Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,985,256 |
G→T |
91.9% |
intergenic (+138/‑197) |
ygeG → / → ygeH |
SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,985,256 | 0 | G | T | 91.9%
| 780.5
/ 59.4
| 284 | intergenic (+138/‑197) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/11); new base T (119/142); total (131/153) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT > CP009273/2985112‑2985403
|
tGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAAc > 2:2738169/1‑148 (MQ=255)
ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACa < 2:835278/148‑1 (MQ=255)
gCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACaa > 1:2138836/1‑148 (MQ=255)
gCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACaa > 2:1380845/1‑148 (MQ=255)
cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAt < 1:837754/148‑1 (MQ=255)
cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAt < 2:726566/148‑1 (MQ=255)
cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAt < 1:3147636/148‑1 (MQ=255)
cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAt < 2:1899719/148‑1 (MQ=255)
aaGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCt < 1:1242330/148‑1 (MQ=255)
cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACt > 1:2958694/1‑148 (MQ=255)
cATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACt < 1:1690998/148‑1 (MQ=255)
ttACAATAATTTGTTTAAATTTGCTGTTTATAGTGCAGTTAACCAATATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACttt < 1:2039075/148‑1 (MQ=255)
tACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTa > 1:2677420/1‑148 (MQ=255)
tACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTa > 1:1479471/1‑148 (MQ=255)
cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATc > 2:795120/1‑148 (MQ=255)
aaTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCa > 1:333742/1‑148 (MQ=255)
aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaa < 1:1860730/148‑1 (MQ=255)
aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaa > 1:1943011/1‑148 (MQ=255)
tCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCaaa > 2:584562/1‑148 (MQ=255)
acATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAATTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaaa < 2:1656331/147‑1 (MQ=255)
cATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATCAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaaaa > 2:2626733/1‑148 (MQ=255)
cATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCaaaa < 1:437965/148‑1 (MQ=255)
tGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGa < 1:2512463/148‑1 (MQ=255)
tGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGa < 1:2316249/148‑1 (MQ=255)
ggTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGaa < 2:1072869/148‑1 (MQ=255)
gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAt < 1:915953/148‑1 (MQ=255)
tttaaTGTGCTGTTTATAGTGCAGTAAACCAATATAACAAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGAATATTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAAACTACTTTATCAAAATTGAATa < 2:2154374/145‑1 (MQ=255)
ttAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATa > 1:2538725/1‑148 (MQ=255)
aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGc < 1:540654/148‑1 (MQ=255)
aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGc < 1:2474217/148‑1 (MQ=255)
tGCTGGTTATAGTTCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAt < 2:1214690/148‑1 (MQ=255)
tGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTc < 2:2270474/148‑1 (MQ=255)
gTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAg < 1:1446414/148‑1 (MQ=255)
gTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAg < 2:3264761/148‑1 (MQ=255)
ttATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGa > 2:2264436/1‑148 (MQ=255)
ttATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGa > 2:2101110/1‑148 (MQ=255)
tataGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAt > 2:417221/1‑148 (MQ=255)
taGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTGATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTa < 2:1696639/148‑1 (MQ=255)
aGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTAc < 2:3029736/148‑1 (MQ=255)
tGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACAt < 1:1847883/148‑1 (MQ=255)
tGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACAt < 1:1847936/148‑1 (MQ=255)
cAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCa < 1:858915/148‑1 (MQ=255)
cAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCa < 1:2354520/148‑1 (MQ=255)
tAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGa > 1:1611428/1‑148 (MQ=255)
aaCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGaa < 1:1589515/148‑1 (MQ=255)
aCCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAt < 2:2460991/148‑1 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc > 1:388874/1‑148 (MQ=255)
aCTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTcc < 1:1743907/148‑1 (MQ=255)
ataACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTaa > 2:4517/1‑148 (MQ=255)
aaCCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGa > 2:1585755/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCACCTCTTATGTTTGCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGGTAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGAt > 1:2160946/1‑148 (MQ=255)
ccAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATa < 1:2297743/148‑1 (MQ=255)
aCCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTa < 2:2888635/148‑1 (MQ=255)
ccTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAg < 2:2677420/148‑1 (MQ=255)
ctctTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGt > 1:1158213/1‑148 (MQ=255)
tctTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTg > 1:950376/1‑148 (MQ=255)
ctTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGa < 2:307177/148‑1 (MQ=255)
ttATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGaa < 1:2798080/148‑1 (MQ=255)
aTGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAaca > 2:2055352/1‑148 (MQ=255)
aGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGt < 2:754193/148‑1 (MQ=255)
gCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTc > 2:1433785/1‑148 (MQ=255)
cATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCa < 1:1108905/148‑1 (MQ=255)
cATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCa > 1:2197430/1‑148 (MQ=255)
aaaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTaa < 1:989140/148‑1 (MQ=255)
aaCAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAAt < 2:1729895/148‑1 (MQ=255)
aGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTc < 1:1978237/148‑1 (MQ=255)
aaGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGt < 1:3024092/148‑1 (MQ=255)
agagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACGTCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTa > 1:1351124/1‑148 (MQ=255)
agagCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTa > 1:3174354/1‑148 (MQ=255)
agCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGc > 1:447343/1‑148 (MQ=255)
cATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGt > 2:2814546/1‑148 (MQ=255)
cATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGt < 1:2348454/148‑1 (MQ=255)
cATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGt > 2:2333187/1‑148 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTa > 1:2094733/1‑148 (MQ=255)
tACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTa > 1:1222934/1‑148 (MQ=255)
ataAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGa < 1:3126528/148‑1 (MQ=255)
ataAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGa > 1:2365843/1‑148 (MQ=255)
aaaTCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGaca > 2:394643/1‑148 (MQ=255)
aaTCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGacac < 2:1810580/148‑1 (MQ=255)
tCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACAt < 2:296863/148‑1 (MQ=255)
tCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACAt < 2:1603092/148‑1 (MQ=255)
cATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATa > 1:3295255/1‑148 (MQ=255)
attattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATaa < 2:1375051/148‑1 (MQ=255)
tattTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAat < 2:950376/148‑1 (MQ=255)
attTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAata < 2:2777805/148‑1 (MQ=255)
attTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAata > 1:765099/1‑148 (MQ=255)
tttCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTATTGACACATCAATATGa > 2:3145310/1‑148 (MQ=255)
tttCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGa < 1:1191004/148‑1 (MQ=255)
ttCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGaa > 2:2547893/1‑148 (MQ=255)
ttCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGaa < 2:71506/148‑1 (MQ=255)
tCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAAt < 1:1033079/148‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATCGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGc > 1:2237032/1‑148 (MQ=255)
aTGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGc < 1:3272551/148‑1 (MQ=255)
gCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCa < 2:1242658/148‑1 (MQ=255)
gCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCa < 1:794434/148‑1 (MQ=255)
gCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCa < 2:650293/148‑1 (MQ=255)
ttAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATaa < 1:584562/148‑1 (MQ=255)
tAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 2:542815/1‑148 (MQ=255)
tAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAt > 1:492067/1‑148 (MQ=255)
gaACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCt > 1:2575822/1‑148 (MQ=255)
|
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT > CP009273/2985112‑2985403
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985112‑2985405
|
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAA > SRR19973070.478800/1‑150 (MQ=60)
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAA > SRR19973070.2153103/1‑150 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT < SRR19973070.843417/150‑1 (MQ=60)
CTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCT < SRR19973070.3167976/150‑1 (MQ=60)
AAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTAC < SRR19973070.1251037/150‑1 (MQ=60)
AGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACT < SRR19973070.85384/150‑1 (MQ=60)
AGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACT > SRR19973070.654926/1‑150 (MQ=60)
AGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACT > SRR19973070.2977728/1‑150 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT < SRR19973070.1702620/150‑1 (MQ=60)
CATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT > SRR19973070.795372/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAATAATTTGGTTAAATTTGCTGTTTATAGTGCATTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTT < SRR19973070.16395/150‑1 (MQ=60)
ATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTA > SRR19973070.1823061/1‑150 (MQ=60)
ATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTA > SRR19973070.2200106/1‑150 (MQ=60)
ATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTA > SRR19973070.1489824/1‑150 (MQ=60)
ATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTA > SRR19973070.2694426/1‑150 (MQ=60)
ATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTA > SRR19973070.2694802/1‑150 (MQ=60)
TTACAATAATTTGTTTAAATTTGCTGTTTATAGTGCAGTTAACCAATATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTAT < SRR19973070.2052873/150‑1 (MQ=60)
ACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCA > SRR19973070.336177/1‑150 (MQ=60)
ACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCA > SRR19973070.336182/1‑150 (MQ=60)
CAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAA > SRR19973070.1956088/1‑150 (MQ=60)
CAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAA > SRR19973070.1956062/1‑150 (MQ=60)
ATCATTTGGTTAAATTTGCTGTTTTTAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGAATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAA < SRR19973070.1873202/150‑1 (MQ=60)
ATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAA < SRR19973070.1873461/150‑1 (MQ=60)
TCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAAT < SRR19973070.2180136/150‑1 (MQ=60)
CATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATT < SRR19973070.441141/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTG > SRR19973070.2491987/1‑150 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT < SRR19973070.2528818/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT < SRR19973070.2331314/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT < SRR19973070.2331638/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAATTTGCGGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAAT < SRR19973070.2528828/150‑1 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA > SRR19973070.2555320/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA > SRR19973070.2555317/1‑150 (MQ=60)
GGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATA < SRR19973070.506602/150‑1 (MQ=60)
GTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAA < SRR19973070.922473/150‑1 (MQ=60)
TTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAG > SRR19973070.1251367/1‑150 (MQ=60)
TAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGG > SRR19973070.946050/1‑150 (MQ=60)
AATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCT > SRR19973070.2535114/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTA < SRR19973070.2490336/150‑1 (MQ=60)
ATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTA < SRR19973070.544268/150‑1 (MQ=60)
ATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTA > SRR19973070.863024/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTAT < SRR19973070.1657006/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTC < SRR19973070.1991126/150‑1 (MQ=60)
GTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAT < SRR19973070.152006/150‑1 (MQ=60)
GTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGAT < SRR19973070.1456463/150‑1 (MQ=60)
TATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTA > SRR19973070.2374290/1‑150 (MQ=60)
TATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTA < SRR19973070.2442708/150‑1 (MQ=60)
TATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTA > SRR19973070.3228920/1‑150 (MQ=60)
TAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACA < SRR19973070.1090961/150‑1 (MQ=60)
AGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACAT < SRR19973070.1472106/150‑1 (MQ=60)
TGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCA < SRR19973070.1860556/150‑1 (MQ=60)
TGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCA < SRR19973070.1860598/150‑1 (MQ=60)
TGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCA < SRR19973070.1860609/150‑1 (MQ=60)
TGAAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTAAGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTAAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATTCTTTAGATAACAATCTACTATATCAAAAATGAAAAAGTCTATTTCAGATTACATCA > SRR19973070.2324169/1‑150 (MQ=60)
CAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACT < SRR19973070.2369834/150‑1 (MQ=60)
CAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACT < SRR19973070.2370115/150‑1 (MQ=60)
CAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACT < SRR19973070.864865/150‑1 (MQ=60)
CAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACT < SRR19973070.2371452/150‑1 (MQ=60)
AGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTG > SRR19973070.2268178/1‑150 (MQ=60)
GTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGA > SRR19973070.2040474/1‑150 (MQ=60)
GTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGA > SRR19973070.1622657/1‑150 (MQ=60)
GTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGA > SRR19973070.1622643/1‑150 (MQ=60)
TAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAAT < SRR19973070.2029942/150‑1 (MQ=60)
AACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATT < SRR19973070.1600659/150‑1 (MQ=60)
AACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATT < SRR19973070.1600634/150‑1 (MQ=60)
CCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCC > SRR19973070.391721/1‑150 (MQ=60)
CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCT < SRR19973070.1743628/150‑1 (MQ=60)
CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCT < SRR19973070.1743776/150‑1 (MQ=60)
ACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTA < SRR19973070.1755998/150‑1 (MQ=60)
CTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAA > SRR19973070.2625672/1‑150 (MQ=60)
TATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAG < SRR19973070.899547/150‑1 (MQ=60)
TAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGAT < SRR19973070.550629/150‑1 (MQ=60)
TAACCAGCACCTCTTATGTTTGCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGGTAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGAT > SRR19973070.2175309/1‑150 (MQ=60)
CCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAA < SRR19973070.2313033/150‑1 (MQ=60)
CCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAA < SRR19973070.469123/150‑1 (MQ=60)
CAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAAT < SRR19973070.3108823/150‑1 (MQ=60)
CAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAAT < SRR19973070.3108641/150‑1 (MQ=60)
ACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAATGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGT > SRR19973070.1166311/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTATTG > SRR19973070.957149/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTG > SRR19973070.2112972/1‑150 (MQ=60)
CTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAAC > SRR19973070.807770/1‑150 (MQ=60)
TTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACA < SRR19973070.1154222/150‑1 (MQ=60)
TTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACA < SRR19973070.2816140/150‑1 (MQ=60)
ATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTTAATAAGGCTATTTCAGATTACATAACTGAATTCATAAGATAAATTAGTGAACACA > SRR19973070.2526362/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAAC < SRR19973070.964236/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAACATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACC > SRR19973070.334242/1‑150 (MQ=60)
TTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCA > SRR19973070.2450010/1‑150 (MQ=60)
TCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGT < SRR19973070.3155744/150‑1 (MQ=60)
TCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGT < SRR19973070.3155763/150‑1 (MQ=60)
CAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTC < SRR19973070.346057/150‑1 (MQ=60)
CAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTC < SRR19973070.605135/150‑1 (MQ=60)
AGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCA > SRR19973070.3172154/1‑150 (MQ=60)
AGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCA > SRR19973070.3035937/1‑150 (MQ=60)
AGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCA > SRR19973070.2211926/1‑150 (MQ=60)
AGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCA < SRR19973070.420269/150‑1 (MQ=60)
AGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCA > SRR19973070.2211945/1‑150 (MQ=60)
CATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAA < SRR19973070.1116498/150‑1 (MQ=60)
ATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAAT < SRR19973070.287876/150‑1 (MQ=60)
TTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTA < SRR19973070.449784/150‑1 (MQ=60)
AAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATT < SRR19973070.2755795/150‑1 (MQ=60)
AAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATT < SRR19973070.996193/150‑1 (MQ=60)
AACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTT > SRR19973070.2336961/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTT > SRR19973070.2336914/1‑150 (MQ=60)
CAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCC < SRR19973070.1884262/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCT < SRR19973070.2279461/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCT < SRR19973070.42348/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCT < SRR19973070.1991611/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCT > SRR19973070.1171826/1‑150 (MQ=60)
GTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTG > SRR19973070.2134993/1‑150 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACGTCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA > SRR19973070.1360376/1‑150 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA > SRR19973070.3194877/1‑150 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA > SRR19973070.3194900/1‑150 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA > SRR19973070.3194961/1‑150 (MQ=60)
TAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTA > SRR19973070.1360085/1‑150 (MQ=60)
AAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAG > SRR19973070.3320150/1‑150 (MQ=60)
AAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAG < SRR19973070.3043359/150‑1 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC > SRR19973070.450567/1‑150 (MQ=60)
AGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGC > SRR19973070.448415/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA < SRR19973070.2364030/150‑1 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973070.2108812/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973070.1240578/1‑150 (MQ=60)
CATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGACCCCCACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTA > SRR19973070.1231496/1‑150 (MQ=60)
TACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAAT < SRR19973070.217125/150‑1 (MQ=60)
TACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAAT < SRR19973070.1470723/150‑1 (MQ=60)
ACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATG < SRR19973070.2559119/150‑1 (MQ=60)
ACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATG < SRR19973070.1860764/150‑1 (MQ=60)
ACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATG > SRR19973070.546412/1‑150 (MQ=60)
CTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGA > SRR19973070.1214875/1‑150 (MQ=60)
CTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGA > SRR19973070.2381493/1‑150 (MQ=60)
TATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGagatcggaagagc > SRR19973070.782628/1‑137 (MQ=60)
TATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGAC < SRR19973070.960539/150‑1 (MQ=60)
TATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGAC < SRR19973070.2900692/150‑1 (MQ=60)
ATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACA < SRR19973070.3146712/150‑1 (MQ=60)
ATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGTCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATA < SRR19973070.1833128/150‑1 (MQ=60)
ATCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATA > SRR19973070.3316379/1‑150 (MQ=60)
TCATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAA < SRR19973070.2069238/150‑1 (MQ=60)
ATTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAAT > SRR19973070.1951007/1‑150 (MQ=60)
ATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAAT < SRR19973070.2091843/150‑1 (MQ=60)
TTATTTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATA > SRR19973070.770476/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATG < SRR19973070.1390204/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAA < SRR19973070.1530362/150‑1 (MQ=60)
TTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAAT < SRR19973070.1199376/150‑1 (MQ=60)
TTTCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAAT < SRR19973070.1199360/150‑1 (MQ=60)
TCAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAG < SRR19973070.1040386/150‑1 (MQ=60)
CAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATCGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGC > SRR19973070.2251788/1‑150 (MQ=60)
CAATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGC > SRR19973070.873470/1‑150 (MQ=60)
ATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCA < SRR19973070.3293589/150‑1 (MQ=60)
ATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCA > SRR19973070.1234091/1‑150 (MQ=60)
ATGCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCA < SRR19973070.3293685/150‑1 (MQ=60)
GCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATA < SRR19973070.799925/150‑1 (MQ=60)
GCGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATA < SRR19973070.800614/150‑1 (MQ=60)
CGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAA > SRR19973070.2216849/1‑150 (MQ=60)
CGTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAA > SRR19973070.301837/1‑150 (MQ=60)
GTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAT > SRR19973070.1204005/1‑150 (MQ=60)
GTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAT > SRR19973070.495513/1‑150 (MQ=60)
GTTAGATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAAT > SRR19973070.1145171/1‑150 (MQ=60)
TTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATT < SRR19973070.588592/150‑1 (MQ=60)
GATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT > SRR19973070.654977/1‑150 (MQ=60)
GATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT > SRR19973070.654621/1‑150 (MQ=60)
GAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCT > SRR19973070.2592662/1‑150 (MQ=60)
ATAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTA > SRR19973070.2976870/1‑150 (MQ=60)
ATAACAATCTAATTTATCAAAATTTAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGATTTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTA < SRR19973070.406778/150‑1 (MQ=60)
TAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > SRR19973070.2391026/1‑150 (MQ=60)
TAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT < SRR19973070.3333344/150‑1 (MQ=60)
|
TGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAACCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTAT > CP009273/2985112‑2985405
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
