1573886/148‑1 (MQ=255)
cTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGCAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAg < 2:1913414/148‑1 (MQ=255)
ttAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAggg < 1:1872050/148‑1 (MQ=255)
tAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGc < 2:474625/148‑1 (MQ=255)
aaGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCa > 1:3328316/1‑148 (MQ=255)
aGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAg < 1:2764183/148‑1 (MQ=255)
tCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATa > 1:1651184/1‑148 (MQ=255)
tCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATa > 1:1651198/1‑148 (MQ=255)
cccACGCCGGACGAGCAGGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATaa < 2:2382207/148‑1 (MQ=255)
cACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATaaaa < 2:2981304/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTCAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTCAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAAAAAGGGCAGATAAAAg < 1:3576071/148‑1 (MQ=255)
cGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGt < 2:1092749/148‑1 (MQ=255)
cGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGt < 2:1090428/148‑1 (MQ=255)
ccGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTtg > 2:1464941/1‑148 (MQ=255)
gACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTtgctg > 2:2065448/1‑148 (MQ=255)
gAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCAt < 1:2178533/148‑1 (MQ=255)
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aGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATc > 2:589615/1‑148 (MQ=255)
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AAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGA > SRR19973069.568417/1‑150 (MQ=60)
AGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGACTAAGGGCAGAT > SRR19973069.2256442/1‑150 (MQ=60)
AGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGAT < SRR19973069.2782628/150‑1 (MQ=60)
GTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATA > SRR19973069.1662606/1‑150 (MQ=60)
GTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATA > SRR19973069.1662654/1‑150 (MQ=60)
GTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATA > SRR19973069.1662592/1‑150 (MQ=60)
TTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAA < SRR19973069.3399349/150‑1 (MQ=60)
CCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAG < SRR19973069.2841738/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTT < SRR19973069.3599381/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTCAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTCAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAAAAAGGGCAGATAAAAGTT < SRR19973069.3599387/150‑1 (MQ=60)
CCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCT < SRR19973069.30482/150‑1 (MQ=60)
GAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCT < SRR19973069.2193382/150‑1 (MQ=60)
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AGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTG > SRR19973069.3786427/1‑150 (MQ=60)
GACCGTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGGAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGT < SRR19973069.3251189/150‑1 (MQ=60)
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GTTAGGCAAAGGACAGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCG < SRR19973069.3455716/150‑1 (MQ=60)
AAAGGACAGATAAATTGATTCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCG < SRR19973069.2293878/150‑1 (MQ=60)
AGATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAATCG < SRR19973069.2970440/150‑1 (MQ=60)
GATAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAATCGA > SRR19973069.2243965/1‑150 (MQ=60)
TAAATTGAATCGTTAACATCACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAATCGATG < SRR19973069.3536985/150‑1 (MQ=60)
TAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAATCGATG < SRR19973069.3536998/150‑1 (MQ=60)
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GCCGGTGCCAATCAGCGCCAGCGAGCTTTTCGCATCTGCCTTTGCGTTCTGGCGATGGTTAATAAAAGTGATTTCGCTTTGCCACTGGCTGCACTGTTCTTTAAGTTCCCACGCCGGACGAGCATGTAGACCGTTAGGCAAAGGACAGAGAAATTGAATCGTTAACATAACCGCTCCGGGTTAATCAGGAGATCATCTGAAATCCGTCAGTTGAACAACCGTCTCACGCGTAAGACGTTGAATAAGGGCAGATAAAAGTTGCTGCATCTGCAAAATGTCGCGGCAATCGGCAATCGATG > CP009273/2497797‑2498095
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
