Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,985,256 |
G→T |
100% |
intergenic (+138/‑197) |
ygeG → / → ygeH |
SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,985,256 | 0 | G | T | 96.9%
| 735.9
/ 10.2
| 236 | intergenic (+138/‑197) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/2); new base T (124/104); total (130/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
ATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATT > CP009273/2985111‑2985400
|
tGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAc > 1:1935260/1‑148 (MQ=255)
cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAt < 2:2821360/148‑1 (MQ=255)
tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATc < 2:2500847/148‑1 (MQ=255)
tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATc < 1:2464085/148‑1 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCt > 1:849688/1‑148 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCt > 1:1005496/1‑148 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCt > 1:1639673/1‑148 (MQ=255)
gCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTAc < 2:1451350/148‑1 (MQ=255)
gCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTAc < 1:3035114/148‑1 (MQ=255)
cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACt < 1:2936869/148‑1 (MQ=255)
aTTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACtt > 2:583457/1‑148 (MQ=255)
ttACAATCATTTGGTTAAATTTTCTTTTTATAGTGCATTTAACAACTATAACCAGAACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGAATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACttt < 1:1699885/148‑1 (MQ=255)
ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACttt > 1:352770/1‑148 (MQ=255)
ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACttt > 1:2982953/1‑148 (MQ=255)
tACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTa < 1:2541076/148‑1 (MQ=255)
aCAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTAt < 1:2561109/148‑1 (MQ=255)
aaTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTAtaa > 2:3322178/1‑146 (MQ=255)
aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaa > 2:372672/1‑148 (MQ=255)
tCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaaa < 2:3259858/148‑1 (MQ=255)
aTTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAAt > 1:2619715/1‑148 (MQ=255)
tGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGa < 1:1022219/148‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAt < 2:572047/148‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAt > 1:1416786/1‑148 (MQ=255)
ttAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATa < 2:1522090/148‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATa > 1:1228940/1‑148 (MQ=255)
aaaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAg < 2:3513265/148‑1 (MQ=255)
aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGc < 2:805596/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAGCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt < 1:2623425/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt > 2:3091282/1‑148 (MQ=255)
tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt > 2:277406/1‑148 (MQ=255)
tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt < 2:2058111/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCt < 1:658448/148‑1 (MQ=255)
cTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAttt < 1:1458017/148‑1 (MQ=255)
tGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTc > 1:1257759/1‑148 (MQ=255)
ttATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGAATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAAAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGTATATTTCAGa > 1:3263583/1‑148 (MQ=255)
tataGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAt > 1:902117/1‑148 (MQ=255)
tataGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAt > 2:928674/1‑148 (MQ=255)
taGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTa < 1:3277161/148‑1 (MQ=255)
taGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTa < 1:3274790/148‑1 (MQ=255)
taGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTa < 2:3336839/148‑1 (MQ=255)
gTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACa < 2:2407550/148‑1 (MQ=255)
tGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTAAAt > 2:1868795/1‑148 (MQ=255)
gCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATc < 1:2437706/148‑1 (MQ=255)
ttAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTg > 2:138799/1‑148 (MQ=255)
tAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGa > 2:876103/1‑148 (MQ=255)
aCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAt > 2:3399048/1‑148 (MQ=255)
aCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAt > 2:1695806/1‑148 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc > 1:1140/1‑148 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc > 2:1773491/1‑148 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc < 2:1292061/148‑1 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc < 2:3140290/148‑1 (MQ=255)
taACCAGCACCTCTTTTTTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAg < 2:2721880/148‑1 (MQ=255)
aaCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGa > 2:1237360/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGAt > 2:1605368/1‑148 (MQ=255)
ccAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATa > 1:442410/1‑148 (MQ=255)
ccAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTACTAAGATa > 2:2639074/1‑148 (MQ=255)
cAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATaa > 1:915477/1‑148 (MQ=255)
cACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAAtt > 1:2375630/1‑148 (MQ=255)
aCCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTa > 2:904490/1‑148 (MQ=255)
ttATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGaa > 1:1042923/1‑148 (MQ=255)
tATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAac < 1:297627/148‑1 (MQ=255)
tGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAacac > 1:2898801/1‑148 (MQ=255)
tGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCATAAGATAAATTAGTGAacac > 2:1841139/1‑148 (MQ=255)
ttttCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACaa < 2:2389049/148‑1 (MQ=255)
tCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCa > 1:1970859/1‑148 (MQ=255)
cTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCAt < 2:761537/148‑1 (MQ=255)
ttAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATa < 2:276989/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGata > 1:2762266/1‑148 (MQ=255)
aTCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATAACTAACATAAATTAGTGAACACAACCATAGata > 1:2442943/1‑148 (MQ=255)
tCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGatat > 1:677139/1‑148 (MQ=255)
tCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGatat > 2:3053544/1‑148 (MQ=255)
aTCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCaa < 1:3395001/148‑1 (MQ=255)
aTCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCaa < 2:2920790/148‑1 (MQ=255)
cTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAt > 1:260111/1‑148 (MQ=255)
cTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTACTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAt > 2:2216267/1‑148 (MQ=255)
ttAAAACAGTTAAGATCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATg < 2:3453849/148‑1 (MQ=255)
aaaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTa > 1:847078/1‑148 (MQ=255)
aaaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTa < 2:3191825/148‑1 (MQ=255)
aCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAtt > 1:2333181/1‑148 (MQ=255)
cAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAttt > 1:307863/1‑148 (MQ=255)
aGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTc > 2:380811/1‑148 (MQ=255)
agagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTa < 1:876103/148‑1 (MQ=255)
agagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTa > 2:1954059/1‑148 (MQ=255)
gagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAg < 2:3444840/148‑1 (MQ=255)
agCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGc > 1:2364624/1‑148 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTa > 1:3171227/1‑148 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTa < 2:2995742/148‑1 (MQ=255)
aCTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTaa > 2:1065632/1‑148 (MQ=255)
aCTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTaa > 2:1477994/1‑148 (MQ=255)
tataAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATg > 2:520558/1‑148 (MQ=255)
ataAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCACATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGa > 2:3274454/1‑148 (MQ=255)
aaaTCATTATTTTTGTTTGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGaca < 2:1158051/148‑1 (MQ=255)
aaTCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGacac < 2:1737765/148‑1 (MQ=255)
cATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATa > 2:2582042/1‑148 (MQ=255)
attattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATaa > 1:2223177/1‑148 (MQ=255)
attattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATaa < 2:2012272/148‑1 (MQ=255)
ttattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATaaa > 2:2112960/1‑148 (MQ=255)
tattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAat < 1:1493485/148‑1 (MQ=255)
tattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAat < 2:684560/148‑1 (MQ=255)
gTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATa > 2:458644/1‑148 (MQ=255)
|
ATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATT > CP009273/2985111‑2985400
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985107‑2985405
|
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT > SRR19973065.3014086/1‑150 (MQ=60)
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT > SRR19973065.3015671/1‑150 (MQ=60)
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT < SRR19973065.686576/150‑1 (MQ=60)
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT < SRR19973065.687526/150‑1 (MQ=60)
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT < SRR19973065.688999/150‑1 (MQ=60)
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAT > SRR19973065.3211076/1‑150 (MQ=60)
ATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATA > SRR19973065.2629522/1‑150 (MQ=60)
ATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATA > SRR19973065.3178380/1‑150 (MQ=60)
TAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTAAATGCGTTAGATAA > SRR19973065.2248279/1‑150 (MQ=60)
AATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAC > SRR19973065.2522322/1‑150 (MQ=60)
AATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAC > SRR19973065.1947927/1‑150 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT > SRR19973065.1012173/1‑150 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT > SRR19973065.855194/1‑150 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT > SRR19973065.862161/1‑150 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT > SRR19973065.1650685/1‑150 (MQ=60)
TAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTA < SRR19973065.848986/150‑1 (MQ=60)
TAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTA < SRR19973065.2479615/150‑1 (MQ=60)
GCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTT < SRR19973065.3053703/150‑1 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT > SRR19973065.355243/1‑150 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT < SRR19973065.2328543/150‑1 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT > SRR19973065.3001210/1‑150 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT < SRR19973065.2954685/150‑1 (MQ=60)
TTACAATCATTTGGTTAAATTTTCTTTTTATAGTGCATTTAACAACTATAACCAGAACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGAATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTAT < SRR19973065.1711219/150‑1 (MQ=60)
TACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATC < SRR19973065.2556998/150‑1 (MQ=60)
TACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATC < SRR19973065.2557305/150‑1 (MQ=60)
ACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCA < SRR19973065.2577121/150‑1 (MQ=60)
TCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAAT > SRR19973065.2635933/1‑150 (MQ=60)
TTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGA > SRR19973065.293572/1‑150 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT < SRR19973065.1028992/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT > SRR19973065.1426036/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA > SRR19973065.1236967/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA > SRR19973065.1233495/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA > SRR19973065.2992985/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTA < SRR19973065.2231357/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAGCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973065.2639566/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAGCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973065.2639659/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAGCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973065.2639772/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973065.662799/150‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973065.2430547/150‑1 (MQ=60)
TTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATT < SRR19973065.2590004/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTC > SRR19973065.1266044/1‑150 (MQ=60)
CTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCA < SRR19973065.1467397/150‑1 (MQ=60)
CTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCA < SRR19973065.1467260/150‑1 (MQ=60)
CTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCA < SRR19973065.1248181/150‑1 (MQ=60)
GGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGAATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAAAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGTATATTTCAGA > SRR19973065.3283363/1‑150 (MQ=60)
GTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTATATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAT > SRR19973065.907683/1‑150 (MQ=60)
GTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAT > SRR19973065.907912/1‑150 (MQ=60)
TAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACA < SRR19973065.3294679/150‑1 (MQ=60)
TAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACA < SRR19973065.3294675/150‑1 (MQ=60)
TAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACA < SRR19973065.3297067/150‑1 (MQ=60)
TAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACA < SRR19973065.3294672/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCAC < SRR19973065.2453077/150‑1 (MQ=60)
TTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAA > SRR19973065.3040426/1‑150 (MQ=60)
TAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAT > SRR19973065.1377929/1‑150 (MQ=60)
ACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTC > SRR19973065.372304/1‑150 (MQ=60)
ACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTC < SRR19973065.1339283/150‑1 (MQ=60)
CCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCC > SRR19973065.1154/1‑150 (MQ=60)
CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCT > SRR19973065.2975379/1‑150 (MQ=60)
TATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAG < SRR19973065.3516128/150‑1 (MQ=60)
TAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGAT > SRR19973065.897304/1‑150 (MQ=60)
AACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATA > SRR19973065.445474/1‑150 (MQ=60)
ACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAA > SRR19973065.921452/1‑150 (MQ=60)
AGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATT > SRR19973065.2390468/1‑150 (MQ=60)
CTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGA < SRR19973065.1691681/150‑1 (MQ=60)
TCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAA > SRR19973065.418102/1‑150 (MQ=60)
TCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAA > SRR19973065.1049817/1‑150 (MQ=60)
CTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAAC > SRR19973065.3091140/1‑150 (MQ=60)
CTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAAC > SRR19973065.918616/1‑150 (MQ=60)
TATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACAC > SRR19973065.2916489/1‑150 (MQ=60)
TATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACAC < SRR19973065.299547/150‑1 (MQ=60)
TATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACAC < SRR19973065.299623/150‑1 (MQ=60)
ATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACA < SRR19973065.2445764/150‑1 (MQ=60)
TGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAA < SRR19973065.265025/150‑1 (MQ=60)
TTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCA > SRR19973065.1983707/1‑150 (MQ=60)
TTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCAT > SRR19973065.2477935/1‑150 (MQ=60)
TTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCAT < SRR19973065.1490625/150‑1 (MQ=60)
AAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATA > SRR19973065.2779428/1‑150 (MQ=60)
AAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATAACTAACATAAATTAGTGAACACAACCATAGATA > SRR19973065.2458340/1‑150 (MQ=60)
AATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATAT > SRR19973065.681270/1‑150 (MQ=60)
AATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATAT > SRR19973065.681655/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACATTCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATG > SRR19973065.151603/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATG > SRR19973065.1050564/1‑150 (MQ=60)
ATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAT < SRR19973065.3415760/150‑1 (MQ=60)
ATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAT > SRR19973065.261907/1‑150 (MQ=60)
ATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAT > SRR19973065.261911/1‑150 (MQ=60)
TCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATG > SRR19973065.1038822/1‑150 (MQ=60)
TTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAGATGTA > SRR19973065.852594/1‑150 (MQ=60)
TTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTA > SRR19973065.852568/1‑150 (MQ=60)
TAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAA < SRR19973065.260308/150‑1 (MQ=60)
AAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATT > SRR19973065.2347790/1‑150 (MQ=60)
AAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATT > SRR19973065.2347763/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTT > SRR19973065.309918/1‑150 (MQ=60)
CAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCC > SRR19973065.1056301/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCT < SRR19973065.980558/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGAGCATACTATAAATCATTTTTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCGACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAATATTAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTG < SRR19973065.2465500/150‑1 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA < SRR19973065.1785099/150‑1 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC < SRR19973065.881698/150‑1 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC > SRR19973065.1972787/1‑150 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC > SRR19973065.2379849/1‑150 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC > SRR19973065.2379348/1‑150 (MQ=60)
AGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGT > SRR19973065.511511/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973065.3190419/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973065.3190415/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973065.3190305/1‑150 (MQ=60)
TATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGAC > SRR19973065.245683/1‑150 (MQ=60)
AATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACAT < SRR19973065.2804551/150‑1 (MQ=60)
ATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATA > SRR19973065.3201311/1‑150 (MQ=60)
TCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAA > SRR19973065.2237357/1‑150 (MQ=60)
AATTATTTTTCAATGAGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGTATTCCTATGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAA < SRR19973065.3036175/150‑1 (MQ=60)
ATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAAT > SRR19973065.1018996/1‑150 (MQ=60)
TTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATA < SRR19973065.682870/150‑1 (MQ=60)
TATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATAT < SRR19973065.1503076/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAA < SRR19973065.1844235/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAA < SRR19973065.925021/150‑1 (MQ=60)
TGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCAT < SRR19973065.3342447/150‑1 (MQ=60)
TTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATT < SRR19973065.1595376/150‑1 (MQ=60)
TAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTT < SRR19973065.3352403/150‑1 (MQ=60)
GATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT < SRR19973065.2540016/150‑1 (MQ=60)
GATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT < SRR19973065.1865304/150‑1 (MQ=60)
GATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT < SRR19973065.375279/150‑1 (MQ=60)
TAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > SRR19973065.1173888/1‑150 (MQ=60)
TAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTCCTAT > SRR19973065.1173897/1‑150 (MQ=60)
|
GATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985107‑2985405
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
