Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,985,256 |
G→T |
9.4% |
intergenic (+138/‑197) |
ygeG → / → ygeH |
SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,985,256 | 0 | G | T | 9.4%
| 1313.2
/ 69.3
| 369 | intergenic (+138/‑197) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (178/156); new base T (23/12); total (201/168) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 |
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985107‑2985405
|
aTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAgaga < 2:1333327/150‑1 (MQ=255)
aaTGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGAATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAAc > 1:895536/1‑150 (MQ=255)
aTGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACa > 1:2039730/1‑150 (MQ=255)
ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAAt < 2:3621301/150‑1 (MQ=255)
tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTa > 2:4433266/1‑150 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTAc < 2:3821573/150‑1 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAAACTAc > 1:2909873/1‑150 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTAAGTTTTCTTAAATCATCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATAATTTTTCAATGATTTAGAGAACAATCTAc > 1:2391087/1‑150 (MQ=255)
cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACttt < 2:3722751/150‑1 (MQ=255)
cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCCTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACttt < 2:2703293/150‑1 (MQ=255)
aTTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTa > 2:1046687/1‑150 (MQ=255)
aTTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTa > 1:924262/1‑150 (MQ=255)
tACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATc > 1:4052292/1‑150 (MQ=255)
tCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAAt < 2:1013004/150‑1 (MQ=255)
aTTTGTTTAAATTTGCTGTTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg < 2:2877310/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg < 2:4108250/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGAGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTg > 2:2618431/1‑150 (MQ=255)
gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATaa < 2:1719372/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt < 1:1003049/150‑1 (MQ=255)
tGCTGGTTATAGTGCAGTTAACTACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAttt < 1:1266190/150‑1 (MQ=255)
taGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACa > 1:2355345/1‑150 (MQ=255)
gTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc < 1:1126709/150‑1 (MQ=255)
gCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCAc < 2:1240049/150‑1 (MQ=255)
aGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTg > 1:360310/1‑150 (MQ=255)
ttAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGaa > 2:2413201/1‑150 (MQ=255)
ttAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGaa > 1:3533979/1‑150 (MQ=255)
tAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAt < 2:3953519/150‑1 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAtt < 2:2773648/150‑1 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAtt < 2:2556482/150‑1 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAtt > 1:1330127/1‑150 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAtt < 1:1001544/150‑1 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATCACATCACTGAAtt < 1:4501043/150‑1 (MQ=255)
cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCt > 2:91571/1‑150 (MQ=255)
cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCt > 2:3207738/1‑150 (MQ=255)
ataACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGa > 1:3862566/1‑150 (MQ=255)
aaCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTACTAAGATa > 2:2823572/1‑150 (MQ=255)
aGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAAtt > 2:3420600/1‑150 (MQ=255)
aGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAAtt < 1:1496999/150‑1 (MQ=255)
gCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTa < 2:3706709/150‑1 (MQ=255)
ccTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTg < 1:1422931/150‑1 (MQ=255)
ccTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTg < 1:3682683/150‑1 (MQ=255)
ctTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAac > 2:3989111/1‑150 (MQ=255)
ctTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAac > 1:741386/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTTATTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATACAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAAcaca > 1:2929381/1‑150 (MQ=255)
tttCTTAAATCAGCATCTTGAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCa > 1:3326715/1‑150 (MQ=255)
tttCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATGCTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCa > 1:2282463/1‑150 (MQ=255)
tttCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCa < 1:1184095/150‑1 (MQ=255)
tCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATa < 1:44759/150‑1 (MQ=255)
cTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAg > 2:730450/1‑150 (MQ=255)
aaaTCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGata < 2:439510/150‑1 (MQ=255)
aaaTCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGata < 2:3790468/150‑1 (MQ=255)
aaTCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGatat < 1:4143823/150‑1 (MQ=255)
cAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTc > 1:1615622/1‑150 (MQ=255)
aGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCa > 1:2649121/1‑150 (MQ=255)
aTCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAt > 1:1822021/1‑150 (MQ=255)
aTCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAt < 1:565003/150‑1 (MQ=255)
cTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCATAAGATAAATTAGTGAACACAACAATAGATATGTCAAATGt > 2:2999557/1‑150 (MQ=255)
tAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTaa < 1:1531872/150‑1 (MQ=255)
tAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTaa > 2:2099037/1‑150 (MQ=255)
aaaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAt > 1:1696853/1‑150 (MQ=255)
aaaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAt > 2:562012/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAtt > 1:4353957/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAtt > 1:3286376/1‑150 (MQ=255)
aaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAttt > 2:3291406/1‑150 (MQ=255)
aaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAttt < 2:691423/150‑1 (MQ=255)
cAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTcc > 2:2038317/1‑150 (MQ=255)
cAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTcc > 2:4284702/1‑150 (MQ=255)
gagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCg > 1:3955521/1‑150 (MQ=255)
gCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGtt < 2:1094031/150‑1 (MQ=255)
gCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGtt < 1:2841392/150‑1 (MQ=255)
cATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTa > 1:4529796/1‑150 (MQ=255)
aTACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTaa > 2:765012/1‑150 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAAt > 2:753770/1‑150 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAAt < 2:2505983/150‑1 (MQ=255)
ataAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGaca > 1:1900059/1‑150 (MQ=255)
taAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGacac > 1:2551390/1‑150 (MQ=255)
taAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGacac > 1:2380806/1‑150 (MQ=255)
taAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGacac > 1:3456352/1‑150 (MQ=255)
aTCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATa > 1:4298768/1‑150 (MQ=255)
attattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAat > 1:590428/1‑150 (MQ=255)
attattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACAAAAat > 1:391597/1‑150 (MQ=255)
ttattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAata > 2:2231767/1‑150 (MQ=255)
ttattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAata > 2:1809035/1‑150 (MQ=255)
tattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAatat < 2:1448214/150‑1 (MQ=255)
tattTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAatat < 2:2391622/150‑1 (MQ=255)
attTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATg > 1:2007736/1‑150 (MQ=255)
tttttCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGa > 1:2810412/1‑150 (MQ=255)
ttttCAATGCTTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGaa < 1:3577960/150‑1 (MQ=255)
tCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAg < 2:3873796/150‑1 (MQ=255)
cAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATTAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGAGACATAAATATGAATAGc < 1:4433266/150‑1 (MQ=255)
aaTGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGcc > 2:1489598/1‑150 (MQ=255)
gCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATa < 2:850137/150‑1 (MQ=255)
gTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:2914204/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:419596/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:1588814/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:1641967/1‑150 (MQ=255)
gTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:3098861/1‑150 (MQ=255)
gagaACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCt < 1:3174300/150‑1 (MQ=255)
gaACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAt < 1:691816/150‑1 (MQ=255)
gaACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAt > 1:2106233/1‑150 (MQ=255)
|
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985107‑2985405
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
